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The map label for this gene is 159901315

Identifier: 159901315

GI number: 159901315

Start: 6127380

End: 6129251

Strand: Direct

Name: 159901315

Synonym: Haur_4803

Alternate gene names: NA

Gene position: 6127380-6129251 (Clockwise)

Preceding gene: 159901310

Following gene: 159901316

Centisome position: 96.55

GC content: 40.97

Gene sequence:

>1872_bases
ATGCAGTTCAAAAGGTTCGTATGGGTTAGCCTAGGGTTGGCTGGACTCAGCTTGATGCTCTTGGTTGGCAATACACTCAG
TTTACGGCTATTTGGCCAAATTCAACAGATTGATGTTGGCAATTGGGGCGACCAAAATAATGTTGCTGGCGGCTTCGAGC
AAGAACAAAACGCCCTCGGTGAAACCTACCGTTGGACTCAAGCCGAGGCTACGATTCGGCTTCAGGGCTACGGTTCGGCT
AGCTCACGCTTGCTTAGCTTAAAAATAGGTGGCGTACCAAGTAGTTTGCCAGTTACCGCAACCATGCAGGTTTCGACTAA
TTCCGCTAGTGTGGCCTTGCCACTAACCCAAACTGCTCGTCACTATCACCTGTTGATACCGCCAACCTACCAGCCCGATT
GGCAGGTTCGGCTCAATATCCCAACCCAACAAGTTTTGCCCGACCCCCGATTTTTGGGGGTGCGGCTTGATCATGTGCAA
ATTCAAACCCCAAGTATTGCTTGGTCAAGTGTTCATTGGCACTTATTAATCGTGCAATTGGCAATTATGAGTAGCCTTAT
TGGGGTATTGTGGTTTTTAGCTGCTGATTGGCCGACAATTGTTGGTATCAGCGGCATAACAATCTTGGTGCTGGTAACAA
TCACTGGTAAATTTGTATTGGTGGCATGGGCATGGCAACTCCGTTTATTAATTGTAGCTGCTGCTACAACGCTGTTAGTT
GGCTGGCTCCGTTCATTAATTCAGAATCAGATTAAGCATTTACTAAAACCGTATGAATATCGGTATTTAATTATATTTAG
TGTTATTAGCTTTTTCATTCCAGTAATGAGTATCCTATTTCCAAATTTTGGCTCACATGATCGGGTAATTCATGCTGATC
GTTTAGGTCAAGTTGCTCAAGGCTCAGCATTATTATTAGATAAATTATATGAATTTCAGGGCCGCGAAACCATTACCCCA
ACCACATTTTATCTATTAGCACTACCACTAACTGTATTTTTTAATAATAATGGATTAATTATTGAAGGATTGTATACATT
TTTGCATGCAAGCAGTGGGATTCTTTTGGCAATAACCTTATTACGCTGGAAGGTTCGGCCTATACTTGCACTTGCGGCAA
TGATTTTAATCTCAGCAATGCCAATTCAAATGACAATTTTATGGTGGGGTTTTGCCCCTCAAATTGTTGGTCAGTGGTTG
ATTCTTGTATTTTTGGCTGTTTTTAGTTTTCAATCGACTCTTCGTCCAACCATAATCAGCATTGGGATACTCAGTTTGGC
TATCTGGATGCATAATGGGGTAGCACTTTTAGCAGGAACCTGGATCGCTAGCTATTGTGCATTAGGCTATTGGCGCGATC
CTGCCCAACGTAGGCATTATTGGGCTTGGTTTTTAAACTTAATAGGAATCAGCATTTTTGGGTTGTTGGCAATTTATATT
GATCTTTTTATGACAACAGGTACAACCCAACAACAGGTATTGGGCTTGACTGAATATCTGCCAGCAGTAATCAATGGTTT
ATCTGCAAGCTTTGCGCCAATTGGAATTATGTTTGTAGCTATTTTCGGATTATTACCATTTCTCCAATTAGAAAAAAACA
AAAAAATCTTGCTTATTGCTAGTGGATTAACATTTCTATTGTTTTTGGCCATTGATATCGTGTTTGGTGTACAGGTACGT
TATAGCTATTTTATTCTGCCATTCCTATTGATGATTGGAATAATATTTATCGATCAGCGATTAAGCATCATTCCATATGT
CGAATCTGTGATTATAACGCTAACACTGCTTTGTTATGGCTATAGTTTGTATAGTTGGTACGATGCAATTATCTATGGCG
TAAAGCCTAGTTTGCTTGGGCTAACCCACTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TACTAACCTTTTGCTAGCATACGATTAATCAATCAAGTAATCGAGATCATACGGTACAATTTACTCTGTTTGCTTGGTTA
TTGGTGACAGAGGTTGGTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCTGCTAAGCTTCGATCAAGCGAGCTATGCTACAATAGCAGCTTAGGACAATCTGCTAGGGCTGATATATTATGCGAATC
TGGGCTATTGCCGACTTGCA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 623; Mature: 623

Protein sequence:

>623_residues
MQFKRFVWVSLGLAGLSLMLLVGNTLSLRLFGQIQQIDVGNWGDQNNVAGGFEQEQNALGETYRWTQAEATIRLQGYGSA
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GWLRSLIQNQIKHLLKPYEYRYLIIFSVISFFIPVMSILFPNFGSHDRVIHADRLGQVAQGSALLLDKLYEFQGRETITP
TTFYLLALPLTVFFNNNGLIIEGLYTFLHASSGILLAITLLRWKVRPILALAAMILISAMPIQMTILWWGFAPQIVGQWL
ILVFLAVFSFQSTLRPTIISIGILSLAIWMHNGVALLAGTWIASYCALGYWRDPAQRRHYWAWFLNLIGISIFGLLAIYI
DLFMTTGTTQQQVLGLTEYLPAVINGLSASFAPIGIMFVAIFGLLPFLQLEKNKKILLIASGLTFLLFLAIDIVFGVQVR
YSYFILPFLLMIGIIFIDQRLSIIPYVESVIITLTLLCYGYSLYSWYDAIIYGVKPSLLGLTH

Sequences:

>Translated_623_residues
MQFKRFVWVSLGLAGLSLMLLVGNTLSLRLFGQIQQIDVGNWGDQNNVAGGFEQEQNALGETYRWTQAEATIRLQGYGSA
SSRLLSLKIGGVPSSLPVTATMQVSTNSASVALPLTQTARHYHLLIPPTYQPDWQVRLNIPTQQVLPDPRFLGVRLDHVQ
IQTPSIAWSSVHWHLLIVQLAIMSSLIGVLWFLAADWPTIVGISGITILVLVTITGKFVLVAWAWQLRLLIVAAATTLLV
GWLRSLIQNQIKHLLKPYEYRYLIIFSVISFFIPVMSILFPNFGSHDRVIHADRLGQVAQGSALLLDKLYEFQGRETITP
TTFYLLALPLTVFFNNNGLIIEGLYTFLHASSGILLAITLLRWKVRPILALAAMILISAMPIQMTILWWGFAPQIVGQWL
ILVFLAVFSFQSTLRPTIISIGILSLAIWMHNGVALLAGTWIASYCALGYWRDPAQRRHYWAWFLNLIGISIFGLLAIYI
DLFMTTGTTQQQVLGLTEYLPAVINGLSASFAPIGIMFVAIFGLLPFLQLEKNKKILLIASGLTFLLFLAIDIVFGVQVR
YSYFILPFLLMIGIIFIDQRLSIIPYVESVIITLTLLCYGYSLYSWYDAIIYGVKPSLLGLTH
>Mature_623_residues
MQFKRFVWVSLGLAGLSLMLLVGNTLSLRLFGQIQQIDVGNWGDQNNVAGGFEQEQNALGETYRWTQAEATIRLQGYGSA
SSRLLSLKIGGVPSSLPVTATMQVSTNSASVALPLTQTARHYHLLIPPTYQPDWQVRLNIPTQQVLPDPRFLGVRLDHVQ
IQTPSIAWSSVHWHLLIVQLAIMSSLIGVLWFLAADWPTIVGISGITILVLVTITGKFVLVAWAWQLRLLIVAAATTLLV
GWLRSLIQNQIKHLLKPYEYRYLIIFSVISFFIPVMSILFPNFGSHDRVIHADRLGQVAQGSALLLDKLYEFQGRETITP
TTFYLLALPLTVFFNNNGLIIEGLYTFLHASSGILLAITLLRWKVRPILALAAMILISAMPIQMTILWWGFAPQIVGQWL
ILVFLAVFSFQSTLRPTIISIGILSLAIWMHNGVALLAGTWIASYCALGYWRDPAQRRHYWAWFLNLIGISIFGLLAIYI
DLFMTTGTTQQQVLGLTEYLPAVINGLSASFAPIGIMFVAIFGLLPFLQLEKNKKILLIASGLTFLLFLAIDIVFGVQVR
YSYFILPFLLMIGIIFIDQRLSIIPYVESVIITLTLLCYGYSLYSWYDAIIYGVKPSLLGLTH

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 69703; Mature: 69703

Theoretical pI: Translated: 9.60; Mature: 9.60

Prosite motif: PS00213 LIPOCALIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQFKRFVWVSLGLAGLSLMLLVGNTLSLRLFGQIQQIDVGNWGDQNNVAGGFEQEQNALG
CCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCC
ETYRWTQAEATIRLQGYGSASSRLLSLKIGGVPSSLPVTATMQVSTNSASVALPLTQTAR
CCCEEEECCEEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCC
HYHLLIPPTYQPDWQVRLNIPTQQVLPDPRFLGVRLDHVQIQTPSIAWSSVHWHLLIVQL
EEEEEECCCCCCCCEEEEECCHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHH
AIMSSLIGVLWFLAADWPTIVGISGITILVLVTITGKFVLVAWAWQLRLLIVAAATTLLV
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCHHHHHHEEHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GWLRSLIQNQIKHLLKPYEYRYLIIFSVISFFIPVMSILFPNFGSHDRVIHADRLGQVAQ
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEHHHCCCHHC
GSALLLDKLYEFQGRETITPTTFYLLALPLTVFFNNNGLIIEGLYTFLHASSGILLAITL
CCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
LRWKVRPILALAAMILISAMPIQMTILWWGFAPQIVGQWLILVFLAVFSFQSTLRPTIIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
IGILSLAIWMHNGVALLAGTWIASYCALGYWRDPAQRRHYWAWFLNLIGISIFGLLAIYI
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DLFMTTGTTQQQVLGLTEYLPAVINGLSASFAPIGIMFVAIFGLLPFLQLEKNKKILLIA
HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEE
SGLTFLLFLAIDIVFGVQVRYSYFILPFLLMIGIIFIDQRLSIIPYVESVIITLTLLCYG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSLYSWYDAIIYGVKPSLLGLTH
HHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MQFKRFVWVSLGLAGLSLMLLVGNTLSLRLFGQIQQIDVGNWGDQNNVAGGFEQEQNALG
CCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCC
ETYRWTQAEATIRLQGYGSASSRLLSLKIGGVPSSLPVTATMQVSTNSASVALPLTQTAR
CCCEEEECCEEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCC
HYHLLIPPTYQPDWQVRLNIPTQQVLPDPRFLGVRLDHVQIQTPSIAWSSVHWHLLIVQL
EEEEEECCCCCCCCEEEEECCHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHH
AIMSSLIGVLWFLAADWPTIVGISGITILVLVTITGKFVLVAWAWQLRLLIVAAATTLLV
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCHHHHHHEEHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GWLRSLIQNQIKHLLKPYEYRYLIIFSVISFFIPVMSILFPNFGSHDRVIHADRLGQVAQ
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GSALLLDKLYEFQGRETITPTTFYLLALPLTVFFNNNGLIIEGLYTFLHASSGILLAITL
CCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
LRWKVRPILALAAMILISAMPIQMTILWWGFAPQIVGQWLILVFLAVFSFQSTLRPTIIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
IGILSLAIWMHNGVALLAGTWIASYCALGYWRDPAQRRHYWAWFLNLIGISIFGLLAIYI
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DLFMTTGTTQQQVLGLTEYLPAVINGLSASFAPIGIMFVAIFGLLPFLQLEKNKKILLIA
HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEE
SGLTFLLFLAIDIVFGVQVRYSYFILPFLLMIGIIFIDQRLSIIPYVESVIITLTLLCYG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSLYSWYDAIIYGVKPSLLGLTH
HHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA