Definition Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome.
Accession NC_009972
Length 6,346,587

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The map label for this gene is 159900860

Identifier: 159900860

GI number: 159900860

Start: 5554541

End: 5556433

Strand: Reverse

Name: 159900860

Synonym: Haur_4347

Alternate gene names: NA

Gene position: 5556433-5554541 (Counterclockwise)

Preceding gene: 159900861

Following gene: 159900859

Centisome position: 87.55

GC content: 52.72

Gene sequence:

>1893_bases
ATGGTAGTTGATACGATGACGATCTTCAGCCAGCGTCGCCAGTGGTTGACGCTGGTTACGTTATTAATTGGGCTTTTAAT
TGGTTTGGGCTTTGTATCCAATCGCCAATGGCAAGTGCCGCTGAATCTGGGCTTGGAAGAGGGCATCAACAACGATGCTC
CATTTGTGGTTGGCTTTAATGCTGGCGAACAATTGCCCGATCGTTCAGCTCGTTACCGTTGGTCAACCCTGAATGCCCAA
TTGCGCTTTCCGCATGTGCCGCAACGCCACTACTGGCTCGATTTGCCACAACTTACGGGCAACCCAGCCAGCCTCATCAT
GGGAACCAGCCAATTTACCAGTACTGCCGGACGGGTATTGCATGTGTTGTTGCCTGCCGATGCCGCTGGTAAAGTGGCAA
TTACGGTTGCTCAACCAGTGGTGAGTGATGATCCACGCGAGCTCGGGGCGGCGTTTAGTGGTGGGCAATTAAGCAGCAGT
GGTTGGGCTTGGCCTGGGCTCTATCCGACCTTAGCTTGGTTGTTTTTGCTGACGACACTTGGTTTGAGCATAATCTGGCT
TGGTGGTTCGAGCCTTGAAGTTGGCTTGGCAGTTGGCCTAACAGGCTTGGGGATTGTGGCGGCAACTTGGTTTGCGCCAT
TACGGGCAAGCTATGCCGCACCAGCGGTTGCCCAAACAACGCTCTATGGTTTGGCTGCATTGCTGTTGTTGGGCTGGGCC
TTGCCGCCAATCTTGCAGCGCCTAGGCTTAACGATCAGCCGCGATGTCTTGCGTTGGCTGATTTTGGCGACGGTGCTGGT
CTGGTCGCTCAAATTGGGTGGACGCTTGCTGCTCGAGCATATGCCAGGCGATATTGGCTTTCATCGCAACCGAATTCATG
CAACCAACCTTGGCGATTTATTCCGACCATCGCGCCATCGCGGCATCGATTTTCCCTATCCGCCAGTGTTGTATGCCTTG
TTGCAGCCACTGACCTTGACTGGAATTTCAGCCGATTGGTTGTTGCAATTAACCGCCGCAGCCTGTGAAGCCCTGGCGAT
TCCGGTGCTATTTTGTTTGGGCTTGCGCACAACTGGCTCAAGCCGTGGAGCGCTGGTTGGCGCGATTATGTATGGGCTTG
TGCCAGCAGGCTTTATGACCAACGCATGGTCGTTTGATTCGCACATTTTTAGCCAATTTGTGGCCTTGCTACTGGCAACA
TTTATGGTTTGGACGTGGCAACACTGGCATGAACGACGTAACTGGCTTTGGATAACTTTGGGTTTGAGCACGATTGCGCT
CGGACACTTTGGCTTTTATCTTAATACTGGCTTGATGGGCGGCTTGCTGATGCTATGGCTGTGGTGGCGCGGCCCACGTT
CGCAAGGCTGGGCCTTATTCACCAGCTTGGTAGCAACCCAAGTGATTGTTTGGGCTTTGTATTACTCAAGTTTTATTGGG
CTATTTTTGCAGCAAGGCCAATCGTTTGCCGAAGGCGGCATGAACGCAGTCAATCAGCGCGAAGCTGTACCACGCCTGCA
ACTCCTGTGGGATATGATTGATCTTGGGTTTTGGCGGCATTATGGTTTACTGCCTGTCTTAATCGCGCCATTTGGTTGGT
GGCTCAGTCGCAAACATCGCGGCTTGCAATTGGTCATGGGGGCGACGTTCGTCGTTAGTTTGATCTTGGCGGCCTTTCCA
ATTATCAATGGATCGACCATCACCACCCGTTGGCTAATGTTTAGCGCTTGGGCGATTGCCTTGGCCACTGGCATTGCCCT
CGATTGGTTGTGGCAACGCACGCGTTGGGGTCGCTGGCCTGCGATTCTGATTACTAGTGGTTGTGCGATTTTTGGCATGA
TCGTCTGGTTTGCTGCGATGGTCTATAAAATTCGCCCACCGGAACCGTTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CCTTGCCAATGTTGGCTGAACAAGCCTTTGGCGATGGAGCGGTTTACCATAACCCTGTTGCGCCAACTGTTGATGATTTA
CTGGGGATTTTGCAAGCAGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCAGGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAGGTCAAAGGTCAAAAAGAGCATAAGGAAATTTATGGGGCTGAAGCATGAATTATGA
ATGTATTTGTGAAATTCGTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 630; Mature: 630

Protein sequence:

>630_residues
MVVDTMTIFSQRRQWLTLVTLLIGLLIGLGFVSNRQWQVPLNLGLEEGINNDAPFVVGFNAGEQLPDRSARYRWSTLNAQ
LRFPHVPQRHYWLDLPQLTGNPASLIMGTSQFTSTAGRVLHVLLPADAAGKVAITVAQPVVSDDPRELGAAFSGGQLSSS
GWAWPGLYPTLAWLFLLTTLGLSIIWLGGSSLEVGLAVGLTGLGIVAATWFAPLRASYAAPAVAQTTLYGLAALLLLGWA
LPPILQRLGLTISRDVLRWLILATVLVWSLKLGGRLLLEHMPGDIGFHRNRIHATNLGDLFRPSRHRGIDFPYPPVLYAL
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FMVWTWQHWHERRNWLWITLGLSTIALGHFGFYLNTGLMGGLLMLWLWWRGPRSQGWALFTSLVATQVIVWALYYSSFIG
LFLQQGQSFAEGGMNAVNQREAVPRLQLLWDMIDLGFWRHYGLLPVLIAPFGWWLSRKHRGLQLVMGATFVVSLILAAFP
IINGSTITTRWLMFSAWAIALATGIALDWLWQRTRWGRWPAILITSGCAIFGMIVWFAAMVYKIRPPEPF

Sequences:

>Translated_630_residues
MVVDTMTIFSQRRQWLTLVTLLIGLLIGLGFVSNRQWQVPLNLGLEEGINNDAPFVVGFNAGEQLPDRSARYRWSTLNAQ
LRFPHVPQRHYWLDLPQLTGNPASLIMGTSQFTSTAGRVLHVLLPADAAGKVAITVAQPVVSDDPRELGAAFSGGQLSSS
GWAWPGLYPTLAWLFLLTTLGLSIIWLGGSSLEVGLAVGLTGLGIVAATWFAPLRASYAAPAVAQTTLYGLAALLLLGWA
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FMVWTWQHWHERRNWLWITLGLSTIALGHFGFYLNTGLMGGLLMLWLWWRGPRSQGWALFTSLVATQVIVWALYYSSFIG
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IINGSTITTRWLMFSAWAIALATGIALDWLWQRTRWGRWPAILITSGCAIFGMIVWFAAMVYKIRPPEPF
>Mature_630_residues
MVVDTMTIFSQRRQWLTLVTLLIGLLIGLGFVSNRQWQVPLNLGLEEGINNDAPFVVGFNAGEQLPDRSARYRWSTLNAQ
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GWAWPGLYPTLAWLFLLTTLGLSIIWLGGSSLEVGLAVGLTGLGIVAATWFAPLRASYAAPAVAQTTLYGLAALLLLGWA
LPPILQRLGLTISRDVLRWLILATVLVWSLKLGGRLLLEHMPGDIGFHRNRIHATNLGDLFRPSRHRGIDFPYPPVLYAL
LQPLTLTGISADWLLQLTAAACEALAIPVLFCLGLRTTGSSRGALVGAIMYGLVPAGFMTNAWSFDSHIFSQFVALLLAT
FMVWTWQHWHERRNWLWITLGLSTIALGHFGFYLNTGLMGGLLMLWLWWRGPRSQGWALFTSLVATQVIVWALYYSSFIG
LFLQQGQSFAEGGMNAVNQREAVPRLQLLWDMIDLGFWRHYGLLPVLIAPFGWWLSRKHRGLQLVMGATFVVSLILAAFP
IINGSTITTRWLMFSAWAIALATGIALDWLWQRTRWGRWPAILITSGCAIFGMIVWFAAMVYKIRPPEPF

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 69861; Mature: 69861

Theoretical pI: Translated: 10.29; Mature: 10.29

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVVDTMTIFSQRRQWLTLVTLLIGLLIGLGFVSNRQWQVPLNLGLEEGINNDAPFVVGFN
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHCCCCCCCCEEEEEC
AGEQLPDRSARYRWSTLNAQLRFPHVPQRHYWLDLPQLTGNPASLIMGTSQFTSTAGRVL
CCCCCCCCCCCEEEEECCCEEECCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHEEEECHHHHHHHHHEE
HVLLPADAAGKVAITVAQPVVSDDPRELGAAFSGGQLSSSGWAWPGLYPTLAWLFLLTTL
EEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
GLSIIWLGGSSLEVGLAVGLTGLGIVAATWFAPLRASYAAPAVAQTTLYGLAALLLLGWA
CCEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LPPILQRLGLTISRDVLRWLILATVLVWSLKLGGRLLLEHMPGDIGFHRNRIHATNLGDL
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCHHH
FRPSRHRGIDFPYPPVLYALLQPLTLTGISADWLLQLTAAACEALAIPVLFCLGLRTTGS
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
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CCCHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE
GLSTIALGHFGFYLNTGLMGGLLMLWLWWRGPRSQGWALFTSLVATQVIVWALYYSSFIG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFLQQGQSFAEGGMNAVNQREAVPRLQLLWDMIDLGFWRHYGLLPVLIAPFGWWLSRKHR
HHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
GLQLVMGATFVVSLILAAFPIINGSTITTRWLMFSAWAIALATGIALDWLWQRTRWGRWP
CEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
AILITSGCAIFGMIVWFAAMVYKIRPPEPF
EEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
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CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHCCCCCCCCEEEEEC
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CCCCCCCCCCCEEEEECCCEEECCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHEEEECHHHHHHHHHEE
HVLLPADAAGKVAITVAQPVVSDDPRELGAAFSGGQLSSSGWAWPGLYPTLAWLFLLTTL
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CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
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GLSTIALGHFGFYLNTGLMGGLLMLWLWWRGPRSQGWALFTSLVATQVIVWALYYSSFIG
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GLQLVMGATFVVSLILAAFPIINGSTITTRWLMFSAWAIALATGIALDWLWQRTRWGRWP
CEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
AILITSGCAIFGMIVWFAAMVYKIRPPEPF
EEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA