| Definition | Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009972 |
| Length | 6,346,587 |
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The map label for this gene is 159900860
Identifier: 159900860
GI number: 159900860
Start: 5554541
End: 5556433
Strand: Reverse
Name: 159900860
Synonym: Haur_4347
Alternate gene names: NA
Gene position: 5556433-5554541 (Counterclockwise)
Preceding gene: 159900861
Following gene: 159900859
Centisome position: 87.55
GC content: 52.72
Gene sequence:
>1893_bases ATGGTAGTTGATACGATGACGATCTTCAGCCAGCGTCGCCAGTGGTTGACGCTGGTTACGTTATTAATTGGGCTTTTAAT TGGTTTGGGCTTTGTATCCAATCGCCAATGGCAAGTGCCGCTGAATCTGGGCTTGGAAGAGGGCATCAACAACGATGCTC CATTTGTGGTTGGCTTTAATGCTGGCGAACAATTGCCCGATCGTTCAGCTCGTTACCGTTGGTCAACCCTGAATGCCCAA TTGCGCTTTCCGCATGTGCCGCAACGCCACTACTGGCTCGATTTGCCACAACTTACGGGCAACCCAGCCAGCCTCATCAT GGGAACCAGCCAATTTACCAGTACTGCCGGACGGGTATTGCATGTGTTGTTGCCTGCCGATGCCGCTGGTAAAGTGGCAA TTACGGTTGCTCAACCAGTGGTGAGTGATGATCCACGCGAGCTCGGGGCGGCGTTTAGTGGTGGGCAATTAAGCAGCAGT GGTTGGGCTTGGCCTGGGCTCTATCCGACCTTAGCTTGGTTGTTTTTGCTGACGACACTTGGTTTGAGCATAATCTGGCT TGGTGGTTCGAGCCTTGAAGTTGGCTTGGCAGTTGGCCTAACAGGCTTGGGGATTGTGGCGGCAACTTGGTTTGCGCCAT TACGGGCAAGCTATGCCGCACCAGCGGTTGCCCAAACAACGCTCTATGGTTTGGCTGCATTGCTGTTGTTGGGCTGGGCC TTGCCGCCAATCTTGCAGCGCCTAGGCTTAACGATCAGCCGCGATGTCTTGCGTTGGCTGATTTTGGCGACGGTGCTGGT CTGGTCGCTCAAATTGGGTGGACGCTTGCTGCTCGAGCATATGCCAGGCGATATTGGCTTTCATCGCAACCGAATTCATG CAACCAACCTTGGCGATTTATTCCGACCATCGCGCCATCGCGGCATCGATTTTCCCTATCCGCCAGTGTTGTATGCCTTG TTGCAGCCACTGACCTTGACTGGAATTTCAGCCGATTGGTTGTTGCAATTAACCGCCGCAGCCTGTGAAGCCCTGGCGAT TCCGGTGCTATTTTGTTTGGGCTTGCGCACAACTGGCTCAAGCCGTGGAGCGCTGGTTGGCGCGATTATGTATGGGCTTG TGCCAGCAGGCTTTATGACCAACGCATGGTCGTTTGATTCGCACATTTTTAGCCAATTTGTGGCCTTGCTACTGGCAACA TTTATGGTTTGGACGTGGCAACACTGGCATGAACGACGTAACTGGCTTTGGATAACTTTGGGTTTGAGCACGATTGCGCT CGGACACTTTGGCTTTTATCTTAATACTGGCTTGATGGGCGGCTTGCTGATGCTATGGCTGTGGTGGCGCGGCCCACGTT CGCAAGGCTGGGCCTTATTCACCAGCTTGGTAGCAACCCAAGTGATTGTTTGGGCTTTGTATTACTCAAGTTTTATTGGG CTATTTTTGCAGCAAGGCCAATCGTTTGCCGAAGGCGGCATGAACGCAGTCAATCAGCGCGAAGCTGTACCACGCCTGCA ACTCCTGTGGGATATGATTGATCTTGGGTTTTGGCGGCATTATGGTTTACTGCCTGTCTTAATCGCGCCATTTGGTTGGT GGCTCAGTCGCAAACATCGCGGCTTGCAATTGGTCATGGGGGCGACGTTCGTCGTTAGTTTGATCTTGGCGGCCTTTCCA ATTATCAATGGATCGACCATCACCACCCGTTGGCTAATGTTTAGCGCTTGGGCGATTGCCTTGGCCACTGGCATTGCCCT CGATTGGTTGTGGCAACGCACGCGTTGGGGTCGCTGGCCTGCGATTCTGATTACTAGTGGTTGTGCGATTTTTGGCATGA TCGTCTGGTTTGCTGCGATGGTCTATAAAATTCGCCCACCGGAACCGTTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CCTTGCCAATGTTGGCTGAACAAGCCTTTGGCGATGGAGCGGTTTACCATAACCCTGTTGCGCCAACTGTTGATGATTTA CTGGGGATTTTGCAAGCAGC
Downstream 100 bases:
>100_bases GCAGGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAGGTCAAAGGTCAAAAAGAGCATAAGGAAATTTATGGGGCTGAAGCATGAATTATGA ATGTATTTGTGAAATTCGTG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 630; Mature: 630
Protein sequence:
>630_residues MVVDTMTIFSQRRQWLTLVTLLIGLLIGLGFVSNRQWQVPLNLGLEEGINNDAPFVVGFNAGEQLPDRSARYRWSTLNAQ LRFPHVPQRHYWLDLPQLTGNPASLIMGTSQFTSTAGRVLHVLLPADAAGKVAITVAQPVVSDDPRELGAAFSGGQLSSS GWAWPGLYPTLAWLFLLTTLGLSIIWLGGSSLEVGLAVGLTGLGIVAATWFAPLRASYAAPAVAQTTLYGLAALLLLGWA LPPILQRLGLTISRDVLRWLILATVLVWSLKLGGRLLLEHMPGDIGFHRNRIHATNLGDLFRPSRHRGIDFPYPPVLYAL LQPLTLTGISADWLLQLTAAACEALAIPVLFCLGLRTTGSSRGALVGAIMYGLVPAGFMTNAWSFDSHIFSQFVALLLAT FMVWTWQHWHERRNWLWITLGLSTIALGHFGFYLNTGLMGGLLMLWLWWRGPRSQGWALFTSLVATQVIVWALYYSSFIG LFLQQGQSFAEGGMNAVNQREAVPRLQLLWDMIDLGFWRHYGLLPVLIAPFGWWLSRKHRGLQLVMGATFVVSLILAAFP IINGSTITTRWLMFSAWAIALATGIALDWLWQRTRWGRWPAILITSGCAIFGMIVWFAAMVYKIRPPEPF
Sequences:
>Translated_630_residues MVVDTMTIFSQRRQWLTLVTLLIGLLIGLGFVSNRQWQVPLNLGLEEGINNDAPFVVGFNAGEQLPDRSARYRWSTLNAQ LRFPHVPQRHYWLDLPQLTGNPASLIMGTSQFTSTAGRVLHVLLPADAAGKVAITVAQPVVSDDPRELGAAFSGGQLSSS GWAWPGLYPTLAWLFLLTTLGLSIIWLGGSSLEVGLAVGLTGLGIVAATWFAPLRASYAAPAVAQTTLYGLAALLLLGWA LPPILQRLGLTISRDVLRWLILATVLVWSLKLGGRLLLEHMPGDIGFHRNRIHATNLGDLFRPSRHRGIDFPYPPVLYAL LQPLTLTGISADWLLQLTAAACEALAIPVLFCLGLRTTGSSRGALVGAIMYGLVPAGFMTNAWSFDSHIFSQFVALLLAT FMVWTWQHWHERRNWLWITLGLSTIALGHFGFYLNTGLMGGLLMLWLWWRGPRSQGWALFTSLVATQVIVWALYYSSFIG LFLQQGQSFAEGGMNAVNQREAVPRLQLLWDMIDLGFWRHYGLLPVLIAPFGWWLSRKHRGLQLVMGATFVVSLILAAFP IINGSTITTRWLMFSAWAIALATGIALDWLWQRTRWGRWPAILITSGCAIFGMIVWFAAMVYKIRPPEPF >Mature_630_residues MVVDTMTIFSQRRQWLTLVTLLIGLLIGLGFVSNRQWQVPLNLGLEEGINNDAPFVVGFNAGEQLPDRSARYRWSTLNAQ LRFPHVPQRHYWLDLPQLTGNPASLIMGTSQFTSTAGRVLHVLLPADAAGKVAITVAQPVVSDDPRELGAAFSGGQLSSS GWAWPGLYPTLAWLFLLTTLGLSIIWLGGSSLEVGLAVGLTGLGIVAATWFAPLRASYAAPAVAQTTLYGLAALLLLGWA LPPILQRLGLTISRDVLRWLILATVLVWSLKLGGRLLLEHMPGDIGFHRNRIHATNLGDLFRPSRHRGIDFPYPPVLYAL LQPLTLTGISADWLLQLTAAACEALAIPVLFCLGLRTTGSSRGALVGAIMYGLVPAGFMTNAWSFDSHIFSQFVALLLAT FMVWTWQHWHERRNWLWITLGLSTIALGHFGFYLNTGLMGGLLMLWLWWRGPRSQGWALFTSLVATQVIVWALYYSSFIG LFLQQGQSFAEGGMNAVNQREAVPRLQLLWDMIDLGFWRHYGLLPVLIAPFGWWLSRKHRGLQLVMGATFVVSLILAAFP IINGSTITTRWLMFSAWAIALATGIALDWLWQRTRWGRWPAILITSGCAIFGMIVWFAAMVYKIRPPEPF
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 69861; Mature: 69861
Theoretical pI: Translated: 10.29; Mature: 10.29
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.4 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.4 %Met (Mature Protein) 2.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MVVDTMTIFSQRRQWLTLVTLLIGLLIGLGFVSNRQWQVPLNLGLEEGINNDAPFVVGFN CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHCCCCCCCCEEEEEC AGEQLPDRSARYRWSTLNAQLRFPHVPQRHYWLDLPQLTGNPASLIMGTSQFTSTAGRVL CCCCCCCCCCCEEEEECCCEEECCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHEEEECHHHHHHHHHEE HVLLPADAAGKVAITVAQPVVSDDPRELGAAFSGGQLSSSGWAWPGLYPTLAWLFLLTTL EEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH GLSIIWLGGSSLEVGLAVGLTGLGIVAATWFAPLRASYAAPAVAQTTLYGLAALLLLGWA CCEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LPPILQRLGLTISRDVLRWLILATVLVWSLKLGGRLLLEHMPGDIGFHRNRIHATNLGDL HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCHHH FRPSRHRGIDFPYPPVLYALLQPLTLTGISADWLLQLTAAACEALAIPVLFCLGLRTTGS CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC SRGALVGAIMYGLVPAGFMTNAWSFDSHIFSQFVALLLATFMVWTWQHWHERRNWLWITL CCCHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE GLSTIALGHFGFYLNTGLMGGLLMLWLWWRGPRSQGWALFTSLVATQVIVWALYYSSFIG CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFLQQGQSFAEGGMNAVNQREAVPRLQLLWDMIDLGFWRHYGLLPVLIAPFGWWLSRKHR HHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC GLQLVMGATFVVSLILAAFPIINGSTITTRWLMFSAWAIALATGIALDWLWQRTRWGRWP CEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC AILITSGCAIFGMIVWFAAMVYKIRPPEPF EEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MVVDTMTIFSQRRQWLTLVTLLIGLLIGLGFVSNRQWQVPLNLGLEEGINNDAPFVVGFN CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHCCCCCCCCEEEEEC AGEQLPDRSARYRWSTLNAQLRFPHVPQRHYWLDLPQLTGNPASLIMGTSQFTSTAGRVL CCCCCCCCCCCEEEEECCCEEECCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHEEEECHHHHHHHHHEE HVLLPADAAGKVAITVAQPVVSDDPRELGAAFSGGQLSSSGWAWPGLYPTLAWLFLLTTL EEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH GLSIIWLGGSSLEVGLAVGLTGLGIVAATWFAPLRASYAAPAVAQTTLYGLAALLLLGWA CCEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LPPILQRLGLTISRDVLRWLILATVLVWSLKLGGRLLLEHMPGDIGFHRNRIHATNLGDL HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCHHH FRPSRHRGIDFPYPPVLYALLQPLTLTGISADWLLQLTAAACEALAIPVLFCLGLRTTGS CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC SRGALVGAIMYGLVPAGFMTNAWSFDSHIFSQFVALLLATFMVWTWQHWHERRNWLWITL CCCHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE GLSTIALGHFGFYLNTGLMGGLLMLWLWWRGPRSQGWALFTSLVATQVIVWALYYSSFIG CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFLQQGQSFAEGGMNAVNQREAVPRLQLLWDMIDLGFWRHYGLLPVLIAPFGWWLSRKHR HHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC GLQLVMGATFVVSLILAAFPIINGSTITTRWLMFSAWAIALATGIALDWLWQRTRWGRWP CEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC AILITSGCAIFGMIVWFAAMVYKIRPPEPF EEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA