Definition Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome.
Accession NC_009972
Length 6,346,587

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The map label for this gene is 159898704

Identifier: 159898704

GI number: 159898704

Start: 2766314

End: 2769559

Strand: Reverse

Name: 159898704

Synonym: Haur_2183

Alternate gene names: NA

Gene position: 2769559-2766314 (Counterclockwise)

Preceding gene: 159898712

Following gene: 159898703

Centisome position: 43.64

GC content: 47.69

Gene sequence:

>3246_bases
ATGAGGTATCACTTTATGCAACGTCGCGTTCCGATCAATCCACATTTGCTGACTGCCTTGATTCTGGTGATTGCATTTCA
TGGAATCTTGCTGGTATCGGGCAATTTCAAACGCACTTACGATGCCTATGTGCATATTTTCTTTGCCGATCATTATCGAC
GAACATGGTTTGATCATTGGGATTATCGCTGGTATACGGGCTTTCCGCTGATTAGTTATCCACCAGGCTCCCAACAATCG
ATAGGGTTGCTGGGGATGGTGATTGGTTTATTGCCAGCGTTTGTGGTAGTCCAATTGGCTGCGCTGCTTAATTTAACCCT
TGGAATGTATCGATTTGCCAAGCTTTGGGTTTCTGAGGAAGCGGCAGGTTATGCCGCTCTGCTCATTGTGTTCAGTTCGA
GCATCTGCGAAACCGTGCATGTATTTGGGCAGCTCCCAACAACTTTTTCTTTAGGGTTTTTGTTGAATACCCTGCCATTT
GTCAAACGCTGGCTGAGTGAAGGTGATTGGCGTGATCTGATCAGAGCATGGTTATTACATGCAGCAACCACCGCTGGACA
TCATGTAACAACCTTATTTGGAGCGGTCTTTTTTGCCGGGCCAGTGATTCTTTTAGCCTTGGTTGAAGCATTTCGACAAG
CAAAAGCTGATGAGGATACGCTGCATCCTGCTCGCATTACACGTTCAAATATTCGCCCATTAATCGTTCGACGCTTACGC
CGAATTGCACCACCATTGATTCGCACCGCGATCTATGGACCAGGTTTAATTGCTGCCTTGGTCTTGGTTGTCTTACCATA
TTGGCTTTGGAGTAGCAGTGACCCGATCAGCCAAGTGCCAATTCCTCACGCATCACGTGATTCGTTTATTGAGAACCCAA
ATGCGGGGATTGTTTTTTGGTTATTGCCTTATGGCTCGACCTTGTTGGTCTTGCCTTATCTTTTTTATAAAGGTTTTTTT
AGTCGGGCATGGCCCATGGCGCTCTCGATCAGTGCCTTGTTTTTACTAGGAACTGGCGGTACTACGCCTATTCCTAAGGC
TCTTTTAGGCGGCGCATTTGATATTTTAACCCTTGATCGGTTTACCTTTTGGGCCACAATTTTATTTACGCCCTTGCTTG
GTGAATTTGTGGTGAGCATGCGTCATGGTAATCTTGCCCGCTATCTGCGCGACCAATTTGGCAACAAGATGTGGCGCATA
ACCCAAGTCTGTTGTGTGCTGATCTATGTTGGGGTTGCCGTATTTACCTCAAACTTTACCCAATTTCGCCGCTTTCAGCC
TGATGCGATTGATCCGGTGCCATTGGTTGCCTTTATCGAAAAAGATGAACACTGGCGCTGGCGCTATTTGATGCTTGGCT
TTGGCGATCAGATGGCGTGGGTTTCGGCTCAAACGACGGCTACCACAGTTGATGGCAATTATCATTCAGCTCGTCGCTTA
CCAGAATTAACTACAACCCCAGTTGAGCGGCTTGAGGGAGCTAAATTCCGTGGGATTCCCGGGATTGGTTCGTTACAGCA
ATTTTTGGCAGTTCCCGATAAATACAACCTCAAATATGTATTTTCCAATGATCAATTTTACGATCCGCTACTCTATTTTT
CAGGTTGGCATCGGATTCAACGCCTAGAAAACGGGTTGGTGGTTTGGGAACGTGAGGATATTCCGCCACTACCTGAGATC
TTGCCTCGGCGGGAAATTCCCTGGTTTCAACGGATTATCTGGGGGGTAGTGCCACCTACAGCCCTAGGCTTGGGAATTTT
GGCCTTGAGTGCGGGGCTATGGGGGCCACGCCTGCGACGAATGCTTCGGCCATTGTTGCCGCATCGTATTCCGATCATTC
CCTATGAACGTTGGTGGTATACGTTTGATCAATTGCTTAAACGTTGGTCAGTTGTGCCAGCTACTAATGATCAACGCCGA
ACGCGTTGGCAAATTTGGCGCACGCTCTGGCAAAAGCTGCCAAAGCTTAAGCCTGCTCCGCCATCGGCGCATGCAGTCCG
AAATGGATTATTAGGCTTGATTCTGCTTGCAAGTATTTTTACCGGCTGGCGACATTATGCCCAAGTGCAACAAAGCCCCG
AAGCTGTGGTCTTGGCATATTACGATGATCTCGATTTCCGACGGTTTTCAGCAGCCTATGCCCGCCTTGATCCGCAAACA
CGCCCGACATATGATCAATATCTACTTGAACTTTCAGTTCAAGGGGGCTTAGTGGCTTCGTATGGCAAATTAGATTCGGT
CATTGTTAACGATTTGGGGGGTGATCAAACAACGCGGATCGTCGATGTGGAGACACGTTGGGTTACAGCGCTTAACGAAT
ACCCAACCCGAGAACGGCTGATCTTGGTTAAACGTGATAGTCAATGGTATATCCCGACTGCCAAGGTAGATGTACGGGTT
CCGCCTGATACATTTATTCGACAAGCTGCGATTGATTGGTTTGCGGCTGGACGACGACGAGTCACCACGACGATAACCTC
ATTTGCTGATGTCCAAGATCGGCCTAAACTTTCTGTCCTTTCATCGCGATTGGTCTCCTATCGAGGGCGTACTAGTATTG
TTGGCGAAGTGTTGAATCTCGATGTTGATCCCGCTGATCTTACCGTGACTGGAATCCTCTTTGATGAGAATGATCGAGAA
CTGACCCGCTATAATGCCCAATCGGTGATCAATCATAAGATTTTACCGAAAGAAGTAACTCCCTTTCGAATTGACTTTGA
AGGAGTAGCTGGGGCGGTGCTGAGCGATACATTAACCGCTGGCGAATTCAACCCCAATGCATTCTCACCAGTATCCTTCC
CCTCACCAATTGACCATTTTATCGTCTATGCCAAAGCAGTTGTGACCAATCGCGATCTTAATCGGGGGTTGGCAGTGCAA
GATGTTGTTGTACATGCGCATGCAGAACCGCAGCAGATTGAGTTGACTGCGATCAATAATGGTACGGAAGAAGCTACTAT
TCCGCATATTTTGCTAACCTATTACGATGCAAATGGTGACGTGGCTTGGGTTGATCACGCTTTTGTGGCAAGCTCGATTC
GTCCACAACGCTCAACAGTGGTAAGTATTCCCATTATTCCTGCATCAGCAATTCAGATCATTAAAACTGATGGCGATACG
GTGGTCAACGCCTTGGTCGAGGCAGGGATTCCTGATGCTGAGCCGAGCTATTTCCTGACTCTTCCCGCAACGACGGGCTA
TTCTGCGGTTCGCATCAGTATTCATGGCTATTTTGCGGAGAATTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCACTTTTGACGAGTGCTATGATGCTTCGTAGGATGTCATCATTGTGTCAGGATTAATTGCTGTTTTTAAACCTTGACAT
CAGTATGCTTGTAGGAATCG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCATGCGTTGGATGCTACTCCTGCTTAGCGCTTGCTGGTTAATCGCCTGTCAATCGCAACAATCGCTTCCATCGGCTCCA
ACTCGGATCACGATTGGCGT

Product: putative transmembrane protein

Products: NA

Alternate protein names: Integral Membrane Protein

Number of amino acids: Translated: 1081; Mature: 1081

Protein sequence:

>1081_residues
MRYHFMQRRVPINPHLLTALILVIAFHGILLVSGNFKRTYDAYVHIFFADHYRRTWFDHWDYRWYTGFPLISYPPGSQQS
IGLLGMVIGLLPAFVVVQLAALLNLTLGMYRFAKLWVSEEAAGYAALLIVFSSSICETVHVFGQLPTTFSLGFLLNTLPF
VKRWLSEGDWRDLIRAWLLHAATTAGHHVTTLFGAVFFAGPVILLALVEAFRQAKADEDTLHPARITRSNIRPLIVRRLR
RIAPPLIRTAIYGPGLIAALVLVVLPYWLWSSSDPISQVPIPHASRDSFIENPNAGIVFWLLPYGSTLLVLPYLFYKGFF
SRAWPMALSISALFLLGTGGTTPIPKALLGGAFDILTLDRFTFWATILFTPLLGEFVVSMRHGNLARYLRDQFGNKMWRI
TQVCCVLIYVGVAVFTSNFTQFRRFQPDAIDPVPLVAFIEKDEHWRWRYLMLGFGDQMAWVSAQTTATTVDGNYHSARRL
PELTTTPVERLEGAKFRGIPGIGSLQQFLAVPDKYNLKYVFSNDQFYDPLLYFSGWHRIQRLENGLVVWEREDIPPLPEI
LPRREIPWFQRIIWGVVPPTALGLGILALSAGLWGPRLRRMLRPLLPHRIPIIPYERWWYTFDQLLKRWSVVPATNDQRR
TRWQIWRTLWQKLPKLKPAPPSAHAVRNGLLGLILLASIFTGWRHYAQVQQSPEAVVLAYYDDLDFRRFSAAYARLDPQT
RPTYDQYLLELSVQGGLVASYGKLDSVIVNDLGGDQTTRIVDVETRWVTALNEYPTRERLILVKRDSQWYIPTAKVDVRV
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DVVVHAHAEPQQIELTAINNGTEEATIPHILLTYYDANGDVAWVDHAFVASSIRPQRSTVVSIPIIPASAIQIIKTDGDT
VVNALVEAGIPDAEPSYFLTLPATTGYSAVRISIHGYFAEN

Sequences:

>Translated_1081_residues
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IGLLGMVIGLLPAFVVVQLAALLNLTLGMYRFAKLWVSEEAAGYAALLIVFSSSICETVHVFGQLPTTFSLGFLLNTLPF
VKRWLSEGDWRDLIRAWLLHAATTAGHHVTTLFGAVFFAGPVILLALVEAFRQAKADEDTLHPARITRSNIRPLIVRRLR
RIAPPLIRTAIYGPGLIAALVLVVLPYWLWSSSDPISQVPIPHASRDSFIENPNAGIVFWLLPYGSTLLVLPYLFYKGFF
SRAWPMALSISALFLLGTGGTTPIPKALLGGAFDILTLDRFTFWATILFTPLLGEFVVSMRHGNLARYLRDQFGNKMWRI
TQVCCVLIYVGVAVFTSNFTQFRRFQPDAIDPVPLVAFIEKDEHWRWRYLMLGFGDQMAWVSAQTTATTVDGNYHSARRL
PELTTTPVERLEGAKFRGIPGIGSLQQFLAVPDKYNLKYVFSNDQFYDPLLYFSGWHRIQRLENGLVVWEREDIPPLPEI
LPRREIPWFQRIIWGVVPPTALGLGILALSAGLWGPRLRRMLRPLLPHRIPIIPYERWWYTFDQLLKRWSVVPATNDQRR
TRWQIWRTLWQKLPKLKPAPPSAHAVRNGLLGLILLASIFTGWRHYAQVQQSPEAVVLAYYDDLDFRRFSAAYARLDPQT
RPTYDQYLLELSVQGGLVASYGKLDSVIVNDLGGDQTTRIVDVETRWVTALNEYPTRERLILVKRDSQWYIPTAKVDVRV
PPDTFIRQAAIDWFAAGRRRVTTTITSFADVQDRPKLSVLSSRLVSYRGRTSIVGEVLNLDVDPADLTVTGILFDENDRE
LTRYNAQSVINHKILPKEVTPFRIDFEGVAGAVLSDTLTAGEFNPNAFSPVSFPSPIDHFIVYAKAVVTNRDLNRGLAVQ
DVVVHAHAEPQQIELTAINNGTEEATIPHILLTYYDANGDVAWVDHAFVASSIRPQRSTVVSIPIIPASAIQIIKTDGDT
VVNALVEAGIPDAEPSYFLTLPATTGYSAVRISIHGYFAEN
>Mature_1081_residues
MRYHFMQRRVPINPHLLTALILVIAFHGILLVSGNFKRTYDAYVHIFFADHYRRTWFDHWDYRWYTGFPLISYPPGSQQS
IGLLGMVIGLLPAFVVVQLAALLNLTLGMYRFAKLWVSEEAAGYAALLIVFSSSICETVHVFGQLPTTFSLGFLLNTLPF
VKRWLSEGDWRDLIRAWLLHAATTAGHHVTTLFGAVFFAGPVILLALVEAFRQAKADEDTLHPARITRSNIRPLIVRRLR
RIAPPLIRTAIYGPGLIAALVLVVLPYWLWSSSDPISQVPIPHASRDSFIENPNAGIVFWLLPYGSTLLVLPYLFYKGFF
SRAWPMALSISALFLLGTGGTTPIPKALLGGAFDILTLDRFTFWATILFTPLLGEFVVSMRHGNLARYLRDQFGNKMWRI
TQVCCVLIYVGVAVFTSNFTQFRRFQPDAIDPVPLVAFIEKDEHWRWRYLMLGFGDQMAWVSAQTTATTVDGNYHSARRL
PELTTTPVERLEGAKFRGIPGIGSLQQFLAVPDKYNLKYVFSNDQFYDPLLYFSGWHRIQRLENGLVVWEREDIPPLPEI
LPRREIPWFQRIIWGVVPPTALGLGILALSAGLWGPRLRRMLRPLLPHRIPIIPYERWWYTFDQLLKRWSVVPATNDQRR
TRWQIWRTLWQKLPKLKPAPPSAHAVRNGLLGLILLASIFTGWRHYAQVQQSPEAVVLAYYDDLDFRRFSAAYARLDPQT
RPTYDQYLLELSVQGGLVASYGKLDSVIVNDLGGDQTTRIVDVETRWVTALNEYPTRERLILVKRDSQWYIPTAKVDVRV
PPDTFIRQAAIDWFAAGRRRVTTTITSFADVQDRPKLSVLSSRLVSYRGRTSIVGEVLNLDVDPADLTVTGILFDENDRE
LTRYNAQSVINHKILPKEVTPFRIDFEGVAGAVLSDTLTAGEFNPNAFSPVSFPSPIDHFIVYAKAVVTNRDLNRGLAVQ
DVVVHAHAEPQQIELTAINNGTEEATIPHILLTYYDANGDVAWVDHAFVASSIRPQRSTVVSIPIIPASAIQIIKTDGDT
VVNALVEAGIPDAEPSYFLTLPATTGYSAVRISIHGYFAEN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 122330; Mature: 122330

Theoretical pI: Translated: 9.38; Mature: 9.38

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
0.9 %Met     (Translated Protein)
1.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
0.9 %Met     (Mature Protein)
1.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRYHFMQRRVPINPHLLTALILVIAFHGILLVSGNFKRTYDAYVHIFFADHYRRTWFDHW
CCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCCEEEEEEEEEEEECCHHHHHHCCC
DYRWYTGFPLISYPPGSQQSIGLLGMVIGLLPAFVVVQLAALLNLTLGMYRFAKLWVSEE
CCEEEECCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
AAGYAALLIVFSSSICETVHVFGQLPTTFSLGFLLNTLPFVKRWLSEGDWRDLIRAWLLH
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
AATTAGHHVTTLFGAVFFAGPVILLALVEAFRQAKADEDTLHPARITRSNIRPLIVRRLR
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RIAPPLIRTAIYGPGLIAALVLVVLPYWLWSSSDPISQVPIPHASRDSFIENPNAGIVFW
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FTFWATILFTPLLGEFVVSMRHGNLARYLRDQFGNKMWRITQVCCVLIYVGVAVFTSNFT
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PELTTTPVERLEGAKFRGIPGIGSLQQFLAVPDKYNLKYVFSNDQFYDPLLYFSGWHRIQ
CCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHH
RLENGLVVWEREDIPPLPEILPRREIPWFQRIIWGVVPPTALGLGILALSAGLWGPRLRR
HHHCCEEEEECCCCCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
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RPTYDQYLLELSVQGGLVASYGKLDSVIVNDLGGDQTTRIVDVETRWVTALNEYPTRERL
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CEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHH
DVVVHAHAEPQQIELTAINNGTEEATIPHILLTYYDANGDVAWVDHAFVASSIRPQRSTV
HEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEHHHHHHHCCCCCCCEE
VSIPIIPASAIQIIKTDGDTVVNALVEAGIPDAEPSYFLTLPATTGYSAVRISIHGYFAE
EEEECCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEEEEEEEEC
N
C
>Mature Secondary Structure
MRYHFMQRRVPINPHLLTALILVIAFHGILLVSGNFKRTYDAYVHIFFADHYRRTWFDHW
CCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCCEEEEEEEEEEEECCHHHHHHCCC
DYRWYTGFPLISYPPGSQQSIGLLGMVIGLLPAFVVVQLAALLNLTLGMYRFAKLWVSEE
CCEEEECCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
AAGYAALLIVFSSSICETVHVFGQLPTTFSLGFLLNTLPFVKRWLSEGDWRDLIRAWLLH
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
AATTAGHHVTTLFGAVFFAGPVILLALVEAFRQAKADEDTLHPARITRSNIRPLIVRRLR
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HHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEE
LLPYGSTLLVLPYLFYKGFFSRAWPMALSISALFLLGTGGTTPIPKALLGGAFDILTLDR
ECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHH
FTFWATILFTPLLGEFVVSMRHGNLARYLRDQFGNKMWRITQVCCVLIYVGVAVFTSNFT
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HHHCCEEEEECCCCCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
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HHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
PSAHAVRNGLLGLILLASIFTGWRHYAQVQQSPEAVVLAYYDDLDFRRFSAAYARLDPQT
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCC
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CCCHHHHHHEEECCCCEEEECCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHCCCCCCEE
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EEEEECCCEECCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHCCCCCCHHHHH
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HHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
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CEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHH
DVVVHAHAEPQQIELTAINNGTEEATIPHILLTYYDANGDVAWVDHAFVASSIRPQRSTV
HEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEHHHHHHHCCCCCCCEE
VSIPIIPASAIQIIKTDGDTVVNALVEAGIPDAEPSYFLTLPATTGYSAVRISIHGYFAE
EEEECCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEEEEEEEEC
N
C

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA