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Definition Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome.
Accession NC_009972
Length 6,346,587

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The map label for this gene is kdpE [C]

Identifier: 159897967

GI number: 159897967

Start: 1674028

End: 1676694

Strand: Direct

Name: kdpE [C]

Synonym: Haur_1442

Alternate gene names: 159897967

Gene position: 1674028-1676694 (Clockwise)

Preceding gene: 159897963

Following gene: 159897980

Centisome position: 26.38

GC content: 43.79

Gene sequence:

>2667_bases
ATGGCGAATGCAGGGAAGGTGCATATGACTGTCGATTCAATCATTACGATTGACCAACTTGAGATTAATTTGACTGAGCA
GCGAGTCAAGCGGGCGGGAGTTTATGTGCGGCTTGGGCGCAAAGAGTGGGGTTTGTTAGAACTGTTAGTGCGTAATCGTA
ATCACGTGCTCAGCCATCGCCAGTTGTTGCAGCATGTGTGGGGCGATAATTATGAACGTGATAGTAGCTATTTATTGCAT
GTAGCGATTGGCCGTTTGCGCGAGAAATTGGGCGATAAACCGCCGCGCTATATTGTGGCCGAGGCCGATTTGGGCTATCG
TTTTGCCCTGTCAACGCCAAATTTGCCAAGTGTGCCAACGCCTGAGCCCAGCTCCTTGGTTGTACCATCAATCAGCTATA
CCAATATTCCTGCGCCATTGAATGCCTTTATTGGGCGCGAAAACGAGCAACAACGCTTGTTGCAGCTTCTCCGTCAGCCG
CATATTCGCTTGATTAGCGTTTTGGGGGTTGGTGGGGTTGGCAAAACCCGTTTAGTGCTGCAAAGTGCCATGCAATGGCT
GCCGATCTTTCATCATGGCGTGCATGTTGTGCATTTAGCTGCTTTGCGCGATCCTGAGCTACTAATCCAGACAATTATTC
AATCATTGGCGATTAAAACGACTAGTCAATTACCATTGCTCAAACAGCTCAAAGATTTTCTGTATGATAAACAACTCTTG
CTCATTCTCGATAATTTTGAGCAATTGCTTGATGCTGCGCCGATTGTGACCGATCTCTTAGCCCATGCACCGCAATTAAA
GTTAATGACGACTAGCCGCGAGGCTTTGAATGTGTATGCTGAGCAACAATTTGAATTAATGCCCTTTAGCGTTGATTGTT
CGCAACAGTTGATGCTGCGCCAACAACCAGCAGTTAATCTTTTTCTCAGCCGTGCTCAAGCGCTACAAGCGACTATTGCT
TATAACGATGCTGAATTAGCAACGATTGCTCAAATTTGCCAACGGCTTGATGGTTTAGCCTTGGCAATTGAGCTGGCCGC
CAGCCGAATCAGCTTGTTTTCATTAACAAATTTACTTGAGCGTTTAAGCCAACGCTTGAGTTTTATCAATAGTGGACCAC
GCGATCTACCAGCTCGCCACCAAACCTTGCAAGCAGTCATCGAATGGAGCTATGTTTTACTTACACCTCAAGAACAAGCG
CTATTTGTCCAATTATCAGTGTTTGTCGGCAGCTTTGATCTACCAGCAGCTAGCGCAATTTGTGCGAGGGCTGAACAATC
AGCAGTTGAATTAGTGTTATTAAGCTTGGTGCAAAAACACCTGCTTCAGTATCAGATAACCGAACAACGTTTTTATTTCT
TGGAAACAATCCGTGAATATGCTCAAGATCAATTAAATCAACGAACTGATAGTCGATGCTACTATACAGCGCATACTGAT
TATTATCGAACGTTTGTTCAAAATTATGTGCATGAATTAACTGGCTCAGAGCAACAACACTGGATGAGTCAATTTCAAGC
GAATTATCCCAATATTCGGGCTGCGCTAGCTCAAAGCCTCAAATCTGGGGCGTTTGCGAGTGCTGCTCATTTGGGTGCTG
TGCTCTGGAATTTTTGGCATCGCGCTGATCTCGCCCAAGAAGGTAGTTATTGGATTAAAAAAATTCTCGATCAGCCAGCC
GAATTTGATCCCAAGCATCAGATTATGATGCTACGTGGATTAAGTACTTTCATGCGTAATCAGGGAGATTTTCAATTAGC
CCAGCAGTATCTTGCTCAAGGTTTAAGCATTGCACGCCAAGAACAACTTGATGAATTGGCGATGGGTTTATTGAATGGAA
TCGGTTTGCTCTATAAACGTGAGGGTTTATTTGAACAAGCAGGCCAAGCATTCAGTGAAGCGATTCAACTTGCCCGTACA
TTCGATAAAACCCGCGATATGGCGGCGATTCTCAGCAATCTTGGCGAAATTCGGCGTAGCCTCGAACAATATCAGCAAGC
ACAGCTCGATTTACAAGAATCATTGGGATTAGCACGCAAAGTCAATGATCATCATATGGCTGCAAATATTTTGAATAGTC
TAGGCTTATTGGCCTATGATACCTGCAATTATCAACAAGCACAGCAATACTATCGACAAGGCCTAGAAATTCATCAACAA
TTACAAAATAAACGTGGAATTGCCCTAATTTACACGAATTTAGCCGATAGCTTAACCAAATTACTGCAATTTAGCCAAGC
AAATGAATATTATGATCAAGCATTAATCCATAGTCATACCATTGCTGATCCCTATTTTATCTGTCATATAACGATTCAAA
AAGCCTGGGCTTTGCGCCAACAAGCCCAAATTGCCCAAGCTCAACCATTAATTATTCAAGCATTACACTTGGCCAATCAA
CACAAATTTATCGCTCATAACCTACGAGCAACATTGGAGTTGACCGAATGTTATTTAGCCCAACAACAATTGCCATTAGC
AGCATGGTTGGCAGGGTTTATGTACCAATTGGCCCAAGACCATCAACAGTTGCTCGATGGCAATGATCGGCGCTATCACC
AAACGCGTTTGGCCGAATTGCAAGCAATACTTGCTGAACATAATGAATATTGGCAGCAAGGCTATCAAAGCTCGTTTGAA
CAGCTGTTGGCGGCAATTGTGGTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTGTTGATCACGAATAAACAGGTTTAGCTTAGTCAAGGCTGCTAACATTTCAGCCAACATCGGCTAACATGGTGGCGAA
CATTTTGCGAGGGTCACCCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCTGTGGCCTATGGTGTCGTCCGCAACCGCTGCTCTGAGATTTTTCCAGCTGCTTGGTTGTGGACGACCTACCCACCAAT
TTACTCATAGCGATTTTTCA

Product: transcriptional regulator

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 888; Mature: 887

Protein sequence:

>888_residues
MANAGKVHMTVDSIITIDQLEINLTEQRVKRAGVYVRLGRKEWGLLELLVRNRNHVLSHRQLLQHVWGDNYERDSSYLLH
VAIGRLREKLGDKPPRYIVAEADLGYRFALSTPNLPSVPTPEPSSLVVPSISYTNIPAPLNAFIGRENEQQRLLQLLRQP
HIRLISVLGVGGVGKTRLVLQSAMQWLPIFHHGVHVVHLAALRDPELLIQTIIQSLAIKTTSQLPLLKQLKDFLYDKQLL
LILDNFEQLLDAAPIVTDLLAHAPQLKLMTTSREALNVYAEQQFELMPFSVDCSQQLMLRQQPAVNLFLSRAQALQATIA
YNDAELATIAQICQRLDGLALAIELAASRISLFSLTNLLERLSQRLSFINSGPRDLPARHQTLQAVIEWSYVLLTPQEQA
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YYRTFVQNYVHELTGSEQQHWMSQFQANYPNIRAALAQSLKSGAFASAAHLGAVLWNFWHRADLAQEGSYWIKKILDQPA
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LQNKRGIALIYTNLADSLTKLLQFSQANEYYDQALIHSHTIADPYFICHITIQKAWALRQQAQIAQAQPLIIQALHLANQ
HKFIAHNLRATLELTECYLAQQQLPLAAWLAGFMYQLAQDHQQLLDGNDRRYHQTRLAELQAILAEHNEYWQQGYQSSFE
QLLAAIVV

Sequences:

>Translated_888_residues
MANAGKVHMTVDSIITIDQLEINLTEQRVKRAGVYVRLGRKEWGLLELLVRNRNHVLSHRQLLQHVWGDNYERDSSYLLH
VAIGRLREKLGDKPPRYIVAEADLGYRFALSTPNLPSVPTPEPSSLVVPSISYTNIPAPLNAFIGRENEQQRLLQLLRQP
HIRLISVLGVGGVGKTRLVLQSAMQWLPIFHHGVHVVHLAALRDPELLIQTIIQSLAIKTTSQLPLLKQLKDFLYDKQLL
LILDNFEQLLDAAPIVTDLLAHAPQLKLMTTSREALNVYAEQQFELMPFSVDCSQQLMLRQQPAVNLFLSRAQALQATIA
YNDAELATIAQICQRLDGLALAIELAASRISLFSLTNLLERLSQRLSFINSGPRDLPARHQTLQAVIEWSYVLLTPQEQA
LFVQLSVFVGSFDLPAASAICARAEQSAVELVLLSLVQKHLLQYQITEQRFYFLETIREYAQDQLNQRTDSRCYYTAHTD
YYRTFVQNYVHELTGSEQQHWMSQFQANYPNIRAALAQSLKSGAFASAAHLGAVLWNFWHRADLAQEGSYWIKKILDQPA
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FDKTRDMAAILSNLGEIRRSLEQYQQAQLDLQESLGLARKVNDHHMAANILNSLGLLAYDTCNYQQAQQYYRQGLEIHQQ
LQNKRGIALIYTNLADSLTKLLQFSQANEYYDQALIHSHTIADPYFICHITIQKAWALRQQAQIAQAQPLIIQALHLANQ
HKFIAHNLRATLELTECYLAQQQLPLAAWLAGFMYQLAQDHQQLLDGNDRRYHQTRLAELQAILAEHNEYWQQGYQSSFE
QLLAAIVV
>Mature_887_residues
ANAGKVHMTVDSIITIDQLEINLTEQRVKRAGVYVRLGRKEWGLLELLVRNRNHVLSHRQLLQHVWGDNYERDSSYLLHV
AIGRLREKLGDKPPRYIVAEADLGYRFALSTPNLPSVPTPEPSSLVVPSISYTNIPAPLNAFIGRENEQQRLLQLLRQPH
IRLISVLGVGGVGKTRLVLQSAMQWLPIFHHGVHVVHLAALRDPELLIQTIIQSLAIKTTSQLPLLKQLKDFLYDKQLLL
ILDNFEQLLDAAPIVTDLLAHAPQLKLMTTSREALNVYAEQQFELMPFSVDCSQQLMLRQQPAVNLFLSRAQALQATIAY
NDAELATIAQICQRLDGLALAIELAASRISLFSLTNLLERLSQRLSFINSGPRDLPARHQTLQAVIEWSYVLLTPQEQAL
FVQLSVFVGSFDLPAASAICARAEQSAVELVLLSLVQKHLLQYQITEQRFYFLETIREYAQDQLNQRTDSRCYYTAHTDY
YRTFVQNYVHELTGSEQQHWMSQFQANYPNIRAALAQSLKSGAFASAAHLGAVLWNFWHRADLAQEGSYWIKKILDQPAE
FDPKHQIMMLRGLSTFMRNQGDFQLAQQYLAQGLSIARQEQLDELAMGLLNGIGLLYKREGLFEQAGQAFSEAIQLARTF
DKTRDMAAILSNLGEIRRSLEQYQQAQLDLQESLGLARKVNDHHMAANILNSLGLLAYDTCNYQQAQQYYRQGLEIHQQL
QNKRGIALIYTNLADSLTKLLQFSQANEYYDQALIHSHTIADPYFICHITIQKAWALRQQAQIAQAQPLIIQALHLANQH
KFIAHNLRATLELTECYLAQQQLPLAAWLAGFMYQLAQDHQQLLDGNDRRYHQTRLAELQAILAEHNEYWQQGYQSSFEQ
LLAAIVV

Specific function: Member Of The Two-Component Regulatory System Kdpd/Kdpe Involved In The Regulation Of The Kdp Operon. [C]

COG id: COG3903

COG function: function code R; Predicted ATPase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 HTH luxR-type DNA-binding domain [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000767
- InterPro:   IPR016032
- InterPro:   IPR011990
- InterPro:   IPR000792
- InterPro:   IPR011991 [H]

Pfam domain/function: PF00196 GerE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 101141; Mature: 101010

Theoretical pI: Translated: 7.02; Mature: 7.02

Prosite motif: PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MANAGKVHMTVDSIITIDQLEINLTEQRVKRAGVYVRLGRKEWGLLELLVRNRNHVLSHR
CCCCCEEEEEHHHEEEEEHEEECHHHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHH
QLLQHVWGDNYERDSSYLLHVAIGRLREKLGDKPPRYIVAEADLGYRFALSTPNLPSVPT
HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCC
PEPSSLVVPSISYTNIPAPLNAFIGRENEQQRLLQLLRQPHIRLISVLGVGGVGKTRLVL
CCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
QSAMQWLPIFHHGVHVVHLAALRDPELLIQTIIQSLAIKTTSQLPLLKQLKDFLYDKQLL
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHH
LILDNFEQLLDAAPIVTDLLAHAPQLKLMTTSREALNVYAEQQFELMPFSVDCSQQLMLR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCCEECCCCCCHHHHHHHH
QQPAVNLFLSRAQALQATIAYNDAELATIAQICQRLDGLALAIELAASRISLFSLTNLLE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RLSQRLSFINSGPRDLPARHQTLQAVIEWSYVLLTPQEQALFVQLSVFVGSFDLPAASAI
HHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHEEHHHHHCCCCCCHHHHH
CARAEQSAVELVLLSLVQKHLLQYQITEQRFYFLETIREYAQDQLNQRTDSRCYYTAHTD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHH
YYRTFVQNYVHELTGSEQQHWMSQFQANYPNIRAALAQSLKSGAFASAAHLGAVLWNFWH
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
RADLAQEGSYWIKKILDQPAEFDPKHQIMMLRGLSTFMRNQGDFQLAQQYLAQGLSIARQ
HHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
EQLDELAMGLLNGIGLLYKREGLFEQAGQAFSEAIQLARTFDKTRDMAAILSNLGEIRRS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LEQYQQAQLDLQESLGLARKVNDHHMAANILNSLGLLAYDTCNYQQAQQYYRQGLEIHQQ
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQNKRGIALIYTNLADSLTKLLQFSQANEYYDQALIHSHTIADPYFICHITIQKAWALRQ
HHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHH
QAQIAQAQPLIIQALHLANQHKFIAHNLRATLELTECYLAQQQLPLAAWLAGFMYQLAQD
HHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
HQQLLDGNDRRYHQTRLAELQAILAEHNEYWQQGYQSSFEQLLAAIVV
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
ANAGKVHMTVDSIITIDQLEINLTEQRVKRAGVYVRLGRKEWGLLELLVRNRNHVLSHR
CCCCEEEEEHHHEEEEEHEEECHHHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHH
QLLQHVWGDNYERDSSYLLHVAIGRLREKLGDKPPRYIVAEADLGYRFALSTPNLPSVPT
HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCC
PEPSSLVVPSISYTNIPAPLNAFIGRENEQQRLLQLLRQPHIRLISVLGVGGVGKTRLVL
CCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
QSAMQWLPIFHHGVHVVHLAALRDPELLIQTIIQSLAIKTTSQLPLLKQLKDFLYDKQLL
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCCEECCCCCCHHHHHHHH
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CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
RADLAQEGSYWIKKILDQPAEFDPKHQIMMLRGLSTFMRNQGDFQLAQQYLAQGLSIARQ
HHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
EQLDELAMGLLNGIGLLYKREGLFEQAGQAFSEAIQLARTFDKTRDMAAILSNLGEIRRS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LEQYQQAQLDLQESLGLARKVNDHHMAANILNSLGLLAYDTCNYQQAQQYYRQGLEIHQQ
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHH
QAQIAQAQPLIIQALHLANQHKFIAHNLRATLELTECYLAQQQLPLAAWLAGFMYQLAQD
HHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
HQQLLDGNDRRYHQTRLAELQAILAEHNEYWQQGYQSSFEQLLAAIVV
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9634230; 12218036 [H]