| Definition | Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009972 |
| Length | 6,346,587 |
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The map label for this gene is kdpE [C]
Identifier: 159897967
GI number: 159897967
Start: 1674028
End: 1676694
Strand: Direct
Name: kdpE [C]
Synonym: Haur_1442
Alternate gene names: 159897967
Gene position: 1674028-1676694 (Clockwise)
Preceding gene: 159897963
Following gene: 159897980
Centisome position: 26.38
GC content: 43.79
Gene sequence:
>2667_bases ATGGCGAATGCAGGGAAGGTGCATATGACTGTCGATTCAATCATTACGATTGACCAACTTGAGATTAATTTGACTGAGCA GCGAGTCAAGCGGGCGGGAGTTTATGTGCGGCTTGGGCGCAAAGAGTGGGGTTTGTTAGAACTGTTAGTGCGTAATCGTA ATCACGTGCTCAGCCATCGCCAGTTGTTGCAGCATGTGTGGGGCGATAATTATGAACGTGATAGTAGCTATTTATTGCAT GTAGCGATTGGCCGTTTGCGCGAGAAATTGGGCGATAAACCGCCGCGCTATATTGTGGCCGAGGCCGATTTGGGCTATCG TTTTGCCCTGTCAACGCCAAATTTGCCAAGTGTGCCAACGCCTGAGCCCAGCTCCTTGGTTGTACCATCAATCAGCTATA CCAATATTCCTGCGCCATTGAATGCCTTTATTGGGCGCGAAAACGAGCAACAACGCTTGTTGCAGCTTCTCCGTCAGCCG CATATTCGCTTGATTAGCGTTTTGGGGGTTGGTGGGGTTGGCAAAACCCGTTTAGTGCTGCAAAGTGCCATGCAATGGCT GCCGATCTTTCATCATGGCGTGCATGTTGTGCATTTAGCTGCTTTGCGCGATCCTGAGCTACTAATCCAGACAATTATTC AATCATTGGCGATTAAAACGACTAGTCAATTACCATTGCTCAAACAGCTCAAAGATTTTCTGTATGATAAACAACTCTTG CTCATTCTCGATAATTTTGAGCAATTGCTTGATGCTGCGCCGATTGTGACCGATCTCTTAGCCCATGCACCGCAATTAAA GTTAATGACGACTAGCCGCGAGGCTTTGAATGTGTATGCTGAGCAACAATTTGAATTAATGCCCTTTAGCGTTGATTGTT CGCAACAGTTGATGCTGCGCCAACAACCAGCAGTTAATCTTTTTCTCAGCCGTGCTCAAGCGCTACAAGCGACTATTGCT TATAACGATGCTGAATTAGCAACGATTGCTCAAATTTGCCAACGGCTTGATGGTTTAGCCTTGGCAATTGAGCTGGCCGC CAGCCGAATCAGCTTGTTTTCATTAACAAATTTACTTGAGCGTTTAAGCCAACGCTTGAGTTTTATCAATAGTGGACCAC GCGATCTACCAGCTCGCCACCAAACCTTGCAAGCAGTCATCGAATGGAGCTATGTTTTACTTACACCTCAAGAACAAGCG CTATTTGTCCAATTATCAGTGTTTGTCGGCAGCTTTGATCTACCAGCAGCTAGCGCAATTTGTGCGAGGGCTGAACAATC AGCAGTTGAATTAGTGTTATTAAGCTTGGTGCAAAAACACCTGCTTCAGTATCAGATAACCGAACAACGTTTTTATTTCT TGGAAACAATCCGTGAATATGCTCAAGATCAATTAAATCAACGAACTGATAGTCGATGCTACTATACAGCGCATACTGAT TATTATCGAACGTTTGTTCAAAATTATGTGCATGAATTAACTGGCTCAGAGCAACAACACTGGATGAGTCAATTTCAAGC GAATTATCCCAATATTCGGGCTGCGCTAGCTCAAAGCCTCAAATCTGGGGCGTTTGCGAGTGCTGCTCATTTGGGTGCTG TGCTCTGGAATTTTTGGCATCGCGCTGATCTCGCCCAAGAAGGTAGTTATTGGATTAAAAAAATTCTCGATCAGCCAGCC GAATTTGATCCCAAGCATCAGATTATGATGCTACGTGGATTAAGTACTTTCATGCGTAATCAGGGAGATTTTCAATTAGC CCAGCAGTATCTTGCTCAAGGTTTAAGCATTGCACGCCAAGAACAACTTGATGAATTGGCGATGGGTTTATTGAATGGAA TCGGTTTGCTCTATAAACGTGAGGGTTTATTTGAACAAGCAGGCCAAGCATTCAGTGAAGCGATTCAACTTGCCCGTACA TTCGATAAAACCCGCGATATGGCGGCGATTCTCAGCAATCTTGGCGAAATTCGGCGTAGCCTCGAACAATATCAGCAAGC ACAGCTCGATTTACAAGAATCATTGGGATTAGCACGCAAAGTCAATGATCATCATATGGCTGCAAATATTTTGAATAGTC TAGGCTTATTGGCCTATGATACCTGCAATTATCAACAAGCACAGCAATACTATCGACAAGGCCTAGAAATTCATCAACAA TTACAAAATAAACGTGGAATTGCCCTAATTTACACGAATTTAGCCGATAGCTTAACCAAATTACTGCAATTTAGCCAAGC AAATGAATATTATGATCAAGCATTAATCCATAGTCATACCATTGCTGATCCCTATTTTATCTGTCATATAACGATTCAAA AAGCCTGGGCTTTGCGCCAACAAGCCCAAATTGCCCAAGCTCAACCATTAATTATTCAAGCATTACACTTGGCCAATCAA CACAAATTTATCGCTCATAACCTACGAGCAACATTGGAGTTGACCGAATGTTATTTAGCCCAACAACAATTGCCATTAGC AGCATGGTTGGCAGGGTTTATGTACCAATTGGCCCAAGACCATCAACAGTTGCTCGATGGCAATGATCGGCGCTATCACC AAACGCGTTTGGCCGAATTGCAAGCAATACTTGCTGAACATAATGAATATTGGCAGCAAGGCTATCAAAGCTCGTTTGAA CAGCTGTTGGCGGCAATTGTGGTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTGTTGATCACGAATAAACAGGTTTAGCTTAGTCAAGGCTGCTAACATTTCAGCCAACATCGGCTAACATGGTGGCGAA CATTTTGCGAGGGTCACCCC
Downstream 100 bases:
>100_bases TCTGTGGCCTATGGTGTCGTCCGCAACCGCTGCTCTGAGATTTTTCCAGCTGCTTGGTTGTGGACGACCTACCCACCAAT TTACTCATAGCGATTTTTCA
Product: transcriptional regulator
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 888; Mature: 887
Protein sequence:
>888_residues MANAGKVHMTVDSIITIDQLEINLTEQRVKRAGVYVRLGRKEWGLLELLVRNRNHVLSHRQLLQHVWGDNYERDSSYLLH VAIGRLREKLGDKPPRYIVAEADLGYRFALSTPNLPSVPTPEPSSLVVPSISYTNIPAPLNAFIGRENEQQRLLQLLRQP HIRLISVLGVGGVGKTRLVLQSAMQWLPIFHHGVHVVHLAALRDPELLIQTIIQSLAIKTTSQLPLLKQLKDFLYDKQLL LILDNFEQLLDAAPIVTDLLAHAPQLKLMTTSREALNVYAEQQFELMPFSVDCSQQLMLRQQPAVNLFLSRAQALQATIA YNDAELATIAQICQRLDGLALAIELAASRISLFSLTNLLERLSQRLSFINSGPRDLPARHQTLQAVIEWSYVLLTPQEQA LFVQLSVFVGSFDLPAASAICARAEQSAVELVLLSLVQKHLLQYQITEQRFYFLETIREYAQDQLNQRTDSRCYYTAHTD YYRTFVQNYVHELTGSEQQHWMSQFQANYPNIRAALAQSLKSGAFASAAHLGAVLWNFWHRADLAQEGSYWIKKILDQPA EFDPKHQIMMLRGLSTFMRNQGDFQLAQQYLAQGLSIARQEQLDELAMGLLNGIGLLYKREGLFEQAGQAFSEAIQLART FDKTRDMAAILSNLGEIRRSLEQYQQAQLDLQESLGLARKVNDHHMAANILNSLGLLAYDTCNYQQAQQYYRQGLEIHQQ LQNKRGIALIYTNLADSLTKLLQFSQANEYYDQALIHSHTIADPYFICHITIQKAWALRQQAQIAQAQPLIIQALHLANQ HKFIAHNLRATLELTECYLAQQQLPLAAWLAGFMYQLAQDHQQLLDGNDRRYHQTRLAELQAILAEHNEYWQQGYQSSFE QLLAAIVV
Sequences:
>Translated_888_residues MANAGKVHMTVDSIITIDQLEINLTEQRVKRAGVYVRLGRKEWGLLELLVRNRNHVLSHRQLLQHVWGDNYERDSSYLLH VAIGRLREKLGDKPPRYIVAEADLGYRFALSTPNLPSVPTPEPSSLVVPSISYTNIPAPLNAFIGRENEQQRLLQLLRQP HIRLISVLGVGGVGKTRLVLQSAMQWLPIFHHGVHVVHLAALRDPELLIQTIIQSLAIKTTSQLPLLKQLKDFLYDKQLL LILDNFEQLLDAAPIVTDLLAHAPQLKLMTTSREALNVYAEQQFELMPFSVDCSQQLMLRQQPAVNLFLSRAQALQATIA YNDAELATIAQICQRLDGLALAIELAASRISLFSLTNLLERLSQRLSFINSGPRDLPARHQTLQAVIEWSYVLLTPQEQA LFVQLSVFVGSFDLPAASAICARAEQSAVELVLLSLVQKHLLQYQITEQRFYFLETIREYAQDQLNQRTDSRCYYTAHTD YYRTFVQNYVHELTGSEQQHWMSQFQANYPNIRAALAQSLKSGAFASAAHLGAVLWNFWHRADLAQEGSYWIKKILDQPA EFDPKHQIMMLRGLSTFMRNQGDFQLAQQYLAQGLSIARQEQLDELAMGLLNGIGLLYKREGLFEQAGQAFSEAIQLART FDKTRDMAAILSNLGEIRRSLEQYQQAQLDLQESLGLARKVNDHHMAANILNSLGLLAYDTCNYQQAQQYYRQGLEIHQQ LQNKRGIALIYTNLADSLTKLLQFSQANEYYDQALIHSHTIADPYFICHITIQKAWALRQQAQIAQAQPLIIQALHLANQ HKFIAHNLRATLELTECYLAQQQLPLAAWLAGFMYQLAQDHQQLLDGNDRRYHQTRLAELQAILAEHNEYWQQGYQSSFE QLLAAIVV >Mature_887_residues ANAGKVHMTVDSIITIDQLEINLTEQRVKRAGVYVRLGRKEWGLLELLVRNRNHVLSHRQLLQHVWGDNYERDSSYLLHV AIGRLREKLGDKPPRYIVAEADLGYRFALSTPNLPSVPTPEPSSLVVPSISYTNIPAPLNAFIGRENEQQRLLQLLRQPH IRLISVLGVGGVGKTRLVLQSAMQWLPIFHHGVHVVHLAALRDPELLIQTIIQSLAIKTTSQLPLLKQLKDFLYDKQLLL ILDNFEQLLDAAPIVTDLLAHAPQLKLMTTSREALNVYAEQQFELMPFSVDCSQQLMLRQQPAVNLFLSRAQALQATIAY NDAELATIAQICQRLDGLALAIELAASRISLFSLTNLLERLSQRLSFINSGPRDLPARHQTLQAVIEWSYVLLTPQEQAL FVQLSVFVGSFDLPAASAICARAEQSAVELVLLSLVQKHLLQYQITEQRFYFLETIREYAQDQLNQRTDSRCYYTAHTDY YRTFVQNYVHELTGSEQQHWMSQFQANYPNIRAALAQSLKSGAFASAAHLGAVLWNFWHRADLAQEGSYWIKKILDQPAE FDPKHQIMMLRGLSTFMRNQGDFQLAQQYLAQGLSIARQEQLDELAMGLLNGIGLLYKREGLFEQAGQAFSEAIQLARTF DKTRDMAAILSNLGEIRRSLEQYQQAQLDLQESLGLARKVNDHHMAANILNSLGLLAYDTCNYQQAQQYYRQGLEIHQQL QNKRGIALIYTNLADSLTKLLQFSQANEYYDQALIHSHTIADPYFICHITIQKAWALRQQAQIAQAQPLIIQALHLANQH KFIAHNLRATLELTECYLAQQQLPLAAWLAGFMYQLAQDHQQLLDGNDRRYHQTRLAELQAILAEHNEYWQQGYQSSFEQ LLAAIVV
Specific function: Member Of The Two-Component Regulatory System Kdpd/Kdpe Involved In The Regulation Of The Kdp Operon. [C]
COG id: COG3903
COG function: function code R; Predicted ATPase
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 HTH luxR-type DNA-binding domain [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR000767 - InterPro: IPR016032 - InterPro: IPR011990 - InterPro: IPR000792 - InterPro: IPR011991 [H]
Pfam domain/function: PF00196 GerE [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 101141; Mature: 101010
Theoretical pI: Translated: 7.02; Mature: 7.02
Prosite motif: PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MANAGKVHMTVDSIITIDQLEINLTEQRVKRAGVYVRLGRKEWGLLELLVRNRNHVLSHR CCCCCEEEEEHHHEEEEEHEEECHHHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHH QLLQHVWGDNYERDSSYLLHVAIGRLREKLGDKPPRYIVAEADLGYRFALSTPNLPSVPT HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCC PEPSSLVVPSISYTNIPAPLNAFIGRENEQQRLLQLLRQPHIRLISVLGVGGVGKTRLVL CCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH QSAMQWLPIFHHGVHVVHLAALRDPELLIQTIIQSLAIKTTSQLPLLKQLKDFLYDKQLL HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHH LILDNFEQLLDAAPIVTDLLAHAPQLKLMTTSREALNVYAEQQFELMPFSVDCSQQLMLR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCCEECCCCCCHHHHHHHH QQPAVNLFLSRAQALQATIAYNDAELATIAQICQRLDGLALAIELAASRISLFSLTNLLE CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RLSQRLSFINSGPRDLPARHQTLQAVIEWSYVLLTPQEQALFVQLSVFVGSFDLPAASAI HHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHEEHHHHHCCCCCCHHHHH CARAEQSAVELVLLSLVQKHLLQYQITEQRFYFLETIREYAQDQLNQRTDSRCYYTAHTD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHH YYRTFVQNYVHELTGSEQQHWMSQFQANYPNIRAALAQSLKSGAFASAAHLGAVLWNFWH HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH RADLAQEGSYWIKKILDQPAEFDPKHQIMMLRGLSTFMRNQGDFQLAQQYLAQGLSIARQ HHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH EQLDELAMGLLNGIGLLYKREGLFEQAGQAFSEAIQLARTFDKTRDMAAILSNLGEIRRS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LEQYQQAQLDLQESLGLARKVNDHHMAANILNSLGLLAYDTCNYQQAQQYYRQGLEIHQQ HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LQNKRGIALIYTNLADSLTKLLQFSQANEYYDQALIHSHTIADPYFICHITIQKAWALRQ HHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHH QAQIAQAQPLIIQALHLANQHKFIAHNLRATLELTECYLAQQQLPLAAWLAGFMYQLAQD HHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH HQQLLDGNDRRYHQTRLAELQAILAEHNEYWQQGYQSSFEQLLAAIVV HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure ANAGKVHMTVDSIITIDQLEINLTEQRVKRAGVYVRLGRKEWGLLELLVRNRNHVLSHR CCCCEEEEEHHHEEEEEHEEECHHHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHH QLLQHVWGDNYERDSSYLLHVAIGRLREKLGDKPPRYIVAEADLGYRFALSTPNLPSVPT HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCC PEPSSLVVPSISYTNIPAPLNAFIGRENEQQRLLQLLRQPHIRLISVLGVGGVGKTRLVL CCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH QSAMQWLPIFHHGVHVVHLAALRDPELLIQTIIQSLAIKTTSQLPLLKQLKDFLYDKQLL HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHH LILDNFEQLLDAAPIVTDLLAHAPQLKLMTTSREALNVYAEQQFELMPFSVDCSQQLMLR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCCEECCCCCCHHHHHHHH QQPAVNLFLSRAQALQATIAYNDAELATIAQICQRLDGLALAIELAASRISLFSLTNLLE CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RLSQRLSFINSGPRDLPARHQTLQAVIEWSYVLLTPQEQALFVQLSVFVGSFDLPAASAI HHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHEEHHHHHCCCCCCHHHHH CARAEQSAVELVLLSLVQKHLLQYQITEQRFYFLETIREYAQDQLNQRTDSRCYYTAHTD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHH YYRTFVQNYVHELTGSEQQHWMSQFQANYPNIRAALAQSLKSGAFASAAHLGAVLWNFWH HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH RADLAQEGSYWIKKILDQPAEFDPKHQIMMLRGLSTFMRNQGDFQLAQQYLAQGLSIARQ HHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH EQLDELAMGLLNGIGLLYKREGLFEQAGQAFSEAIQLARTFDKTRDMAAILSNLGEIRRS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LEQYQQAQLDLQESLGLARKVNDHHMAANILNSLGLLAYDTCNYQQAQQYYRQGLEIHQQ HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LQNKRGIALIYTNLADSLTKLLQFSQANEYYDQALIHSHTIADPYFICHITIQKAWALRQ HHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHH QAQIAQAQPLIIQALHLANQHKFIAHNLRATLELTECYLAQQQLPLAAWLAGFMYQLAQD HHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH HQQLLDGNDRRYHQTRLAELQAILAEHNEYWQQGYQSSFEQLLAAIVV HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9634230; 12218036 [H]