| Definition | Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009972 |
| Length | 6,346,587 |
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The map label for this gene is 159896642
Identifier: 159896642
GI number: 159896642
Start: 141655
End: 143475
Strand: Reverse
Name: 159896642
Synonym: Haur_0109
Alternate gene names: NA
Gene position: 143475-141655 (Counterclockwise)
Preceding gene: 159896643
Following gene: 159896636
Centisome position: 2.26
GC content: 36.63
Gene sequence:
>1821_bases ATGGATTTTTATGCAAAGGCTTGTATGGGCACATTTAAATTAACATCAATCAAAGATCGGTATATTATTGTATTTGGAAC ATTTTGTATATTTCTATGCTATGCACTATTTATCTTCAATTCTGATGTGGCTTATTTAGCCTTTACTCAACCTCAAGATG ATTCGTTTTATTATTTCCTACCGGCCTGGAATTTCAAAGCCTATGGATTTTATACCTTTGACGGTTTGAATGAAACATAC GGCTTTCAGCCATTATGGATGGTTTTACTAACCATAATGGCTTTTTTTATATCAAGTAAAATTCTATTTTTCAAGCTTTC GCTTCTAGTGGGATGCCTGTTCTATCTCTTAACTGGCTTAATTATCTACAAAATCAGCAAGTTATTGATCAGGCAACGGC TACTAACATTTATTCCATGGTTTGTTTGGGTTAGCAATATCTACTTATTACGTATATTTGCTTCAGGTAAAGAAAATTCA CTCTCAGTTTTTTTATATGCACTGATTGCTTTAAGCCTTCTCAATATCCATTTTAAAAATCGCCAACAATCAAGCCTGTA TGGGTTAATCGATGCTAGCTTTATGCTGGTTCGGATCAACAATCTGATGTTTGTTGGGCCAATTCTGCTCTATCGGCTCT ATCATAATCGTCAGCAAAAATCCCAGATTGGATTCTATTTAGCAACCTTTAGTTTAGTATTAAGTCTATGGTTTGGCTAT AGCTATGCTGCATTTGGTACGCTTTTTCCCAATAGTGGCAGCTTAAAGACAGTTATTTCTAAACCTTCAATCGTCTATTG GCTTAATCAACAAACTGGCGTTGAGCTGGGTGGCATGCTTAGCTCACAGGAACAATTACTCTTACAGCATCCTGAATTTT TAGATGTTCCGCGGGCGAATTTCTTCTGGCAATATCTTAGTCAAATTGTGCCCCAAAAAGTTACAGATATTTATTTTGAT CAAAAATTCTCGTCAATAACGCTTGTTTCAACGCTCAATCAAGTTCTTTTGCTGAGTATTGGGCTTGGATTAATTGGATT TTTAGGTGGATTATGGCAACGAAGCATTACCATCAATCAACAACTAATCAAATTATTAAGCTATTGTGGCATCATTGCCT TAGCAAATAGCGTGGTTAATTGGCTATTTTTTCAACGTTACCTCAGCTTTACGATTTGGTATCCAGTACCAGAATTATTT TGGTTTAGCTTGGTATTGGGTTTATTAGTGGTAGCAAGTATCATTGGTTGGCAACAATTAAGCCAAATCAAACCCATCAT TAAGCCAGTGCAATACATAATGTTGCTAGCAATTGGCATATTTTTATTAAGCCCATTGAGTCGTTTTCCACAGGAGCTAT TACCGCAAAAAACCAGTGAACATTATCGTGGAACCTATCGATTTTTCTCGTATATTTGGCAGGATGAAGCACTCAAAGCC ACTAGTTGGGCCAACCAAGCATTAGCGCCAAATACGACTATTGGTTCGTGGAATGCAGGGATTGTTGGCTATTTTTATGA AAATGGTTCGACGATTAATTTAGATGGCTTAGCAAACAGCCCAGCGTTTGTCGATGAGGTTTTACGCCAGAATATTTTAT TTACACGTGGCTTAGCAAACGAAAATGTGCTATGGAACTATATTCAACACCAGGATATTCGCTATATTATTGATTCATGG TATAGCGGGGAAATGGGCAAAAGCAGATTTATTAATAGTATTCCACCAGAGCATTATGAAATTATCTACGAGGGTGCGGT TACGTTTTCAGATGGGAATCGGCCTGATCGAAGAATGTATGTATTGAAATTGAAGTATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATAAACAAATTTGAGTTTCACTTAAAATTGCCTATAATAAGCCAAAACTCGTACCATTTAAGATCAATCCATTAGATGTT TCAATGCATTGAAACATCTA
Downstream 100 bases:
>100_bases CAATCAATGCGGCTAAACAAGCAATCGCTTAGCCGCATTCGCCCAAACTTACTGGCGAGCCGCCGCTTTTTGGTCGGCAA TGCTCGGTAGGCTTTGTTCT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 606; Mature: 606
Protein sequence:
>606_residues MDFYAKACMGTFKLTSIKDRYIIVFGTFCIFLCYALFIFNSDVAYLAFTQPQDDSFYYFLPAWNFKAYGFYTFDGLNETY GFQPLWMVLLTIMAFFISSKILFFKLSLLVGCLFYLLTGLIIYKISKLLIRQRLLTFIPWFVWVSNIYLLRIFASGKENS LSVFLYALIALSLLNIHFKNRQQSSLYGLIDASFMLVRINNLMFVGPILLYRLYHNRQQKSQIGFYLATFSLVLSLWFGY SYAAFGTLFPNSGSLKTVISKPSIVYWLNQQTGVELGGMLSSQEQLLLQHPEFLDVPRANFFWQYLSQIVPQKVTDIYFD QKFSSITLVSTLNQVLLLSIGLGLIGFLGGLWQRSITINQQLIKLLSYCGIIALANSVVNWLFFQRYLSFTIWYPVPELF WFSLVLGLLVVASIIGWQQLSQIKPIIKPVQYIMLLAIGIFLLSPLSRFPQELLPQKTSEHYRGTYRFFSYIWQDEALKA TSWANQALAPNTTIGSWNAGIVGYFYENGSTINLDGLANSPAFVDEVLRQNILFTRGLANENVLWNYIQHQDIRYIIDSW YSGEMGKSRFINSIPPEHYEIIYEGAVTFSDGNRPDRRMYVLKLKY
Sequences:
>Translated_606_residues MDFYAKACMGTFKLTSIKDRYIIVFGTFCIFLCYALFIFNSDVAYLAFTQPQDDSFYYFLPAWNFKAYGFYTFDGLNETY GFQPLWMVLLTIMAFFISSKILFFKLSLLVGCLFYLLTGLIIYKISKLLIRQRLLTFIPWFVWVSNIYLLRIFASGKENS LSVFLYALIALSLLNIHFKNRQQSSLYGLIDASFMLVRINNLMFVGPILLYRLYHNRQQKSQIGFYLATFSLVLSLWFGY SYAAFGTLFPNSGSLKTVISKPSIVYWLNQQTGVELGGMLSSQEQLLLQHPEFLDVPRANFFWQYLSQIVPQKVTDIYFD QKFSSITLVSTLNQVLLLSIGLGLIGFLGGLWQRSITINQQLIKLLSYCGIIALANSVVNWLFFQRYLSFTIWYPVPELF WFSLVLGLLVVASIIGWQQLSQIKPIIKPVQYIMLLAIGIFLLSPLSRFPQELLPQKTSEHYRGTYRFFSYIWQDEALKA TSWANQALAPNTTIGSWNAGIVGYFYENGSTINLDGLANSPAFVDEVLRQNILFTRGLANENVLWNYIQHQDIRYIIDSW YSGEMGKSRFINSIPPEHYEIIYEGAVTFSDGNRPDRRMYVLKLKY >Mature_606_residues MDFYAKACMGTFKLTSIKDRYIIVFGTFCIFLCYALFIFNSDVAYLAFTQPQDDSFYYFLPAWNFKAYGFYTFDGLNETY GFQPLWMVLLTIMAFFISSKILFFKLSLLVGCLFYLLTGLIIYKISKLLIRQRLLTFIPWFVWVSNIYLLRIFASGKENS LSVFLYALIALSLLNIHFKNRQQSSLYGLIDASFMLVRINNLMFVGPILLYRLYHNRQQKSQIGFYLATFSLVLSLWFGY SYAAFGTLFPNSGSLKTVISKPSIVYWLNQQTGVELGGMLSSQEQLLLQHPEFLDVPRANFFWQYLSQIVPQKVTDIYFD QKFSSITLVSTLNQVLLLSIGLGLIGFLGGLWQRSITINQQLIKLLSYCGIIALANSVVNWLFFQRYLSFTIWYPVPELF WFSLVLGLLVVASIIGWQQLSQIKPIIKPVQYIMLLAIGIFLLSPLSRFPQELLPQKTSEHYRGTYRFFSYIWQDEALKA TSWANQALAPNTTIGSWNAGIVGYFYENGSTINLDGLANSPAFVDEVLRQNILFTRGLANENVLWNYIQHQDIRYIIDSW YSGEMGKSRFINSIPPEHYEIIYEGAVTFSDGNRPDRRMYVLKLKY
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 70075; Mature: 70075
Theoretical pI: Translated: 9.30; Mature: 9.30
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 2.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDFYAKACMGTFKLTSIKDRYIIVFGTFCIFLCYALFIFNSDVAYLAFTQPQDDSFYYFL CCCHHHHHHCHHEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCEEEEE PAWNFKAYGFYTFDGLNETYGFQPLWMVLLTIMAFFISSKILFFKLSLLVGCLFYLLTGL ECCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IIYKISKLLIRQRLLTFIPWFVWVSNIYLLRIFASGKENSLSVFLYALIALSLLNIHFKN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC RQQSSLYGLIDASFMLVRINNLMFVGPILLYRLYHNRQQKSQIGFYLATFSLVLSLWFGY CCCCHHHHHHHHHEEEEHHCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SYAAFGTLFPNSGSLKTVISKPSIVYWLNQQTGVELGGMLSSQEQLLLQHPEFLDVPRAN HHHHHHEECCCCCCCEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHH FFWQYLSQIVPQKVTDIYFDQKFSSITLVSTLNQVLLLSIGLGLIGFLGGLWQRSITINQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QLIKLLSYCGIIALANSVVNWLFFQRYLSFTIWYPVPELFWFSLVLGLLVVASIIGWQQL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SQIKPIIKPVQYIMLLAIGIFLLSPLSRFPQELLPQKTSEHYRGTYRFFSYIWQDEALKA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TSWANQALAPNTTIGSWNAGIVGYFYENGSTINLDGLANSPAFVDEVLRQNILFTRGLAN HHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCC ENVLWNYIQHQDIRYIIDSWYSGEMGKSRFINSIPPEHYEIIYEGAVTFSDGNRPDRRMY CCHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCCCCHHEEEEECEEEECCCCCCCCEEE VLKLKY EEEECC >Mature Secondary Structure MDFYAKACMGTFKLTSIKDRYIIVFGTFCIFLCYALFIFNSDVAYLAFTQPQDDSFYYFL CCCHHHHHHCHHEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCEEEEE PAWNFKAYGFYTFDGLNETYGFQPLWMVLLTIMAFFISSKILFFKLSLLVGCLFYLLTGL ECCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IIYKISKLLIRQRLLTFIPWFVWVSNIYLLRIFASGKENSLSVFLYALIALSLLNIHFKN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC RQQSSLYGLIDASFMLVRINNLMFVGPILLYRLYHNRQQKSQIGFYLATFSLVLSLWFGY CCCCHHHHHHHHHEEEEHHCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SYAAFGTLFPNSGSLKTVISKPSIVYWLNQQTGVELGGMLSSQEQLLLQHPEFLDVPRAN HHHHHHEECCCCCCCEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHH FFWQYLSQIVPQKVTDIYFDQKFSSITLVSTLNQVLLLSIGLGLIGFLGGLWQRSITINQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QLIKLLSYCGIIALANSVVNWLFFQRYLSFTIWYPVPELFWFSLVLGLLVVASIIGWQQL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SQIKPIIKPVQYIMLLAIGIFLLSPLSRFPQELLPQKTSEHYRGTYRFFSYIWQDEALKA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TSWANQALAPNTTIGSWNAGIVGYFYENGSTINLDGLANSPAFVDEVLRQNILFTRGLAN HHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCC ENVLWNYIQHQDIRYIIDSWYSGEMGKSRFINSIPPEHYEIIYEGAVTFSDGNRPDRRMY CCHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCCCCHHEEEEECEEEECCCCCCCCEEE VLKLKY EEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA