Definition Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome.
Accession NC_009972
Length 6,346,587

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The map label for this gene is 159896642

Identifier: 159896642

GI number: 159896642

Start: 141655

End: 143475

Strand: Reverse

Name: 159896642

Synonym: Haur_0109

Alternate gene names: NA

Gene position: 143475-141655 (Counterclockwise)

Preceding gene: 159896643

Following gene: 159896636

Centisome position: 2.26

GC content: 36.63

Gene sequence:

>1821_bases
ATGGATTTTTATGCAAAGGCTTGTATGGGCACATTTAAATTAACATCAATCAAAGATCGGTATATTATTGTATTTGGAAC
ATTTTGTATATTTCTATGCTATGCACTATTTATCTTCAATTCTGATGTGGCTTATTTAGCCTTTACTCAACCTCAAGATG
ATTCGTTTTATTATTTCCTACCGGCCTGGAATTTCAAAGCCTATGGATTTTATACCTTTGACGGTTTGAATGAAACATAC
GGCTTTCAGCCATTATGGATGGTTTTACTAACCATAATGGCTTTTTTTATATCAAGTAAAATTCTATTTTTCAAGCTTTC
GCTTCTAGTGGGATGCCTGTTCTATCTCTTAACTGGCTTAATTATCTACAAAATCAGCAAGTTATTGATCAGGCAACGGC
TACTAACATTTATTCCATGGTTTGTTTGGGTTAGCAATATCTACTTATTACGTATATTTGCTTCAGGTAAAGAAAATTCA
CTCTCAGTTTTTTTATATGCACTGATTGCTTTAAGCCTTCTCAATATCCATTTTAAAAATCGCCAACAATCAAGCCTGTA
TGGGTTAATCGATGCTAGCTTTATGCTGGTTCGGATCAACAATCTGATGTTTGTTGGGCCAATTCTGCTCTATCGGCTCT
ATCATAATCGTCAGCAAAAATCCCAGATTGGATTCTATTTAGCAACCTTTAGTTTAGTATTAAGTCTATGGTTTGGCTAT
AGCTATGCTGCATTTGGTACGCTTTTTCCCAATAGTGGCAGCTTAAAGACAGTTATTTCTAAACCTTCAATCGTCTATTG
GCTTAATCAACAAACTGGCGTTGAGCTGGGTGGCATGCTTAGCTCACAGGAACAATTACTCTTACAGCATCCTGAATTTT
TAGATGTTCCGCGGGCGAATTTCTTCTGGCAATATCTTAGTCAAATTGTGCCCCAAAAAGTTACAGATATTTATTTTGAT
CAAAAATTCTCGTCAATAACGCTTGTTTCAACGCTCAATCAAGTTCTTTTGCTGAGTATTGGGCTTGGATTAATTGGATT
TTTAGGTGGATTATGGCAACGAAGCATTACCATCAATCAACAACTAATCAAATTATTAAGCTATTGTGGCATCATTGCCT
TAGCAAATAGCGTGGTTAATTGGCTATTTTTTCAACGTTACCTCAGCTTTACGATTTGGTATCCAGTACCAGAATTATTT
TGGTTTAGCTTGGTATTGGGTTTATTAGTGGTAGCAAGTATCATTGGTTGGCAACAATTAAGCCAAATCAAACCCATCAT
TAAGCCAGTGCAATACATAATGTTGCTAGCAATTGGCATATTTTTATTAAGCCCATTGAGTCGTTTTCCACAGGAGCTAT
TACCGCAAAAAACCAGTGAACATTATCGTGGAACCTATCGATTTTTCTCGTATATTTGGCAGGATGAAGCACTCAAAGCC
ACTAGTTGGGCCAACCAAGCATTAGCGCCAAATACGACTATTGGTTCGTGGAATGCAGGGATTGTTGGCTATTTTTATGA
AAATGGTTCGACGATTAATTTAGATGGCTTAGCAAACAGCCCAGCGTTTGTCGATGAGGTTTTACGCCAGAATATTTTAT
TTACACGTGGCTTAGCAAACGAAAATGTGCTATGGAACTATATTCAACACCAGGATATTCGCTATATTATTGATTCATGG
TATAGCGGGGAAATGGGCAAAAGCAGATTTATTAATAGTATTCCACCAGAGCATTATGAAATTATCTACGAGGGTGCGGT
TACGTTTTCAGATGGGAATCGGCCTGATCGAAGAATGTATGTATTGAAATTGAAGTATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAAACAAATTTGAGTTTCACTTAAAATTGCCTATAATAAGCCAAAACTCGTACCATTTAAGATCAATCCATTAGATGTT
TCAATGCATTGAAACATCTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAATCAATGCGGCTAAACAAGCAATCGCTTAGCCGCATTCGCCCAAACTTACTGGCGAGCCGCCGCTTTTTGGTCGGCAA
TGCTCGGTAGGCTTTGTTCT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 606; Mature: 606

Protein sequence:

>606_residues
MDFYAKACMGTFKLTSIKDRYIIVFGTFCIFLCYALFIFNSDVAYLAFTQPQDDSFYYFLPAWNFKAYGFYTFDGLNETY
GFQPLWMVLLTIMAFFISSKILFFKLSLLVGCLFYLLTGLIIYKISKLLIRQRLLTFIPWFVWVSNIYLLRIFASGKENS
LSVFLYALIALSLLNIHFKNRQQSSLYGLIDASFMLVRINNLMFVGPILLYRLYHNRQQKSQIGFYLATFSLVLSLWFGY
SYAAFGTLFPNSGSLKTVISKPSIVYWLNQQTGVELGGMLSSQEQLLLQHPEFLDVPRANFFWQYLSQIVPQKVTDIYFD
QKFSSITLVSTLNQVLLLSIGLGLIGFLGGLWQRSITINQQLIKLLSYCGIIALANSVVNWLFFQRYLSFTIWYPVPELF
WFSLVLGLLVVASIIGWQQLSQIKPIIKPVQYIMLLAIGIFLLSPLSRFPQELLPQKTSEHYRGTYRFFSYIWQDEALKA
TSWANQALAPNTTIGSWNAGIVGYFYENGSTINLDGLANSPAFVDEVLRQNILFTRGLANENVLWNYIQHQDIRYIIDSW
YSGEMGKSRFINSIPPEHYEIIYEGAVTFSDGNRPDRRMYVLKLKY

Sequences:

>Translated_606_residues
MDFYAKACMGTFKLTSIKDRYIIVFGTFCIFLCYALFIFNSDVAYLAFTQPQDDSFYYFLPAWNFKAYGFYTFDGLNETY
GFQPLWMVLLTIMAFFISSKILFFKLSLLVGCLFYLLTGLIIYKISKLLIRQRLLTFIPWFVWVSNIYLLRIFASGKENS
LSVFLYALIALSLLNIHFKNRQQSSLYGLIDASFMLVRINNLMFVGPILLYRLYHNRQQKSQIGFYLATFSLVLSLWFGY
SYAAFGTLFPNSGSLKTVISKPSIVYWLNQQTGVELGGMLSSQEQLLLQHPEFLDVPRANFFWQYLSQIVPQKVTDIYFD
QKFSSITLVSTLNQVLLLSIGLGLIGFLGGLWQRSITINQQLIKLLSYCGIIALANSVVNWLFFQRYLSFTIWYPVPELF
WFSLVLGLLVVASIIGWQQLSQIKPIIKPVQYIMLLAIGIFLLSPLSRFPQELLPQKTSEHYRGTYRFFSYIWQDEALKA
TSWANQALAPNTTIGSWNAGIVGYFYENGSTINLDGLANSPAFVDEVLRQNILFTRGLANENVLWNYIQHQDIRYIIDSW
YSGEMGKSRFINSIPPEHYEIIYEGAVTFSDGNRPDRRMYVLKLKY
>Mature_606_residues
MDFYAKACMGTFKLTSIKDRYIIVFGTFCIFLCYALFIFNSDVAYLAFTQPQDDSFYYFLPAWNFKAYGFYTFDGLNETY
GFQPLWMVLLTIMAFFISSKILFFKLSLLVGCLFYLLTGLIIYKISKLLIRQRLLTFIPWFVWVSNIYLLRIFASGKENS
LSVFLYALIALSLLNIHFKNRQQSSLYGLIDASFMLVRINNLMFVGPILLYRLYHNRQQKSQIGFYLATFSLVLSLWFGY
SYAAFGTLFPNSGSLKTVISKPSIVYWLNQQTGVELGGMLSSQEQLLLQHPEFLDVPRANFFWQYLSQIVPQKVTDIYFD
QKFSSITLVSTLNQVLLLSIGLGLIGFLGGLWQRSITINQQLIKLLSYCGIIALANSVVNWLFFQRYLSFTIWYPVPELF
WFSLVLGLLVVASIIGWQQLSQIKPIIKPVQYIMLLAIGIFLLSPLSRFPQELLPQKTSEHYRGTYRFFSYIWQDEALKA
TSWANQALAPNTTIGSWNAGIVGYFYENGSTINLDGLANSPAFVDEVLRQNILFTRGLANENVLWNYIQHQDIRYIIDSW
YSGEMGKSRFINSIPPEHYEIIYEGAVTFSDGNRPDRRMYVLKLKY

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 70075; Mature: 70075

Theoretical pI: Translated: 9.30; Mature: 9.30

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDFYAKACMGTFKLTSIKDRYIIVFGTFCIFLCYALFIFNSDVAYLAFTQPQDDSFYYFL
CCCHHHHHHCHHEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCEEEEE
PAWNFKAYGFYTFDGLNETYGFQPLWMVLLTIMAFFISSKILFFKLSLLVGCLFYLLTGL
ECCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIYKISKLLIRQRLLTFIPWFVWVSNIYLLRIFASGKENSLSVFLYALIALSLLNIHFKN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
RQQSSLYGLIDASFMLVRINNLMFVGPILLYRLYHNRQQKSQIGFYLATFSLVLSLWFGY
CCCCHHHHHHHHHEEEEHHCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SYAAFGTLFPNSGSLKTVISKPSIVYWLNQQTGVELGGMLSSQEQLLLQHPEFLDVPRAN
HHHHHHEECCCCCCCEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHH
FFWQYLSQIVPQKVTDIYFDQKFSSITLVSTLNQVLLLSIGLGLIGFLGGLWQRSITINQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QLIKLLSYCGIIALANSVVNWLFFQRYLSFTIWYPVPELFWFSLVLGLLVVASIIGWQQL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SQIKPIIKPVQYIMLLAIGIFLLSPLSRFPQELLPQKTSEHYRGTYRFFSYIWQDEALKA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TSWANQALAPNTTIGSWNAGIVGYFYENGSTINLDGLANSPAFVDEVLRQNILFTRGLAN
HHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
ENVLWNYIQHQDIRYIIDSWYSGEMGKSRFINSIPPEHYEIIYEGAVTFSDGNRPDRRMY
CCHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCCCCHHEEEEECEEEECCCCCCCCEEE
VLKLKY
EEEECC
>Mature Secondary Structure
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CCCHHHHHHCHHEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCEEEEE
PAWNFKAYGFYTFDGLNETYGFQPLWMVLLTIMAFFISSKILFFKLSLLVGCLFYLLTGL
ECCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIYKISKLLIRQRLLTFIPWFVWVSNIYLLRIFASGKENSLSVFLYALIALSLLNIHFKN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
RQQSSLYGLIDASFMLVRINNLMFVGPILLYRLYHNRQQKSQIGFYLATFSLVLSLWFGY
CCCCHHHHHHHHHEEEEHHCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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TSWANQALAPNTTIGSWNAGIVGYFYENGSTINLDGLANSPAFVDEVLRQNILFTRGLAN
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ENVLWNYIQHQDIRYIIDSWYSGEMGKSRFINSIPPEHYEIIYEGAVTFSDGNRPDRRMY
CCHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCCCCHHEEEEECEEEECCCCCCCCEEE
VLKLKY
EEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA