Definition Caldivirga maquilingensis IC-167 chromosome, complete genome.
Accession NC_009954
Length 2,077,567

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 159041021

Identifier: 159041021

GI number: 159041021

Start: 471342

End: 473822

Strand: Reverse

Name: 159041021

Synonym: Cmaq_0438

Alternate gene names: NA

Gene position: 473822-471342 (Counterclockwise)

Preceding gene: 159041022

Following gene: 159041016

Centisome position: 22.81

GC content: 47.4

Gene sequence:

>2481_bases
ATGGTTAAGGCAGGGGGAGGGAAGAGAGGTAGTGCCGCTAAGGCGCCAACTAAGACTAGGGTAAGCCTCACTGATGCCGA
GTTGAGGGAATTAAGGTCAACTCAGTGGTTTGGCTTATTGGCAGCATTAGCCGCAGCCTTCACTGCTGGGCTTTACATTA
GGCTTTACCCAGCATTCCTATGGGGTAATTACATTAATGAGTTTGACCCATACATTAGATACTACTTAACGGAATTCATG
CTTAAAATGGGGGTGGTTAAGGGTATTGAATGGTGGCTCAGCGGGGGTTTAATTAATGGTAACCTTTACATAAACACCCA
TTTCTGGTACCCATGGGGGATTAATTGGGCTACAACCCTATCCCCAGGCGTATCCTTCACTGGACTAATACTTTACGATA
TCTTGGTTAAGCACCTACACCTTCACTTAACCCTACTATCAATAGCCGTCTACACACCGGGTATAGTGAATGCCTTATCC
GTCTTATCCATGTATTACCTGGGTTCAAGGTTCGGAGGCAGGTACGTGGGTCTTTTAACCGCATTAATGACTGCCTTCTC
CCTAATATTCCTACAGAGGGGTGAGGCCAGTTGGTACGCTGATGCAACCCTGTTTCAATTCATAGCACCACTGGGCATGG
CTCTATTCATTGAGGCACTTAGGCAGAGGAATTGGATACCCTACGCGGTCTTAGCCGCTGTGGTGAATGGTTCACTAGTA
TGGTTCTGGGGTTCATTCACCTTCGTGTTGAACGCATATGGTGCATACGCCATACTACTCTCCATATATGTGCTTTACAG
GCTTTATAGAGGTAGGGTTATTCCACTCCGCATTACTGACGGTATCTCAGTTGACCCAGTGAATGCACTAGGCACCTACA
CGTTAACTTACCTTGGCTTCGCAGCCTTCCTAGCCATGACGCCGAGGTATAAGTTGCATGCAGTACTTAGTCTTGGTGCA
TTAGGTACTTTAGCGGCTTTACTGGCTGTTGTGGCGATTATAGTTGTTCTGCTGGAGAGGTTTGGTGCACGTAAACTAGT
TACCGCATCCAAGTACATTATAGCTGCCGCAGTGGTGTTCCTTGTGATTATTCTTGCCTTAGCCCTATCCGGTGTTTCAG
TCCTCATACATATACCTGGTGGTAAGTACTTGGCTGCCTTATTCCCAACAGCCCGCAGTGCCTTGGTTCAAAGCGTCGCT
GAGCATTCCCCATCAACGGCTCATCAATTACTCTCAACAACAGGTTATACCCTTCCCTTCGAGATTGCTGGCTTAACGTA
CGCCTTATCCACGGTTGACGTGGCTGGCTTACTGTTATCCATTACGTCAGTCTTATCAGTATACTTCGCCTCCAGTGAGG
CTTGGTTAACAATGCTCATGTTTGCCTGGCTCCCCGTGGCCGCCTACGGCCTCTACCTGGTAATTAGGTTCGTGGCTAGA
CGTGGTATTGATGTTATTGGGCTACTGACCGTGGCCGTTGTGACTGCGTTATTCGCAATATCGGTTGTAGTTATTGCTCA
ATCAGGTGTACCTATTGCTGCTGCGCCTCAGCAGATTGTCTCAACCACTGAGCCTGCAATACCATCCAGTGACTGGCTTG
ATGCACTCTACTGGATTCAATACAATACTCCTCATAATTCAGTCCTAGCCTCCTGGTGGGATTACGGTTACTGGTTGGCG
ATAATGGGTAATAGGACTAGCTTGGCCGATAACTCAACGGTTAATGGTACTCAGATTAAGCTCATAGCCACCGCCTTCAC
GTCAACTAATGTAACCGAATCCCTTAAGTTACTGCGTAGTGTTGGTGCTGATTACGTTGTTGTCTTCCTACCATACTACC
CATTCCCCATAACCGTCCCCTCACCCATGTCAGCGTTAAGCGTTGGCTCATCATCCCAAAGCATGTTAGCCCTCTGCGCC
CTCTACCCAGAGTACCCTACTGGTGGTGATTTCGTTAAGAGCTACTGGATGAGCACAATATCCGGTAATTCACCAGAATA
CACCAACACCCACATACTCAGTGCCGCTGAGATAATCAGTAGTACACCCAGTGGTGGAACAGCTACATATAACCTGTACG
TACCCTTAACCAACACCACGCTTTACCGTCTCCTCTTTGACTTAGAGGCCCCAGCATACTCAATTACCGTTGACCAGTGC
TTGACTCAGATAAGGACAACCACGTCGGCGACACCATTAACACTACCCCTGTGGTTATTCAATACTTGGCCAACCTACTC
TCAGTCATCATCCTCATCCTCTGCAGTTCACCTAGTATTGACATTCCAGCCGATACTAGGTCAAAGCCTAGTACCGCCTC
CGTTTGTTGGCACTAACACTACTCTGTTGAATCAGCTTTACTTCACATGGTTCTACGGTAATTGGTTAATTTCACCGCCA
GGCTTCCAGTTGGTTTACGTTTCAAGGCCATATGGATGGGTATTGGTGTATAAGATCAATTACTCAGTGCTTAAAAGCTA
A

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCCCAGTCTTAACAAGGAAGATTAGGGAGAGGAGGCGTTGACACTGCCTCAACTGCATCGTTTGGGAAATCTTTATTAAA
ATGCGCCGTAGACCGTCCAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTGCGTTATTTACTCTTTTCCTTAATGTTAATTGTAATAATCTTAGTGTTCTTCACGTGTTTCCTTAATGCTTTTATGAG
GCCTACATCATCAGTTACTA

Product: dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase

Products: NA

Alternate protein names: Dolichyl-Diphosphooligosaccharide-Protein Glycotransferase; Oligosaccharyl Transferase; Oligosaccharyl Transferase STT3 Like-Protein; Oligosaccharyl Transferase STT3-Like Protein

Number of amino acids: Translated: 826; Mature: 826

Protein sequence:

>826_residues
MVKAGGGKRGSAAKAPTKTRVSLTDAELRELRSTQWFGLLAALAAAFTAGLYIRLYPAFLWGNYINEFDPYIRYYLTEFM
LKMGVVKGIEWWLSGGLINGNLYINTHFWYPWGINWATTLSPGVSFTGLILYDILVKHLHLHLTLLSIAVYTPGIVNALS
VLSMYYLGSRFGGRYVGLLTALMTAFSLIFLQRGEASWYADATLFQFIAPLGMALFIEALRQRNWIPYAVLAAVVNGSLV
WFWGSFTFVLNAYGAYAILLSIYVLYRLYRGRVIPLRITDGISVDPVNALGTYTLTYLGFAAFLAMTPRYKLHAVLSLGA
LGTLAALLAVVAIIVVLLERFGARKLVTASKYIIAAAVVFLVIILALALSGVSVLIHIPGGKYLAALFPTARSALVQSVA
EHSPSTAHQLLSTTGYTLPFEIAGLTYALSTVDVAGLLLSITSVLSVYFASSEAWLTMLMFAWLPVAAYGLYLVIRFVAR
RGIDVIGLLTVAVVTALFAISVVVIAQSGVPIAAAPQQIVSTTEPAIPSSDWLDALYWIQYNTPHNSVLASWWDYGYWLA
IMGNRTSLADNSTVNGTQIKLIATAFTSTNVTESLKLLRSVGADYVVVFLPYYPFPITVPSPMSALSVGSSSQSMLALCA
LYPEYPTGGDFVKSYWMSTISGNSPEYTNTHILSAAEIISSTPSGGTATYNLYVPLTNTTLYRLLFDLEAPAYSITVDQC
LTQIRTTTSATPLTLPLWLFNTWPTYSQSSSSSSAVHLVLTFQPILGQSLVPPPFVGTNTTLLNQLYFTWFYGNWLISPP
GFQLVYVSRPYGWVLVYKINYSVLKS

Sequences:

>Translated_826_residues
MVKAGGGKRGSAAKAPTKTRVSLTDAELRELRSTQWFGLLAALAAAFTAGLYIRLYPAFLWGNYINEFDPYIRYYLTEFM
LKMGVVKGIEWWLSGGLINGNLYINTHFWYPWGINWATTLSPGVSFTGLILYDILVKHLHLHLTLLSIAVYTPGIVNALS
VLSMYYLGSRFGGRYVGLLTALMTAFSLIFLQRGEASWYADATLFQFIAPLGMALFIEALRQRNWIPYAVLAAVVNGSLV
WFWGSFTFVLNAYGAYAILLSIYVLYRLYRGRVIPLRITDGISVDPVNALGTYTLTYLGFAAFLAMTPRYKLHAVLSLGA
LGTLAALLAVVAIIVVLLERFGARKLVTASKYIIAAAVVFLVIILALALSGVSVLIHIPGGKYLAALFPTARSALVQSVA
EHSPSTAHQLLSTTGYTLPFEIAGLTYALSTVDVAGLLLSITSVLSVYFASSEAWLTMLMFAWLPVAAYGLYLVIRFVAR
RGIDVIGLLTVAVVTALFAISVVVIAQSGVPIAAAPQQIVSTTEPAIPSSDWLDALYWIQYNTPHNSVLASWWDYGYWLA
IMGNRTSLADNSTVNGTQIKLIATAFTSTNVTESLKLLRSVGADYVVVFLPYYPFPITVPSPMSALSVGSSSQSMLALCA
LYPEYPTGGDFVKSYWMSTISGNSPEYTNTHILSAAEIISSTPSGGTATYNLYVPLTNTTLYRLLFDLEAPAYSITVDQC
LTQIRTTTSATPLTLPLWLFNTWPTYSQSSSSSSAVHLVLTFQPILGQSLVPPPFVGTNTTLLNQLYFTWFYGNWLISPP
GFQLVYVSRPYGWVLVYKINYSVLKS
>Mature_826_residues
MVKAGGGKRGSAAKAPTKTRVSLTDAELRELRSTQWFGLLAALAAAFTAGLYIRLYPAFLWGNYINEFDPYIRYYLTEFM
LKMGVVKGIEWWLSGGLINGNLYINTHFWYPWGINWATTLSPGVSFTGLILYDILVKHLHLHLTLLSIAVYTPGIVNALS
VLSMYYLGSRFGGRYVGLLTALMTAFSLIFLQRGEASWYADATLFQFIAPLGMALFIEALRQRNWIPYAVLAAVVNGSLV
WFWGSFTFVLNAYGAYAILLSIYVLYRLYRGRVIPLRITDGISVDPVNALGTYTLTYLGFAAFLAMTPRYKLHAVLSLGA
LGTLAALLAVVAIIVVLLERFGARKLVTASKYIIAAAVVFLVIILALALSGVSVLIHIPGGKYLAALFPTARSALVQSVA
EHSPSTAHQLLSTTGYTLPFEIAGLTYALSTVDVAGLLLSITSVLSVYFASSEAWLTMLMFAWLPVAAYGLYLVIRFVAR
RGIDVIGLLTVAVVTALFAISVVVIAQSGVPIAAAPQQIVSTTEPAIPSSDWLDALYWIQYNTPHNSVLASWWDYGYWLA
IMGNRTSLADNSTVNGTQIKLIATAFTSTNVTESLKLLRSVGADYVVVFLPYYPFPITVPSPMSALSVGSSSQSMLALCA
LYPEYPTGGDFVKSYWMSTISGNSPEYTNTHILSAAEIISSTPSGGTATYNLYVPLTNTTLYRLLFDLEAPAYSITVDQC
LTQIRTTTSATPLTLPLWLFNTWPTYSQSSSSSSAVHLVLTFQPILGQSLVPPPFVGTNTTLLNQLYFTWFYGNWLISPP
GFQLVYVSRPYGWVLVYKINYSVLKS

Specific function: Unknown

COG id: COG1287

COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, required for N-linked glycosylation

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI22749415, Length=595, Percent_Identity=24.7058823529412, Blast_Score=114, Evalue=3e-25,
Organism=Homo sapiens, GI30578410, Length=79, Percent_Identity=43.0379746835443, Blast_Score=77, Evalue=7e-14,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI17555006, Length=624, Percent_Identity=22.9166666666667, Blast_Score=103, Evalue=3e-22,
Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6321416, Length=592, Percent_Identity=23.4797297297297, Blast_Score=109, Evalue=2e-24,
Organism=Drosophila melanogaster, GI20129103, Length=608, Percent_Identity=24.5065789473684, Blast_Score=119, Evalue=7e-27,
Organism=Drosophila melanogaster, GI17738187, Length=79, Percent_Identity=43.0379746835443, Blast_Score=74, Evalue=3e-13,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 90424; Mature: 90424

Theoretical pI: Translated: 9.29; Mature: 9.29

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
1.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
1.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVKAGGGKRGSAAKAPTKTRVSLTDAELRELRSTQWFGLLAALAAAFTAGLYIRLYPAFL
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WGNYINEFDPYIRYYLTEFMLKMGVVKGIEWWLSGGLINGNLYINTHFWYPWGINWATTL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECEEEEEEEEEECCCCCEEEEC
SPGVSFTGLILYDILVKHLHLHLTLLSIAVYTPGIVNALSVLSMYYLGSRFGGRYVGLLT
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
ALMTAFSLIFLQRGEASWYADATLFQFIAPLGMALFIEALRQRNWIPYAVLAAVVNGSLV
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCEE
WFWGSFTFVLNAYGAYAILLSIYVLYRLYRGRVIPLRITDGISVDPVNALGTYTLTYLGF
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
AAFLAMTPRYKLHAVLSLGALGTLAALLAVVAIIVVLLERFGARKLVTASKYIIAAAVVF
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LVIILALALSGVSVLIHIPGGKYLAALFPTARSALVQSVAEHSPSTAHQLLSTTGYTLPF
HHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCEE
EIAGLTYALSTVDVAGLLLSITSVLSVYFASSEAWLTMLMFAWLPVAAYGLYLVIRFVAR
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RGIDVIGLLTVAVVTALFAISVVVIAQSGVPIAAAPQQIVSTTEPAIPSSDWLDALYWIQ
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHCEEEEEE
YNTPHNSVLASWWDYGYWLAIMGNRTSLADNSTVNGTQIKLIATAFTSTNVTESLKLLRS
ECCCCCHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHH
VGADYVVVFLPYYPFPITVPSPMSALSVGSSSQSMLALCALYPEYPTGGDFVKSYWMSTI
CCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
SGNSPEYTNTHILSAAEIISSTPSGGTATYNLYVPLTNTTLYRLLFDLEAPAYSITVDQC
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHH
LTQIRTTTSATPLTLPLWLFNTWPTYSQSSSSSSAVHLVLTFQPILGQSLVPPPFVGTNT
HHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECHHHCCCCCCCCCCCCCH
TLLNQLYFTWFYGNWLISPPGFQLVYVSRPYGWVLVYKINYSVLKS
HHHHHHHHHEEECCEEECCCCEEEEEEECCCCEEEEEEECHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MVKAGGGKRGSAAKAPTKTRVSLTDAELRELRSTQWFGLLAALAAAFTAGLYIRLYPAFL
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WGNYINEFDPYIRYYLTEFMLKMGVVKGIEWWLSGGLINGNLYINTHFWYPWGINWATTL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECEEEEEEEEEECCCCCEEEEC
SPGVSFTGLILYDILVKHLHLHLTLLSIAVYTPGIVNALSVLSMYYLGSRFGGRYVGLLT
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
ALMTAFSLIFLQRGEASWYADATLFQFIAPLGMALFIEALRQRNWIPYAVLAAVVNGSLV
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCEE
WFWGSFTFVLNAYGAYAILLSIYVLYRLYRGRVIPLRITDGISVDPVNALGTYTLTYLGF
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
AAFLAMTPRYKLHAVLSLGALGTLAALLAVVAIIVVLLERFGARKLVTASKYIIAAAVVF
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LVIILALALSGVSVLIHIPGGKYLAALFPTARSALVQSVAEHSPSTAHQLLSTTGYTLPF
HHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCEE
EIAGLTYALSTVDVAGLLLSITSVLSVYFASSEAWLTMLMFAWLPVAAYGLYLVIRFVAR
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RGIDVIGLLTVAVVTALFAISVVVIAQSGVPIAAAPQQIVSTTEPAIPSSDWLDALYWIQ
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHCEEEEEE
YNTPHNSVLASWWDYGYWLAIMGNRTSLADNSTVNGTQIKLIATAFTSTNVTESLKLLRS
ECCCCCHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHH
VGADYVVVFLPYYPFPITVPSPMSALSVGSSSQSMLALCALYPEYPTGGDFVKSYWMSTI
CCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
SGNSPEYTNTHILSAAEIISSTPSGGTATYNLYVPLTNTTLYRLLFDLEAPAYSITVDQC
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHH
LTQIRTTTSATPLTLPLWLFNTWPTYSQSSSSSSAVHLVLTFQPILGQSLVPPPFVGTNT
HHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECHHHCCCCCCCCCCCCCH
TLLNQLYFTWFYGNWLISPPGFQLVYVSRPYGWVLVYKINYSVLKS
HHHHHHHHHEEECCEEECCCCEEEEEEECCCCEEEEEEECHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA