| Definition | Caldivirga maquilingensis IC-167 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009954 |
| Length | 2,077,567 |
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The map label for this gene is 159040961
Identifier: 159040961
GI number: 159040961
Start: 411222
End: 412619
Strand: Reverse
Name: 159040961
Synonym: Cmaq_0377
Alternate gene names: NA
Gene position: 412619-411222 (Counterclockwise)
Preceding gene: 159040967
Following gene: 159040960
Centisome position: 19.86
GC content: 46.42
Gene sequence:
>1398_bases ATGTCACTATTCGGTGGTAGAAAGGATCAGGTGAGTGGTGTTGTGCAGAGGATTGAGCAGATTGCCTTAACTGTTGATAA CCTTAATAAGCAGCAGCAGGCGTTGATGAATGAGGTTAGTAACGTTAGAGGTATGCTTCAGGGTATTGGGGGTGAGGTGA GTAGGCTTAGTAAGATTGTTCAGGATTTAAGCGGTATTATTAGGGATATTGTCTCGGTTCAGGATAAGAGGATAAATGAC ATAAGTGAATTATACCAGAGGTTCTCACAGGCCACGGACAGTTACCTAAACGCCCTCTCAGCGCTACTCGGTAGAGTTGA GCAGTTGAGTAAGGTGATGGAGGATGCTGCCAATGGGTTAACAGCTAGGATTAATGAATTGAGTAAGGGTCTTGAAGGTG GCTTAAACATGATGAGTGTAATAGATGGTAAGTTGAGTGACGTCTCCCAGAGGTCAAGTCAACTCCTTGATCAATTCTCT AAAATAGAGCAGGTTGCCACTAGGCTTCAGGCAGCCAGTGATGAGGCCATTAGTAGGCAGAGGGAGCTTGAAAGTAGGAT AATTGAGTTAGCTAATAAGGAGAGTGAGCTTAAGGTTAGGGAGGAGAGTCTTAAGAGGAGGGAGGAGGAGTTAAGTAGGA TTGAGGCTACCCTGGAGGAGGAGAAGCGTAGAGTTGATGCTGCTTCAAAACTCATGAATGACTTATCCAGTTTATCCAAC AACATGGGAAGCGTCATAAGTGAGTTGGTTAATAGGTTGAGTAACTACGAGAAGACCCTTAAGGACCTTCAGGAGAGGGA GGCTAGGCTCAGGGAGCAGGAAATTAACCTAAAGAACCTTGAGGCTAGGCTACAACTTGAGGCAGCGAGGATTGAGGCTA ATTCAGAGAGGCTTAAGGAGCTTGAGAAGAAGGAGGAGGAGATTAAGGCTAGGCTCCAGGAATTAGCCAATAGGGAGAGC CAGATTAAGGCTAGGGAGGAGCAGGTTAATAAGTTGGCTGCTGAGTGGGAGAGGAAGGCTAAGGAACTCAGTGAGCTTGA GGCTAAGTTGAATAATTATAGGGATGAGTTAAATAAGAGGGAGAAGGAACTTGAGTCCATTAAGAATGAACTCGACGCCA GGAGAAGGGAGCTTGAGGGTAAGTTGGAGCCTCTAGTAACTAGGTTAACTGAGGAGGAGAGGAGGTTGGCTGAATGGGAG AGGAAGCTACTGGAGAGGGAGAGGGAGTTGATTAATTACCAGAGGACCCTTGTGGTTAGGGAGAGTATGCTCGTGGAGCT TAAGGAGAAGCTTGATGAGGAAGCTGAGCACTTAAAGAGGCAGCAGGCCGAGTTCGAGGAGATTAAAAGGAAGTACGAGG AATTGGTTAAACAGTGTCAGAGCCAGCAGAGGCAGTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases CATAAAGGTAAGTAACCCCAAGGCTCAGGGAACGTTCACCCTCAGGGTGGGAAGAGTTAATACGCGATAAGTTTAAAATA ATTAACAAGGCTTATAAAGT
Downstream 100 bases:
>100_bases AGCTTGGTGGTGTTGACTTATCAGTGAAGAGGGTGAGTGGGGTAGCTGAGGTTAATGATGGGGTACTGGTTAGTAGGCTT GTTGAGAGTGATGATGAGGT
Product: chromosome segregation ATPase-like protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 465; Mature: 464
Protein sequence:
>465_residues MSLFGGRKDQVSGVVQRIEQIALTVDNLNKQQQALMNEVSNVRGMLQGIGGEVSRLSKIVQDLSGIIRDIVSVQDKRIND ISELYQRFSQATDSYLNALSALLGRVEQLSKVMEDAANGLTARINELSKGLEGGLNMMSVIDGKLSDVSQRSSQLLDQFS KIEQVATRLQAASDEAISRQRELESRIIELANKESELKVREESLKRREEELSRIEATLEEEKRRVDAASKLMNDLSSLSN NMGSVISELVNRLSNYEKTLKDLQEREARLREQEINLKNLEARLQLEAARIEANSERLKELEKKEEEIKARLQELANRES QIKAREEQVNKLAAEWERKAKELSELEAKLNNYRDELNKREKELESIKNELDARRRELEGKLEPLVTRLTEEERRLAEWE RKLLERERELINYQRTLVVRESMLVELKEKLDEEAEHLKRQQAEFEEIKRKYEELVKQCQSQQRQ
Sequences:
>Translated_465_residues MSLFGGRKDQVSGVVQRIEQIALTVDNLNKQQQALMNEVSNVRGMLQGIGGEVSRLSKIVQDLSGIIRDIVSVQDKRIND ISELYQRFSQATDSYLNALSALLGRVEQLSKVMEDAANGLTARINELSKGLEGGLNMMSVIDGKLSDVSQRSSQLLDQFS KIEQVATRLQAASDEAISRQRELESRIIELANKESELKVREESLKRREEELSRIEATLEEEKRRVDAASKLMNDLSSLSN NMGSVISELVNRLSNYEKTLKDLQEREARLREQEINLKNLEARLQLEAARIEANSERLKELEKKEEEIKARLQELANRES QIKAREEQVNKLAAEWERKAKELSELEAKLNNYRDELNKREKELESIKNELDARRRELEGKLEPLVTRLTEEERRLAEWE RKLLERERELINYQRTLVVRESMLVELKEKLDEEAEHLKRQQAEFEEIKRKYEELVKQCQSQQRQ >Mature_464_residues SLFGGRKDQVSGVVQRIEQIALTVDNLNKQQQALMNEVSNVRGMLQGIGGEVSRLSKIVQDLSGIIRDIVSVQDKRINDI SELYQRFSQATDSYLNALSALLGRVEQLSKVMEDAANGLTARINELSKGLEGGLNMMSVIDGKLSDVSQRSSQLLDQFSK IEQVATRLQAASDEAISRQRELESRIIELANKESELKVREESLKRREEELSRIEATLEEEKRRVDAASKLMNDLSSLSNN MGSVISELVNRLSNYEKTLKDLQEREARLREQEINLKNLEARLQLEAARIEANSERLKELEKKEEEIKARLQELANRESQ IKAREEQVNKLAAEWERKAKELSELEAKLNNYRDELNKREKELESIKNELDARRRELEGKLEPLVTRLTEEERRLAEWER KLLERERELINYQRTLVVRESMLVELKEKLDEEAEHLKRQQAEFEEIKRKYEELVKQCQSQQRQ
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 53983; Mature: 53852
Theoretical pI: Translated: 5.04; Mature: 5.04
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSLFGGRKDQVSGVVQRIEQIALTVDNLNKQQQALMNEVSNVRGMLQGIGGEVSRLSKIV CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH QDLSGIIRDIVSVQDKRINDISELYQRFSQATDSYLNALSALLGRVEQLSKVMEDAANGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH TARINELSKGLEGGLNMMSVIDGKLSDVSQRSSQLLDQFSKIEQVATRLQAASDEAISRQ HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RELESRIIELANKESELKVREESLKRREEELSRIEATLEEEKRRVDAASKLMNDLSSLSN HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NMGSVISELVNRLSNYEKTLKDLQEREARLREQEINLKNLEARLQLEAARIEANSERLKE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH LEKKEEEIKARLQELANRESQIKAREEQVNKLAAEWERKAKELSELEAKLNNYRDELNKR HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EKELESIKNELDARRRELEGKLEPLVTRLTEEERRLAEWERKLLERERELINYQRTLVVR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ESMLVELKEKLDEEAEHLKRQQAEFEEIKRKYEELVKQCQSQQRQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure SLFGGRKDQVSGVVQRIEQIALTVDNLNKQQQALMNEVSNVRGMLQGIGGEVSRLSKIV CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH QDLSGIIRDIVSVQDKRINDISELYQRFSQATDSYLNALSALLGRVEQLSKVMEDAANGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH TARINELSKGLEGGLNMMSVIDGKLSDVSQRSSQLLDQFSKIEQVATRLQAASDEAISRQ HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RELESRIIELANKESELKVREESLKRREEELSRIEATLEEEKRRVDAASKLMNDLSSLSN HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NMGSVISELVNRLSNYEKTLKDLQEREARLREQEINLKNLEARLQLEAARIEANSERLKE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH LEKKEEEIKARLQELANRESQIKAREEQVNKLAAEWERKAKELSELEAKLNNYRDELNKR HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EKELESIKNELDARRRELEGKLEPLVTRLTEEERRLAEWERKLLERERELINYQRTLVVR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ESMLVELKEKLDEEAEHLKRQQAEFEEIKRKYEELVKQCQSQQRQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA