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Definition Caldivirga maquilingensis IC-167 chromosome, complete genome.
Accession NC_009954
Length 2,077,567

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The map label for this gene is 159040899

Identifier: 159040899

GI number: 159040899

Start: 350546

End: 351715

Strand: Reverse

Name: 159040899

Synonym: Cmaq_0313

Alternate gene names: NA

Gene position: 351715-350546 (Counterclockwise)

Preceding gene: 159040901

Following gene: 159040897

Centisome position: 16.93

GC content: 44.27

Gene sequence:

>1170_bases
GTGGATAAACTGAGATTATACGTACTAATTCAGAACCTGGCTAATGGTTTAACGCAACCATTCATGAGCTTTCTGGCGGT
TGCCAGCGGGGTACCTAATATTGGCTTAGGCTTAATTTCATCAGCCAACGGCTTCTTCGCAGGGGTGACTCAGCTACCAT
TAAGGAAACTCAGTGAACCTGTTAAGCTACTTAAGCTATCAACTGCATCATTAATCATCCTATGGTTATTAATGGCGTTC
ATCTCATACACTAATCCCATACTCTACGTGGTTACTTACCTATCCATTGCCGCCACTGGTGGTGTTTCCTCATACGCATG
GGCATTATTACTAGAGAGGGCAAGCAGAGGCTCTAGGGGTAGGGTTCTTGCTGAATACGGCTTCTTTGGGTCAATAGGTG
GTTTACTGGCTACGTTAACCGCTGGACTAGTGGTTAGGGGTAATTACGCCTTAGCTAAGTATGTTTTCATAACAGCTGCA
TTACTCATTGCCAGTAACTTCACTGTGGTGATGAGGCTGGATAACGTTAAGTATGATGGAGTGAATTCAAGTAACCTTAG
GCAGAGCATTAAGGGTATTGAGAATTTCCTGGGTGCAACATTCATATTCGCTGTTGTCTGGTCCTTCGCATGGCCAATAT
TCCCAGTGGCTCAATACTACGTATTCAGTATGACTACTGAGCAAGTCGCCATACTAAGCATAGTGGGTGGCGCATCAACG
TTAATACTACAGAGGCCTGTGGGTTCACTTGTGGATAAGCATAGGAGGATAATGATGTTCCTAGGTAGATTCCTCCTTAT
AACGTTCCCATTAATGTACGTGTTCAGCACCAGTGTCTATCAATTATTCATAATAAACGTGGTGTCTGGGTTCACTAACT
CAGTATCAAACACAGCCTACATGGCTTACCTCTTCGATAATTCAAGGGATAAGAAAAGCGCAATAACTATATATAATGCA
GTCTACGGTACTGGGACACTGGTTGGTTCACTCATAGGTAGTGCATCATTATCAGCAGTTGAATTAATGGTTGGGGTTAA
GGAGGCTGTGAAGTACCTCCTGTTGATTGATGCAGCCGCTAGGGCTGGAGCCGCTGTGGCTTACTTGAAGCTACCTGAGT
TTAAGCCAGCCAGTAGGGGTACTTTAACGGTCTCCGCTAGGACTAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGGTGTGAAATATGTGCGTAAATACCGTGAATGCTAGTATCATTCTTTAATTTAATGTATAGATAGGTTTAAATATTCA
ATGGTTAATACGGTTTAACC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCCATATTAAGTATAGTCCTCAGGTAGTTAAGCACCTCATCAACCGCAGCATCCCTATTAACGTAGCTTAACCTAATTAA
GCTACCTAGGTTTAAGTGTG

Product: major facilitator transporter

Products: NA

Alternate protein names: Facilitator Superfamily Protein; Facilitator Superfamily Permease

Number of amino acids: Translated: 389; Mature: 389

Protein sequence:

>389_residues
MDKLRLYVLIQNLANGLTQPFMSFLAVASGVPNIGLGLISSANGFFAGVTQLPLRKLSEPVKLLKLSTASLIILWLLMAF
ISYTNPILYVVTYLSIAATGGVSSYAWALLLERASRGSRGRVLAEYGFFGSIGGLLATLTAGLVVRGNYALAKYVFITAA
LLIASNFTVVMRLDNVKYDGVNSSNLRQSIKGIENFLGATFIFAVVWSFAWPIFPVAQYYVFSMTTEQVAILSIVGGAST
LILQRPVGSLVDKHRRIMMFLGRFLLITFPLMYVFSTSVYQLFIINVVSGFTNSVSNTAYMAYLFDNSRDKKSAITIYNA
VYGTGTLVGSLIGSASLSAVELMVGVKEAVKYLLLIDAAARAGAAVAYLKLPEFKPASRGTLTVSARTN

Sequences:

>Translated_389_residues
MDKLRLYVLIQNLANGLTQPFMSFLAVASGVPNIGLGLISSANGFFAGVTQLPLRKLSEPVKLLKLSTASLIILWLLMAF
ISYTNPILYVVTYLSIAATGGVSSYAWALLLERASRGSRGRVLAEYGFFGSIGGLLATLTAGLVVRGNYALAKYVFITAA
LLIASNFTVVMRLDNVKYDGVNSSNLRQSIKGIENFLGATFIFAVVWSFAWPIFPVAQYYVFSMTTEQVAILSIVGGAST
LILQRPVGSLVDKHRRIMMFLGRFLLITFPLMYVFSTSVYQLFIINVVSGFTNSVSNTAYMAYLFDNSRDKKSAITIYNA
VYGTGTLVGSLIGSASLSAVELMVGVKEAVKYLLLIDAAARAGAAVAYLKLPEFKPASRGTLTVSARTN
>Mature_389_residues
MDKLRLYVLIQNLANGLTQPFMSFLAVASGVPNIGLGLISSANGFFAGVTQLPLRKLSEPVKLLKLSTASLIILWLLMAF
ISYTNPILYVVTYLSIAATGGVSSYAWALLLERASRGSRGRVLAEYGFFGSIGGLLATLTAGLVVRGNYALAKYVFITAA
LLIASNFTVVMRLDNVKYDGVNSSNLRQSIKGIENFLGATFIFAVVWSFAWPIFPVAQYYVFSMTTEQVAILSIVGGAST
LILQRPVGSLVDKHRRIMMFLGRFLLITFPLMYVFSTSVYQLFIINVVSGFTNSVSNTAYMAYLFDNSRDKKSAITIYNA
VYGTGTLVGSLIGSASLSAVELMVGVKEAVKYLLLIDAAARAGAAVAYLKLPEFKPASRGTLTVSARTN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 42055; Mature: 42055

Theoretical pI: Translated: 10.29; Mature: 10.29

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDKLRLYVLIQNLANGLTQPFMSFLAVASGVPNIGLGLISSANGFFAGVTQLPLRKLSEP
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
VKLLKLSTASLIILWLLMAFISYTNPILYVVTYLSIAATGGVSSYAWALLLERASRGSRG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCC
RVLAEYGFFGSIGGLLATLTAGLVVRGNYALAKYVFITAALLIASNFTVVMRLDNVKYDG
CEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCEEECC
VNSSNLRQSIKGIENFLGATFIFAVVWSFAWPIFPVAQYYVFSMTTEQVAILSIVGGAST
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCHHHEEEEEEECCCHH
LILQRPVGSLVDKHRRIMMFLGRFLLITFPLMYVFSTSVYQLFIINVVSGFTNSVSNTAY
EEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE
MAYLFDNSRDKKSAITIYNAVYGTGTLVGSLIGSASLSAVELMVGVKEAVKYLLLIDAAA
EEEEECCCCCCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RAGAAVAYLKLPEFKPASRGTLTVSARTN
HCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCC
>Mature Secondary Structure
MDKLRLYVLIQNLANGLTQPFMSFLAVASGVPNIGLGLISSANGFFAGVTQLPLRKLSEP
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
VKLLKLSTASLIILWLLMAFISYTNPILYVVTYLSIAATGGVSSYAWALLLERASRGSRG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCC
RVLAEYGFFGSIGGLLATLTAGLVVRGNYALAKYVFITAALLIASNFTVVMRLDNVKYDG
CEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCEEECC
VNSSNLRQSIKGIENFLGATFIFAVVWSFAWPIFPVAQYYVFSMTTEQVAILSIVGGAST
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCHHHEEEEEEECCCHH
LILQRPVGSLVDKHRRIMMFLGRFLLITFPLMYVFSTSVYQLFIINVVSGFTNSVSNTAY
EEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE
MAYLFDNSRDKKSAITIYNAVYGTGTLVGSLIGSASLSAVELMVGVKEAVKYLLLIDAAA
EEEEECCCCCCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RAGAAVAYLKLPEFKPASRGTLTVSARTN
HCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA