Definition Acaryochloris marina MBIC11017 chromosome, complete genome.
Accession NC_009925
Length 6,503,724

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The map label for this gene is 158338111

Identifier: 158338111

GI number: 158338111

Start: 5047983

End: 5050766

Strand: Reverse

Name: 158338111

Synonym: AM1_5001

Alternate gene names: NA

Gene position: 5050766-5047983 (Counterclockwise)

Preceding gene: 158338112

Following gene: 158338105

Centisome position: 77.66

GC content: 48.38

Gene sequence:

>2784_bases
ATGATCAGTACCGTCAACAGAGCCTTGCTAAATTCTCGTCTAGACTCTGCCACTATACTCTCCGGTGGACAGATTATCGT
TGTTGTTTTAGCGGGTCTTTTATTCGGACTCGCTTTCCAGTTATTGCTGGCTAATTTTGGTATTGCCATTGGGTTATCCA
TATTTAACCTGAAACCCAACCCCCCAACTTCAGATAAGCCACCAGAACCTGAAGACGCTAGCTTTGGTAGTGTTGCGCTG
ATCGGTGTCGCAGCAGGCTTGGCCATTATGCTCTCCATTGATGGAGTGTTATTTGCGGCTTGTTATTTAGCAGTCAAACT
CAGTCAGGTAAGCGATCCATGGCTAGGGGCAATTTTAGGGGGCTTAGTTTGGGCCGTTTATCTGATTCTGCTCACTTGGT
TGAGCACATCAGCAGTGGGGACTATCGCCGATACGGTCTTGGGGTTTACTCGCGCAGGATTACGACGACTGTTTGCAGCC
GTCGGCCAACTCTTCAATCCCACATCATCAGACACAAGCTCTGCTGATGAAGATCCAGACGTGATAGGACATTCTAAGCT
AATCCAGGCTTTGGAGGACATGGACTTCTCTCCTGTATTTGAGAGCACTCTAGCTAAGCTGAAGTCTGAAACCCCCTCTA
AAGCAACCCATCTCTCGCAAATTGCAGAAGAGGTGATTGCCAATACGACAGAAAATCACACGATCGATTTGGGGCAGATC
GTAGAAGAGTTGCAAAATCGGCTAAACCTCCCTCAGCCCATACTGGAAGAACTTCAGCAGCAGCTTCAAAAGCTAACTCA
AGAGGTGGGAAACGACCCACACCCAGTTCCAGAACACCCTCAGCAATCGGCCCCTGTCACAGATCTCAAAAACTTTCTGC
AAACGGCAGATCCATCGGACTTACAATCCGAATCCTTATCCACGCAACTCGCCCCCTTAGAAACCTCCCATTCCTGGAGC
ACGTTACAGGATATTGATTTCAAAGGGCTACTTCGCACTGCTCTCCGACGAGTTGATTTATCGGACTGGGACGTACAGCG
AATTTGGCAGGTCCTGCAATCGACTCAGCAAAAACTGACGGGTTCATCTGAGTCCAAGCAACCGATCAATATTATCCAGT
TGGACGTTGAAGACTACCTATTAAACACACCCCCATGGAATCTGCAGCCGGACATTATTGAGGTTGACTTCAAAGATATT
CTTTATGACCCTGCAGCGGATCCATCACTTGTTCACCAACAGCTAATTCTCCTCACCCCCGATCAGATCCAGGAATTCCT
CCAGCAACGGCAGGATTTACCTGATCATCAACTGGCTAAAATTGCCAACGTGCTTAATCGGGTGCGCCTCAATATCTTGG
ATCAAGTACAGCCTTCTTCAGACCTGAAGCCGCCTGAACGGGAGCACCTCCATCAGATCCAACAAAAACTGGAGTCTTAT
TGCCGCTACACCACCCTGAGCAAATTGAGTCCAGAGGGGATTGAACAGAAACTGAAATCCTTAATTGAAGAGATTCCCAT
TCCAACTCCAATGCTGGCTTCCTATCCGCCAGACCTTGACGCTCTGCAAAAAATCTTGAAACGGCGTAAAGGTCTCCAAC
CCAAGAAACGAAAAGCACTATTAGCTGCAATCTCTGAAAACTGGCAACATCTTTTACCCGATTCGATTCAGCCAGCTCCA
CCATCTATTCACAAACGACTTAAGACCATCATTGCTGAGCAGTTGCAAGGGCCGGATGTTCAGTCCATAACCTTAGAAGA
CCTCAAGCCTCAACTGATGCAACTGATCGATCAACCGACATCTGGTTTAACTGTGTTCAACCAATATCTGGGACAACTGG
ACTGGATGTCACTGGCTCAGGAGTTACAAGACGAGTACGATCTTACCCCCCAAAATCTGAACTCAATCCTGGCGACCCTG
CAAGAAGAATGGCAGCAGATTGCCAAATTTCCTCGCCGTTGGGCTCGTCGGACGCAACGCACTGCTCAAGATTGGCAAGG
TCAGCTCCAACGCTATCTCAAATATCAGGATCGCGCTGCGCTTACAAAGATTGAATCTATAGAACAAGACTTGAAGTGCC
TTTTAGAGGAAGTCAATATGGGAAGTTCATCACCAAACCCATTCCCCCAGCTTCCTTGCCAGTCTGAAATCATTGCTCTA
CTCCAGGAGCGGAAAGATTTAACGGCTGCAGAAATGGAACAAATTTCATTGCAGCTTGCTTTAACTTGGGAAAAGCTAGG
AGAGGAAGCTCAATCTTTGCAGAAACAAGCCCAATCCTCTCTGGACACCGTAGCGACTAAGGTCCGAGAGATACTGAGTT
CGCTTCCCTATGCAGGGTCGATTCAACTCCAGGAAACGCTAAGTGATGCCCTACCCCATATCGAGGTTTCTCAGATCGGG
GACAGTCTTCAAGATTTTGCCCGAAAAGCACCCACTGAATTACTGACAGAATCCTCTTGGCAGCAGATTCGCGATCGCAT
CTCCGTACTGACCCAATCCACCTACCAACAAATCATCCATACCCGCGATGACTTAGAAGATACCGTCAAACACCAACTGT
CTGAACAGGCTGAAGCACTCCAGCAGCAACTCTTAGACCAAGTCGATCAACTGCAAACCGAGCTGCAACAGCAGGCCCGT
GAATTGAAACAAGACACCCAACGTCAGGCCGATAAAGTTCGTCAGTCCGCTGCGATCGCAGCTTGGTGGCTATTTGCCAT
TGCTCTCACCTCTGGCATAACTTCAGCCCTATCGGGCTACTGGGCCGTAAGGGGGTTTCGGTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATAGACATCATTCTTCAACAGGGTTTTAAGAATTTGCCCCTATCAGCTCAATCTTTCTAGGACCGAATGTTTCAGGACT
ATGCATTCTCTGGGAGGGCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCTTACTGCAGTAGCGCTGCAGGAATCGGTTGCCATCGGGCTGGGAGTTGCTGTTGTCGATTAACCACAGCTTGTTTACA
AGTCGCTAGCATCCGTTGGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 927; Mature: 927

Protein sequence:

>927_residues
MISTVNRALLNSRLDSATILSGGQIIVVVLAGLLFGLAFQLLLANFGIAIGLSIFNLKPNPPTSDKPPEPEDASFGSVAL
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ELKQDTQRQADKVRQSAAIAAWWLFAIALTSGITSALSGYWAVRGFR

Sequences:

>Translated_927_residues
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IGVAAGLAIMLSIDGVLFAACYLAVKLSQVSDPWLGAILGGLVWAVYLILLTWLSTSAVGTIADTVLGFTRAGLRRLFAA
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TLQDIDFKGLLRTALRRVDLSDWDVQRIWQVLQSTQQKLTGSSESKQPINIIQLDVEDYLLNTPPWNLQPDIIEVDFKDI
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ELKQDTQRQADKVRQSAAIAAWWLFAIALTSGITSALSGYWAVRGFR
>Mature_927_residues
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IGVAAGLAIMLSIDGVLFAACYLAVKLSQVSDPWLGAILGGLVWAVYLILLTWLSTSAVGTIADTVLGFTRAGLRRLFAA
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ELKQDTQRQADKVRQSAAIAAWWLFAIALTSGITSALSGYWAVRGFR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 103716; Mature: 103716

Theoretical pI: Translated: 4.60; Mature: 4.60

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
0.9 %Met     (Translated Protein)
1.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
0.9 %Met     (Mature Protein)
1.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MISTVNRALLNSRLDSATILSGGQIIVVVLAGLLFGLAFQLLLANFGIAIGLSIFNLKPN
CCCHHHHHHHHHCCCCHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCC
PPTSDKPPEPEDASFGSVALIGVAAGLAIMLSIDGVLFAACYLAVKLSQVSDPWLGAILG
CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
GLVWAVYLILLTWLSTSAVGTIADTVLGFTRAGLRRLFAAVGQLFNPTSSDTSSADEDPD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCH
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AWWLFAIALTSGITSALSGYWAVRGFR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
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CCCHHHHHHHHHCCCCHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCC
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AWWLFAIALTSGITSALSGYWAVRGFR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA