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The map label for this gene is yycG [H]

Identifier: 158334818

GI number: 158334818

Start: 1624770

End: 1629671

Strand: Reverse

Name: yycG [H]

Synonym: AM1_1654

Alternate gene names: 158334818

Gene position: 1629671-1624770 (Counterclockwise)

Preceding gene: 158334821

Following gene: 158334813

Centisome position: 25.06

GC content: 30.38

Gene sequence:

>4902_bases
TTGGAGATAGCTTGCCAGATTTCTAAAACTTTAAATGAAGTTCATTTGCAAGGTATTATTCATAAAGATATTAATCCTTC
GAATATTATTTATAATCCAAAAACTAATGAAGTTAAGTTGACCGACTTTAGTATAGCCGCAGAAAATACGCAAGAGAAAA
TAAGTATTGATGATGAAGAGATTATTAATGGGACTCCACTTTATTTATCTCCTGAACAAACTGGAAGAATAGATCGAACA
ATTGATTATCGCACTGACTTATATTCATTAGGAATTACTTTTTATGAGATTTTAACTGGTCGATTACCATTTTATTCTCA
TAAAGTCTCTGAGGTTATTCATATGCACTTATCTGTTATTCCTGATACTCCTCACAATATTTATGATTTTATCCCTGAAC
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CTAGAGCAATGTGTAAAAAACTTATCTATTAATAATACTGATTTTATTCTTAAAACGAGACAAAGTATAGCTATTAGTCA
ATTTAGTATCCCTAATAAATTATATGGCAGAGAAAATGAAATTAAGCTCCTAAATAATGCCTTTAAAAGTACTTTTATTG
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CTTGACTATTGCTATTAGAAAAATATTGCGAAGTAATAGTAATGATATAAATTACTGGAGAGAAAGATTTATCAGTTCTT
TAGGAAAGAATATTAATCTATTAGTTAATATTATTCCTGAACTTAATATAGTCTTACAAATTGATCAGATTGAGATTAGA
CAAGTTATTCCAGAATCACAAGCCATATTTATTCAGACACTAGAGACATTTATACAATCTTTTGGTAGCAAGAAGCATCC
TATAGTTTTATTCTTGGATGATTTGCAGTGGGCTGATTTTGCTTCTCTAGAGTTGCTTACTAGCCTAGCTAATAGTAAGC
AGAGTAAGTATATTTTATTTATACTAGCGTACCGTCATGTTGAAATAAGTAAATTACACCCTTTCAATAGAGTACTGAGT
GATTTAAATAAGAAAGATCTTATTAATCATAGTATTGAATTGCAGCCATTATCTTTATCTTCTGCAAAAGATCTTGTCGC
AGATACTCTTAATTGCGACCTTGAATATATTGATTTTTTAGCAAACCTTATATTTCAAAAGTCTGGTGGTAATCCGTTTT
TTCTTATTCAGCTATTAAAAACTTTATATCAAGATAAGTATATATATTTTGATTATGCTGTAGAAAAATGGAATTGGAAT
ATAGAACGAATATTGAAAAGTAGTATTACGGACTTTAGTGTTTTAGAACTACTATCTAGGAATATACAGAAATTACCTAA
ACAAACACAAGATTTAATTCAATATTGTTCATGTATAGGTAGTCAGTTTGATCTGATTACTCTTGCGGGTATTAGCCATA
AGACTAAATCAGAATTAACAGAGACTATGTTCGCTGCTATTGATTCTGGATTGATTGTCTCTACACAAGATTCTTATGAG
TCTAACTTACTTCTTGAAGATGACATTAAACCTCATTTTAATATATATTTTAGATTTGTACATGATTATATTCAACAAGC
TATTTATCTCAGTATACCTGAGTCTGAAAAAAGCTCTCTGCATTTATTGATTGGAGATTTTTTGTTGAGAAAATACAGAG
ATTCAGCTTTTGATAAAAAGCTATTTGAAATTATAAAGCATTTCAATAAAGGAATTCATCTTGTTGATGATTTAATTAAG
AAAAATGAGCTTGCTGAATTAAATTTTATAGCAGGTAATAAATCTAAATTAGCAGCAGCTTATGAATCAGCTTGTGAATA
TTATAAAACAGCATCAGTATTATCAAAAAAATATTGCTTAGAAAATTTTAATAACTCTAGTACAGAATTATATCTTTCAC
TTTTAGAGTGCTTATATATAAGCTCAGAAAGAAATCAAGCTGATTCATTAGCTATAAAATTAATTCATAATGCAAAATCT
TTGTCGATTAAAATTTCTGTCTATGAGTTGCAAATTGCTTTCTGTTTTACTCAGAATCAACCTTTGCAATCAATAGATAA
AGCAATTGAAGCATTAAATCTTTTAAATGTAAAACTTCCGAATAACCCTAACAAAATAGAGCTACTATTTAATGTATTAA
GAGCAAAAATATCACATCGAAATCTTACAATAGAGAGCTTAACAGAGTTACCAGTGATGAGTGATGAAAAAAGTCTTGCT
GCAATGCGGGTACTTATGACTGTTGTACCCGCAGCTTTTGTTGCTAGGCCTAATCTTTTTCCATTAGCTATATTAAAAAT
GGTAAATCTATCTATATCCTATGGTAATTCTCCAGTTTCTGGCTTTGCTTATAATAGTTATGGAACAATTTATAATGTTG
TTTTTAATGATATAGAAAAATGTTGTAGTTATAGCGATTTATCATTGCAGTTGCTTGAAAAGTTTTCTAGCTATGAGATA
AAACCAGCTATTTATTTAGTAGGCTATGCTTTTAATAAACCATGGAAGTATCAAATTAGAAGTTTATTAACCCATCTATC
TAATGCTTCTAATTACGCGTTAGAAATTGGTGATGTTGAAAATCTAGGTCATTGCTCTGCTTTTTATTGCATTTTATCTT
TTTTTAGCGGGAAACCTCTTTCCGAAGTTATTGACGAGAATTTTAAGTATATCGATATTTTGTCGAGTTATAAGCAATAC
TTTCAGTGTACCCATTTAAGCATTTGGGCACAAGTATCTGAGAATTATGTAGATACTAAACTAGATGTGAGCTTACTTGA
AGGTAGTTTTTTTAATGAAGAAGAGCAAAGCTCTGACATTCTTCATTCATCAAACGATTTAATAATTTTTCCTTTTTATT
TGGCAAAGATGATTTTATCTTTTTACTATAAAAAATTTGATGAGGCTTTGCATTTATCTAATCTTCTGAATGATCATATT
GATGGTGTAAACGGAATAATTTACATAGCAATTTATTATTTTTACTATTGTTTAACTTTATTGGCTTTGTGTAGTACGCA
AAAAATTATTGTCCGTCGCAAGTATTTAATTATAGTTAATCGCATTATTCATAGATTTAAAAAATGGGCTAAAGCTTGCC
CTGAGAATTTTAGCAATAAGTATTTTCTGATTAAAGCTGAGTATTATAGAGTTATAAATAATTTTAGTTCTTCTTCTAAA
TATTACGATAAAGCTATCGAATCTTCAAAATCTAATCTTTTCTTACAAGAGGAAGCTCTTGCCAATGAATTAGCAGCTGA
ATTTTATTTCAGCAATAAGAATTTTAAGATTTCTGCTTTATATTTCAAGGAATCTTGTTATGCCTATTTTAATTGGGGTG
CGTTATCAAAAATTGAAGATATCAAATATAGATATTCAAATATTAGTGAGGAATTTAAGCAAATTTTTACTTCATATCAG
AAAGATGGAAACAACGTAAAACTATCATCTTCAGAAACTCTGGGGAATATTGATTTAAGAACTGTCATAGAAACTTCTCA
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AAGCTTATTTAATATTATATAGAGATGAAAATTTATATATAGAGGCAACGGCTTCAATGAATAGTTCACCTATCGTTAAA
ATCAAAACAGAATTGATTAAGAATAGGAATGATATCCCTCATAGCATTTTAAACTATATCTTTAGGACTAAAGAAAATGT
CGTTATTAATGACACAAGAGAGGAGCATAAAGAAAACTATAATTTGGAAATATACTTTAATCTTCCAAAGTCTTTACTAG
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AATCATCTCGAGACCATTAGAATTCTTTGTGCCCAAGCTGCTATTTCCCTTGAGAATGCCTATTTATATGAAGATTTACA
GCAATCTCAAGCTAGAGAACAAGCTGAGCGAGAAATTAATGAATTGAAATCTCGCTTTATCTCGATGACTTCCCATGAAT
TCCGAACACCTTTAACAGCTATTTTAGGGACAACAGAGTTAATCAAGCATTATGGACAAGGGTGGGATACTAATAAGCAA
CATACTTATCTAGATCGTATCCAAAAGAATGTTAAGCATATGACTGGACTTCTAGATGATGTCTTAGTTTTGAGTAAAGC
TGATGTCAATAAAGTTGAGTTTAATCCTAAACTAATTAACCTTGAAGTTTTCTGCAGTAGTCTTGTCGAAGAATTTCAGC
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AGACAAATCCTCAGTAACTTATTGTCCAATGCCATTAAATATTCTCCTGAAAGTACTAGTGTTCGATTTCAGGTCAATGT
AAATGAAGAAGAAGCAACCTTTTTCATAAAAGATCAAGGAATTGGGATTCCTGAAGCTGATCAGCAGCATCTGTTTGAAT
CATTTCATCGCGCTACAAATGTTGGACAAATTCAAGGTACAGGACTAGGTCTCGCAATTGTTAAAAAGTCCGTCGAGCTG
CATCGGGGGACGATCGATTTTGAGAGTATTGCAGATCAAGGCACAACTTTTATTGTCAAGCTGCCGATTACTGCAGAAGC
ATTAGGCATTGAATCCCATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATAGCAAACAACAATAATTATGCGTTTATAAAAGAGTATTTTGAAGGATGTACACTGAAGGAATATATATCTAAAAATC
GCGTAAATATAAGGACTTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCTTGTGCTGCTTTTTCAAAGGCTAACGCTGCATCTATGGTTGCATCGACTTGGAAGAGTTGTTCTGCGATCGCAGGTGA
TACCGTAAACGTATCGAGGG

Product: serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1633; Mature: 1633

Protein sequence:

>1633_residues
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Sequences:

>Translated_1633_residues
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Specific function: Member of the two-component regulatory system YycG/YycF involved in the regulation of the ftsAZ operon, the yocH and ykvT, cwlO, lytE, ydjM, yjeA, yoeB genes and the tagAB and tagDEF operons. Probably phosphorylates YycF [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 PAS (PER-ARNT-SIM) domain [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI217330634, Length=113, Percent_Identity=33.6283185840708, Blast_Score=71, Evalue=1e-11,
Organism=Homo sapiens, GI150456432, Length=108, Percent_Identity=35.1851851851852, Blast_Score=70, Evalue=2e-11,
Organism=Homo sapiens, GI121114283, Length=162, Percent_Identity=30.2469135802469, Blast_Score=68, Evalue=9e-11,
Organism=Homo sapiens, GI299829210, Length=162, Percent_Identity=30.2469135802469, Blast_Score=68, Evalue=1e-10,
Organism=Escherichia coli, GI1786600, Length=240, Percent_Identity=29.5833333333333, Blast_Score=100, Evalue=5e-22,
Organism=Escherichia coli, GI145693157, Length=251, Percent_Identity=29.8804780876494, Blast_Score=100, Evalue=1e-21,
Organism=Escherichia coli, GI1786783, Length=225, Percent_Identity=29.7777777777778, Blast_Score=99, Evalue=2e-21,
Organism=Escherichia coli, GI1788713, Length=227, Percent_Identity=26.8722466960352, Blast_Score=98, Evalue=4e-21,
Organism=Escherichia coli, GI1786912, Length=293, Percent_Identity=26.6211604095563, Blast_Score=98, Evalue=4e-21,
Organism=Escherichia coli, GI1789149, Length=251, Percent_Identity=31.0756972111554, Blast_Score=96, Evalue=2e-20,
Organism=Escherichia coli, GI48994928, Length=247, Percent_Identity=29.9595141700405, Blast_Score=91, Evalue=6e-19,
Organism=Escherichia coli, GI1790346, Length=225, Percent_Identity=27.1111111111111, Blast_Score=87, Evalue=7e-18,
Organism=Escherichia coli, GI1788393, Length=231, Percent_Identity=27.2727272727273, Blast_Score=80, Evalue=1e-15,
Organism=Escherichia coli, GI1790861, Length=217, Percent_Identity=24.4239631336406, Blast_Score=80, Evalue=1e-15,
Organism=Escherichia coli, GI1788279, Length=220, Percent_Identity=28.1818181818182, Blast_Score=79, Evalue=2e-15,
Organism=Escherichia coli, GI1788549, Length=248, Percent_Identity=25.4032258064516, Blast_Score=74, Evalue=5e-14,
Organism=Escherichia coli, GI1789808, Length=237, Percent_Identity=23.6286919831224, Blast_Score=73, Evalue=2e-13,
Organism=Escherichia coli, GI1787894, Length=238, Percent_Identity=24.3697478991597, Blast_Score=72, Evalue=3e-13,
Organism=Escherichia coli, GI1789403, Length=236, Percent_Identity=29.6610169491525, Blast_Score=72, Evalue=3e-13,
Organism=Escherichia coli, GI87082128, Length=228, Percent_Identity=22.8070175438596, Blast_Score=67, Evalue=7e-12,
Organism=Escherichia coli, GI1790436, Length=308, Percent_Identity=25, Blast_Score=65, Evalue=5e-11,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI17570207, Length=138, Percent_Identity=35.5072463768116, Blast_Score=70, Evalue=1e-11,
Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6325107, Length=188, Percent_Identity=29.7872340425532, Blast_Score=68, Evalue=1e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003594
- InterPro:   IPR003660
- InterPro:   IPR001610
- InterPro:   IPR000014
- InterPro:   IPR000700
- InterPro:   IPR004358
- InterPro:   IPR003661
- InterPro:   IPR005467
- InterPro:   IPR009082 [H]

Pfam domain/function: PF00672 HAMP; PF02518 HATPase_c; PF00512 HisKA [H]

EC number: =2.7.13.3 [H]

Molecular weight: Translated: 187687; Mature: 187687

Theoretical pI: Translated: 6.16; Mature: 6.16

Prosite motif: PS50011 PROTEIN_KINASE_DOM ; PS50109 HIS_KIN ; PS00133 CARBOXYPEPT_ZN_2

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
0.8 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
0.8 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEIACQISKTLNEVHLQGIIHKDINPSNIIYNPKTNEVKLTDFSIAAENTQEKISIDDEE
CCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHH
IINGTPLYLSPEQTGRIDRTIDYRTDLYSLGITFYEILTGRLPFYSHKVSEVIHMHLSVI
HCCCCCEEECCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC
PDTPHNIYDFIPEQISQIIMRLLQKNAEDRYQNALELLVDLEQCVKNLSINNTDFILKTR
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEH
QSIAISQFSIPNKLYGRENEIKLLNNAFKSTFIGQKRIILVKGNAGVGKTSLIKSINKSN
HHHEEHHCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCC
SDHCGIEISGKFEQSHKNIPYYGFVQGLTIAIRKILRSNSNDINYWRERFISSLGKNINL
CCCCCEEEECCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEE
LVNIIPELNIVLQIDQIEIRQVIPESQAIFIQTLETFIQSFGSKKHPIVLFLDDLQWADF
EEEECCCCEEEEEECCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCH
ASLELLTSLANSKQSKYILFILAYRHVEISKLHPFNRVLSDLNKKDLINHSIELQPLSLS
HHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCEEHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHCCCEEEEECCCC
SAKDLVADTLNCDLEYIDFLANLIFQKSGGNPFFLIQLLKTLYQDKYIYFDYAVEKWNWN
CHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEECCCC
IERILKSSITDFSVLELLSRNIQKLPKQTQDLIQYCSCIGSQFDLITLAGISHKTKSELT
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHH
ETMFAAIDSGLIVSTQDSYESNLLLEDDIKPHFNIYFRFVHDYIQQAIYLSIPESEKSSL
HHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCE
HLLIGDFLLRKYRDSAFDKKLFEIIKHFNKGIHLVDDLIKKNELAELNFIAGNKSKLAAA
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHH
YESACEYYKTASVLSKKYCLENFNNSSTELYLSLLECLYISSERNQADSLAIKLIHNAKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHEEECCCE
LSIKISVYELQIAFCFTQNQPLQSIDKAIEALNLLNVKLPNNPNKIELLFNVLRAKISHR
EEEEEEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC
NLTIESLTELPVMSDEKSLAAMRVLMTVVPAAFVARPNLFPLAILKMVNLSISYGNSPVS
CCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCEEECCCCCCC
GFAYNSYGTIYNVVFNDIEKCCSYSDLSLQLLEKFSSYEIKPAIYLVGYAFNKPWKYQIR
CEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHH
SLLTHLSNASNYALEIGDVENLGHCSAFYCILSFFSGKPLSEVIDENFKYIDILSSYKQY
HHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
FQCTHLSIWAQVSENYVDTKLDVSLLEGSFFNEEEQSSDILHSSNDLIIFPFYLAKMILS
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHCCCCCCCHHHCCHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHH
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