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The map label for this gene is 157963076

Identifier: 157963076

GI number: 157963076

Start: 3996613

End: 3998196

Strand: Reverse

Name: 157963076

Synonym: Spea_3259

Alternate gene names: NA

Gene position: 3998196-3996613 (Counterclockwise)

Preceding gene: 157963080

Following gene: 157963075

Centisome position: 77.27

GC content: 50.32

Gene sequence:

>1584_bases
ATGAGTTTAGTTCAATATTCCGATTCCCTGCTGTCGGTGGTGCCACCACTGTTAGCCGTTATCCTCGCCATTACGACCCG
CCGTGTACTGCTATCCTTAGGGGTTGGTATTCTTGCCGGTGCCATACTGTTAAACAGCTATAATCCGCTGAATGCACTTC
ACTATCTGTTTAATATTGTCTCCGGGATCTTTTGGGCCGATGGCGCTATCAATAGCGGCAACGTCAATATGTTACTGTTT
ATGTTGCTGCTCGGTGGTTTGATCAGCCTGATGACGGCTACGGGGGCGACCAGAGCCTTTGCTGAGTGGGGAGTGCGTCG
TTGTAAAGACCGCCGCAGTGCCAATATGCTTACCGGCTTAATGGTCTTTGCCTTCTTTATCGATGACTTTTTTCACAGTT
TGTCAGTTGGCCCTATCTGCCGCCCGGTAACGGATAGATTCCAGATCTCGCGGGCAAAGCTGGCTTATCTGCTGGATTCA
ACTGCCGCGCCTGTGTGCGTCATCATGCCGATCTCCTCTTGGGGCGCATTTATCATTGCGATCTTAGGCGGTATTTTGGT
GACAAATGGTATTACCGATATCAGCCCTATTGCCATGTTTGTACAGATGATCCCAATGAACCTATATGCGGTGTTTACTC
TGTTAATGGTACTTGTCGTCATTGCTTTTCAGCTCGACATTGGCCCTATGCGTCAACATGAACGTTGGGCGCAAGAGGGC
AAGCTGTGGGATGAGTCTAAAGGACGCCCTAAAGGGCTTGAAATCACCACCGAGGGGCAAGGCCGTGGTGGCATGATTGA
TATGGTCTTACCTATTGCGACCTTAACCCTGTCGAGCATCTTCTTCATGGTGATGAGTGGCGCCGATGCCCTGTCGGCTA
AGGGCCAAGCGTTTAGCTTGATAGGCTCTCTTGAGCATACCGATGTGGGCTCGTCCTTGGTATATGCGGCGCTGTGTAGT
CTTGCCGTCTCTATCGTGCTCGCCCTGCGATTAAAGTTGCCAGCAAAAACATGGTTATCTGCAGCGCCACAAGGTGTTCA
GGCTATGATGCCTGCGATTATTATCCTGCTGTTTGCTTGGACAATTGGTACTGTGGTGAGCGATATGCAAACTGGCCAAT
ACTTAGCAGCGTTGACTAAGAGCAGCATTCCGGTTCAGCTTCTACCAGCCTTAGTGTTTGTTTTAGCATGCGGGATGTCA
TTTGCCACCGGTACTAGCTGGGGCACGTTTGGCATCATGTTGCCACTGGCTGGTGATATCGCTATTGCCAGTGACGCAAG
TCTATTAATGCCTATGCTTGCGGCGGTATTGGCTGGCTCTGTATTTGGTGACCATAGCTCACCTATATCGAGTACCAGTA
TCTTATCGGCGACAGGCGCGAGCTGTCATCATATGGACCATGTTATGACCCAGCTGCCCTATGCCGTTACGGTTGCCTTT
GGTGCCTTCCTCGGTTATCTGGCGATGGGCATCACTGGCTCAACCCTTGCCGGTATTGCGGTGAGTAGCCTATGGTTTAT
CGCGAACTGTGTATTCCATCTTCGTCGTCATAAAAGACAGCAAATGCTACCAGCTAATGCATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGGAGCGCTACCTAAAGGGGTAAGAAGTATTATTTCGACTGAAATCTGTTTCTCTATCCTTTTGGTAGATCTCCACCTAA
ATAATAGGTGTTACGAGATC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCAGTTACCGAGGGTTTAACGCGAAAAGTTAACCCAAAGAAAAGGCCCTTTACGGGCCTTTTTTATTTTCAGTGTCTTGT
CCTGAAATGTGTTTACACAT

Product: Na+/H+ antiporter NhaC

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 527; Mature: 526

Protein sequence:

>527_residues
MSLVQYSDSLLSVVPPLLAVILAITTRRVLLSLGVGILAGAILLNSYNPLNALHYLFNIVSGIFWADGAINSGNVNMLLF
MLLLGGLISLMTATGATRAFAEWGVRRCKDRRSANMLTGLMVFAFFIDDFFHSLSVGPICRPVTDRFQISRAKLAYLLDS
TAAPVCVIMPISSWGAFIIAILGGILVTNGITDISPIAMFVQMIPMNLYAVFTLLMVLVVIAFQLDIGPMRQHERWAQEG
KLWDESKGRPKGLEITTEGQGRGGMIDMVLPIATLTLSSIFFMVMSGADALSAKGQAFSLIGSLEHTDVGSSLVYAALCS
LAVSIVLALRLKLPAKTWLSAAPQGVQAMMPAIIILLFAWTIGTVVSDMQTGQYLAALTKSSIPVQLLPALVFVLACGMS
FATGTSWGTFGIMLPLAGDIAIASDASLLMPMLAAVLAGSVFGDHSSPISSTSILSATGASCHHMDHVMTQLPYAVTVAF
GAFLGYLAMGITGSTLAGIAVSSLWFIANCVFHLRRHKRQQMLPANA

Sequences:

>Translated_527_residues
MSLVQYSDSLLSVVPPLLAVILAITTRRVLLSLGVGILAGAILLNSYNPLNALHYLFNIVSGIFWADGAINSGNVNMLLF
MLLLGGLISLMTATGATRAFAEWGVRRCKDRRSANMLTGLMVFAFFIDDFFHSLSVGPICRPVTDRFQISRAKLAYLLDS
TAAPVCVIMPISSWGAFIIAILGGILVTNGITDISPIAMFVQMIPMNLYAVFTLLMVLVVIAFQLDIGPMRQHERWAQEG
KLWDESKGRPKGLEITTEGQGRGGMIDMVLPIATLTLSSIFFMVMSGADALSAKGQAFSLIGSLEHTDVGSSLVYAALCS
LAVSIVLALRLKLPAKTWLSAAPQGVQAMMPAIIILLFAWTIGTVVSDMQTGQYLAALTKSSIPVQLLPALVFVLACGMS
FATGTSWGTFGIMLPLAGDIAIASDASLLMPMLAAVLAGSVFGDHSSPISSTSILSATGASCHHMDHVMTQLPYAVTVAF
GAFLGYLAMGITGSTLAGIAVSSLWFIANCVFHLRRHKRQQMLPANA
>Mature_526_residues
SLVQYSDSLLSVVPPLLAVILAITTRRVLLSLGVGILAGAILLNSYNPLNALHYLFNIVSGIFWADGAINSGNVNMLLFM
LLLGGLISLMTATGATRAFAEWGVRRCKDRRSANMLTGLMVFAFFIDDFFHSLSVGPICRPVTDRFQISRAKLAYLLDST
AAPVCVIMPISSWGAFIIAILGGILVTNGITDISPIAMFVQMIPMNLYAVFTLLMVLVVIAFQLDIGPMRQHERWAQEGK
LWDESKGRPKGLEITTEGQGRGGMIDMVLPIATLTLSSIFFMVMSGADALSAKGQAFSLIGSLEHTDVGSSLVYAALCSL
AVSIVLALRLKLPAKTWLSAAPQGVQAMMPAIIILLFAWTIGTVVSDMQTGQYLAALTKSSIPVQLLPALVFVLACGMSF
ATGTSWGTFGIMLPLAGDIAIASDASLLMPMLAAVLAGSVFGDHSSPISSTSILSATGASCHHMDHVMTQLPYAVTVAFG
AFLGYLAMGITGSTLAGIAVSSLWFIANCVFHLRRHKRQQMLPANA

Specific function: Unknown

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56101; Mature: 55970

Theoretical pI: Translated: 8.29; Mature: 8.29

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
5.1 %Met     (Translated Protein)
6.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
4.9 %Met     (Mature Protein)
6.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSLVQYSDSLLSVVPPLLAVILAITTRRVLLSLGVGILAGAILLNSYNPLNALHYLFNIV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
SGIFWADGAINSGNVNMLLFMLLLGGLISLMTATGATRAFAEWGVRRCKDRRSANMLTGL
HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MVFAFFIDDFFHSLSVGPICRPVTDRFQISRAKLAYLLDSTAAPVCVIMPISSWGAFIIA
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECHHHHHHHHH
ILGGILVTNGITDISPIAMFVQMIPMNLYAVFTLLMVLVVIAFQLDIGPMRQHERWAQEG
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHC
KLWDESKGRPKGLEITTEGQGRGGMIDMVLPIATLTLSSIFFMVMSGADALSAKGQAFSL
CCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCHHHH
IGSLEHTDVGSSLVYAALCSLAVSIVLALRLKLPAKTWLSAAPQGVQAMMPAIIILLFAW
HHCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
TIGTVVSDMQTGQYLAALTKSSIPVQLLPALVFVLACGMSFATGTSWGTFGIMLPLAGDI
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCE
AIASDASLLMPMLAAVLAGSVFGDHSSPISSTSILSATGASCHHMDHVMTQLPYAVTVAF
EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
GAFLGYLAMGITGSTLAGIAVSSLWFIANCVFHLRRHKRQQMLPANA
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SLVQYSDSLLSVVPPLLAVILAITTRRVLLSLGVGILAGAILLNSYNPLNALHYLFNIV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
SGIFWADGAINSGNVNMLLFMLLLGGLISLMTATGATRAFAEWGVRRCKDRRSANMLTGL
HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MVFAFFIDDFFHSLSVGPICRPVTDRFQISRAKLAYLLDSTAAPVCVIMPISSWGAFIIA
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECHHHHHHHHH
ILGGILVTNGITDISPIAMFVQMIPMNLYAVFTLLMVLVVIAFQLDIGPMRQHERWAQEG
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHC
KLWDESKGRPKGLEITTEGQGRGGMIDMVLPIATLTLSSIFFMVMSGADALSAKGQAFSL
CCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCHHHH
IGSLEHTDVGSSLVYAALCSLAVSIVLALRLKLPAKTWLSAAPQGVQAMMPAIIILLFAW
HHCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
TIGTVVSDMQTGQYLAALTKSSIPVQLLPALVFVLACGMSFATGTSWGTFGIMLPLAGDI
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCE
AIASDASLLMPMLAAVLAGSVFGDHSSPISSTSILSATGASCHHMDHVMTQLPYAVTVAF
EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
GAFLGYLAMGITGSTLAGIAVSSLWFIANCVFHLRRHKRQQMLPANA
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]