Definition Shewanella pealeana ATCC 700345 chromosome, complete genome.
Accession NC_009901
Length 5,174,581

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The map label for this gene is 157961237

Identifier: 157961237

GI number: 157961237

Start: 1712484

End: 1713719

Strand: Direct

Name: 157961237

Synonym: Spea_1410

Alternate gene names: NA

Gene position: 1712484-1713719 (Clockwise)

Preceding gene: 157961236

Following gene: 157961238

Centisome position: 33.09

GC content: 32.36

Gene sequence:

>1236_bases
ATGGTTTTTGACATGTTATTTAAAGCTTTAGTGTTTCTTTTTCTGATGTACAACATTAAGTTTACATTTTTAAGCGGTAT
TGGCTCTTCTTACATTGCTTTATTATTTCTTTTGGTTCTAGTGATTCTTCGTGGAAAACTAGTGAACTTGGAACTTTTAG
CTTTAGGTGCTGCTACTGGGTTATGCTTTCTTTCTATCAGCATGTTTTCATTACTTCATCCATCTTCAGACTTTGGTTTG
ATAAAGTTCTCTATTATTGCTTTTATCTCAATAGCTATCAGTGGAGCTGTGTTCAAAAGTTTTTTTTATTCTAGGCCAAT
TGAATTGTTTGGGGTTTTTGGGCTTGCAGGTTTAATTAATGCTTTTTTGATTATATTAATGTCACTATCTTCAACTTTTC
AGGATTTATATTTATCACTTCTGATCGTCGAGGCGGAAGAGTTATATGGTGATGGTATTTCTGATGGTTTCTTTTCCCTT
AGAATGGTCGGTAGTACCGGGTTTGCAACTTATTCAACTGCTTTTACGCAGTGTGTTTGTGTATTTTCTTATTATATTTA
TGTAAGTTATTGCTCTAGTGTGAATAACACAAAGATTAGTGTTTATAACTATCTGGCTATGACGGTAGTTCTCATATCTG
CTGTAATAGCTGCTAGGACAGCATTTGTTGGTATTGCCATTCTTTTTGTAATGATGATGTTCGATGTAAAAAATAGAAGA
GGGAATCTTTTATTTTTGTTTGTTTGTGTCTTAATATTTACCGTGATCATTAGTGTTGTATCCTTTTATTTTTCTTCTGA
GCGAACCGATTTTTTCGTTAATTGGGTGACTGAGGTTTTTTATAAAGGTTTACAAGTTGGCTCTGTTCAAAAAATGGGCG
GGATGTTTCATTTTTCTTATTATGATTTTTCTATATTAGGTGAGTCCAAATTAAACAATCCCGCTGGTGGGTATTACATG
GGAGTTGATATTGGATATTTGAGGGTTCTTTTTTCAGCTGGTTATTTTGGAACTTTATTAATAGCTTTGTTGTTTATTAC
TTCCGTAAGGATTTATAACTTTGACCGAATATATATTGTTTATACATTTTTTCTGTTTGCTATTATTTTAGTTTTTATGA
TTAAAGGGCTTATTATCTTTGATGCCTTTTATATTTTGTTATATGTTGGCTTGATGAGTCATGCTTTTAAAGCACTTAGT
GCTACTGGTTTTAGGAGAGGACACCTTGAGAGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTCCCCGGTTGCATGTTGCAATAGTTATCTTAATTCTGTTGGCTTGTCGTGATTGGTTTCTATCGCTTTAATCTTCTGAG
TTTCTGTTGTTTGACTATTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAACCGTCCGTTAGTTTCTGTTGTTTTACTTAGTTATAATTCAAGTAGTACTATACTTGATACATTAAATAGTGTTGTAA
ATCAATCTTACGGTGCTTGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 411; Mature: 411

Protein sequence:

>411_residues
MVFDMLFKALVFLFLMYNIKFTFLSGIGSSYIALLFLLVLVILRGKLVNLELLALGAATGLCFLSISMFSLLHPSSDFGL
IKFSIIAFISIAISGAVFKSFFYSRPIELFGVFGLAGLINAFLIILMSLSSTFQDLYLSLLIVEAEELYGDGISDGFFSL
RMVGSTGFATYSTAFTQCVCVFSYYIYVSYCSSVNNTKISVYNYLAMTVVLISAVIAARTAFVGIAILFVMMMFDVKNRR
GNLLFLFVCVLIFTVIISVVSFYFSSERTDFFVNWVTEVFYKGLQVGSVQKMGGMFHFSYYDFSILGESKLNNPAGGYYM
GVDIGYLRVLFSAGYFGTLLIALLFITSVRIYNFDRIYIVYTFFLFAIILVFMIKGLIIFDAFYILLYVGLMSHAFKALS
ATGFRRGHLES

Sequences:

>Translated_411_residues
MVFDMLFKALVFLFLMYNIKFTFLSGIGSSYIALLFLLVLVILRGKLVNLELLALGAATGLCFLSISMFSLLHPSSDFGL
IKFSIIAFISIAISGAVFKSFFYSRPIELFGVFGLAGLINAFLIILMSLSSTFQDLYLSLLIVEAEELYGDGISDGFFSL
RMVGSTGFATYSTAFTQCVCVFSYYIYVSYCSSVNNTKISVYNYLAMTVVLISAVIAARTAFVGIAILFVMMMFDVKNRR
GNLLFLFVCVLIFTVIISVVSFYFSSERTDFFVNWVTEVFYKGLQVGSVQKMGGMFHFSYYDFSILGESKLNNPAGGYYM
GVDIGYLRVLFSAGYFGTLLIALLFITSVRIYNFDRIYIVYTFFLFAIILVFMIKGLIIFDAFYILLYVGLMSHAFKALS
ATGFRRGHLES
>Mature_411_residues
MVFDMLFKALVFLFLMYNIKFTFLSGIGSSYIALLFLLVLVILRGKLVNLELLALGAATGLCFLSISMFSLLHPSSDFGL
IKFSIIAFISIAISGAVFKSFFYSRPIELFGVFGLAGLINAFLIILMSLSSTFQDLYLSLLIVEAEELYGDGISDGFFSL
RMVGSTGFATYSTAFTQCVCVFSYYIYVSYCSSVNNTKISVYNYLAMTVVLISAVIAARTAFVGIAILFVMMMFDVKNRR
GNLLFLFVCVLIFTVIISVVSFYFSSERTDFFVNWVTEVFYKGLQVGSVQKMGGMFHFSYYDFSILGESKLNNPAGGYYM
GVDIGYLRVLFSAGYFGTLLIALLFITSVRIYNFDRIYIVYTFFLFAIILVFMIKGLIIFDAFYILLYVGLMSHAFKALS
ATGFRRGHLES

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 46067; Mature: 46067

Theoretical pI: Translated: 8.58; Mature: 8.58

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
3.6 %Met     (Translated Protein)
4.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
3.6 %Met     (Mature Protein)
4.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVFDMLFKALVFLFLMYNIKFTFLSGIGSSYIALLFLLVLVILRGKLVNLELLALGAATG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
LCFLSISMFSLLHPSSDFGLIKFSIIAFISIAISGAVFKSFFYSRPIELFGVFGLAGLIN
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
AFLIILMSLSSTFQDLYLSLLIVEAEELYGDGISDGFFSLRMVGSTGFATYSTAFTQCVC
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHH
VFSYYIYVSYCSSVNNTKISVYNYLAMTVVLISAVIAARTAFVGIAILFVMMMFDVKNRR
HHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
GNLLFLFVCVLIFTVIISVVSFYFSSERTDFFVNWVTEVFYKGLQVGSVQKMGGMFHFSY
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCEEEEEE
YDFSILGESKLNNPAGGYYMGVDIGYLRVLFSAGYFGTLLIALLFITSVRIYNFDRIYIV
EEEEEECCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
YTFFLFAIILVFMIKGLIIFDAFYILLYVGLMSHAFKALSATGFRRGHLES
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MVFDMLFKALVFLFLMYNIKFTFLSGIGSSYIALLFLLVLVILRGKLVNLELLALGAATG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
LCFLSISMFSLLHPSSDFGLIKFSIIAFISIAISGAVFKSFFYSRPIELFGVFGLAGLIN
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
AFLIILMSLSSTFQDLYLSLLIVEAEELYGDGISDGFFSLRMVGSTGFATYSTAFTQCVC
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHH
VFSYYIYVSYCSSVNNTKISVYNYLAMTVVLISAVIAARTAFVGIAILFVMMMFDVKNRR
HHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
GNLLFLFVCVLIFTVIISVVSFYFSSERTDFFVNWVTEVFYKGLQVGSVQKMGGMFHFSY
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCEEEEEE
YDFSILGESKLNNPAGGYYMGVDIGYLRVLFSAGYFGTLLIALLFITSVRIYNFDRIYIV
EEEEEECCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
YTFFLFAIILVFMIKGLIIFDAFYILLYVGLMSHAFKALSATGFRRGHLES
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA