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The map label for this gene is yhjK [C]

Identifier: 157960191

GI number: 157960191

Start: 417531

End: 419450

Strand: Reverse

Name: yhjK [C]

Synonym: Spea_0362

Alternate gene names: 157960191

Gene position: 419450-417531 (Counterclockwise)

Preceding gene: 157960192

Following gene: 157960190

Centisome position: 8.11

GC content: 45.1

Gene sequence:

>1920_bases
ATGACACTGTTTCGACAGATATACACACTACTGTTTGTACTGTTCTTGTTGGTTGTTGCGAGTTTAGGTTATGTACAATT
TACCGAAACTCAAAGCTTCCTAACTAAACAAATGGAATCCGATCTCAACAATACCAGCCACTCACTCGGTATTATGTTGG
TCCCCGATTTAGAAGCGGGTGATATTGTAGGTGCAGAAACCCTGATCAATGTGATTTTTGAGGGTGGCTACTACCAGCAA
GTCAAACTCACCTGGTTAGTTGATGGCAAACAACAGGTGTGGGAAAACCCGATGAAAATCGAAGGGGTTCCCCAGTGGTT
TATCGACTTAGGGCTATTCAAAACTATTAAACGCGAGAGCACCATCACCTCAGGCTGGATCCAACTCGCTCGCCTTGAGA
TCACCGCTCACCCAGGTTTCGGCTATCACGAACTCTGGCGTACCATGACCAATGCCATCATAGTCTTTTCAATCCTATTT
CTGATTGCCATTATTTTTGCCCGAGTCGGTTTAACTTGGATTTTAAAACCACTGCACGATATTGCAGAACATGCCACAGA
GATCGCCAATCGCAAATTTGGTCCCGACATGACAGTGCCCAAGACCATTGAGTTAAAATCTGTGGTACAGGCTTTCAACA
GCATGTCCGATCAACTCAAGCAGATCTTTAATTCACTCGATGAAGAAGTTGGCGAGCTGAGAAAGAAAAACCTTGTCGAC
CAAGTCTCTGGCCTACCAAACCGCCAATACATGATGGGACGGTTAAACAGTTGGCTAAGTGAGCCCAAGAGTGGCGCACT
CATGATGGCAAAATTTGACTGGCTAGAAGAAGTACACAGCAAGTATGGCTACCAAGTCCGCGATGAAACCATCAAGTTGC
TATCGGATAAAATGAAGCAGCATTTAGATGGTGTAACCACCTCTGTTATTGCCCGTATTGCCGCATATGAATTTGCTTTC
TTGATCACCAGTTCTGAGCATGAGCAGACCAGTAAATACCTGCAAACCCTGATCCGTACCATTAATCAAGAGATCTCCAA
GGCAGGCTGTAAGCCAAACGAACACTTTGCGATTGGTATTGCCGAGCGTATCGGTCAGATGACAGTCACTGATATTTTGG
CACAAGCCGATAATGCCCTGCAGAAGTCTCTGCAAGAGAATAAAGTTTTCCATTGGTTTGAGACCAGTGAGAAGCAGCTA
TTCACTCGAGAGCAGTGGCGCGAGCATCTAAGCCATGCAATTACCGACGGTCAATTCAAGTTTAAGTGGCAACCCATTTT
GCTCAATCAAACTGAGTCTGTTTTACAGCGAGAGCTATATTGCCAGTTGGAGATCGACGGCAAGATGGTGCATGCGGGTC
AGTTCATGCCCTATGTCGAACTGCTCTCTTTAGGAAGCCTGCTAGATAAATGCCTAATTAAGACTATTCATAATAAGAAA
CTATTAGATAGAAACTTCGAACCTGTCGCCATTAACTTAACTTTCCAGAGTATTGGCGATATCGAGTTCCATCAATGGCT
CGATAAGTTCCTACGTTCTTCAACACTACGAGAGCGGATCTGTTTTGATATTCCCGAAGCCGCTGTTTACAGTAACCCTG
AAGCCTGTCAGGCCATATGTGCCATCATTCGTGATAACGGTGCCCACTTCGGTATTGACCACTTTGGCCGCCAATTTGGC
TCAATGGCCTACTTGCAGAACATACGCCCGAGCTATGTGAAGCTTGATCAATCCTTCGCTTACTACGATGAAGATGCTCA
CAGCAGCGAGCTATGCCGAGCGTTGATTAATGTCGCCAAAGGTTTAGATATCGAGATCATAGCTACTGGCATAGAGGAAG
AAGCACAGCTAAAACGTTTCATACCATTAAAGACCAATGCGTATATGGGCTTTATCTCCCCGCCTACCGCAATTGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCGGGTTCTTCATCAAAACTTGCTAAATGGAATGACCTGCAACATCGCTTGGGTGTTGAGCGCCTTAACCAACCCAAGAT
AAAACTGGAGTAGTTAGAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGTCGATAGTTAAGACGAATTAGTTAAAGCTGAAACAAACAAAGGCCTCTCAGAGGCCTTTTTTATTTTTAGGATAGGAA
AAGCAAAGAAGGCCCTAGGC

Product: diguanylate cyclase/phosphodiesterase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 639; Mature: 638

Protein sequence:

>639_residues
MTLFRQIYTLLFVLFLLVVASLGYVQFTETQSFLTKQMESDLNNTSHSLGIMLVPDLEAGDIVGAETLINVIFEGGYYQQ
VKLTWLVDGKQQVWENPMKIEGVPQWFIDLGLFKTIKRESTITSGWIQLARLEITAHPGFGYHELWRTMTNAIIVFSILF
LIAIIFARVGLTWILKPLHDIAEHATEIANRKFGPDMTVPKTIELKSVVQAFNSMSDQLKQIFNSLDEEVGELRKKNLVD
QVSGLPNRQYMMGRLNSWLSEPKSGALMMAKFDWLEEVHSKYGYQVRDETIKLLSDKMKQHLDGVTTSVIARIAAYEFAF
LITSSEHEQTSKYLQTLIRTINQEISKAGCKPNEHFAIGIAERIGQMTVTDILAQADNALQKSLQENKVFHWFETSEKQL
FTREQWREHLSHAITDGQFKFKWQPILLNQTESVLQRELYCQLEIDGKMVHAGQFMPYVELLSLGSLLDKCLIKTIHNKK
LLDRNFEPVAINLTFQSIGDIEFHQWLDKFLRSSTLRERICFDIPEAAVYSNPEACQAICAIIRDNGAHFGIDHFGRQFG
SMAYLQNIRPSYVKLDQSFAYYDEDAHSSELCRALINVAKGLDIEIIATGIEEEAQLKRFIPLKTNAYMGFISPPTAIE

Sequences:

>Translated_639_residues
MTLFRQIYTLLFVLFLLVVASLGYVQFTETQSFLTKQMESDLNNTSHSLGIMLVPDLEAGDIVGAETLINVIFEGGYYQQ
VKLTWLVDGKQQVWENPMKIEGVPQWFIDLGLFKTIKRESTITSGWIQLARLEITAHPGFGYHELWRTMTNAIIVFSILF
LIAIIFARVGLTWILKPLHDIAEHATEIANRKFGPDMTVPKTIELKSVVQAFNSMSDQLKQIFNSLDEEVGELRKKNLVD
QVSGLPNRQYMMGRLNSWLSEPKSGALMMAKFDWLEEVHSKYGYQVRDETIKLLSDKMKQHLDGVTTSVIARIAAYEFAF
LITSSEHEQTSKYLQTLIRTINQEISKAGCKPNEHFAIGIAERIGQMTVTDILAQADNALQKSLQENKVFHWFETSEKQL
FTREQWREHLSHAITDGQFKFKWQPILLNQTESVLQRELYCQLEIDGKMVHAGQFMPYVELLSLGSLLDKCLIKTIHNKK
LLDRNFEPVAINLTFQSIGDIEFHQWLDKFLRSSTLRERICFDIPEAAVYSNPEACQAICAIIRDNGAHFGIDHFGRQFG
SMAYLQNIRPSYVKLDQSFAYYDEDAHSSELCRALINVAKGLDIEIIATGIEEEAQLKRFIPLKTNAYMGFISPPTAIE
>Mature_638_residues
TLFRQIYTLLFVLFLLVVASLGYVQFTETQSFLTKQMESDLNNTSHSLGIMLVPDLEAGDIVGAETLINVIFEGGYYQQV
KLTWLVDGKQQVWENPMKIEGVPQWFIDLGLFKTIKRESTITSGWIQLARLEITAHPGFGYHELWRTMTNAIIVFSILFL
IAIIFARVGLTWILKPLHDIAEHATEIANRKFGPDMTVPKTIELKSVVQAFNSMSDQLKQIFNSLDEEVGELRKKNLVDQ
VSGLPNRQYMMGRLNSWLSEPKSGALMMAKFDWLEEVHSKYGYQVRDETIKLLSDKMKQHLDGVTTSVIARIAAYEFAFL
ITSSEHEQTSKYLQTLIRTINQEISKAGCKPNEHFAIGIAERIGQMTVTDILAQADNALQKSLQENKVFHWFETSEKQLF
TREQWREHLSHAITDGQFKFKWQPILLNQTESVLQRELYCQLEIDGKMVHAGQFMPYVELLSLGSLLDKCLIKTIHNKKL
LDRNFEPVAINLTFQSIGDIEFHQWLDKFLRSSTLRERICFDIPEAAVYSNPEACQAICAIIRDNGAHFGIDHFGRQFGS
MAYLQNIRPSYVKLDQSFAYYDEDAHSSELCRALINVAKGLDIEIIATGIEEEAQLKRFIPLKTNAYMGFISPPTAIE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 MHYT domain [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI226510982, Length=494, Percent_Identity=20.8502024291498, Blast_Score=77, Evalue=3e-15,
Organism=Escherichia coli, GI1789650, Length=501, Percent_Identity=20.7584830339321, Blast_Score=72, Evalue=2e-13,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001054
- InterPro:   IPR000160
- InterPro:   IPR001633
- InterPro:   IPR005330 [H]

Pfam domain/function: PF00563 EAL; PF00990 GGDEF; PF03707 MHYT [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 73093; Mature: 72962

Theoretical pI: Translated: 6.05; Mature: 6.05

Prosite motif: PS50885 HAMP ; PS50883 EAL ; PS50887 GGDEF

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTLFRQIYTLLFVLFLLVVASLGYVQFTETQSFLTKQMESDLNNTSHSLGIMLVPDLEAG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCC
DIVGAETLINVIFEGGYYQQVKLTWLVDGKQQVWENPMKIEGVPQWFIDLGLFKTIKRES
CCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEECCHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHC
TITSGWIQLARLEITAHPGFGYHELWRTMTNAIIVFSILFLIAIIFARVGLTWILKPLHD
CHHHHHHEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAEHATEIANRKFGPDMTVPKTIELKSVVQAFNSMSDQLKQIFNSLDEEVGELRKKNLVD
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QVSGLPNRQYMMGRLNSWLSEPKSGALMMAKFDWLEEVHSKYGYQVRDETIKLLSDKMKQ
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
HLDGVTTSVIARIAAYEFAFLITSSEHEQTSKYLQTLIRTINQEISKAGCKPNEHFAIGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEH
AERIGQMTVTDILAQADNALQKSLQENKVFHWFETSEKQLFTREQWREHLSHAITDGQFK
HHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
FKWQPILLNQTESVLQRELYCQLEIDGKMVHAGQFMPYVELLSLGSLLDKCLIKTIHNKK
EEEEEEEECCHHHHHHHHHEEEEEECCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH
LLDRNFEPVAINLTFQSIGDIEFHQWLDKFLRSSTLRERICFDIPEAAVYSNPEACQAIC
HHCCCCCCEEEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCHHHHHHHH
AIIRDNGAHFGIDHFGRQFGSMAYLQNIRPSYVKLDQSFAYYDEDAHSSELCRALINVAK
HHHHCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHC
GLDIEIIATGIEEEAQLKRFIPLKTNAYMGFISPPTAIE
CCCEEEEEECCCHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
TLFRQIYTLLFVLFLLVVASLGYVQFTETQSFLTKQMESDLNNTSHSLGIMLVPDLEAG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCC
DIVGAETLINVIFEGGYYQQVKLTWLVDGKQQVWENPMKIEGVPQWFIDLGLFKTIKRES
CCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEECCHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHC
TITSGWIQLARLEITAHPGFGYHELWRTMTNAIIVFSILFLIAIIFARVGLTWILKPLHD
CHHHHHHEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAEHATEIANRKFGPDMTVPKTIELKSVVQAFNSMSDQLKQIFNSLDEEVGELRKKNLVD
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HHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
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AERIGQMTVTDILAQADNALQKSLQENKVFHWFETSEKQLFTREQWREHLSHAITDGQFK
HHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
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EEEEEEEECCHHHHHHHHHEEEEEECCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH
LLDRNFEPVAINLTFQSIGDIEFHQWLDKFLRSSTLRERICFDIPEAAVYSNPEACQAIC
HHCCCCCCEEEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCHHHHHHHH
AIIRDNGAHFGIDHFGRQFGSMAYLQNIRPSYVKLDQSFAYYDEDAHSSELCRALINVAK
HHHHCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHC
GLDIEIIATGIEEEAQLKRFIPLKTNAYMGFISPPTAIE
CCCEEEEEECCCHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 10984043 [H]