Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 157960143

Identifier: 157960143

GI number: 157960143

Start: 351180

End: 352661

Strand: Direct

Name: 157960143

Synonym: Spea_0314

Alternate gene names: NA

Gene position: 351180-352661 (Clockwise)

Preceding gene: 157960141

Following gene: 157960145

Centisome position: 6.79

GC content: 48.31

Gene sequence:

>1482_bases
ATGTTCGGTAATTGTCTGGTACTCATTCCGCTTCTGTTGACGCTGACTTTGGCTCTGTTACTGCGCAGAACCTTGGTCGC
CTTAGGTGTGGGGATCATCTCAGGTGCACTGATCTTAACCGAATTCAGCTTAACCCAGTCTGCCGTATATATGGCTGATA
AAGCCTGGCTGCAATTTTATCGCGATGGACAATGGCAGGCTTGGCACTTAAATGTGCTAGCGGCCATGATGTTATTAGGA
ATGATGACCCAAGTATTGGCTCGAGGAGGTGCGGTTAAGCTATTTGCCGATTGGTTATATCACCGGATTAACAGTGGCCG
TCAGGCACGGATCGGCGTCGTGCTGCTTGGCTGGGTAGTTTTTATCGATGGAATATTTAGTTGCTTAGCCGTGGGTCATG
TTTGTCAGCCTTTAAGTCAAAGATACAAGATGCCACCTGAGCAAATTGCCTATCTGGTTGATTCCAATGCTTCGCCTCTA
TGTGCCTTATTACCATTTTCGAGCTGGGGACCCTATGTGATGGCTATCTTGGCCGGGATCACTCTATTGCCCCTCACGCC
GTTAGAATCTTTTATTGAAATGGCAAAGTTAAACTTTTATGCGGTCACCGTGGTGTTGCTATCTTTGCTAGTAGCCTGGT
TTGGAATTGGTTTTACTTCTGACTCAGCCCCTTTGCAAAGTAGTGAGCGAGTGGATTCTGGTAACCCTTGGCTACTAGGG
TTACCCATGGTTAGCTTGCTGTTAGCTTCCATAGGGTTAACCTTGTATTCGGGGGCGAGCAATGCTCAGGGATCTAGCCT
CAGTGATTGGATCTCAGCAGCCGATATTGGTGCCGCCATGCGCAATGCCTGCCTAATTGCTATCTCACTTGCTCTGTTGA
TGCTAAAGGTTAGTGGCCGCAGTATGTGGTTATTATTGGCCGATCTCCTATCAGGAGTGCGCTCAATGAGTTTCGCAATC
TCCATCTTACTCTTCACCTGGATGATAGGGGCGGTGATAGCCGATCTTGGGGTGGCTAAGTTGCTCGCAGGATGGGCAGA
GCAATTTCTCTCGAAAGAGGTGTTAATTGCAGGTACCTTTTTGTTGTGCGCGATGATGGCGTTTACCACAGGTTCGAGCT
GGGGAACGTTCGCGATTATGATCCCAATCGGGGCTGAAGTGGCATTAACCTTAGACCAAGCTTTGTTATTACCCGCACTC
AGTGCTGTGATGGCGGGCTCAGTATTTGGCGATCACTGTTCACCGATCTCCGATACCAGCGTGATCAGTGCGACCAGTTC
AGGCTGTGCGCCCCATGACCACGTCATTACTCAGCTGCCCTTTGCTATTATTGCCGCCTTGAGTTCAGTGCTAGGTTTTC
AACTGATTAACCTCGACGTCTCCATATTTTGGGCTTGGCTGGCGGTGATAATTGTTGCGCTCACTTTGTTAGGGGCTTAT
CAAAAATTCATTCAAAATGAGCGTTTATCCCTATCAGTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAAGAGAAAATAGCCGATAAAATTGTTAAAAATAGTTTTTTTTTGCACTTGTTGCTAAGTAGTTAGTATTCTTCTAATTA
TTTCCTATTGAATCGTGGCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAAGTGAGTTACTGCATAGCATAAAGCCGCCAACTAACTCAGGTAGTTGGCGGCTTTATTGTTTTAAGCGTTTTTCTTAC
AAGCGGCTCTTTTAGAGGCC

Product: Na+/H+ antiporter NhaC

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 493; Mature: 493

Protein sequence:

>493_residues
MFGNCLVLIPLLLTLTLALLLRRTLVALGVGIISGALILTEFSLTQSAVYMADKAWLQFYRDGQWQAWHLNVLAAMMLLG
MMTQVLARGGAVKLFADWLYHRINSGRQARIGVVLLGWVVFIDGIFSCLAVGHVCQPLSQRYKMPPEQIAYLVDSNASPL
CALLPFSSWGPYVMAILAGITLLPLTPLESFIEMAKLNFYAVTVVLLSLLVAWFGIGFTSDSAPLQSSERVDSGNPWLLG
LPMVSLLLASIGLTLYSGASNAQGSSLSDWISAADIGAAMRNACLIAISLALLMLKVSGRSMWLLLADLLSGVRSMSFAI
SILLFTWMIGAVIADLGVAKLLAGWAEQFLSKEVLIAGTFLLCAMMAFTTGSSWGTFAIMIPIGAEVALTLDQALLLPAL
SAVMAGSVFGDHCSPISDTSVISATSSGCAPHDHVITQLPFAIIAALSSVLGFQLINLDVSIFWAWLAVIIVALTLLGAY
QKFIQNERLSLSV

Sequences:

>Translated_493_residues
MFGNCLVLIPLLLTLTLALLLRRTLVALGVGIISGALILTEFSLTQSAVYMADKAWLQFYRDGQWQAWHLNVLAAMMLLG
MMTQVLARGGAVKLFADWLYHRINSGRQARIGVVLLGWVVFIDGIFSCLAVGHVCQPLSQRYKMPPEQIAYLVDSNASPL
CALLPFSSWGPYVMAILAGITLLPLTPLESFIEMAKLNFYAVTVVLLSLLVAWFGIGFTSDSAPLQSSERVDSGNPWLLG
LPMVSLLLASIGLTLYSGASNAQGSSLSDWISAADIGAAMRNACLIAISLALLMLKVSGRSMWLLLADLLSGVRSMSFAI
SILLFTWMIGAVIADLGVAKLLAGWAEQFLSKEVLIAGTFLLCAMMAFTTGSSWGTFAIMIPIGAEVALTLDQALLLPAL
SAVMAGSVFGDHCSPISDTSVISATSSGCAPHDHVITQLPFAIIAALSSVLGFQLINLDVSIFWAWLAVIIVALTLLGAY
QKFIQNERLSLSV
>Mature_493_residues
MFGNCLVLIPLLLTLTLALLLRRTLVALGVGIISGALILTEFSLTQSAVYMADKAWLQFYRDGQWQAWHLNVLAAMMLLG
MMTQVLARGGAVKLFADWLYHRINSGRQARIGVVLLGWVVFIDGIFSCLAVGHVCQPLSQRYKMPPEQIAYLVDSNASPL
CALLPFSSWGPYVMAILAGITLLPLTPLESFIEMAKLNFYAVTVVLLSLLVAWFGIGFTSDSAPLQSSERVDSGNPWLLG
LPMVSLLLASIGLTLYSGASNAQGSSLSDWISAADIGAAMRNACLIAISLALLMLKVSGRSMWLLLADLLSGVRSMSFAI
SILLFTWMIGAVIADLGVAKLLAGWAEQFLSKEVLIAGTFLLCAMMAFTTGSSWGTFAIMIPIGAEVALTLDQALLLPAL
SAVMAGSVFGDHCSPISDTSVISATSSGCAPHDHVITQLPFAIIAALSSVLGFQLINLDVSIFWAWLAVIIVALTLLGAY
QKFIQNERLSLSV

Specific function: Unknown

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 52783; Mature: 52783

Theoretical pI: Translated: 6.23; Mature: 6.23

Prosite motif: PS00549 BACTERIOFERRITIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
3.9 %Met     (Translated Protein)
5.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
3.9 %Met     (Mature Protein)
5.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFGNCLVLIPLLLTLTLALLLRRTLVALGVGIISGALILTEFSLTQSAVYMADKAWLQFY
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RDGQWQAWHLNVLAAMMLLGMMTQVLARGGAVKLFADWLYHRINSGRQARIGVVLLGWVV
HCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
FIDGIFSCLAVGHVCQPLSQRYKMPPEQIAYLVDSNASPLCALLPFSSWGPYVMAILAGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHH
TLLPLTPLESFIEMAKLNFYAVTVVLLSLLVAWFGIGFTSDSAPLQSSERVDSGNPWLLG
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEH
LPMVSLLLASIGLTLYSGASNAQGSSLSDWISAADIGAAMRNACLIAISLALLMLKVSGR
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SMWLLLADLLSGVRSMSFAISILLFTWMIGAVIADLGVAKLLAGWAEQFLSKEVLIAGTF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
LLCAMMAFTTGSSWGTFAIMIPIGAEVALTLDQALLLPALSAVMAGSVFGDHCSPISDTS
HHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCC
VISATSSGCAPHDHVITQLPFAIIAALSSVLGFQLINLDVSIFWAWLAVIIVALTLLGAY
CEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QKFIQNERLSLSV
HHHHCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MFGNCLVLIPLLLTLTLALLLRRTLVALGVGIISGALILTEFSLTQSAVYMADKAWLQFY
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RDGQWQAWHLNVLAAMMLLGMMTQVLARGGAVKLFADWLYHRINSGRQARIGVVLLGWVV
HCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
FIDGIFSCLAVGHVCQPLSQRYKMPPEQIAYLVDSNASPLCALLPFSSWGPYVMAILAGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHH
TLLPLTPLESFIEMAKLNFYAVTVVLLSLLVAWFGIGFTSDSAPLQSSERVDSGNPWLLG
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEH
LPMVSLLLASIGLTLYSGASNAQGSSLSDWISAADIGAAMRNACLIAISLALLMLKVSGR
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SMWLLLADLLSGVRSMSFAISILLFTWMIGAVIADLGVAKLLAGWAEQFLSKEVLIAGTF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
LLCAMMAFTTGSSWGTFAIMIPIGAEVALTLDQALLLPALSAVMAGSVFGDHCSPISDTS
HHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCC
VISATSSGCAPHDHVITQLPFAIIAALSSVLGFQLINLDVSIFWAWLAVIIVALTLLGAY
CEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QKFIQNERLSLSV
HHHHCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]