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The map label for this gene is yhfK [H]

Identifier: 153948212

GI number: 153948212

Start: 4421706

End: 4423826

Strand: Direct

Name: yhfK [H]

Synonym: YpsIP31758_3946

Alternate gene names: 153948212

Gene position: 4421706-4423826 (Clockwise)

Preceding gene: 153948667

Following gene: 153947458

Centisome position: 93.61

GC content: 48.75

Gene sequence:

>2121_bases
ATGAAGTGGCAACGGCTTATTTATCATCCTGAAGTTAACTACGCACTACGCCAAACATTGGTCCTTTGCCTGCCGGCAGC
GCTGGGGTTTGCTATCGGTGATTTACGGCTTGGGTTGATGTTTTCCCTGATACCTGCCTGCTGCAATATTGCTTCCCTGG
ATACACCGCACCAACATTTTTTCCGGCGTCTGATTATTGGCGGCGTACTCTTTACGCTAAGCAGTTTCCTGACTCAACAA
CTGTTGCTATGGCATATTCCCTTGCCTGTGGTTATGCTCGGACTGGCATTGATAGTGGGTGTCAGCGGTGCGATTAGCCC
ACTAAATGGCCGTCTACTTCCCGCGGTCTTGATCGCTGCCATTTTCAGTCTCAGCATGGTGGGCCGCGCCCCTATCTGGC
AGGCACCCTTGCTCTGTGCCGTGGGGACGCTCTGGTATGGCGTATTTAACTGGTTGTGGTTCCGGTTATGTAAAGACCAA
CCTATTCGCGAACCACTGAGCCAGCTTTATCATTTATTGGCCGATTACTGTGATGCTAAATACAGCCGGCTTACCCAGCA
TCTTGAACCCGAAAAAGCGATACCACCGCTACTCGATAGACAACAAGGAATGATGGATAAAGTTAATCAGCTTTATCAAC
AATTTAACTTGTTGCACAACACCACCAAGAAAGAGCAAAAGCGTTTGTTGGGACTGTTTCAGATGGCGCTGGATTTACAA
GAGCACATCACTGCAGCGCTGAATCAGCCAGAAGAAATGCAAGAGCTGATAAAAAAGACGCCCATAGAAGCGGTGACTCA
GAGTAATGCGCAAATTATTTCAGCCCAAATGCGCGCCATTGCTGATGACATTCTCTATCACCGCCGCACCGTAGAACACT
TCACCGCGGGTGTCCCTTTAGCCGAGCTGGAAACGATCGCACAGCAAAATCCCGACAACCCGGTGGCACAATTTTGTTAC
TACCACATTAGCCATATCACCCAAATACTGAGCGACCGCCGTCCACTGTATAACCGCGACTTGATGTCCAGTCAGTTGTC
GCAACCTTTTTGGCCTGCTCTGGTAAGTTATTTGTCGTTTAAATCCAGTGCGCTACGAGATGCCGCCAGAATAGGAGTGA
CACTGGCCGTAGGCAGTTATATTGGTGTATTGATCAACCTCCCCAAACCCTATTGGATTTTACTCACAATAATGTTGGTG
ATGCAAAACGGTTATAACGCCACGCGGGTGCGGATCCATCACCGTGCGTTGGGCACCCTGGTAGGGCTGATACTGACGGC
GGGCTTGCTGCACCTACAACTGACAGAAATCACCACCCTCGGCATTATGTTACTGATCACACTGCTGTCTTATTTAGTAC
AGCGTAAAAATTATGGTCTGGCGGTTGTGGGTAGAACGATAACCGCCGTGTATATCGTGCAGTTATTGACTGGGGAAGGC
GCTAACTTTTTAGTCCCACGTCTACTGGATACCTTAATCGGTTGTGCCTTGGCACTTGGCAGTGCGTTATGGCTTTGGCC
TCAGTGGCAGAGCGGGTTGTTGCGTAAAAATGCCCATCAGGCACTGGAGGCTTATCAGACGATCCTGCGTTTGCTACTGA
CCCCTCATCCTGACATTACGCAATTAGATTATGAGCGTTTTAACGTGAATAAGGCCAGCAACACCGTTTTAAGTTCACTA
AATCAGGCAATGCAAGAACCGGGATTCAATTCAAAATATTTGGCAGATATGCGCCTTTGGGCCGCCCATGGCGAGTTGAT
TGTTTGCCATATCAATGAGATGACAACGCTGATCAGAGAGAATCCATTGACTGAGGTGGACTCACCATCAACCAATGGTC
ATCCACTCATGAGCACTAAACTGGCCGCAAGCTATTTACAGCTATGTGAGATGGCCATCCAGTTGTGCCAACAACGGCTG
GAATCGGATAATCTTGAGGACAATGATAGCGTCGTTCAGATACCCGATATGGCTCCAGATACCCAAGCCTCAGAGCTAGA
ACGTAATTTACGCAGGGTTTTATCACACTTAAACGTGATGCATACCGTTTCTGCCATGGCATGGCAACAGCAGCCACATC
ATGGCATATGGCGCAGCCGGAAGTTACGGGATAATACGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTCGTTTACGGCACCCGTTAATTCCCTCTAAAAACCGGCGCTAAAGCTATTAGCGCCGGTTTTTCCCGTTTTCTGTGAGT
AATAAATTTCTGGGGCCTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAGAGAGAGGCTAGCGCCTCTCCATAACGCGGTTATTGACTGCTTAACCTTTGATCACACTCGCCATTGCTTTCTCCAA
CCGCCCCATCCCTTGCTGGA

Product: YccS/YhfK family integral membrane protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 706; Mature: 706

Protein sequence:

>706_residues
MKWQRLIYHPEVNYALRQTLVLCLPAALGFAIGDLRLGLMFSLIPACCNIASLDTPHQHFFRRLIIGGVLFTLSSFLTQQ
LLLWHIPLPVVMLGLALIVGVSGAISPLNGRLLPAVLIAAIFSLSMVGRAPIWQAPLLCAVGTLWYGVFNWLWFRLCKDQ
PIREPLSQLYHLLADYCDAKYSRLTQHLEPEKAIPPLLDRQQGMMDKVNQLYQQFNLLHNTTKKEQKRLLGLFQMALDLQ
EHITAALNQPEEMQELIKKTPIEAVTQSNAQIISAQMRAIADDILYHRRTVEHFTAGVPLAELETIAQQNPDNPVAQFCY
YHISHITQILSDRRPLYNRDLMSSQLSQPFWPALVSYLSFKSSALRDAARIGVTLAVGSYIGVLINLPKPYWILLTIMLV
MQNGYNATRVRIHHRALGTLVGLILTAGLLHLQLTEITTLGIMLLITLLSYLVQRKNYGLAVVGRTITAVYIVQLLTGEG
ANFLVPRLLDTLIGCALALGSALWLWPQWQSGLLRKNAHQALEAYQTILRLLLTPHPDITQLDYERFNVNKASNTVLSSL
NQAMQEPGFNSKYLADMRLWAAHGELIVCHINEMTTLIRENPLTEVDSPSTNGHPLMSTKLAASYLQLCEMAIQLCQQRL
ESDNLEDNDSVVQIPDMAPDTQASELERNLRRVLSHLNVMHTVSAMAWQQQPHHGIWRSRKLRDNT

Sequences:

>Translated_706_residues
MKWQRLIYHPEVNYALRQTLVLCLPAALGFAIGDLRLGLMFSLIPACCNIASLDTPHQHFFRRLIIGGVLFTLSSFLTQQ
LLLWHIPLPVVMLGLALIVGVSGAISPLNGRLLPAVLIAAIFSLSMVGRAPIWQAPLLCAVGTLWYGVFNWLWFRLCKDQ
PIREPLSQLYHLLADYCDAKYSRLTQHLEPEKAIPPLLDRQQGMMDKVNQLYQQFNLLHNTTKKEQKRLLGLFQMALDLQ
EHITAALNQPEEMQELIKKTPIEAVTQSNAQIISAQMRAIADDILYHRRTVEHFTAGVPLAELETIAQQNPDNPVAQFCY
YHISHITQILSDRRPLYNRDLMSSQLSQPFWPALVSYLSFKSSALRDAARIGVTLAVGSYIGVLINLPKPYWILLTIMLV
MQNGYNATRVRIHHRALGTLVGLILTAGLLHLQLTEITTLGIMLLITLLSYLVQRKNYGLAVVGRTITAVYIVQLLTGEG
ANFLVPRLLDTLIGCALALGSALWLWPQWQSGLLRKNAHQALEAYQTILRLLLTPHPDITQLDYERFNVNKASNTVLSSL
NQAMQEPGFNSKYLADMRLWAAHGELIVCHINEMTTLIRENPLTEVDSPSTNGHPLMSTKLAASYLQLCEMAIQLCQQRL
ESDNLEDNDSVVQIPDMAPDTQASELERNLRRVLSHLNVMHTVSAMAWQQQPHHGIWRSRKLRDNT
>Mature_706_residues
MKWQRLIYHPEVNYALRQTLVLCLPAALGFAIGDLRLGLMFSLIPACCNIASLDTPHQHFFRRLIIGGVLFTLSSFLTQQ
LLLWHIPLPVVMLGLALIVGVSGAISPLNGRLLPAVLIAAIFSLSMVGRAPIWQAPLLCAVGTLWYGVFNWLWFRLCKDQ
PIREPLSQLYHLLADYCDAKYSRLTQHLEPEKAIPPLLDRQQGMMDKVNQLYQQFNLLHNTTKKEQKRLLGLFQMALDLQ
EHITAALNQPEEMQELIKKTPIEAVTQSNAQIISAQMRAIADDILYHRRTVEHFTAGVPLAELETIAQQNPDNPVAQFCY
YHISHITQILSDRRPLYNRDLMSSQLSQPFWPALVSYLSFKSSALRDAARIGVTLAVGSYIGVLINLPKPYWILLTIMLV
MQNGYNATRVRIHHRALGTLVGLILTAGLLHLQLTEITTLGIMLLITLLSYLVQRKNYGLAVVGRTITAVYIVQLLTGEG
ANFLVPRLLDTLIGCALALGSALWLWPQWQSGLLRKNAHQALEAYQTILRLLLTPHPDITQLDYERFNVNKASNTVLSSL
NQAMQEPGFNSKYLADMRLWAAHGELIVCHINEMTTLIRENPLTEVDSPSTNGHPLMSTKLAASYLQLCEMAIQLCQQRL
ESDNLEDNDSVVQIPDMAPDTQASELERNLRRVLSHLNVMHTVSAMAWQQQPHHGIWRSRKLRDNT

Specific function: Unknown

COG id: COG1289

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the yccS/yhfK family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87082248, Length=707, Percent_Identity=55.8698727015559, Blast_Score=780, Evalue=0.0,
Organism=Escherichia coli, GI87081808, Length=539, Percent_Identity=24.30426716141, Blast_Score=111, Evalue=2e-25,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR006726
- InterPro:   IPR010020 [H]

Pfam domain/function: PF04632 FUSC [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 79663; Mature: 79663

Theoretical pI: Translated: 8.22; Mature: 8.22

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
4.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
4.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9278503 [H]