| Definition | Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009707 |
| Length | 1,845,106 |
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The map label for this gene is 153951333
Identifier: 153951333
GI number: 153951333
Start: 259599
End: 261947
Strand: Direct
Name: 153951333
Synonym: JJD26997_0283
Alternate gene names: NA
Gene position: 259599-261947 (Clockwise)
Preceding gene: 153951403
Following gene: 153951976
Centisome position: 14.07
GC content: 24.99
Gene sequence:
>2349_bases TTGTTAAATAAAGAATTAGAAATTTTTAAAAAAAATCTTAGTTCCTATACTCAAAGTTGTAGAAAGTTTTTTCTTAAGCA AGGGGCGTTTAGCTTATATCATTCTAAAAATATGGATAATTTCATAAAAAAAGCTTATGATATAGTTCTTAAAGATTATT TTGATGATTTTTCACCTCCAAGTGATAATATCCCTTTTTGTGTTTTGGCAAGCAAAGCATATGCAAACAATAGTCTTTGT TTTAATGAAAGTATTTCTTTGATTTTTGTTTATAAAGATATTAAGGCTTTTCATTTAAAACCTATGATTAAGGCTTTTAT CGAAATTTTAAATGATGCGCATTTGCAAATAGACTCTGTTATCTTAGAATTTAATGGACTTTATAATGCTAGCAATGAGC TTAAGACTTCTATAATACAAACTCGTTTTATATGTGGTTCTAGGATTTTATTTAAAGGGATTAAGACAAAATTTGAGAGT ATTTTAAAAGAAAATAAAAATGATTTTGCCAAGCTTTTATTAGAAAATTTTAAAGAATTTGATATTCCATTTATAAAGCA AGAATTTAATATCTTAAAAGATTTTGGCGGATTAAATCATTTAAGATCCTTAGAGAGTTTGCTTGTTCTTTTTAAGACTT CTCCAAAAAATTATGCTTTAAATTTTATAGATGAGAAAAATTTAAGTGAGTTGCGTTTAGCTGGAGATTTTTTACTTTCT TTAAAATCAGCGATGAATTTATTAAGTGCTAAGGATGAGGATGAGTTTTTACTTATTAATGTTCATGATTTGAGTGAATT AATGTATAAAAAAGCTAAAAAACATTTTGGAGCAAATGAGTTGTTGGTTCAAAAAGCTTTGCAAAGTATGCATACTATAG GTTTTTATACGCACTTTTTAGCAAAGCAAATTCAAGATGGGTTAAATCATACTCTTAAACAAGAATATAAATTTAAAACT CTTGTGGAAGTTTTAGAATACTTATTAAAACTTGAAGATAAACAGGTTATTTTCGATCTTCACTTGGTTTTTTCCCTAAG AAGATTAAAATACGGTAAAAAAGATATAGAAAAAGCTTTAATACTTTTTGAGAAAATTTTTTATAAAAGGCATAGTTTTT GTGTTTTAAAACTTTTGCTTGATAGTGGAATTTTAAAAGATTTATGCAAGCCTTTTTGGACAGTTCGTTTTTTAAGTGAT GAAGAAGGAAATTATAGTTTTGATGAGCAAGTTTTTCTTATGTTAAGTGAATTTGAAAAATACGAAGATGAGCTTGAGAT ACTCCAAAAACTTAAAACCGATGAAAAAATGATTTTAAAGCTCGTAATACTTTTAAGTGCTATAGAAAGTGAAAATGAAA TTTCTTTAGCAGGCATATATAGAGCGTATTGTTCCAAATTTGATTTAAAGAATGAAATTTTAGAATGGGGTCTTAAAATA TTTAAAAACAATAATGCCTTAAAAGATCTTGTAGAAAAAGAAGATATATATAATCCTATTGTTGTAAGTAGTTTGGTTTC TAAACTAGAAAATTTAGAAAATTTAGAGCTTTTATATACTTTAACTTGGCTAAAGGCTAAGGCTTTAAATTACAATGCTT TTTATTTTAGGGTTCTTGATAAACTTTTAGAAAATGCAAAACAAGGTTTTGAAGATGAAAATCTACTTGAAGAAAGTGCA AGAAGGGTAAAAAAAGAATTAACACTTAAAAGAAGTAAGATTTTTTTAGAGCAAGATGAAATTTTGCAAGATAAAATCAT ACATATCAAATCAAATCTTTTTATTATAAAAAATACTTTTGAAGATATTGTTATGATTTCTAAATTAGCTAAAGAAAATG ATTTTAAATTTTGGTTTAGCAATGAAACAAATCTTAGTTTGCAAATTGTTGCGCCACTTCATTTTAATATTGCCATTATT TTAAGTTCTTTAACAAATTTAAATCTTATTTTTATGAATTTTTTTGAACTTTTTGATGATAAAATTTATTTAAGGTTTGA ATATGATAATATTATCAGTGATGAGCAAAAACTAAAACTTTGTGAGCTTTTAAATTCAAATCTTTCTGGTTTTAATTTGA AAAAAATTAAAAAGCCAATCATTAAAAAAGATGAGTTAAAATTAGACTTAAATTATTCTAAAATGTATGCCAAATTAGGT CTTAATACCAAAGATCAGCAAGGTTTAATGGCGTATTTGATGAATGTTTTTAATGAACTTGAACTTGTTTTATGTGCAGC AAAAATTCAAACCATAAGACAAAGGACGCGTAATATTTTTATTTTTCAAAAGAATGAAAAATTAGAACATAGCGAGCAAA AGTTAGTTAATTTATTAATAAGTGAGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CATTATAATTTTTGCTTACTGAAAAAGAGTTTATAGAAAAAGCCAAAATAAAAGATATTTTTGTTAAGATTATTATTAAA ATTTAAAGAGAGTAGAAATT
Downstream 100 bases:
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Product: GlnD family protein
Products: NA
Alternate protein names: Nucleotidyltransferase; GlnD Family Protein; Protein-P-II Uridylyltransferase; (Protein-PII) Uridylyltransferase; GlnD PII-Uridylyltransferase Family; Nucleotidyltransferase GlnD Family; ATP-Dependent DNA Helicase UvrD
Number of amino acids: Translated: 782; Mature: 782
Protein sequence:
>782_residues MLNKELEIFKKNLSSYTQSCRKFFLKQGAFSLYHSKNMDNFIKKAYDIVLKDYFDDFSPPSDNIPFCVLASKAYANNSLC FNESISLIFVYKDIKAFHLKPMIKAFIEILNDAHLQIDSVILEFNGLYNASNELKTSIIQTRFICGSRILFKGIKTKFES ILKENKNDFAKLLLENFKEFDIPFIKQEFNILKDFGGLNHLRSLESLLVLFKTSPKNYALNFIDEKNLSELRLAGDFLLS LKSAMNLLSAKDEDEFLLINVHDLSELMYKKAKKHFGANELLVQKALQSMHTIGFYTHFLAKQIQDGLNHTLKQEYKFKT LVEVLEYLLKLEDKQVIFDLHLVFSLRRLKYGKKDIEKALILFEKIFYKRHSFCVLKLLLDSGILKDLCKPFWTVRFLSD EEGNYSFDEQVFLMLSEFEKYEDELEILQKLKTDEKMILKLVILLSAIESENEISLAGIYRAYCSKFDLKNEILEWGLKI FKNNNALKDLVEKEDIYNPIVVSSLVSKLENLENLELLYTLTWLKAKALNYNAFYFRVLDKLLENAKQGFEDENLLEESA RRVKKELTLKRSKIFLEQDEILQDKIIHIKSNLFIIKNTFEDIVMISKLAKENDFKFWFSNETNLSLQIVAPLHFNIAII LSSLTNLNLIFMNFFELFDDKIYLRFEYDNIISDEQKLKLCELLNSNLSGFNLKKIKKPIIKKDELKLDLNYSKMYAKLG LNTKDQQGLMAYLMNVFNELELVLCAAKIQTIRQRTRNIFIFQKNEKLEHSEQKLVNLLISE
Sequences:
>Translated_782_residues MLNKELEIFKKNLSSYTQSCRKFFLKQGAFSLYHSKNMDNFIKKAYDIVLKDYFDDFSPPSDNIPFCVLASKAYANNSLC FNESISLIFVYKDIKAFHLKPMIKAFIEILNDAHLQIDSVILEFNGLYNASNELKTSIIQTRFICGSRILFKGIKTKFES ILKENKNDFAKLLLENFKEFDIPFIKQEFNILKDFGGLNHLRSLESLLVLFKTSPKNYALNFIDEKNLSELRLAGDFLLS LKSAMNLLSAKDEDEFLLINVHDLSELMYKKAKKHFGANELLVQKALQSMHTIGFYTHFLAKQIQDGLNHTLKQEYKFKT LVEVLEYLLKLEDKQVIFDLHLVFSLRRLKYGKKDIEKALILFEKIFYKRHSFCVLKLLLDSGILKDLCKPFWTVRFLSD EEGNYSFDEQVFLMLSEFEKYEDELEILQKLKTDEKMILKLVILLSAIESENEISLAGIYRAYCSKFDLKNEILEWGLKI FKNNNALKDLVEKEDIYNPIVVSSLVSKLENLENLELLYTLTWLKAKALNYNAFYFRVLDKLLENAKQGFEDENLLEESA RRVKKELTLKRSKIFLEQDEILQDKIIHIKSNLFIIKNTFEDIVMISKLAKENDFKFWFSNETNLSLQIVAPLHFNIAII LSSLTNLNLIFMNFFELFDDKIYLRFEYDNIISDEQKLKLCELLNSNLSGFNLKKIKKPIIKKDELKLDLNYSKMYAKLG LNTKDQQGLMAYLMNVFNELELVLCAAKIQTIRQRTRNIFIFQKNEKLEHSEQKLVNLLISE >Mature_782_residues MLNKELEIFKKNLSSYTQSCRKFFLKQGAFSLYHSKNMDNFIKKAYDIVLKDYFDDFSPPSDNIPFCVLASKAYANNSLC FNESISLIFVYKDIKAFHLKPMIKAFIEILNDAHLQIDSVILEFNGLYNASNELKTSIIQTRFICGSRILFKGIKTKFES ILKENKNDFAKLLLENFKEFDIPFIKQEFNILKDFGGLNHLRSLESLLVLFKTSPKNYALNFIDEKNLSELRLAGDFLLS LKSAMNLLSAKDEDEFLLINVHDLSELMYKKAKKHFGANELLVQKALQSMHTIGFYTHFLAKQIQDGLNHTLKQEYKFKT LVEVLEYLLKLEDKQVIFDLHLVFSLRRLKYGKKDIEKALILFEKIFYKRHSFCVLKLLLDSGILKDLCKPFWTVRFLSD EEGNYSFDEQVFLMLSEFEKYEDELEILQKLKTDEKMILKLVILLSAIESENEISLAGIYRAYCSKFDLKNEILEWGLKI FKNNNALKDLVEKEDIYNPIVVSSLVSKLENLENLELLYTLTWLKAKALNYNAFYFRVLDKLLENAKQGFEDENLLEESA RRVKKELTLKRSKIFLEQDEILQDKIIHIKSNLFIIKNTFEDIVMISKLAKENDFKFWFSNETNLSLQIVAPLHFNIAII LSSLTNLNLIFMNFFELFDDKIYLRFEYDNIISDEQKLKLCELLNSNLSGFNLKKIKKPIIKKDELKLDLNYSKMYAKLG LNTKDQQGLMAYLMNVFNELELVLCAAKIQTIRQRTRNIFIFQKNEKLEHSEQKLVNLLISE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 91735; Mature: 91735
Theoretical pI: Translated: 7.95; Mature: 7.95
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 2.8 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLNKELEIFKKNLSSYTQSCRKFFLKQGAFSLYHSKNMDNFIKKAYDIVLKDYFDDFSPP CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC SDNIPFCVLASKAYANNSLCFNESISLIFVYKDIKAFHLKPMIKAFIEILNDAHLQIDSV CCCCCEEEEECHHHCCCCEEECCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH ILEFNGLYNASNELKTSIIQTRFICGSRILFKGIKTKFESILKENKNDFAKLLLENFKEF HEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHC DIPFIKQEFNILKDFGGLNHLRSLESLLVLFKTSPKNYALNFIDEKNLSELRLAGDFLLS CCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHH LKSAMNLLSAKDEDEFLLINVHDLSELMYKKAKKHFGANELLVQKALQSMHTIGFYTHFL HHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AKQIQDGLNHTLKQEYKFKTLVEVLEYLLKLEDKQVIFDLHLVFSLRRLKYGKKDIEKAL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH ILFEKIFYKRHSFCVLKLLLDSGILKDLCKPFWTVRFLSDEEGNYSFDEQVFLMLSEFEK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH YEDELEILQKLKTDEKMILKLVILLSAIESENEISLAGIYRAYCSKFDLKNEILEWGLKI HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH FKNNNALKDLVEKEDIYNPIVVSSLVSKLENLENLELLYTLTWLKAKALNYNAFYFRVLD HCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH KLLENAKQGFEDENLLEESARRVKKELTLKRSKIFLEQDEILQDKIIHIKSNLFIIKNTF HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCEEEEECCH EDIVMISKLAKENDFKFWFSNETNLSLQIVAPLHFNIAIILSSLTNLNLIFMNFFELFDD HHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCC KIYLRFEYDNIISDEQKLKLCELLNSNLSGFNLKKIKKPIIKKDELKLDLNYSKMYAKLG CEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHC LNTKDQQGLMAYLMNVFNELELVLCAAKIQTIRQRTRNIFIFQKNEKLEHSEQKLVNLLI CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHH SE CC >Mature Secondary Structure MLNKELEIFKKNLSSYTQSCRKFFLKQGAFSLYHSKNMDNFIKKAYDIVLKDYFDDFSPP CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC SDNIPFCVLASKAYANNSLCFNESISLIFVYKDIKAFHLKPMIKAFIEILNDAHLQIDSV CCCCCEEEEECHHHCCCCEEECCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH ILEFNGLYNASNELKTSIIQTRFICGSRILFKGIKTKFESILKENKNDFAKLLLENFKEF HEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHC DIPFIKQEFNILKDFGGLNHLRSLESLLVLFKTSPKNYALNFIDEKNLSELRLAGDFLLS CCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHH LKSAMNLLSAKDEDEFLLINVHDLSELMYKKAKKHFGANELLVQKALQSMHTIGFYTHFL HHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AKQIQDGLNHTLKQEYKFKTLVEVLEYLLKLEDKQVIFDLHLVFSLRRLKYGKKDIEKAL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH ILFEKIFYKRHSFCVLKLLLDSGILKDLCKPFWTVRFLSDEEGNYSFDEQVFLMLSEFEK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH YEDELEILQKLKTDEKMILKLVILLSAIESENEISLAGIYRAYCSKFDLKNEILEWGLKI HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH FKNNNALKDLVEKEDIYNPIVVSSLVSKLENLENLELLYTLTWLKAKALNYNAFYFRVLD HCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH KLLENAKQGFEDENLLEESARRVKKELTLKRSKIFLEQDEILQDKIIHIKSNLFIIKNTF HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCEEEEECCH EDIVMISKLAKENDFKFWFSNETNLSLQIVAPLHFNIAIILSSLTNLNLIFMNFFELFDD HHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCC KIYLRFEYDNIISDEQKLKLCELLNSNLSGFNLKKIKKPIIKKDELKLDLNYSKMYAKLG CEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHC LNTKDQQGLMAYLMNVFNELELVLCAAKIQTIRQRTRNIFIFQKNEKLEHSEQKLVNLLI CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHH SE CC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA