Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 153937678

Identifier: 153937678

GI number: 153937678

Start: 2270942

End: 2272573

Strand: Reverse

Name: 153937678

Synonym: CLC_2136

Alternate gene names: NA

Gene position: 2272573-2270942 (Counterclockwise)

Preceding gene: 153936942

Following gene: 153934974

Centisome position: 60.43

GC content: 31.74

Gene sequence:

>1632_bases
GTGAGTGAAAATTCAAAATCTAAGGTAAGATTTTTAACTGCTTTTCAGGTAGCAGCAGTGTGGTTTGGAGCTCATGTAGG
AGGGGGATTTGCAACAGGTAATCAAACAATGAATTTTTTTGTTAAATATGGTTGGCATTCTATATGGTTACCTGCAGTTA
TAATTATAATTATAGGATTAACCTATAGAGAGTCATTAGTATTAGCAAAAAATTATGGGACTTATGATTATAAAAGTTGG
TCAAAAAAAATGTATGAACCCTATGATAAATTCTTTTCTGTTATTTTTGAAATAGGATATTTAATGATAGTATTATTAGG
TACAGGAGGATCTATAGCAGGTTCTGCTTCTCTAATGGAGACTTATGGAGTTAATTATTTAGTAGGAGTATTAATTACAG
GTAGCATTTTTTATATATTAACTATATATGGATCAGAATTAATAAGAAAGGCTTCAACTATTATAACTGTTCTAATATTA
ATATTTTTAACAATCATAGTAATTGTAGGCATAGTTAATAATTCAGGGAATTTATCACATCTTGTTTCTACAAAATATTC
CCCTTCATCCTTTGGTACAGTTTTGTATAGTGGACTTCGATATGCTGGTTATCAGGCCTTTGTTGTTGCTATTGTACTAA
GTGCCAGTGACACTTTAAAATCTGATAAAGCTATTAATAAGTCAATTCTTTTAGGTATTATTTTAAACGGTGTAATGATC
ACACTATCCTGTATAATGCTATTGGCATGGATGCCAGGAGCTCAAAAGGAAACTATACCAATTTTATATATATGTAAACG
TTTAAACAGTGGATTTTTATTATTTTCTTACTCAGTAGTACTATTTCTAGCCTTTGTATCCACAGGTATAGGATGTGTCT
TTGGAGCAGTGGCTAGATTTGAACATGTTTTTAAGAAACCAGAAAATATTAAAAAAAGAAGAGGATTAATTTCTCTTGTT
TGTATGGTGTTATCTATGGCAATTTCCTTGTTTGGATTAACTAAAATTGTTGTTGTAGGCTATGGATATGTAGGAATAAT
CGGTATATTCGCTGTAGTTATTCCATGTATAGTTGTAGGAAGAATAAAAAACAACAGATTTAAAAAAGAGAAGGAAAGTA
TATTATTAGAAGAGCAAAATGATATATCAAATGAAGATCAGAACAGTGCATCAGTAGAAGATAAAGGTAATGTGTTAAAG
GGAGAAGACAGTGAGTTAATAGAAGACCAAGATGATATATCGGAGGAAGATGAGGAAAACGTGCCAGTAGAAGGTCCAGA
TAATACATTAAAGGAAAATAAGGAAAGTATGTTAGTAGAAGATCAAGTTGATGTGCTAAAGGGAGAACAGGACAGTGTAC
CAGAAGGTGCAGATGATATGTTAAAAGAAGATAAGGAAAGTATGTCAATAGAAGGTCAGGATGATATGTTAAAGGGAGAG
CAGGACAGTGTATCAGAAGGTGAAGATGATACGTTAAAGGAAGATAAGGAAAATGTGGCAGTAGAAGGTCAGGATGATAT
GCAAAAAGGAGATAAAGAAAGTATATCAATAGAAGAGGAAAAAAGTACAGATGACGATGCATCAAAGGAAGATGAGGACA
ATATATCAGTAGAAGATCAAGATAATATATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGTGTTGGTTATAAAAAATTTAATATTTAATAGGATTGTCTTAATAGGGGGACATAATATAAAAATTATACCCAATTAA
TATATATAGGGGAGGATAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAAGATGGTATATCAATTGTAGAGTCTGAATAACAATTACTATACTAAAATATTTTAAAAAGGGGGATACACATATGT
ACACAATGGGATTAGACATA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 543; Mature: 542

Protein sequence:

>543_residues
MSENSKSKVRFLTAFQVAAVWFGAHVGGGFATGNQTMNFFVKYGWHSIWLPAVIIIIIGLTYRESLVLAKNYGTYDYKSW
SKKMYEPYDKFFSVIFEIGYLMIVLLGTGGSIAGSASLMETYGVNYLVGVLITGSIFYILTIYGSELIRKASTIITVLIL
IFLTIIVIVGIVNNSGNLSHLVSTKYSPSSFGTVLYSGLRYAGYQAFVVAIVLSASDTLKSDKAINKSILLGIILNGVMI
TLSCIMLLAWMPGAQKETIPILYICKRLNSGFLLFSYSVVLFLAFVSTGIGCVFGAVARFEHVFKKPENIKKRRGLISLV
CMVLSMAISLFGLTKIVVVGYGYVGIIGIFAVVIPCIVVGRIKNNRFKKEKESILLEEQNDISNEDQNSASVEDKGNVLK
GEDSELIEDQDDISEEDEENVPVEGPDNTLKENKESMLVEDQVDVLKGEQDSVPEGADDMLKEDKESMSIEGQDDMLKGE
QDSVSEGEDDTLKEDKENVAVEGQDDMQKGDKESISIEEEKSTDDDASKEDEDNISVEDQDNI

Sequences:

>Translated_543_residues
MSENSKSKVRFLTAFQVAAVWFGAHVGGGFATGNQTMNFFVKYGWHSIWLPAVIIIIIGLTYRESLVLAKNYGTYDYKSW
SKKMYEPYDKFFSVIFEIGYLMIVLLGTGGSIAGSASLMETYGVNYLVGVLITGSIFYILTIYGSELIRKASTIITVLIL
IFLTIIVIVGIVNNSGNLSHLVSTKYSPSSFGTVLYSGLRYAGYQAFVVAIVLSASDTLKSDKAINKSILLGIILNGVMI
TLSCIMLLAWMPGAQKETIPILYICKRLNSGFLLFSYSVVLFLAFVSTGIGCVFGAVARFEHVFKKPENIKKRRGLISLV
CMVLSMAISLFGLTKIVVVGYGYVGIIGIFAVVIPCIVVGRIKNNRFKKEKESILLEEQNDISNEDQNSASVEDKGNVLK
GEDSELIEDQDDISEEDEENVPVEGPDNTLKENKESMLVEDQVDVLKGEQDSVPEGADDMLKEDKESMSIEGQDDMLKGE
QDSVSEGEDDTLKEDKENVAVEGQDDMQKGDKESISIEEEKSTDDDASKEDEDNISVEDQDNI
>Mature_542_residues
SENSKSKVRFLTAFQVAAVWFGAHVGGGFATGNQTMNFFVKYGWHSIWLPAVIIIIIGLTYRESLVLAKNYGTYDYKSWS
KKMYEPYDKFFSVIFEIGYLMIVLLGTGGSIAGSASLMETYGVNYLVGVLITGSIFYILTIYGSELIRKASTIITVLILI
FLTIIVIVGIVNNSGNLSHLVSTKYSPSSFGTVLYSGLRYAGYQAFVVAIVLSASDTLKSDKAINKSILLGIILNGVMIT
LSCIMLLAWMPGAQKETIPILYICKRLNSGFLLFSYSVVLFLAFVSTGIGCVFGAVARFEHVFKKPENIKKRRGLISLVC
MVLSMAISLFGLTKIVVVGYGYVGIIGIFAVVIPCIVVGRIKNNRFKKEKESILLEEQNDISNEDQNSASVEDKGNVLKG
EDSELIEDQDDISEEDEENVPVEGPDNTLKENKESMLVEDQVDVLKGEQDSVPEGADDMLKEDKESMSIEGQDDMLKGEQ
DSVSEGEDDTLKEDKENVAVEGQDDMQKGDKESISIEEEKSTDDDASKEDEDNISVEDQDNI

Specific function: Unknown

COG id: COG3949

COG function: function code S; Uncharacterized membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 59825; Mature: 59694

Theoretical pI: Translated: 4.30; Mature: 4.30

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CCC
>Mature Secondary Structure 
SENSKSKVRFLTAFQVAAVWFGAHVGGGFATGNQTMNFFVKYGWHSIWLPAVIIIIIGL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHH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CCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA