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The map label for this gene is yisQ [H]

Identifier: 153935621

GI number: 153935621

Start: 409849

End: 411189

Strand: Direct

Name: yisQ [H]

Synonym: CLC_0417

Alternate gene names: 153935621

Gene position: 409849-411189 (Clockwise)

Preceding gene: 153935942

Following gene: 153934899

Centisome position: 10.9

GC content: 26.47

Gene sequence:

>1341_bases
ATGACAAAAAGATATCCAATGAAAGAAATTTTGGACACTTCTATTCCGATCATAGCAGAAATGACATTGTATAATCTAAT
GATAGTATTTGATATGATGATGATAGGAAATTATGGAGGAAATAAATGCTTAACTGCAGTAGGATTGAGCAATGGTGTTA
TTTTTACTCTTTGTGATGTATTTATTTCTGTAGGACTTGCAGTTTCTGTAACTTCACTAATAGCTAGAAGTATAGGAAGT
AGACATTATAAAAATGCACAACAATACTCTATATGTGGTTTATTTTTGGGAGTTATAATTTCATTTTTAATAAGTTACTT
TATGTTTTATAAAAGCGAAAAAATTTTGTATATAGCAGGTGCGAGAGGGGATATACTTAAAATAGCTAATGTTTTTAATA
AGACAATGGCTATTTCAATTTTTTTTAAAATGAATACGGAAATTATAAATTCTATACTAAGAGGATATAAGAACACAAAA
ATACCTTTTTTTACAGCAGTAATAATAAGTAGCTGTAAAATTATATTAGATTTTATTTTTATATTTGGTATAGGAAAAAA
TGGTTTAGGCGTATTTGGAGCAGCATTAGCTTCTATATTATCTCAAATAGTAGGTTTTACATTTTCCTTTATATACATGT
TAGATAAATTAAAATCTCATGGTAATATAAATTTGTTTAAATTATTTAAAATAGATAAAATAAAGGATATCTTAAATATG
TATATACCAGCATCTTTAGAAGAAGCTACATATAGTGTAAGTAGATTATTGTGCGCTTTTATGATAATAAAAATTGGAAG
CATTTCTTTTTCTGCTAATGAAATAGCAAATACCATAGAAACAGTTTCCATAATACCTAGTGCTGCTTTGGGAGTTTCTG
CTACTACATTGGTTGGAATGAAGATAGGAGAAAAAGATTATAGAGGTGCAAAAGAATATGCAAATAAATCTGTCTGGTTT
GCAGTTAGTATATCTTTAATATTTTCTTTATTATTTATTTTTATGCCTAATTTATTAGTAGGCTGCTTTGTAGGAAATAA
AGAAAAAAATGTTGTAAAATTAGCAACTGTATGTTTGTTAGTGGGGGCAATAGAACAACCCTTTATAGCTGCATCTACTG
TTGTTGAAGATATATTAAAAGGTATGGGAGATGCCAAAACTCCATTTATTGTAACTTTGATTTCTAGTTGGTGTATAAGA
GTTCCATTGTTTTATTATTATATATATAAATTAAAGTATTCTGTAGTATGTGTTTGGTGGATAACAGCTTTTCAATGGTT
CATAGATTTCTTACTTATGAAAATAATTTTAAAGAAAAAATTTAATAAATTTAAATTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CATAATTTAGTATTTCCCAAAAGTTTAAATAAAAATTCTATATAAAATTTGTTAAATCAATTTTAAGGTATAAATATAAT
TAATTTTTATGAGGGATGAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTCTGTAAAATGTAAATTTAATAGTTCTTATATATTTATATATAAAGTAAAAAAGTTTTAGATATATAACTACAATA
TATTTAAAATTCTATAAATA

Product: MATE efflux family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 446; Mature: 445

Protein sequence:

>446_residues
MTKRYPMKEILDTSIPIIAEMTLYNLMIVFDMMMIGNYGGNKCLTAVGLSNGVIFTLCDVFISVGLAVSVTSLIARSIGS
RHYKNAQQYSICGLFLGVIISFLISYFMFYKSEKILYIAGARGDILKIANVFNKTMAISIFFKMNTEIINSILRGYKNTK
IPFFTAVIISSCKIILDFIFIFGIGKNGLGVFGAALASILSQIVGFTFSFIYMLDKLKSHGNINLFKLFKIDKIKDILNM
YIPASLEEATYSVSRLLCAFMIIKIGSISFSANEIANTIETVSIIPSAALGVSATTLVGMKIGEKDYRGAKEYANKSVWF
AVSISLIFSLLFIFMPNLLVGCFVGNKEKNVVKLATVCLLVGAIEQPFIAASTVVEDILKGMGDAKTPFIVTLISSWCIR
VPLFYYYIYKLKYSVVCVWWITAFQWFIDFLLMKIILKKKFNKFKL

Sequences:

>Translated_446_residues
MTKRYPMKEILDTSIPIIAEMTLYNLMIVFDMMMIGNYGGNKCLTAVGLSNGVIFTLCDVFISVGLAVSVTSLIARSIGS
RHYKNAQQYSICGLFLGVIISFLISYFMFYKSEKILYIAGARGDILKIANVFNKTMAISIFFKMNTEIINSILRGYKNTK
IPFFTAVIISSCKIILDFIFIFGIGKNGLGVFGAALASILSQIVGFTFSFIYMLDKLKSHGNINLFKLFKIDKIKDILNM
YIPASLEEATYSVSRLLCAFMIIKIGSISFSANEIANTIETVSIIPSAALGVSATTLVGMKIGEKDYRGAKEYANKSVWF
AVSISLIFSLLFIFMPNLLVGCFVGNKEKNVVKLATVCLLVGAIEQPFIAASTVVEDILKGMGDAKTPFIVTLISSWCIR
VPLFYYYIYKLKYSVVCVWWITAFQWFIDFLLMKIILKKKFNKFKL
>Mature_445_residues
TKRYPMKEILDTSIPIIAEMTLYNLMIVFDMMMIGNYGGNKCLTAVGLSNGVIFTLCDVFISVGLAVSVTSLIARSIGSR
HYKNAQQYSICGLFLGVIISFLISYFMFYKSEKILYIAGARGDILKIANVFNKTMAISIFFKMNTEIINSILRGYKNTKI
PFFTAVIISSCKIILDFIFIFGIGKNGLGVFGAALASILSQIVGFTFSFIYMLDKLKSHGNINLFKLFKIDKIKDILNMY
IPASLEEATYSVSRLLCAFMIIKIGSISFSANEIANTIETVSIIPSAALGVSATTLVGMKIGEKDYRGAKEYANKSVWFA
VSISLIFSLLFIFMPNLLVGCFVGNKEKNVVKLATVCLLVGAIEQPFIAASTVVEDILKGMGDAKTPFIVTLISSWCIRV
PLFYYYIYKLKYSVVCVWWITAFQWFIDFLLMKIILKKKFNKFKL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI226510954, Length=424, Percent_Identity=24.7641509433962, Blast_Score=107, Evalue=2e-24,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49857; Mature: 49725

Theoretical pI: Translated: 9.84; Mature: 9.84

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.0 %Cys     (Translated Protein)
3.8 %Met     (Translated Protein)
5.8 %Cys+Met (Translated Protein)
2.0 %Cys     (Mature Protein)
3.6 %Met     (Mature Protein)
5.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTKRYPMKEILDTSIPIIAEMTLYNLMIVFDMMMIGNYGGNKCLTAVGLSNGVIFTLCDV
CCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHEEEECCCCCHHHHHHHH
FISVGLAVSVTSLIARSIGSRHYKNAQQYSICGLFLGVIISFLISYFMFYKSEKILYIAG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEC
ARGDILKIANVFNKTMAISIFFKMNTEIINSILRGYKNTKIPFFTAVIISSCKIILDFIF
CCCCHHHHHHHHCCCEEEEEEEEECHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFGIGKNGLGVFGAALASILSQIVGFTFSFIYMLDKLKSHGNINLFKLFKIDKIKDILNM
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHH
YIPASLEEATYSVSRLLCAFMIIKIGSISFSANEIANTIETVSIIPSAALGVSATTLVGM
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHH
KIGEKDYRGAKEYANKSVWFAVSISLIFSLLFIFMPNLLVGCFVGNKEKNVVKLATVCLL
CCCCHHCCCHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
VGAIEQPFIAASTVVEDILKGMGDAKTPFIVTLISSWCIRVPLFYYYIYKLKYSVVCVWW
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ITAFQWFIDFLLMKIILKKKFNKFKL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
TKRYPMKEILDTSIPIIAEMTLYNLMIVFDMMMIGNYGGNKCLTAVGLSNGVIFTLCDV
CCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHEEEECCCCCHHHHHHHH
FISVGLAVSVTSLIARSIGSRHYKNAQQYSICGLFLGVIISFLISYFMFYKSEKILYIAG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEC
ARGDILKIANVFNKTMAISIFFKMNTEIINSILRGYKNTKIPFFTAVIISSCKIILDFIF
CCCCHHHHHHHHCCCEEEEEEEEECHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFGIGKNGLGVFGAALASILSQIVGFTFSFIYMLDKLKSHGNINLFKLFKIDKIKDILNM
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHH
YIPASLEEATYSVSRLLCAFMIIKIGSISFSANEIANTIETVSIIPSAALGVSATTLVGM
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHH
KIGEKDYRGAKEYANKSVWFAVSISLIFSLLFIFMPNLLVGCFVGNKEKNVVKLATVCLL
CCCCHHCCCHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
VGAIEQPFIAASTVVEDILKGMGDAKTPFIVTLISSWCIRVPLFYYYIYKLKYSVVCVWW
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ITAFQWFIDFLLMKIILKKKFNKFKL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9353932; 9384377 [H]