| Definition | Clostridium botulinum A str. ATCC 19397, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009697 |
| Length | 3,863,450 |
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The map label for this gene is 153930866
Identifier: 153930866
GI number: 153930866
Start: 3114511
End: 3119655
Strand: Reverse
Name: 153930866
Synonym: CLB_2962
Alternate gene names: NA
Gene position: 3119655-3114511 (Counterclockwise)
Preceding gene: 153933861
Following gene: 153933690
Centisome position: 80.75
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Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AGGAGTGAGAATTTGCAAAAATTAATTATAAATACAGACAGAGGGCAGAGCATTACATTGGGTAATTCTCGCCCTTTTAT TTTATCTAAAATTGATAATA
Product: TP901 family phage tail tape measure protein
Products: NA
Alternate protein names: Phage Protein; Tape Measure Protein; Phage-Related Tail Protein; Phage Related Protein; Phage Tail Tape Measure Protein Family Core Region; Phage Tail Tape Measure Protein Family; Truncated PhiSLT; Tail Length Tape Measure Protein; Phage Tail Tape Measure Core Region; Phage Tail Fiber Protein; Phage-Related Protein-Like Protein; Phage Minor Tail Protein; Tail Tape Measure Protein; Bacteriophage-Related Protein; Bacteriophage Tape Measure Protein; Phage Tail Length Tape-Measure Protein; Prophage; Phage-Like Protein; Phage Tail Like Protein; Bacteriophage P2 Tail Protein GpT; Tail Tape Meausure Protein; Bacteriophage Tail Fiber Protein T; Phage Protein Tail Length Tape Measure Protein; Tail Protein; Phage Tail Protein; Phage Tail Tape Measure Protein Core Region; Phage Tail Tape Measure Protein TMP
Number of amino acids: Translated: 1714; Mature: 1713
Protein sequence:
>1714_residues MAEDVGSLVVRVAMENSNFQQGIQNLNRSMKVIQSEFKNATNGLKDHGKGLDGLKSKQEMLSKSIDVQSKIVQQYKDKLK QSKDTLSKNAEAQAKLKEKVEAAKSAYEQSKNTLGENNTKTKELKQSYEQLSSEYSKNEEKLRNNVRAVDNWTTKANNAE SKLKGMQQEFSSTSKEIAKQESSWDKLSVKLDNIGKKFDMIGKKMQSIGKDLTAKLTTPIAGIGVVASKIGMDFEASMSN VSALSGNTGKDLKQLETAARDAGASTSKSAKDAADALGYMALAGYDNKQMMEALMPVLRLSEAGNLDLARTSDLVTDSLS SLGKSTKDLPVYLDQVAKTAASSNTNIDALMEGLIVCGGTVKNLNVPLDEANTLLGTLANRGIKGSEAGNSFNSILINLT SGAGQAGEAMEKLGLSAFDSNGKFKGVTNVLLELKEKTKNMTEEQRNMYLAMIGGKTQITTLQALLSGVGEEYGDLRGKI QDSNGALDKMAITMQDNNKGSITSLKSALEELGIKIYDVLKPAIANVVDKLKEWTEKLNNLTPAQQQAIVKIAGMVAAIG PLLLIGGKLAAGIGKIITIFSTISGAIAVVTTGAAAATPAIGALATAFTVLTGPVGIAIAAIAGIGAAAYATHKHFSKEA VPSVDLFANKTEQTAQRVKAANGQMVTVYGQTTTKISEETKKAVGSYMELDKGATKSLTNLYTNGIKITQKNGKQLQDTY NQMNSQIKTGIDKQHQDRIKGIQKFFANSKSISAKEQSQIIAKEQQHNAKMQSNQQALANKINSIIQNAASKNRELKAEE VKEIEVCQKQMQENAVKHLSESETESKVIMERVKSYNGRMSAEQASEVIKNAESQRVKTVDQANKQFLETKANIENMRDV TGSITKEQADKMIKDAEKQRDGSVKKADELKQGVVNKVKEMNSDVIKDVDTSDGHIKTTWEKTKESVSTKAQEMKNSVVE AFNQKKKEVTDKGNEIKESITTKWNETVEWFNTLPSRLREKAHNMFESMRQGINEKMASVKQSATDIGESIKNAFTSIPE KMRTIGHDIMEGLKNGIRNRIDSIKEAASEAARAVEEKVKTVLDIHSPSRVMMELGKYTSQGLALGILEDIDKVEKAASL AAQTIKDITEGKLSDVKVKTNTNDREIKDRLARQLNWGANNKAEYQKYLEFINKLNKEEVEQSKEYLKEDYENRVKSLDD RLKILKNENSVELQTEKARVDAQIAYYQQLQRNTKDKNAKANYVNEIAALKQYQKQVLNTTKANQKAQVDTLERSKKALE EYYKHGLNLLDKREKDVKKSLKVQENVFKDLMITYDTAIKTLSIKTGDLIKDLENQEAIVVVQSKKVEDLRKRYEDLAYT FGVTADEAIKAREEFEKARVELENMANAVSEVSKKIAEDINKFQKTVIDALRERYAQQFKLEEDALKEEITNLDNWKKES LDRINSVYDERIKKIEESSKAQIEALQEEIQAIDDAEKAKNRNDEDEQDIKKINDLKASIEFEHNDFNKEQLKKELEKAI EEREEKLRKRNIEDRKAELNEQIKNIQDSTNKEKEILQKQKQEETEKINKLYEFEKETLNNRMTNLKEFYDNKTSAAQLQ AEAEKMIMNKNQAEIIELLHSYSKEYELAGQTLGERLVEGFKPAIDEIKDMIASITAEINAAKDSAIATKALVQNIDNRR SASYNIEVKSRGRTFSDDIREAESMARRLTFQTT
Sequences:
>Translated_1714_residues MAEDVGSLVVRVAMENSNFQQGIQNLNRSMKVIQSEFKNATNGLKDHGKGLDGLKSKQEMLSKSIDVQSKIVQQYKDKLK QSKDTLSKNAEAQAKLKEKVEAAKSAYEQSKNTLGENNTKTKELKQSYEQLSSEYSKNEEKLRNNVRAVDNWTTKANNAE SKLKGMQQEFSSTSKEIAKQESSWDKLSVKLDNIGKKFDMIGKKMQSIGKDLTAKLTTPIAGIGVVASKIGMDFEASMSN VSALSGNTGKDLKQLETAARDAGASTSKSAKDAADALGYMALAGYDNKQMMEALMPVLRLSEAGNLDLARTSDLVTDSLS SLGKSTKDLPVYLDQVAKTAASSNTNIDALMEGLIVCGGTVKNLNVPLDEANTLLGTLANRGIKGSEAGNSFNSILINLT SGAGQAGEAMEKLGLSAFDSNGKFKGVTNVLLELKEKTKNMTEEQRNMYLAMIGGKTQITTLQALLSGVGEEYGDLRGKI QDSNGALDKMAITMQDNNKGSITSLKSALEELGIKIYDVLKPAIANVVDKLKEWTEKLNNLTPAQQQAIVKIAGMVAAIG PLLLIGGKLAAGIGKIITIFSTISGAIAVVTTGAAAATPAIGALATAFTVLTGPVGIAIAAIAGIGAAAYATHKHFSKEA VPSVDLFANKTEQTAQRVKAANGQMVTVYGQTTTKISEETKKAVGSYMELDKGATKSLTNLYTNGIKITQKNGKQLQDTY NQMNSQIKTGIDKQHQDRIKGIQKFFANSKSISAKEQSQIIAKEQQHNAKMQSNQQALANKINSIIQNAASKNRELKAEE VKEIEVCQKQMQENAVKHLSESETESKVIMERVKSYNGRMSAEQASEVIKNAESQRVKTVDQANKQFLETKANIENMRDV TGSITKEQADKMIKDAEKQRDGSVKKADELKQGVVNKVKEMNSDVIKDVDTSDGHIKTTWEKTKESVSTKAQEMKNSVVE AFNQKKKEVTDKGNEIKESITTKWNETVEWFNTLPSRLREKAHNMFESMRQGINEKMASVKQSATDIGESIKNAFTSIPE KMRTIGHDIMEGLKNGIRNRIDSIKEAASEAARAVEEKVKTVLDIHSPSRVMMELGKYTSQGLALGILEDIDKVEKAASL AAQTIKDITEGKLSDVKVKTNTNDREIKDRLARQLNWGANNKAEYQKYLEFINKLNKEEVEQSKEYLKEDYENRVKSLDD RLKILKNENSVELQTEKARVDAQIAYYQQLQRNTKDKNAKANYVNEIAALKQYQKQVLNTTKANQKAQVDTLERSKKALE EYYKHGLNLLDKREKDVKKSLKVQENVFKDLMITYDTAIKTLSIKTGDLIKDLENQEAIVVVQSKKVEDLRKRYEDLAYT FGVTADEAIKAREEFEKARVELENMANAVSEVSKKIAEDINKFQKTVIDALRERYAQQFKLEEDALKEEITNLDNWKKES LDRINSVYDERIKKIEESSKAQIEALQEEIQAIDDAEKAKNRNDEDEQDIKKINDLKASIEFEHNDFNKEQLKKELEKAI EEREEKLRKRNIEDRKAELNEQIKNIQDSTNKEKEILQKQKQEETEKINKLYEFEKETLNNRMTNLKEFYDNKTSAAQLQ AEAEKMIMNKNQAEIIELLHSYSKEYELAGQTLGERLVEGFKPAIDEIKDMIASITAEINAAKDSAIATKALVQNIDNRR SASYNIEVKSRGRTFSDDIREAESMARRLTFQTT >Mature_1713_residues AEDVGSLVVRVAMENSNFQQGIQNLNRSMKVIQSEFKNATNGLKDHGKGLDGLKSKQEMLSKSIDVQSKIVQQYKDKLKQ SKDTLSKNAEAQAKLKEKVEAAKSAYEQSKNTLGENNTKTKELKQSYEQLSSEYSKNEEKLRNNVRAVDNWTTKANNAES KLKGMQQEFSSTSKEIAKQESSWDKLSVKLDNIGKKFDMIGKKMQSIGKDLTAKLTTPIAGIGVVASKIGMDFEASMSNV SALSGNTGKDLKQLETAARDAGASTSKSAKDAADALGYMALAGYDNKQMMEALMPVLRLSEAGNLDLARTSDLVTDSLSS LGKSTKDLPVYLDQVAKTAASSNTNIDALMEGLIVCGGTVKNLNVPLDEANTLLGTLANRGIKGSEAGNSFNSILINLTS GAGQAGEAMEKLGLSAFDSNGKFKGVTNVLLELKEKTKNMTEEQRNMYLAMIGGKTQITTLQALLSGVGEEYGDLRGKIQ DSNGALDKMAITMQDNNKGSITSLKSALEELGIKIYDVLKPAIANVVDKLKEWTEKLNNLTPAQQQAIVKIAGMVAAIGP LLLIGGKLAAGIGKIITIFSTISGAIAVVTTGAAAATPAIGALATAFTVLTGPVGIAIAAIAGIGAAAYATHKHFSKEAV PSVDLFANKTEQTAQRVKAANGQMVTVYGQTTTKISEETKKAVGSYMELDKGATKSLTNLYTNGIKITQKNGKQLQDTYN QMNSQIKTGIDKQHQDRIKGIQKFFANSKSISAKEQSQIIAKEQQHNAKMQSNQQALANKINSIIQNAASKNRELKAEEV KEIEVCQKQMQENAVKHLSESETESKVIMERVKSYNGRMSAEQASEVIKNAESQRVKTVDQANKQFLETKANIENMRDVT GSITKEQADKMIKDAEKQRDGSVKKADELKQGVVNKVKEMNSDVIKDVDTSDGHIKTTWEKTKESVSTKAQEMKNSVVEA FNQKKKEVTDKGNEIKESITTKWNETVEWFNTLPSRLREKAHNMFESMRQGINEKMASVKQSATDIGESIKNAFTSIPEK MRTIGHDIMEGLKNGIRNRIDSIKEAASEAARAVEEKVKTVLDIHSPSRVMMELGKYTSQGLALGILEDIDKVEKAASLA AQTIKDITEGKLSDVKVKTNTNDREIKDRLARQLNWGANNKAEYQKYLEFINKLNKEEVEQSKEYLKEDYENRVKSLDDR LKILKNENSVELQTEKARVDAQIAYYQQLQRNTKDKNAKANYVNEIAALKQYQKQVLNTTKANQKAQVDTLERSKKALEE YYKHGLNLLDKREKDVKKSLKVQENVFKDLMITYDTAIKTLSIKTGDLIKDLENQEAIVVVQSKKVEDLRKRYEDLAYTF GVTADEAIKAREEFEKARVELENMANAVSEVSKKIAEDINKFQKTVIDALRERYAQQFKLEEDALKEEITNLDNWKKESL DRINSVYDERIKKIEESSKAQIEALQEEIQAIDDAEKAKNRNDEDEQDIKKINDLKASIEFEHNDFNKEQLKKELEKAIE EREEKLRKRNIEDRKAELNEQIKNIQDSTNKEKEILQKQKQEETEKINKLYEFEKETLNNRMTNLKEFYDNKTSAAQLQA EAEKMIMNKNQAEIIELLHSYSKEYELAGQTLGERLVEGFKPAIDEIKDMIASITAEINAAKDSAIATKALVQNIDNRRS ASYNIEVKSRGRTFSDDIREAESMARRLTFQTT
Specific function: Unknown
COG id: COG5283
COG function: function code S; Phage-related tail protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 190952; Mature: 190820
Theoretical pI: Translated: 9.05; Mature: 9.05
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
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Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 2.7 %Met (Translated Protein) 2.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAEDVGSLVVRVAMENSNFQQGIQNLNRSMKVIQSEFKNATNGLKDHGKGLDGLKSKQEM CCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHHHH LSKSIDVQSKIVQQYKDKLKQSKDTLSKNAEAQAKLKEKVEAAKSAYEQSKNTLGENNTK HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH TKELKQSYEQLSSEYSKNEEKLRNNVRAVDNWTTKANNAESKLKGMQQEFSSTSKEIAKQ HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ESSWDKLSVKLDNIGKKFDMIGKKMQSIGKDLTAKLTTPIAGIGVVASKIGMDFEASMSN HCCHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH VSALSGNTGKDLKQLETAARDAGASTSKSAKDAADALGYMALAGYDNKQMMEALMPVLRL HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH SEAGNLDLARTSDLVTDSLSSLGKSTKDLPVYLDQVAKTAASSNTNIDALMEGLIVCGGT CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCC VKNLNVPLDEANTLLGTLANRGIKGSEAGNSFNSILINLTSGAGQAGEAMEKLGLSAFDS CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCHHCCC NGKFKGVTNVLLELKEKTKNMTEEQRNMYLAMIGGKTQITTLQALLSGVGEEYGDLRGKI 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