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Definition Sinorhizobium medicae WSM419 chromosome, complete genome.
Accession NC_009636
Length 3,781,904

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The map label for this gene is 150396748

Identifier: 150396748

GI number: 150396748

Start: 1623967

End: 1630125

Strand: Direct

Name: 150396748

Synonym: Smed_1538

Alternate gene names: NA

Gene position: 1623967-1630125 (Clockwise)

Preceding gene: 150396745

Following gene: 150396754

Centisome position: 42.94

GC content: 64.43

Gene sequence:

>6159_bases
ATGGCGACGAAGAAGACCAACGAGTCGATCGACGAAAAGGCGTTCGAGGCGCTGGAAGCGGCCTTGAAGATCGACTTTGA
CGACCTGAAGTCGGCATTGAACGACGAGGTTTCTCCGAGCGAGCCGGAAGCAAAAGCGTCCGAGCCCGGGAAGCAGGCTG
CCGGCTCCGGTGAGGCCCGCGCCGCACGCCCGCAACAAGATTCTCAGACGCAACCACGCGGCACGGAAGCACCGCGCAGC
TTTGCGAGCGAGATGGCGCCGAAGCAGCCCCCCTTGGCGCCCGCCAACGACGACACGCGCAAGTCCCCTGCCGCAACGCT
GCGCTCGCTCGAGGTCCGCTCCAGCCGTGCGGCGATACGCGTCGCTGCGCTCGTGTCCTTAATCTGGACCGCAGCCGCGC
TCGGTGTTGCCCACCTTCTTTATGCGCCGGAGATCTGGCAGATCCGCTCTCTCGGCGATCTGGCAGCGATGCCCGGTGTG
ATTGGCGTCCTGCTTGGCATCGCCCTGCCCGTCATGCTCTTCTTCTCCTTCGCGATCATGATCGCGCGAGCCCAGGAACT
GCGCAGCGCAGCGCGCTCCATGGCTGAGGTCGCGATGCGGCTCGCTGAACCGGAGACCAATGCCGCGGACCGCGTCATGA
CGGTCGGCCAGGCCGTGCGCCGCGAAGTCTCTGCGATGAACGAGGGCATAGAGCGCACCATAGCCCGGGCAACCGAACTC
GAAGCGCTTGTGCATTCGGAAGTCAGCGCACTCGAGCGCAGCTACAGCGATAACGAGCTGCGGGTCCGCACGCTCGTCCA
GGAGCTTGGTCTCGAGCGCGAAGCGATCATCGGCCATTCTGAGCGCATCCGAACGGCAATCGCAGGTGCGCACACCAAGC
TGAAAGACGACCTGGAGACGGCAAGCGAGGACATTGCCTCGCGCATCGCCGTTTCCGGCGAAGCCTTCGCTTCACTCATA
GACACCCGCGCCGCAGCACTTACGGACAAATCGGATCATGCGCTCGAAAACCTGAGCACGATGCTGAGCACCCGGACCGA
CGCGCTGCTCTCGGGCCTGACGACTGCTGGAGTGGCCCTCAGCAGCGAATTCGACTCGCGCCTGGACGCACTCAGCGAAA
ATCTCACGCAGCGCGGCGAGCAGCTGCTCAGCCAGTTCGAAACCCGCGCCTCGACGCTCGACGCCAACACCGAGAAGCTC
AACGCCGCGCTGAACGAACGCGCCCGTCAGCTCAACGAAACACTGATCGCCCGGACGCGTGACCTCAATGAGAGCATCAG
GATAGGCCAGCAGGCTATCTCCGGCGGCCTCGATGACGTGCTTTCTTCGCTCAACACCGCACTTGATGAAAAGGGTGCGA
GCTTCCGCCAGAGCCTCAAATCGAGCGCCGACGACGCGATCATGGATCTCGATCTGCGCGGCGGCTTCTTCGAGGAGAAG
CTGCAGACCACGGTCGGCCATCTGGCAACCGCTTTCGACGAACGCTTCCACGAATTTGCAAGCGCCTTCGACAAGCGCGC
CAGCCAGCTCGACACGAAGCTCATGGAAAGTCTCCACCGTATCAACGAGACGGTATCCGGCGGCTCGGAGGCTATCGGCG
GCGCACTCGACAGCAGTGTGGAAAAGATCAACTCGGCGCTTTCCGACCAGTCGCTGACCTTGGCAACGGCGCTCGGTGCG
ACACAAGATTTCATCGAGGAGACGATCGGCAGCCGCACCAACGAACTCAGCAGCCTGATCGGCAACGCGCACAACCGCAT
CGAGAGCGTCCTATCGGACAAGACCGGTTCGCTGATGGGAGCCCTGACCGAAGCACAGGACCGCATCGAAAACGGCTTCG
GCAAGCGCGCAGATGCGCTCGCCGAAGCGCTGACGACAAGCGAGCAACGCCTGACGGATGGGCTCGACTCCCGCACGTCC
GCCTTCATCGATGGCTTGCAGTCGGCTCACGCCCGTATCGAACAAACCCTTACCGGCTCCACGGACGAGATCACGAGTGC
GATCGCCGCAAGCCAGCATCGGCTCGACAACACGCTTTCCGAACGAACCGCAGCGCTGTCGGGCGCCCTCGCCTCGGGAG
CAAGCGTCATCGAAAATGCTGTCGGCGGCACCGCCGATCGGCTGGAGCGCGTCCTCTCCGAGCGCGGCCGAACGATCACC
GACGTGCTGTCCACTCAGACCACGGCACTGGACGAAGTGCTTGCGGAGCGCGCGACGCAAATCAACTCCACCATGTCGGC
TCGCGCAAGCGAAATGGCCGACTCGCTCAGCCGCCACGCGGAGGATGTCGCCGATAGCCTGACGTTCCGCGCCATGGCGG
TCGCAGAAACCATGACCGACCGCGTCGGCGAGATCGAAAACAAGCTTTCGCAGAGTGTCTCCGAAGTCGCCGAAAACTTG
GGGGGCCGGGTCAGTCTGATCGCCGGCACACTCACCGATACCAGCGCCCGTATTGCCGAGGACCTGAGCAGCCGCGTCGG
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CGCTTGCCGGAAAAGCCGCCGAAATCGAACAGACGCTGACCGGCAGGGCCGAACACCTGCGCGATACGCTGACGACGACA
CACGACCAGATCCGCTCGACGCTCGACGACCGGATCAGGGCGATCAACGTTTCAGTCGGACAAGGCCGCGAGCAGCTCGA
AGAACTGCTCTCCGACCAGTCGATGGCGATGGCGACGACGCTTGCGACCAGTGCCAGCATGCTTGAAATGTCGATCGAGG
AGCGTCAGGCCGCAATCGCCGGGGCGATCGAGCGCGGCACCGAGGCGCTCGCCGCCCGCGCATCGGAAGCGACAGCAGCG
CTTGCCGGCAAGGCCAACGAGATCGATCAGACGCTCTCCGGCAAGACCGCGCAGTTGCGCGATGCATTGGCGAGCACGCA
TGAGCAATTGCGCACGACTCTTGACGACCGGATCAGTGCGATTGACCTTTCAGTCGGCCAGGGCCGCGAGCGTTTGGAAG
AAATCCTGTCCGATCAATCAGTTGCAATGGCCACCACTCTGGCGACCAGCGCCAGCATGCTTGAAATGTCGCTCGAGGAG
CGCCAGGCATCGATCGCCGGAGCGATCGATCGCAGCGCCGAAGCGCTCGACTCCCGGATGCGCTCGACGACGGGCGAGAT
AGCGGAGCGACTTGCCGAGACAGCAGATCAGATCAGTCTCGCGGCCGACTCCCTCACCAATCGGGTCGACATTTCGATCA
GCGGCGTGAACAGCCGGCTTGACGAGACCGGCGCTCGGATCGAGACAAGCCTCGGATCGCTCGAGGAGCGTATTCGCTCC
AGCGTCGGCGACGTCGATGCGGTGCTCGGCGACACCGGCGCCCGCATCGAGACGAGCCTCGGCTCCCTTGAAGAGCGCAT
TCGCGACAGCGTCGGCAGCGTCAATGCCATTGTCGACAATGCCGGCCAGCGGATCGCCGAAAGTCTCGGTGAACGCGCGG
GCGAGATCGACAGGATCAGCGAAACTGCGGCAACGCGGATATCGACGGCGATCGAGGCCGGCGCAGGCCGGATAGAAGAA
CGTCTCGGCACGATGGATCGCGCGCTCAATATCGGGTTGGAAAACGTCAACCGCACGATCGAAGGGAAGGCTGCCGCGCT
CGTCACAAGCTTGCGCGGCGCCGTCAGCGACGCCACTCAGGAGATCGATGCGGAAGCCGCGCGTTCGGCCGGGCTGCTGT
CCAAAGCGGGGGCTGACTTTGCCGGCGCGCTCGCCGCGAGCAACGCCGAATTTGCATCATCGATCGAGCAAACCGCTTCT
GTAACGGCCGCGCGCCATGCTGAGATCGCCCGTTCGGTCACCGAAGCAGCGGAAACCGCGACCGCCCGTCTCGCCTCTAC
GAACAGTCAGATCGCAAGCCATGCCAAGAGCATCCAGCAGAGCCTGACCGAAGCGGAGAAATCCCTGGATGCGCGCGGCC
AGTCCATCCGCAGCACGCTGGACGAAAGCACCCGCGAGCTCAATTCGATGCTCGCCGGGCGCTCGATCGAACTTTCGCGC
CTCCTCGACGAACAGGCTCGCCCCGTCATCGAACAATACGCTGCTACCGGCAAGGAGGCCGCCGAGCGTATTGCCACCCT
CACCCAGGAAAGCGCCGACCGCTTGCGTGCCGAAAACGCCGCGCTCATCAACGCCATCACCGAGCGTACCGGCGAGACGC
TCGATGCCATCTCGATGCGTGCGGAAGAGACCGCCAAGGCTATGAAGATGGTCGAGAACCGGCTGCAGTCGACCGCCATG
GGTCTGATCGACCAGCTTGCGTCAAGCAATTCGGCGATCGCGTCGGTGATCGACCAGGCGAGCGGCAATCTCGGCGATAT
GGATCAGCGCCTCGAGGCGACAGCCGCGAAGGTTTCGGAGACGGCACGCCAAGCCTCTGACATGCTTTCCACCTCGACCC
GCCTGATCGAAGGCAAGGTCGACAAGCTGTCGGACATTTCCTCCTCGACGCTATCGCAGATCGGCGGCATCGTCGGCCGC
TTCGAAGATCATTCGAAGGTTCTCGGACAGGCATCCGACCTTCTGGCAGCCGCTCAGTCGAATCTCGTCAGTACGCTCGA
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TCGAGGGCTTCGTCGATGGGGCCTTCCAGCGTGCCGAGGAGCGCTCCGGCCAGGTCGCCGGCAATCTGCGCAGCGGCATA
CAGTCCTCCTTCGCCGATGTGGGGCGGCTTCTTTCCAACACCGAACAGCGGGCAACCGAGGCCGCCGAAGCGCTTCGCGA
CACGCTTGTCAAGGCAAGCGATGAAGCCGCCGCTTCGGTCGAGGGCGTCTTCACGCAAGCGGAGGAACGCTCACGGCAGA
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CTCAGCGCCTCCGAGGCTCTGCGGCAGGTCGTGGCAAAGACTGGCGAGGAAGCCGGACAGGCGCTCGAAGGAGCGTTCGC
CACCGTGGAGGAGCGTGCCAAGGACGCAGCTTCGCGGCTACGCGGCAGCATCGGAGCCTCCGTCTCCGACGTCGAGCGCA
TGCTGACCGAGAGCGGCAAGAAGTCCGATGGGGTCGCGGTACAATTGCGGGAGGCCGTCCGCCAGGCGATCGAAGACGCG
ATCGGCCGCTTCAATGGCGCTACCGACGACATCCGGCGCTCTGCGGGCGAGATCCGCAAGGAACTCGATATGACCCGCGA
AGAGCTGAAGCGGGGCGCCTTCGACCTTCCGGAAGAAGCCAAGGAGAACGCGGCACTGATGCGCCGCGCCGTCGGCGAGC
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GCGCCGAAGAGGGCGGCGGCTGGATGCGCGATCTCCTACGCGCCGCTTCCCGCGAGGAAGAGCCTGCAGCTGCACGGCCG
CGGGCCACGGACGGCCAGCCGGTTGCAAAGGCAGGGGACAGCCGTAACCCGCGCCACGTCGTCGAGTCGCTGAACTCGCT
CTCGGTAGACATTGCGCGCGCGATCGACCACGACGCCTCTGTCGATCTTTGGCGGCGCTATCAGCGTGGCGAACGCGACG
TCTTCACACGTCGCCTCTATACGCTGAAGGGGCAGCAGACCTTCGACGAGATCAAGCGGAAGTACGATCGCGAACCGGAA
TTCCGCACCGCGGTCGACCGTTACATCGCCGACTTCGAGAAGCTGCTCGCCGATGTCGCCCGCAACGATCCCGACAAGCG
CATCACCCAGACCTATCTGACGTCCGATACGGGCAAGGTCTACACCATGCTTGCCCATGCAGCGGGGCGCTTCAGCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAGATCTTGCGATCGCCGCCCTGGTTCGGATGTTCCGCTGGGCAGCTGGCGGCGCAGAAAGACGGCCATTATCGGGCAA
TAGTAGTGAGGCGTATCCGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCCCCGACAGCAATCGGTATCTGTCTCCTGAACGGCCTCGTCGCAAGACGGGGCCGTTTTGGTAACGGGCGGACCGACAT
CTCAAAAACGGAGTGTTGCC

Product: chemotaxis sensory transducer

Products: NA

Alternate protein names: Chemotaxis Sensory Transducer; Transmembrane Protein; Methyl-Accepting Chemotaxis Protein; Kinesin-Like Protein; ATPase

Number of amino acids: Translated: 2052; Mature: 2051

Protein sequence:

>2052_residues
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Sequences:

>Translated_2052_residues
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RTAVDRYIADFEKLLADVARNDPDKRITQTYLTSDTGKVYTMLAHAAGRFS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 218940; Mature: 218809

Theoretical pI: Translated: 4.59; Mature: 4.59

Prosite motif: PS00012 PHOSPHOPANTETHEINE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
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CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
AARPQQDSQTQPRGTEAPRSFASEMAPKQPPLAPANDDTRKSPAATLRSLEVRSSRAAIR
CCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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IARAQELRSAARSMAEVAMRLAEPETNAADRVMTVGQAVRREVSAMNEGIERTIARATEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DLNESIRIGQQAISGGLDDVLSSLNTALDEKGASFRQSLKSSADDAIMDLDLRGGFFEEK
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LQTTVGHLATAFDERFHEFASAFDKRASQLDTKLMESLHRINETVSGGSEAIGGALDSSV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
EKINSALSDQSLTLATALGATQDFIEETIGSRTNELSSLIGNAHNRIESVLSDKTGSLMG
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ALTEAQDRIENGFGKRADALAEALTTSEQRLTDGLDSRTSAFIDGLQSAHARIEQTLTGS
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHH
DVLSTQTTALDEVLAERATQINSTMSARASEMADSLSRHAEDVADSLTFRAMAVAETMTD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RVGEIENKLSQSVSEVAENLGGRVSLIAGTLTDTSARIAEDLSSRVGRISETLAGTSAEI
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AEALTARTSEATASLAGKAAEIEQTLTGRAEHLRDTLTTTHDQIRSTLDDRIRAINVSVG
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QGREQLEELLSDQSMAMATTLATSASMLEMSIEERQAAIAGAIERGTEALAARASEATAA
CCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAGKANEIDQTLSGKTAQLRDALASTHEQLRTTLDDRISAIDLSVGQGRERLEEILSDQS
HHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCH
VAMATTLATSASMLEMSLEERQASIAGAIDRSAEALDSRMRSTTGEIAERLAETADQISL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AADSLTNRVDISISGVNSRLDETGARIETSLGSLEERIRSSVGDVDAVLGDTGARIETSL
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AGALAASNAEFASSIEQTASVTAARHAEIARSVTEAAETATARLASTNSQIASHAKSIQQ
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLTEAEKSLDARGQSIRSTLDESTRELNSMLAGRSIELSRLLDEQARPVIEQYAATGKEA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
AERIATLTQESADRLRAENAALINAITERTGETLDAISMRAEETAKAMKMVENRLQSTAM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLIDQLASSNSAIASVIDQASGNLGDMDQRLEATAAKVSETARQASDMLSTSTRLIEGKV
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DKLSDISSSTLSQIGGIVGRFEDHSKVLGQASDLLAAAQSNLVSTLEERQDALRTLSVGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VQRSEEIERTMRALEGFVDGAFQRAEERSGQVAGNLRSGIQSSFADVGRLLSNTEQRATE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC
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CCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCC
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CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHH
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>Mature Secondary Structure 
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