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Definition Methanococcus aeolicus Nankai-3, complete genome.
Accession NC_009635
Length 1,569,500

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The map label for this gene is 150401929

Identifier: 150401929

GI number: 150401929

Start: 1568372

End: 1569478

Strand: Direct

Name: 150401929

Synonym: Maeo_1507

Alternate gene names: NA

Gene position: 1568372-1569478 (Clockwise)

Preceding gene: 150401928

Following gene: NA

Centisome position: 99.93

GC content: 25.84

Gene sequence:

>1107_bases
ATGGAGCTCCCTACTATAAACACAATAAAAGAAAAAATAAAAATACATCATTTATTTTTAATGGTGGGTTGCATATATAT
TTCACTATCTAGCGTTTCCTATTATTCTGGATTTTTAGCTTTTTTTAGCTTAATTTTCTTTTATTTATCCTATATTGTAG
GGGAAAAATTATATTATAATTTAAAATTAGATAATTTAATTGATAATGCAAATATAACAGGCAAATATAAAATAAATTAT
TCAAAACATTACAAATTTGGATTAATATTATTATTTATAGGAATATTGTTTATATTTTTTAATTTATTGTGGGTAAGGGG
TGTGCCATTATTTGACCCAGATTCAAGAAGATTTTTAAATGTGCCATTTACAGCATTATCTCGGTTATTATTAATTGGCT
GGGCAATAACTGTTGCATCTAATTTAAATTTAAATAGGTTAAAAATATTAATTTATTCGTTGGTTTTTTCATCGTTAATT
ATGCTGTTGGGATATAGGACAAATGGTATGATATTGTTATTGTCCATATTGTTTGTGGCATATTATTCAAATAGAATAAA
AACAAAAGAATTAATATATTCCTCAGGAGGATTGTTTTTAATATTAATTGCAATGTCATTACAGAGACTTTATACAATGG
GCATTGGCGGAATTCCGTTAATTTCAAGAATTGACTTAACTATGAGTGTTTTTGACATTATTGTTAAAGATTTTAATGGG
GCATTTCTTGGATTATTGCATTATAGTGCCATATTTTCGTATTTTGGAATGGCATCAGGTGCAAGAAACATTATTGCAAA
TAATATAGGCGTTACTTCTGTTTCAATAACTCCCACCATATTTGGAGCTGTAATTGGAGATTATGGAATACTTGGGATTA
TTCCATATTTTGGGATATTGGGTATATTTTTAGGACTATTTTATAAAATAGCTGAAAAATTAAAAGGGGTTTATTTGGGT
GTTTTTGCTATTGTAGTATCATATTTGATAGTATCAATTGAAACAGGTTTGTTGGATTTTGATGTGCTTCTATATTATTT
ATTTGGGTTTATTTTATGTATTTATGCTTCTATTAAATATATATTAATTGACAAATTTAAAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCATTGAGAAATACGACCCAACCATTACAAAATTGTAAATCTTATACCTTATATAATGTGTAATATATAATATATTAATT
AATATAGAGATGGTTATATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATATTTTTATCCCATTTATAATATAATCAAATATATGGCATACTAAGAACTTTTTGCAATATTATAGAACAAATTAAATA
AATATCCCTTTGGGATTTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 368; Mature: 368

Protein sequence:

>368_residues
MELPTINTIKEKIKIHHLFLMVGCIYISLSSVSYYSGFLAFFSLIFFYLSYIVGEKLYYNLKLDNLIDNANITGKYKINY
SKHYKFGLILLFIGILFIFFNLLWVRGVPLFDPDSRRFLNVPFTALSRLLLIGWAITVASNLNLNRLKILIYSLVFSSLI
MLLGYRTNGMILLLSILFVAYYSNRIKTKELIYSSGGLFLILIAMSLQRLYTMGIGGIPLISRIDLTMSVFDIIVKDFNG
AFLGLLHYSAIFSYFGMASGARNIIANNIGVTSVSITPTIFGAVIGDYGILGIIPYFGILGIFLGLFYKIAEKLKGVYLG
VFAIVVSYLIVSIETGLLDFDVLLYYLFGFILCIYASIKYILIDKFKK

Sequences:

>Translated_368_residues
MELPTINTIKEKIKIHHLFLMVGCIYISLSSVSYYSGFLAFFSLIFFYLSYIVGEKLYYNLKLDNLIDNANITGKYKINY
SKHYKFGLILLFIGILFIFFNLLWVRGVPLFDPDSRRFLNVPFTALSRLLLIGWAITVASNLNLNRLKILIYSLVFSSLI
MLLGYRTNGMILLLSILFVAYYSNRIKTKELIYSSGGLFLILIAMSLQRLYTMGIGGIPLISRIDLTMSVFDIIVKDFNG
AFLGLLHYSAIFSYFGMASGARNIIANNIGVTSVSITPTIFGAVIGDYGILGIIPYFGILGIFLGLFYKIAEKLKGVYLG
VFAIVVSYLIVSIETGLLDFDVLLYYLFGFILCIYASIKYILIDKFKK
>Mature_368_residues
MELPTINTIKEKIKIHHLFLMVGCIYISLSSVSYYSGFLAFFSLIFFYLSYIVGEKLYYNLKLDNLIDNANITGKYKINY
SKHYKFGLILLFIGILFIFFNLLWVRGVPLFDPDSRRFLNVPFTALSRLLLIGWAITVASNLNLNRLKILIYSLVFSSLI
MLLGYRTNGMILLLSILFVAYYSNRIKTKELIYSSGGLFLILIAMSLQRLYTMGIGGIPLISRIDLTMSVFDIIVKDFNG
AFLGLLHYSAIFSYFGMASGARNIIANNIGVTSVSITPTIFGAVIGDYGILGIIPYFGILGIFLGLFYKIAEKLKGVYLG
VFAIVVSYLIVSIETGLLDFDVLLYYLFGFILCIYASIKYILIDKFKK

Specific function: Unknown

COG id: COG1822

COG function: function code S; Predicted archaeal membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002760 [H]

Pfam domain/function: PF01901 DUF70 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 41593; Mature: 41593

Theoretical pI: Translated: 9.76; Mature: 9.76

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MELPTINTIKEKIKIHHLFLMVGCIYISLSSVSYYSGFLAFFSLIFFYLSYIVGEKLYYN
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEE
LKLDNLIDNANITGKYKINYSKHYKFGLILLFIGILFIFFNLLWVRGVPLFDPDSRRFLN
EEHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEE
VPFTALSRLLLIGWAITVASNLNLNRLKILIYSLVFSSLIMLLGYRTNGMILLLSILFVA
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
YYSNRIKTKELIYSSGGLFLILIAMSLQRLYTMGIGGIPLISRIDLTMSVFDIIVKDFNG
HHHCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
AFLGLLHYSAIFSYFGMASGARNIIANNIGVTSVSITPTIFGAVIGDYGILGIIPYFGIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
GIFLGLFYKIAEKLKGVYLGVFAIVVSYLIVSIETGLLDFDVLLYYLFGFILCIYASIKY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILIDKFKK
HHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MELPTINTIKEKIKIHHLFLMVGCIYISLSSVSYYSGFLAFFSLIFFYLSYIVGEKLYYN
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEE
LKLDNLIDNANITGKYKINYSKHYKFGLILLFIGILFIFFNLLWVRGVPLFDPDSRRFLN
EEHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEE
VPFTALSRLLLIGWAITVASNLNLNRLKILIYSLVFSSLIMLLGYRTNGMILLLSILFVA
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
YYSNRIKTKELIYSSGGLFLILIAMSLQRLYTMGIGGIPLISRIDLTMSVFDIIVKDFNG
HHHCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
AFLGLLHYSAIFSYFGMASGARNIIANNIGVTSVSITPTIFGAVIGDYGILGIIPYFGIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
GIFLGLFYKIAEKLKGVYLGVFAIVVSYLIVSIETGLLDFDVLLYYLFGFILCIYASIKY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILIDKFKK
HHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]