| Definition | Methanococcus aeolicus Nankai-3, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009635 |
| Length | 1,569,500 |
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The map label for this gene is 150400673
Identifier: 150400673
GI number: 150400673
Start: 260652
End: 262316
Strand: Direct
Name: 150400673
Synonym: Maeo_0235
Alternate gene names: NA
Gene position: 260652-262316 (Clockwise)
Preceding gene: 150400672
Following gene: 150400674
Centisome position: 16.61
GC content: 26.31
Gene sequence:
>1665_bases ATGTTTGGCATTGCAAAAATTAAAGATAGGATTATAAAAAAAATTAAATCATTCGAAGGGTGGATTTCAGACGGTAATAA TTATTTAGATGTTAAAGATTACAAAAATGCAGCGGATTGTTATTATAATGCACTAAATAAAAATCCAAATGATGATAAGG CATGGTATTCTATGGCTTATGCATTATATAAACTGGGAGATTATAAAGCTTCATTTGATGCGATTAATGAGGCTTTGAAG TTAAATCAAGATAATCCAACAAAATATCATTATCTAAAAGGTAGTATTTATTATGCTCTTGGCAGATATATTGATGAAGA TGAATCCTATAATTTAGAAGATAATAAAAGTTACCTGGAAGAGGCTTTTACTAATCTAAATAGTTATTATGAACAAAATA GACAGAATACCTCCGCACTTATAAAAATGGGGAAGATATTGATATATTTTGGGGAATTTGAAAAAGCACATATTATTTTT AAAAAATGTTATAATTTAAATCCAAATAGTGTATGTAGAGATTTTATAAAAAATTATAATATTACAATTAAAAATATAGA TAGTTTTGAATATATTGAAAGAGGATTATCTTTACTTAACAGCAAAAAATATATTGATGCAATAAAATATATCAATAAAG CATATGAATTAAATGAATTAAATGAGCTCCCAATATATTATAAAAGTTGTATTTATGAGTATTTTAGAGACTATAAAAAA GCACTATCTTGTATAGATACTTCTTTAAGAATGGTCGAGAGAGACATATTTTTTAGTAAAAAAGGAGATATTCTTTTTAA ATTAGGAAAATACAACGATGCAATCAACTGCTATGAAAAAGCACTGGATATTAATGACGATTTACCTTATGCATACTTGG GGTTAGGTATATTATATTATAATATTGAAAAATATGATTTTGCCCTTGAATGCTTTGACAACTTATTTGAGCTATATATG GAGCATTTAACTGATGATGAGAAATATCTGATTACAACATATACACTCATTGGAATGGGGGACATCACCAACAATATTGA TTTTTTTGAAGAAGCCCTTAATTATATTGATAAACAGATTAACAGAGATATGGATAATATAGATTTATGGAGTCTAAAAG GATATGTCTTATTTAAAATGGGAAAATATAGGGAAACACTTGGGGTATATAATAATGCGTTGAGTATAGACCCCACCAAT ATAGGAATATTAGAATCCATTGCCATCACTTATGAAAATCTTGGAAAATTTAATGATGCCATTAGAACATACGAAAAACT TTTAAAATTAAATCCGGACGACGAGAAATACATTAATGCAAAATACGGTGCTGAAAATTTAATGTTTGAAAATAAAACAA CCCATAAAATCATCACATCACCATTGTTAAATGAAATTACCCTACATTATAAGATAAAAAATATTGAAATATATATTATG GAACTGGTAGTAAAATATGTAAATGAAAATAATCCTACGGTGGCCTACCATCTGCTTATACATTTGGAAGAATATATGGA CAGTAATGAATTTCCAGAAATAGAGATATTAAAGAGAAAACTAATGATTGAGATATATAAATATATTGAGAATAAAAGAA ATGTTGATGATTACACATTAAATCTTACTAAACAATTGCTGTTATCAATTAAAGAATATCAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AATAGTCTTCCTACCAAAAAGATAAAAGATAAAAAATATAAATTATAATTATTTATATTGATGTATATTTAAGTGTAATT TTAATAAAACAGGCGATAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAAAGGACATTATTATTATTATTATTATTTATATATTACATAAATTATTATGGTGACGCCATGAACAAAATCGGTGTAG TTTATGAGGATACGGGAATA
Product: TPR repeat-containing protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 554; Mature: 554
Protein sequence:
>554_residues MFGIAKIKDRIIKKIKSFEGWISDGNNYLDVKDYKNAADCYYNALNKNPNDDKAWYSMAYALYKLGDYKASFDAINEALK LNQDNPTKYHYLKGSIYYALGRYIDEDESYNLEDNKSYLEEAFTNLNSYYEQNRQNTSALIKMGKILIYFGEFEKAHIIF KKCYNLNPNSVCRDFIKNYNITIKNIDSFEYIERGLSLLNSKKYIDAIKYINKAYELNELNELPIYYKSCIYEYFRDYKK ALSCIDTSLRMVERDIFFSKKGDILFKLGKYNDAINCYEKALDINDDLPYAYLGLGILYYNIEKYDFALECFDNLFELYM EHLTDDEKYLITTYTLIGMGDITNNIDFFEEALNYIDKQINRDMDNIDLWSLKGYVLFKMGKYRETLGVYNNALSIDPTN IGILESIAITYENLGKFNDAIRTYEKLLKLNPDDEKYINAKYGAENLMFENKTTHKIITSPLLNEITLHYKIKNIEIYIM ELVVKYVNENNPTVAYHLLIHLEEYMDSNEFPEIEILKRKLMIEIYKYIENKRNVDDYTLNLTKQLLLSIKEYQ
Sequences:
>Translated_554_residues MFGIAKIKDRIIKKIKSFEGWISDGNNYLDVKDYKNAADCYYNALNKNPNDDKAWYSMAYALYKLGDYKASFDAINEALK LNQDNPTKYHYLKGSIYYALGRYIDEDESYNLEDNKSYLEEAFTNLNSYYEQNRQNTSALIKMGKILIYFGEFEKAHIIF KKCYNLNPNSVCRDFIKNYNITIKNIDSFEYIERGLSLLNSKKYIDAIKYINKAYELNELNELPIYYKSCIYEYFRDYKK ALSCIDTSLRMVERDIFFSKKGDILFKLGKYNDAINCYEKALDINDDLPYAYLGLGILYYNIEKYDFALECFDNLFELYM EHLTDDEKYLITTYTLIGMGDITNNIDFFEEALNYIDKQINRDMDNIDLWSLKGYVLFKMGKYRETLGVYNNALSIDPTN IGILESIAITYENLGKFNDAIRTYEKLLKLNPDDEKYINAKYGAENLMFENKTTHKIITSPLLNEITLHYKIKNIEIYIM ELVVKYVNENNPTVAYHLLIHLEEYMDSNEFPEIEILKRKLMIEIYKYIENKRNVDDYTLNLTKQLLLSIKEYQ >Mature_554_residues MFGIAKIKDRIIKKIKSFEGWISDGNNYLDVKDYKNAADCYYNALNKNPNDDKAWYSMAYALYKLGDYKASFDAINEALK LNQDNPTKYHYLKGSIYYALGRYIDEDESYNLEDNKSYLEEAFTNLNSYYEQNRQNTSALIKMGKILIYFGEFEKAHIIF KKCYNLNPNSVCRDFIKNYNITIKNIDSFEYIERGLSLLNSKKYIDAIKYINKAYELNELNELPIYYKSCIYEYFRDYKK ALSCIDTSLRMVERDIFFSKKGDILFKLGKYNDAINCYEKALDINDDLPYAYLGLGILYYNIEKYDFALECFDNLFELYM EHLTDDEKYLITTYTLIGMGDITNNIDFFEEALNYIDKQINRDMDNIDLWSLKGYVLFKMGKYRETLGVYNNALSIDPTN IGILESIAITYENLGKFNDAIRTYEKLLKLNPDDEKYINAKYGAENLMFENKTTHKIITSPLLNEITLHYKIKNIEIYIM ELVVKYVNENNPTVAYHLLIHLEEYMDSNEFPEIEILKRKLMIEIYKYIENKRNVDDYTLNLTKQLLLSIKEYQ
Specific function: Unknown
COG id: COG0457
COG function: function code R; FOG: TPR repeat
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 13 TPR repeats [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR001440 - InterPro: IPR013026 - InterPro: IPR011990 - InterPro: IPR019734 [H]
Pfam domain/function: PF00515 TPR_1 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 65604; Mature: 65604
Theoretical pI: Translated: 4.93; Mature: 4.93
Prosite motif: PS50005 TPR ; PS50293 TPR_REGION
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.3 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 3.4 %Cys+Met (Translated Protein) 1.3 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 3.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFGIAKIKDRIIKKIKSFEGWISDGNNYLDVKDYKNAADCYYNALNKNPNDDKAWYSMAY CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH ALYKLGDYKASFDAINEALKLNQDNPTKYHYLKGSIYYALGRYIDEDESYNLEDNKSYLE HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHH EAFTNLNSYYEQNRQNTSALIKMGKILIYFGEFEKAHIIFKKCYNLNPNSVCRDFIKNYN HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCC ITIKNIDSFEYIERGLSLLNSKKYIDAIKYINKAYELNELNELPIYYKSCIYEYFRDYKK EEEEECCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH ALSCIDTSLRMVERDIFFSKKGDILFKLGKYNDAINCYEKALDINDDLPYAYLGLGILYY HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHEE NIEKYDFALECFDNLFELYMEHLTDDEKYLITTYTLIGMGDITNNIDFFEEALNYIDKQI EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH NRDMDNIDLWSLKGYVLFKMGKYRETLGVYNNALSIDPTNIGILESIAITYENLGKFNDA CCCCCCCEEEEECCEEEEECCHHHHHHHHHCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH IRTYEKLLKLNPDDEKYINAKYGAENLMFENKTTHKIITSPLLNEITLHYKIKNIEIYIM HHHHHHHHCCCCCCHHEEECCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHEEEEEEEECHHHHHH ELVVKYVNENNPTVAYHLLIHLEEYMDSNEFPEIEILKRKLMIEIYKYIENKRNVDDYTL HHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH NLTKQLLLSIKEYQ HHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MFGIAKIKDRIIKKIKSFEGWISDGNNYLDVKDYKNAADCYYNALNKNPNDDKAWYSMAY CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH ALYKLGDYKASFDAINEALKLNQDNPTKYHYLKGSIYYALGRYIDEDESYNLEDNKSYLE HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHH EAFTNLNSYYEQNRQNTSALIKMGKILIYFGEFEKAHIIFKKCYNLNPNSVCRDFIKNYN HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCC ITIKNIDSFEYIERGLSLLNSKKYIDAIKYINKAYELNELNELPIYYKSCIYEYFRDYKK EEEEECCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH ALSCIDTSLRMVERDIFFSKKGDILFKLGKYNDAINCYEKALDINDDLPYAYLGLGILYY HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHEE NIEKYDFALECFDNLFELYMEHLTDDEKYLITTYTLIGMGDITNNIDFFEEALNYIDKQI EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH NRDMDNIDLWSLKGYVLFKMGKYRETLGVYNNALSIDPTNIGILESIAITYENLGKFNDA CCCCCCCEEEEECCEEEEECCHHHHHHHHHCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH IRTYEKLLKLNPDDEKYINAKYGAENLMFENKTTHKIITSPLLNEITLHYKIKNIEIYIM HHHHHHHHCCCCCCHHEEECCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHEEEEEEEECHHHHHH ELVVKYVNENNPTVAYHLLIHLEEYMDSNEFPEIEILKRKLMIEIYKYIENKRNVDDYTL HHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH NLTKQLLLSIKEYQ HHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087 [H]