Definition Methanococcus aeolicus Nankai-3, complete genome.
Accession NC_009635
Length 1,569,500

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The map label for this gene is 150400610

Identifier: 150400610

GI number: 150400610

Start: 190324

End: 191625

Strand: Reverse

Name: 150400610

Synonym: Maeo_0172

Alternate gene names: NA

Gene position: 191625-190324 (Counterclockwise)

Preceding gene: 150400611

Following gene: 150400608

Centisome position: 12.21

GC content: 26.96

Gene sequence:

>1302_bases
ATGTCATTTAATTTAAAAAATTTAAAAAAAGATGGACTTTTAAAAGATAGCATATTTATGATTTTTTCAAATATCTATTC
AAAAGGAATGGGATATTTATTTTATTTTTTAACTGCTTTAATATTAGGAACGGAAGGATTTGGAACTCTTAGAGGACTTC
TTCCACTTATGGATATAATAACTATATTTTTTTGTTCTGGAATACCGCCTTCAATAGCAAAACATCTATCAGAAAATGAA
AATTCTAATAATGAGTGGATAATATCTATTTTAAAAATCATGATATTATTTTCAATATTGGGAGCTCCCATAATAATACT
ATTAAAATATATATTGGGGGGAGGTTATTCTACCATAGATATTAGTATATATATTGCTGTGGTGTTGGCTGTTATATGTT
CTTCATTTATCTCGTGGAATAGAGGAGTTTTGCAGGGCAGTTTAAAAATAAAGGAATTGTCTTTAACATGGATTATTGAA
AATACTTCAAAAATAATATTTTTAATTATATTTGCCTTATTATTTGGTGTAATGGGTGCATTTTTATCGATATCCTTTGC
ATATCTAATTGGCGGGATTTTTGGATATTATTTATTATTAAAATATATTAAAATAGATAATATAAATATAAAAAACATAA
ATTTATTTAAATGGGACAATAAACACAATAAAAAGGTAAAACAAGTATTATATTATGCCATTCCCATAGCATTGGGGACC
GCTTCATATCGTCTTTTAAATGACATTGATAGTATTGCCATTATGTCATTATTGGGAGCGTATGATAATGGTATTTATGG
TTATGCTTCGTTATTATCTCGGGCGGTATTTTTATTTGCTTCGGCGATATCCATACCATTAATACCACGAATAGCAAAAA
CCAAGGATATTAATTATTTAAAAAAAGGTTTATTATTAAATTTCTTTATTGTAATTCCTGTTCTTGCAGTGGTATTTATA
TTTGCGGGGGAGCTCCTAAAATTATTCTTTGGAATTGTTAACAATGATGCCGTGAATTGCTTAAAGATATTGTCAATTTC
AGCAGGTTTTATGAGTTCTTATACTGTATGTAGCTCATCATTACAGGGATTAGGTAGGGCTAAAATACCACTTTATATAT
TAATTGTAGGAATATTATTAAATATAATTTTAAATTATACCTTAATACCAAAAATAGGAATAATTGGGGGAGCTTATGCT
ACGCTAATAAGTTCTATGTCCATATTTTTAATAATTTTAGCGTATATATATTATGGTGTATTTGGGAGCTCCCAAAAGAA
AAAAATATTAAATCTTAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATCCCTACTAAAATATGATAACAATATACTACTAATAGGATAACAAAGGACGGATAAGGACAGTTATTGAAGATTAACT
ATATTTTACTTTGGGGTAAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAACTTTGGTCTTCTACATCATAGGTTAATTTATCTACGACTTCATGTTTTTCATTTGGCACAAATCTATCCTCTAAAT
CGGCCAATACTTTTTTAATT

Product: polysaccharide biosynthesis protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 433; Mature: 432

Protein sequence:

>433_residues
MSFNLKNLKKDGLLKDSIFMIFSNIYSKGMGYLFYFLTALILGTEGFGTLRGLLPLMDIITIFFCSGIPPSIAKHLSENE
NSNNEWIISILKIMILFSILGAPIIILLKYILGGGYSTIDISIYIAVVLAVICSSFISWNRGVLQGSLKIKELSLTWIIE
NTSKIIFLIIFALLFGVMGAFLSISFAYLIGGIFGYYLLLKYIKIDNINIKNINLFKWDNKHNKKVKQVLYYAIPIALGT
ASYRLLNDIDSIAIMSLLGAYDNGIYGYASLLSRAVFLFASAISIPLIPRIAKTKDINYLKKGLLLNFFIVIPVLAVVFI
FAGELLKLFFGIVNNDAVNCLKILSISAGFMSSYTVCSSSLQGLGRAKIPLYILIVGILLNIILNYTLIPKIGIIGGAYA
TLISSMSIFLIILAYIYYGVFGSSQKKKILNLK

Sequences:

>Translated_433_residues
MSFNLKNLKKDGLLKDSIFMIFSNIYSKGMGYLFYFLTALILGTEGFGTLRGLLPLMDIITIFFCSGIPPSIAKHLSENE
NSNNEWIISILKIMILFSILGAPIIILLKYILGGGYSTIDISIYIAVVLAVICSSFISWNRGVLQGSLKIKELSLTWIIE
NTSKIIFLIIFALLFGVMGAFLSISFAYLIGGIFGYYLLLKYIKIDNINIKNINLFKWDNKHNKKVKQVLYYAIPIALGT
ASYRLLNDIDSIAIMSLLGAYDNGIYGYASLLSRAVFLFASAISIPLIPRIAKTKDINYLKKGLLLNFFIVIPVLAVVFI
FAGELLKLFFGIVNNDAVNCLKILSISAGFMSSYTVCSSSLQGLGRAKIPLYILIVGILLNIILNYTLIPKIGIIGGAYA
TLISSMSIFLIILAYIYYGVFGSSQKKKILNLK
>Mature_432_residues
SFNLKNLKKDGLLKDSIFMIFSNIYSKGMGYLFYFLTALILGTEGFGTLRGLLPLMDIITIFFCSGIPPSIAKHLSENEN
SNNEWIISILKIMILFSILGAPIIILLKYILGGGYSTIDISIYIAVVLAVICSSFISWNRGVLQGSLKIKELSLTWIIEN
TSKIIFLIIFALLFGVMGAFLSISFAYLIGGIFGYYLLLKYIKIDNINIKNINLFKWDNKHNKKVKQVLYYAIPIALGTA
SYRLLNDIDSIAIMSLLGAYDNGIYGYASLLSRAVFLFASAISIPLIPRIAKTKDINYLKKGLLLNFFIVIPVLAVVFIF
AGELLKLFFGIVNNDAVNCLKILSISAGFMSSYTVCSSSLQGLGRAKIPLYILIVGILLNIILNYTLIPKIGIIGGAYAT
LISSMSIFLIILAYIYYGVFGSSQKKKILNLK

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR002797 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 47954; Mature: 47822

Theoretical pI: Translated: 9.97; Mature: 9.97

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSFNLKNLKKDGLLKDSIFMIFSNIYSKGMGYLFYFLTALILGTEGFGTLRGLLPLMDII
CCCCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
TIFFCSGIPPSIAKHLSENENSNNEWIISILKIMILFSILGAPIIILLKYILGGGYSTID
HHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
ISIYIAVVLAVICSSFISWNRGVLQGSLKIKELSLTWIIENTSKIIFLIIFALLFGVMGA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCEEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLSISFAYLIGGIFGYYLLLKYIKIDNINIKNINLFKWDNKHNKKVKQVLYYAIPIALGT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ASYRLLNDIDSIAIMSLLGAYDNGIYGYASLLSRAVFLFASAISIPLIPRIAKTKDINYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCHHHH
KKGLLLNFFIVIPVLAVVFIFAGELLKLFFGIVNNDAVNCLKILSISAGFMSSYTVCSSS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQGLGRAKIPLYILIVGILLNIILNYTLIPKIGIIGGAYATLISSMSIFLIILAYIYYGV
HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGSSQKKKILNLK
CCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SFNLKNLKKDGLLKDSIFMIFSNIYSKGMGYLFYFLTALILGTEGFGTLRGLLPLMDII
CCCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
TIFFCSGIPPSIAKHLSENENSNNEWIISILKIMILFSILGAPIIILLKYILGGGYSTID
HHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
ISIYIAVVLAVICSSFISWNRGVLQGSLKIKELSLTWIIENTSKIIFLIIFALLFGVMGA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCEEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLSISFAYLIGGIFGYYLLLKYIKIDNINIKNINLFKWDNKHNKKVKQVLYYAIPIALGT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ASYRLLNDIDSIAIMSLLGAYDNGIYGYASLLSRAVFLFASAISIPLIPRIAKTKDINYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCHHHH
KKGLLLNFFIVIPVLAVVFIFAGELLKLFFGIVNNDAVNCLKILSISAGFMSSYTVCSSS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQGLGRAKIPLYILIVGILLNIILNYTLIPKIGIIGGAYATLISSMSIFLIILAYIYYGV
HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGSSQKKKILNLK
CCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]