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Definition Parabacteroides distasonis ATCC 8503 chromosome, complete genome.
Accession NC_009615
Length 4,811,379

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The map label for this gene is 150009592

Identifier: 150009592

GI number: 150009592

Start: 3594453

End: 3596162

Strand: Reverse

Name: 150009592

Synonym: BDI_3005

Alternate gene names: NA

Gene position: 3596162-3594453 (Counterclockwise)

Preceding gene: 150009600

Following gene: 150009591

Centisome position: 74.74

GC content: 34.85

Gene sequence:

>1710_bases
ATGAAGTCATTTATATATATACTATTAACTTCCTTGACTTTCCTTGTGGTAGGATGCCAAAATGAATCTGAGGAAATCCG
TTTGATCAATCAGGCGGAACGCCTGTTTGATGCCTATCCGGATAGCGTAATCACTACATTGGATTCCATTCCGCTCCCGG
AAGAGATGAGTCCCCGTCTGATAGCCCGTTGGTGTATGTTGTACGCACGTGCCGCCGATAAAATAGAGGACGAAATGCCT
TATACGAACCAGCTTGAGATCGCCTTGAAATACTATCAAAAGAAAAAGATGCGGGAAGAGGAGGCTGAGATCGGCCTTTA
TCTGGGGCGTTCGTATGTGGAGGATAAGGAGTACGAGAAGGCAATGAGGGCTTACTCCGATGCGCTGGAGGTAGCGTTGG
CGATTAAGAACTATAATCGTGCCGGGTATATTTGTAGTTATATGGGGGATTTGTATGAACTGGATGATCGTTATGTGTTA
GCTGCAAAAAAATATAAGGAGAGCGGACGGTATTTTCGATTGGCCGGTAATATGAAAAGCTATGTGCGTTCGTTTGTGAA
TGAGGGAAGGAGTTATATGGATGTTGATTCTAATTATTTAGCTTTAACTATATTGAAGCGAGCAGAAGTGATAATAGATT
CCTTGAGAGTAGATGAGGTTAGAAATTATGTATACAATGGTCTAGGTAATATATTTAATGTTTTGGAAAAATATGATTTA
GCTGAAAAATATTTATTGAAGAGCATAAAAGAGGATTCGAGTGATACTGCTTCGGATTATTTGACCTTATCAGATCTTGA
GCAAAAGCGTGGAAATTTAGAACAAGCGGAAAATTATCTTCAAAAGGCTAATAGTGTATCCATAGATAATGATTTTGTAC
CGGCTACTATTGCTTATCATTATTATAAAATAAATAAAGAAAGAGATGATTATAAAAGAGCTTTGTCTTTTTATGAAGAA
TATGTAGCAGCAGAGGATTCCCTTATGAATATAAGTAAATCTGTCGATATATATGATACAGAACAAAAATATGAACATTT
GAAATTGCATAATGAAAATATAAGATTACTATTAAAGGGGCAAAGGAATTATACTTTTATATTGATATTGTTATTTTTAT
GTGCTTTACTCATTATTGTCTATTTAGCTACGATAAGAAGAAAGAATCGTTCACTTTTAAAACAACAAGAAAAAATTAAT
ACTTTGAATCAAAGCATATATCAATTATATGCAGAACTTCGGAGAAAGAGTGATGAACTAATCCAATTGCAAAATACTCA
GTATTCTTCGGTGAAAATGCAAGTGGAATATGAAAATGTACAGAAAGAGGTAGATAGCTTGAGATCTCGATTATTCGAAT
TAAGAGAATCTAAAATTCTCAATAGTAATTTAGCTAAAAAAATAAAGAAAATATCTCAAACTGTGCAGCCTAATCATTCT
GAAGCACCCGTTTCCGAAAAAATGTGGATTGATATTGAAGTTTTGATGATGGAAGTTTACCCTAGTGTTATAAAGGTACT
GAAGGATGCAGGCTTGTCACCATCGGAGATGCATCTTTGTTTCCTTACATTATTTAAACTTGATTCAACAGCTATATCTA
TCCTTTTAAATATTATTCCTACTTCCGTCGATCGTACACGTTTGCGAGTACGAAAGAAATTAAATTGGGAAGGTAAACAA
GGATTGTATGAATCTCTTGTTAATATTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGACTTATTGTGTGTTTTTTCTTCTTGTATTTGTTATTTTGTTGTTCTATCGTTTGTTTATGAATTAAAAATATTTAATT
TTGCTTATCTATAATAAAGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATGTAATAAACCTTCATTTAAGGGGCTCTACGATTGTTTGTCTATGTATTTGTTTTTATAGTATTTGATTGTCAAGTGT
TTACGTTTTTTTCTTTGTCT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 569; Mature: 569

Protein sequence:

>569_residues
MKSFIYILLTSLTFLVVGCQNESEEIRLINQAERLFDAYPDSVITTLDSIPLPEEMSPRLIARWCMLYARAADKIEDEMP
YTNQLEIALKYYQKKKMREEEAEIGLYLGRSYVEDKEYEKAMRAYSDALEVALAIKNYNRAGYICSYMGDLYELDDRYVL
AAKKYKESGRYFRLAGNMKSYVRSFVNEGRSYMDVDSNYLALTILKRAEVIIDSLRVDEVRNYVYNGLGNIFNVLEKYDL
AEKYLLKSIKEDSSDTASDYLTLSDLEQKRGNLEQAENYLQKANSVSIDNDFVPATIAYHYYKINKERDDYKRALSFYEE
YVAAEDSLMNISKSVDIYDTEQKYEHLKLHNENIRLLLKGQRNYTFILILLFLCALLIIVYLATIRRKNRSLLKQQEKIN
TLNQSIYQLYAELRRKSDELIQLQNTQYSSVKMQVEYENVQKEVDSLRSRLFELRESKILNSNLAKKIKKISQTVQPNHS
EAPVSEKMWIDIEVLMMEVYPSVIKVLKDAGLSPSEMHLCFLTLFKLDSTAISILLNIIPTSVDRTRLRVRKKLNWEGKQ
GLYESLVNI

Sequences:

>Translated_569_residues
MKSFIYILLTSLTFLVVGCQNESEEIRLINQAERLFDAYPDSVITTLDSIPLPEEMSPRLIARWCMLYARAADKIEDEMP
YTNQLEIALKYYQKKKMREEEAEIGLYLGRSYVEDKEYEKAMRAYSDALEVALAIKNYNRAGYICSYMGDLYELDDRYVL
AAKKYKESGRYFRLAGNMKSYVRSFVNEGRSYMDVDSNYLALTILKRAEVIIDSLRVDEVRNYVYNGLGNIFNVLEKYDL
AEKYLLKSIKEDSSDTASDYLTLSDLEQKRGNLEQAENYLQKANSVSIDNDFVPATIAYHYYKINKERDDYKRALSFYEE
YVAAEDSLMNISKSVDIYDTEQKYEHLKLHNENIRLLLKGQRNYTFILILLFLCALLIIVYLATIRRKNRSLLKQQEKIN
TLNQSIYQLYAELRRKSDELIQLQNTQYSSVKMQVEYENVQKEVDSLRSRLFELRESKILNSNLAKKIKKISQTVQPNHS
EAPVSEKMWIDIEVLMMEVYPSVIKVLKDAGLSPSEMHLCFLTLFKLDSTAISILLNIIPTSVDRTRLRVRKKLNWEGKQ
GLYESLVNI
>Mature_569_residues
MKSFIYILLTSLTFLVVGCQNESEEIRLINQAERLFDAYPDSVITTLDSIPLPEEMSPRLIARWCMLYARAADKIEDEMP
YTNQLEIALKYYQKKKMREEEAEIGLYLGRSYVEDKEYEKAMRAYSDALEVALAIKNYNRAGYICSYMGDLYELDDRYVL
AAKKYKESGRYFRLAGNMKSYVRSFVNEGRSYMDVDSNYLALTILKRAEVIIDSLRVDEVRNYVYNGLGNIFNVLEKYDL
AEKYLLKSIKEDSSDTASDYLTLSDLEQKRGNLEQAENYLQKANSVSIDNDFVPATIAYHYYKINKERDDYKRALSFYEE
YVAAEDSLMNISKSVDIYDTEQKYEHLKLHNENIRLLLKGQRNYTFILILLFLCALLIIVYLATIRRKNRSLLKQQEKIN
TLNQSIYQLYAELRRKSDELIQLQNTQYSSVKMQVEYENVQKEVDSLRSRLFELRESKILNSNLAKKIKKISQTVQPNHS
EAPVSEKMWIDIEVLMMEVYPSVIKVLKDAGLSPSEMHLCFLTLFKLDSTAISILLNIIPTSVDRTRLRVRKKLNWEGKQ
GLYESLVNI

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 66509; Mature: 66509

Theoretical pI: Translated: 6.42; Mature: 6.42

Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN ; PS50005 TPR ; PS50293 TPR_REGION

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKSFIYILLTSLTFLVVGCQNESEEIRLINQAERLFDAYPDSVITTLDSIPLPEEMSPRL
CCHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH
IARWCMLYARAADKIEDEMPYTNQLEIALKYYQKKKMREEEAEIGLYLGRSYVEDKEYEK
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AMRAYSDALEVALAIKNYNRAGYICSYMGDLYELDDRYVLAAKKYKESGRYFRLAGNMKS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHCCCEEEEECCHHH
YVRSFVNEGRSYMDVDSNYLALTILKRAEVIIDSLRVDEVRNYVYNGLGNIFNVLEKYDL
HHHHHHHCCCCEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AEKYLLKSIKEDSSDTASDYLTLSDLEQKRGNLEQAENYLQKANSVSIDNDFVPATIAYH
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHEEHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHEEE
YYKINKERDDYKRALSFYEEYVAAEDSLMNISKSVDIYDTEQKYEHLKLHNENIRLLLKG
EEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEC
QRNYTFILILLFLCALLIIVYLATIRRKNRSLLKQQEKINTLNQSIYQLYAELRRKSDEL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
IQLQNTQYSSVKMQVEYENVQKEVDSLRSRLFELRESKILNSNLAKKIKKISQTVQPNHS
EEECCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
EAPVSEKMWIDIEVLMMEVYPSVIKVLKDAGLSPSEMHLCFLTLFKLDSTAISILLNIIP
CCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
TSVDRTRLRVRKKLNWEGKQGLYESLVNI
CCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MKSFIYILLTSLTFLVVGCQNESEEIRLINQAERLFDAYPDSVITTLDSIPLPEEMSPRL
CCHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH
IARWCMLYARAADKIEDEMPYTNQLEIALKYYQKKKMREEEAEIGLYLGRSYVEDKEYEK
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AMRAYSDALEVALAIKNYNRAGYICSYMGDLYELDDRYVLAAKKYKESGRYFRLAGNMKS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHCCCEEEEECCHHH
YVRSFVNEGRSYMDVDSNYLALTILKRAEVIIDSLRVDEVRNYVYNGLGNIFNVLEKYDL
HHHHHHHCCCCEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AEKYLLKSIKEDSSDTASDYLTLSDLEQKRGNLEQAENYLQKANSVSIDNDFVPATIAYH
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHEEHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHEEE
YYKINKERDDYKRALSFYEEYVAAEDSLMNISKSVDIYDTEQKYEHLKLHNENIRLLLKG
EEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEC
QRNYTFILILLFLCALLIIVYLATIRRKNRSLLKQQEKINTLNQSIYQLYAELRRKSDEL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
IQLQNTQYSSVKMQVEYENVQKEVDSLRSRLFELRESKILNSNLAKKIKKISQTVQPNHS
EEECCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
EAPVSEKMWIDIEVLMMEVYPSVIKVLKDAGLSPSEMHLCFLTLFKLDSTAISILLNIIP
CCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
TSVDRTRLRVRKKLNWEGKQGLYESLVNI
CCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA