| Definition | Haemophilus influenzae PittGG chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009567 |
| Length | 1,887,192 |
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The map label for this gene is mukB [H]
Identifier: 148826844
GI number: 148826844
Start: 107452
End: 111984
Strand: Direct
Name: mukB [H]
Synonym: CGSHiGG_00570
Alternate gene names: 148826844
Gene position: 107452-111984 (Clockwise)
Preceding gene: 148826843
Following gene: 148826845
Centisome position: 5.69
GC content: 39.71
Gene sequence:
>4533_bases ATGTCTGATGTTTTTGAATTAGAAAATGAAATCGAATTAGAGAGCGATGAAGTCATTATGGAAAATGAAAACGTCGAAGA AATCGTTGATGCTCCTATACCTTTTAGCATGACGACAAATAATGGTGTAGAGCGTGGTAAATTTCGTTCTTTAACCTTAA TTAACTGGAATGGTTTTTTTGCCCGTACTTTTGATTTAGACGAATTAGTTACCACGCTTTCTGGTGGTAACGGTGCGGGG AAATCAACCACAATGGCTGGATTTGTGACCGCATTAATTCCCGATTTAACCCTTTTACATTTCCGTAATACAACAGAGGC TGGTTCTACAGGCGGTTCTCGCGATAAAGGTTTACATGGTAAATTGCGTCCAGGTGTTTGTTACGCGGTATTAGATACTA TTAACTCACGTCATCAACGTATTCTTGTTGGTGTGCGTCTGCAACAAATTGCAGGTCGTGATAAAAAGGTGGATTTAAAA ACTTTCTCAATTCAAGGTGTCGAATTATCTCAAAATCCAACCGCACTTTTCACTGAAACAGTGGGCGAACGTCAAGCACG TGTCCTTAATTTAAACGAACTCAAAGATAAAATTGAAAATATCGGTGCGCAATTTAAACAATATCATTCCATCACTGATT ATCACGGCATGATGTTCGATTTAGGTATTATTCCGAAACGTTTACGTTCAGCATCAGACCGAAGCAAATTCTATAAACTT ATCGAAGCGTCTTTATACGGTGGTATTTCCAGCGCAATCACACGTTCTTTACGTGACTATTTATTGCCAGAAAATTTAGG TGTACGTAAAGCTTTCCAAGATATGGAAAGTGCATTACGTGAAAACCGTATGACTTTAGAAGCGATTAAGGTCACGCAAT CAGATCGAGATTTATTCAAACATTTAATTACTGAAACCACCAACTATGTTGCTTCGGATTATATGCGTAATGCGAATGAA CGCCGTGGCAATATTGAGGCTGCATTAGAATCTCGTCGTGAGTGGTATAAAGCAAAAGCAGAGCAGAATTTATCTCAACA TCGTTTAGTTGATTTAAGTCGAGAAGCGGCTGAATTGGCAGAAAATGAACGGACTTTAGAAGTTGATCACCAAAGTGCGG TTGATCATCTTAATTTAGTGTTAAATGCTTTACGTCATCAAGAAAAAATCACGCGCTATCAAGAAGATATTGCAGAACTT ACCGAGCGTTTAGAAGAACAAAAAATGGTGGTTGAAGATGCGAATGATGCGTTAGAAGAAAGCCAAGCCCAATTTGAGCA AACTGAAATTGAAATTGATGCGGTGCGTGCCCAATTAGCTGACTATCAAAAAGCATTAGATGCCCAACAAACTCGCGCAC TTCAATATCAACAAGCCATTGCAGCCCTTGAAAAAGCGAAAACATTATGCGGTTTAGCGGATTTAAGTGTTAAAAATGTA GAAGATTATCACGCAGAATTTGAAGCCCATGCTGAAAGTTTAACGGAAACCGTACTTGAGCTTGAGCACAAAATGTCTAT TTCTGAAGCGGCAAAATCTCAGTTCGATAAAGCGTACCAATTGGTATGCAAAATTGCGGGTGAAATGCCTCGTTCTGCGG CGTGGGAAAGTGCGAAAGAATTATTACGTGAATATCCAAGCCAAAAATTGCAGGCACAACAAACACCACAACTTCGCACA AAATTACATGAACTTGAGCAACGTTATGCACAACAACAAAGTGCGGTCAAATTACTTAATGATTTTAATCAACGTACTAA TTTAAGTTTACAAACAGCAGAAGAATTAGAGGATTATCACGCCGAGCAAGAAGCGTTAATTGAAGACATTTCAGCAGGAC TTTCAGAACAAGTGGAAAACCGTTCTACGCTTCGTCAAAAACGTGAAAATTTAACCGCACTTTATGATGAAAATGCGCGT AAAGCACCAGCATGGCTGACGGCTCAAGCTGCATTGGAACGTCTAGAACAACAAAGTGGCGAGACGTTTGAACATAGCCA AGATGTGATGAATTTTATGCAATCACAACTTGTGAAAGAACGTGAACTCACGATGCAACGTGATCAACTTGAACAAAAAC GTTTGCAATTAGATGAACAAATTTCTCGTTTAAGTCAGCCAGATGGTTCAGAAGATCCACGCTTAAATATGCTGGCAGAA CGTTTTGGTGGAGTACTGCTTTCAGAGCTTTACGATGATGTAACAATTGAAGATGCACCTTATTTCTCCGCACTTTACGG GCCTTCGCGTCATGCTATTGTTGTGCGTGATCTCAATGCTGTGCGTGAACAACTTGCGCAATTAGAAGATTGCCCCGATG ATTTGTATTTAATTGAAGGCGATCCTACCGCATTTGACGACAGCGTATTATCCGCACAAGAACTTGAGCTAGGTGTTGTC GTGCAAGTTTCAGATCGTGAATTACGCTATTCAAGATTCCCTGAAATTCCATTATTTGGGAGTGCAGCACGTGAAAAACG TTTAGAAGAATTACAAATTGAACGTGATGAAGTGGCAGAACAACATGCCCAAATTGCGTTTGATGTACAAAAATACCAAC GTTTACACGAACATTTCAGCCAATTTGTTGGGTTACATTTAGCACTGGCGTTCCAGCCAAATCCAGAAGCGTTAATGTCT GAGATTAATCGCGAACGCAATGAAATTGATCGTGAATTAAACCAATTTAATAACGGCGAACAACAATTACGCATTCAATT AGATAATGCAAAAGAAAAACTGCAGTTACTCAACAAGTTAATTCCACAACTCAATGTATTAGCTGATGAGGATTTAATTG ATCGTATTGAAGAATGTCGTGAGCAATTAGATATTGCAGAGCAAGATGAATATTTTATTCGTCAATATGGCGTAACGTTG TCACAATTAGAGCCTATAGCCAATAGTTTACAAAGTGATCCAGAAAATTACGAAGGCTTAAAAAATGAATTAACTCAAGC GATTGAGCGTCAAAAACAAGTTCAACAACGTGTATTTGCGTTAGCTGATGTTGTACAACGTAAACCGCATTTTGGTTATG AAGATGCAGGGCAGGCTGAAACTTCTGAACTCAATGAAAAACTTCGCCAACGTTTAGAACAAATGCAAGCACAGCGAGAT ACACAACGTGAGCAAGTTCGTCAAAAACAAAGTCAATTTGCTGAATATAATCGCGTATTGATTCAGTTACAAAGTTCTTA CGATAGTAAATATCAACTCTTAAATGAATTGATTGGTGAAATTAGCGATCTTGGCGTGAGAGCTGATGATGGTGCCGAAG AGCGCGCGCGTATCCGTCGTGATGAATTACATCAACAACTTTCAACAAGCCGTCAGCGTCGTTCTTATGTAGAAAAACAA CTCACATTAATTGAAAGCGAAGCTGACAACTTAAATCGTCTTATCCGAAAAACCGAACGTGATTATAAAACTCAACGTGA ATTAGTTGTAGCAGCGAAAGTGAGTTGGTGTGTGGTTTTACGTTTATCACGTAATTCTGATATGGAAAAACGCCTCAATC GCCGAGAGCTCGCTTATTTATCTGCAGATGAGTTACGTTCAATGTCAGATAAAGCATTAGGCGCGTTGCGTACAGCAGTG GCGGATAATGAATATTTACGTGATAGCCTAAGAGTGTCTGAAGATAGTCGCAAACCTGAAAATAAAGTGCGATTCTTTAT TGCGGTATATCAACACCTACGTGAACGTATTCGCCAAGACATTATTAAAACCGATGATCCAATTGATGCCATTGAACAAA TGGAAATTGAGCTTTCTCGTTTAACGGCTGAATTAACTGGCCGTGAGAAAAAATTGGCAATCAGCTCTGAAAGTGTTGCA AATATTATGCGTAAAACGATTCAGCGTGAACAAAACCGTATTCGTATGCTTAACCAAGGCTTACAAAACATTGCGTTTGG TCAGGTAAAATCTGTTCGTTTGGTAGTGAATATTCGTGATACCCATGCCATGTTGCTGGATGCACTTTCTGGTCAGCAAA ATGAATATCAAGATTTATTCAACGATAATCGCATCACCTTCTCTGAAGCTATGGCGAAGCTCTATCAACGCATTAATCCA CATATTGATATGGGGCAACGCACAGCGCAAACAATTGGTGAAGAATTGTTAGATTACCGTAATTATCTTGAGCTTGAAGT GGAAGTATTCCGTGGTGCTGATGGTTGGTTACGTGCAGAAAGTGGCGCACTTTCTACGGGTGAAGCTATCGGTACAGGTA TGTCAATTCTCTTAATGGTTGTTCAAAGCTGGGAAGAAGAAAGCCGTCGAATTCGTGGTAAAGATATTGTGCCTTGTCGC TTGTTGTTCTTAGATGAAGCGGCGCGTTTAGATGGTAAATCTATTTCTACCTTATTCGAACTTTGCGAACGTTTAGATAT GCAGTTGCTTATTGCCGCGCCAGAAAACATTAGCCCGGAAAAAGGTACAACCTATAAACTCGTGCGTAAAATCGCAGGCA ACCAAGAGCACGTACACGTTGTTGGTTTACGCGGATTCGGTGCGACAGAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CACCAGAATCCTTAGCGTTGGAAAAACAAGCGCAATTAATGGAAAATGATACGAAAAGTGCGGATGAAATTGACGAAGAA TTTGACGGAGAACAAGAATA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAATAGAAGGGAAGTGCGGTTGAAATTTGAAGATTTTTGACCGCACTTAAGCCTTTAAGGAAGGAATAATGAAAATCTT TACATCAAAAAAAGGACAAT
Product: cell division protein MukB
Products: NA
Alternate protein names: Structural maintenance of chromosome-related protein [H]
Number of amino acids: Translated: 1510; Mature: 1509
Protein sequence:
>1510_residues MSDVFELENEIELESDEVIMENENVEEIVDAPIPFSMTTNNGVERGKFRSLTLINWNGFFARTFDLDELVTTLSGGNGAG KSTTMAGFVTALIPDLTLLHFRNTTEAGSTGGSRDKGLHGKLRPGVCYAVLDTINSRHQRILVGVRLQQIAGRDKKVDLK TFSIQGVELSQNPTALFTETVGERQARVLNLNELKDKIENIGAQFKQYHSITDYHGMMFDLGIIPKRLRSASDRSKFYKL IEASLYGGISSAITRSLRDYLLPENLGVRKAFQDMESALRENRMTLEAIKVTQSDRDLFKHLITETTNYVASDYMRNANE RRGNIEAALESRREWYKAKAEQNLSQHRLVDLSREAAELAENERTLEVDHQSAVDHLNLVLNALRHQEKITRYQEDIAEL TERLEEQKMVVEDANDALEESQAQFEQTEIEIDAVRAQLADYQKALDAQQTRALQYQQAIAALEKAKTLCGLADLSVKNV EDYHAEFEAHAESLTETVLELEHKMSISEAAKSQFDKAYQLVCKIAGEMPRSAAWESAKELLREYPSQKLQAQQTPQLRT KLHELEQRYAQQQSAVKLLNDFNQRTNLSLQTAEELEDYHAEQEALIEDISAGLSEQVENRSTLRQKRENLTALYDENAR KAPAWLTAQAALERLEQQSGETFEHSQDVMNFMQSQLVKERELTMQRDQLEQKRLQLDEQISRLSQPDGSEDPRLNMLAE RFGGVLLSELYDDVTIEDAPYFSALYGPSRHAIVVRDLNAVREQLAQLEDCPDDLYLIEGDPTAFDDSVLSAQELELGVV VQVSDRELRYSRFPEIPLFGSAAREKRLEELQIERDEVAEQHAQIAFDVQKYQRLHEHFSQFVGLHLALAFQPNPEALMS EINRERNEIDRELNQFNNGEQQLRIQLDNAKEKLQLLNKLIPQLNVLADEDLIDRIEECREQLDIAEQDEYFIRQYGVTL SQLEPIANSLQSDPENYEGLKNELTQAIERQKQVQQRVFALADVVQRKPHFGYEDAGQAETSELNEKLRQRLEQMQAQRD TQREQVRQKQSQFAEYNRVLIQLQSSYDSKYQLLNELIGEISDLGVRADDGAEERARIRRDELHQQLSTSRQRRSYVEKQ LTLIESEADNLNRLIRKTERDYKTQRELVVAAKVSWCVVLRLSRNSDMEKRLNRRELAYLSADELRSMSDKALGALRTAV ADNEYLRDSLRVSEDSRKPENKVRFFIAVYQHLRERIRQDIIKTDDPIDAIEQMEIELSRLTAELTGREKKLAISSESVA NIMRKTIQREQNRIRMLNQGLQNIAFGQVKSVRLVVNIRDTHAMLLDALSGQQNEYQDLFNDNRITFSEAMAKLYQRINP HIDMGQRTAQTIGEELLDYRNYLELEVEVFRGADGWLRAESGALSTGEAIGTGMSILLMVVQSWEEESRRIRGKDIVPCR LLFLDEAARLDGKSISTLFELCERLDMQLLIAAPENISPEKGTTYKLVRKIAGNQEHVHVVGLRGFGATE
Sequences:
>Translated_1510_residues MSDVFELENEIELESDEVIMENENVEEIVDAPIPFSMTTNNGVERGKFRSLTLINWNGFFARTFDLDELVTTLSGGNGAG KSTTMAGFVTALIPDLTLLHFRNTTEAGSTGGSRDKGLHGKLRPGVCYAVLDTINSRHQRILVGVRLQQIAGRDKKVDLK TFSIQGVELSQNPTALFTETVGERQARVLNLNELKDKIENIGAQFKQYHSITDYHGMMFDLGIIPKRLRSASDRSKFYKL IEASLYGGISSAITRSLRDYLLPENLGVRKAFQDMESALRENRMTLEAIKVTQSDRDLFKHLITETTNYVASDYMRNANE RRGNIEAALESRREWYKAKAEQNLSQHRLVDLSREAAELAENERTLEVDHQSAVDHLNLVLNALRHQEKITRYQEDIAEL TERLEEQKMVVEDANDALEESQAQFEQTEIEIDAVRAQLADYQKALDAQQTRALQYQQAIAALEKAKTLCGLADLSVKNV EDYHAEFEAHAESLTETVLELEHKMSISEAAKSQFDKAYQLVCKIAGEMPRSAAWESAKELLREYPSQKLQAQQTPQLRT KLHELEQRYAQQQSAVKLLNDFNQRTNLSLQTAEELEDYHAEQEALIEDISAGLSEQVENRSTLRQKRENLTALYDENAR KAPAWLTAQAALERLEQQSGETFEHSQDVMNFMQSQLVKERELTMQRDQLEQKRLQLDEQISRLSQPDGSEDPRLNMLAE RFGGVLLSELYDDVTIEDAPYFSALYGPSRHAIVVRDLNAVREQLAQLEDCPDDLYLIEGDPTAFDDSVLSAQELELGVV VQVSDRELRYSRFPEIPLFGSAAREKRLEELQIERDEVAEQHAQIAFDVQKYQRLHEHFSQFVGLHLALAFQPNPEALMS EINRERNEIDRELNQFNNGEQQLRIQLDNAKEKLQLLNKLIPQLNVLADEDLIDRIEECREQLDIAEQDEYFIRQYGVTL SQLEPIANSLQSDPENYEGLKNELTQAIERQKQVQQRVFALADVVQRKPHFGYEDAGQAETSELNEKLRQRLEQMQAQRD TQREQVRQKQSQFAEYNRVLIQLQSSYDSKYQLLNELIGEISDLGVRADDGAEERARIRRDELHQQLSTSRQRRSYVEKQ LTLIESEADNLNRLIRKTERDYKTQRELVVAAKVSWCVVLRLSRNSDMEKRLNRRELAYLSADELRSMSDKALGALRTAV ADNEYLRDSLRVSEDSRKPENKVRFFIAVYQHLRERIRQDIIKTDDPIDAIEQMEIELSRLTAELTGREKKLAISSESVA NIMRKTIQREQNRIRMLNQGLQNIAFGQVKSVRLVVNIRDTHAMLLDALSGQQNEYQDLFNDNRITFSEAMAKLYQRINP HIDMGQRTAQTIGEELLDYRNYLELEVEVFRGADGWLRAESGALSTGEAIGTGMSILLMVVQSWEEESRRIRGKDIVPCR LLFLDEAARLDGKSISTLFELCERLDMQLLIAAPENISPEKGTTYKLVRKIAGNQEHVHVVGLRGFGATE >Mature_1509_residues SDVFELENEIELESDEVIMENENVEEIVDAPIPFSMTTNNGVERGKFRSLTLINWNGFFARTFDLDELVTTLSGGNGAGK STTMAGFVTALIPDLTLLHFRNTTEAGSTGGSRDKGLHGKLRPGVCYAVLDTINSRHQRILVGVRLQQIAGRDKKVDLKT FSIQGVELSQNPTALFTETVGERQARVLNLNELKDKIENIGAQFKQYHSITDYHGMMFDLGIIPKRLRSASDRSKFYKLI EASLYGGISSAITRSLRDYLLPENLGVRKAFQDMESALRENRMTLEAIKVTQSDRDLFKHLITETTNYVASDYMRNANER RGNIEAALESRREWYKAKAEQNLSQHRLVDLSREAAELAENERTLEVDHQSAVDHLNLVLNALRHQEKITRYQEDIAELT ERLEEQKMVVEDANDALEESQAQFEQTEIEIDAVRAQLADYQKALDAQQTRALQYQQAIAALEKAKTLCGLADLSVKNVE DYHAEFEAHAESLTETVLELEHKMSISEAAKSQFDKAYQLVCKIAGEMPRSAAWESAKELLREYPSQKLQAQQTPQLRTK LHELEQRYAQQQSAVKLLNDFNQRTNLSLQTAEELEDYHAEQEALIEDISAGLSEQVENRSTLRQKRENLTALYDENARK APAWLTAQAALERLEQQSGETFEHSQDVMNFMQSQLVKERELTMQRDQLEQKRLQLDEQISRLSQPDGSEDPRLNMLAER FGGVLLSELYDDVTIEDAPYFSALYGPSRHAIVVRDLNAVREQLAQLEDCPDDLYLIEGDPTAFDDSVLSAQELELGVVV QVSDRELRYSRFPEIPLFGSAAREKRLEELQIERDEVAEQHAQIAFDVQKYQRLHEHFSQFVGLHLALAFQPNPEALMSE INRERNEIDRELNQFNNGEQQLRIQLDNAKEKLQLLNKLIPQLNVLADEDLIDRIEECREQLDIAEQDEYFIRQYGVTLS QLEPIANSLQSDPENYEGLKNELTQAIERQKQVQQRVFALADVVQRKPHFGYEDAGQAETSELNEKLRQRLEQMQAQRDT QREQVRQKQSQFAEYNRVLIQLQSSYDSKYQLLNELIGEISDLGVRADDGAEERARIRRDELHQQLSTSRQRRSYVEKQL TLIESEADNLNRLIRKTERDYKTQRELVVAAKVSWCVVLRLSRNSDMEKRLNRRELAYLSADELRSMSDKALGALRTAVA DNEYLRDSLRVSEDSRKPENKVRFFIAVYQHLRERIRQDIIKTDDPIDAIEQMEIELSRLTAELTGREKKLAISSESVAN IMRKTIQREQNRIRMLNQGLQNIAFGQVKSVRLVVNIRDTHAMLLDALSGQQNEYQDLFNDNRITFSEAMAKLYQRINPH IDMGQRTAQTIGEELLDYRNYLELEVEVFRGADGWLRAESGALSTGEAIGTGMSILLMVVQSWEEESRRIRGKDIVPCRL LFLDEAARLDGKSISTLFELCERLDMQLLIAAPENISPEKGTTYKLVRKIAGNQEHVHVVGLRGFGATE
Specific function: Plays a central role in chromosome condensation, segregation and cell cycle progression. Functions as a homodimer, which is essential for chromosome partition. Involved in negative DNA supercoiling in vivo, and by this means organize and compact chromosom
COG id: COG3096
COG function: function code D; Uncharacterized protein involved in chromosome partitioning
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasm, nucleoid. Note=Restricted to the nucleoid region (By similarity) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the SMC family. MukB subfamily [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1787154, Length=1468, Percent_Identity=65.2588555858311, Blast_Score=1920, Evalue=0.0,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR012090 - InterPro: IPR007406 [H]
Pfam domain/function: PF04310 MukB [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 173187; Mature: 173056
Theoretical pI: Translated: 4.78; Mature: 4.78
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 2.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSDVFELENEIELESDEVIMENENVEEIVDAPIPFSMTTNNGVERGKFRSLTLINWNGFF CCCHHHCCCCCCCCCCCEEECCCCHHHHHCCCCCCEECCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCE ARTFDLDELVTTLSGGNGAGKSTTMAGFVTALIPDLTLLHFRNTTEAGSTGGSRDKGLHG EEECCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC KLRPGVCYAVLDTINSRHQRILVGVRLQQIAGRDKKVDLKTFSIQGVELSQNPTALFTET CCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEECEEECCCCCHHHHHH VGERQARVLNLNELKDKIENIGAQFKQYHSITDYHGMMFDLGIIPKRLRSASDRSKFYKL HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH IEASLYGGISSAITRSLRDYLLPENLGVRKAFQDMESALRENRMTLEAIKVTQSDRDLFK HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHH HLITETTNYVASDYMRNANERRGNIEAALESRREWYKAKAEQNLSQHRLVDLSREAAELA HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH ENERTLEVDHQSAVDHLNLVLNALRHQEKITRYQEDIAELTERLEEQKMVVEDANDALEE CCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SQAQFEQTEIEIDAVRAQLADYQKALDAQQTRALQYQQAIAALEKAKTLCGLADLSVKNV 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA