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The map label for this gene is yiaN [C]

Identifier: 148825670

GI number: 148825670

Start: 615222

End: 616493

Strand: Direct

Name: yiaN [C]

Synonym: CGSHiEE_03050

Alternate gene names: 148825670

Gene position: 615222-616493 (Clockwise)

Preceding gene: 148825669

Following gene: 148825671

Centisome position: 33.93

GC content: 34.04

Gene sequence:

>1272_bases
ATGTTACTATTATTTTTGTGTAGTTTATTCTTATTGTTATTTCTTGGTGTACCTGTAGCACTATCAATGCTGTTGAGTGC
GAGTATTATGCTATATCATCTTGATATGTTTGATACGCAATTAATTACAGAAAACTTTGTGATGGGAACGAATAATTTTC
CTTTGATGGCTATTCCTTTCTTTATGCTTACTGGAGAAATAATGAAGCATGGTGGAATTTCTGAGCGAATCATTAATTTT
GCAACAAGTATGGTTGGTCATATTAAAGGTGGTTTAGGTTATGTTGCGATCATTTCTGGGTTGATATTTGCAGGGTTATC
TGGTTCTGCGGTAGCGGATACGGCCGCGTTAGGTGCAATACTAATTCCTATGATGATTTCTAAAAAATATGATGGTGCTC
GTTCCACAGGATTAATTTGTGCTGCAGGTATTATTTCAGTTGTTATTCCTCCAAGCATTCCTATGATCATTTACGGTATT
ACTGCTGGAGCATCCATCACTAAATTATTTATGGGGGGAACTGTACCAGGCTTATTAATGGTCGTTGGATTATGGGTTAC
TTGGAAAATTTTGTATAGAAATAATGATACAAGTCTAGAAAGAAAACAAACTGGCAAAGAAAGATGGGTTGCTTTTAAAA
AAGCATTTTGGCCTTTATTATTACCTATCATTATTATTGTGGGATTAAGAGGAGGGATTTTTACTCCAACAGAAGCGGGA
GTTGTTGCTGCAATTTATGCTGGCATAGTAAGTATTGCTTATAAAGGCTTAACATTTTCTAAATTAAAAGACGTCTTCAT
TGGTACCATCAAAACAACATCAATGGTAATGTTTGTTGCTGCATCAGCAATGATATCTGCTTTTGCGATTACAGTTGCTC
AAATTCCAACAGAATTAGTCCAAACGATTAAAGGATTAACTGATAGTCCGACAATTTTAATGTTTATTATAATGCTATTT
TTATTACTTGTTGGATGTGTAATGGATTTAATTCCTGCGGTATTAATCTTTGTTCCAGTCTTATTACCAGTGTTAAGAGC
ATATAATATTGATATTGCGTATTTTGGAATCATGATGGTGATTAATTTATCTATAGGATTAATAACACCGCCTGTGGGAA
CAGTTTTGTATGTAGGCTCAGGGATATCAAAATTAGGGATAGGAGCATTATCCAAAGGAATTGCTCCATTCTTATTTGTG
TACGCAATTATTATGATGTTGATCGTATTTTTTCCTGAAATTGTAATTGTTCCAATGAATTGGTTATCTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATATTTAGCTGCTGTTATATCTGCCGTATCTTACTTTTTTATTGTCATGTTTAGCATGATTAAAGACTATAAAGAATCCT
CTGATAAATAGGAGCTTATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTATTAGGAAGTTACATCATGAAAAAAATAGCATTTATCGGCGAGTGTATGATTGAACTCAATGGGAAACCCTTTGCGG
AAATGTGGCAAAGTTATGGT

Product: putative TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, large permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 423; Mature: 423

Protein sequence:

>423_residues
MLLLFLCSLFLLLFLGVPVALSMLLSASIMLYHLDMFDTQLITENFVMGTNNFPLMAIPFFMLTGEIMKHGGISERIINF
ATSMVGHIKGGLGYVAIISGLIFAGLSGSAVADTAALGAILIPMMISKKYDGARSTGLICAAGIISVVIPPSIPMIIYGI
TAGASITKLFMGGTVPGLLMVVGLWVTWKILYRNNDTSLERKQTGKERWVAFKKAFWPLLLPIIIIVGLRGGIFTPTEAG
VVAAIYAGIVSIAYKGLTFSKLKDVFIGTIKTTSMVMFVAASAMISAFAITVAQIPTELVQTIKGLTDSPTILMFIIMLF
LLLVGCVMDLIPAVLIFVPVLLPVLRAYNIDIAYFGIMMVINLSIGLITPPVGTVLYVGSGISKLGIGALSKGIAPFLFV
YAIIMMLIVFFPEIVIVPMNWLS

Sequences:

>Translated_423_residues
MLLLFLCSLFLLLFLGVPVALSMLLSASIMLYHLDMFDTQLITENFVMGTNNFPLMAIPFFMLTGEIMKHGGISERIINF
ATSMVGHIKGGLGYVAIISGLIFAGLSGSAVADTAALGAILIPMMISKKYDGARSTGLICAAGIISVVIPPSIPMIIYGI
TAGASITKLFMGGTVPGLLMVVGLWVTWKILYRNNDTSLERKQTGKERWVAFKKAFWPLLLPIIIIVGLRGGIFTPTEAG
VVAAIYAGIVSIAYKGLTFSKLKDVFIGTIKTTSMVMFVAASAMISAFAITVAQIPTELVQTIKGLTDSPTILMFIIMLF
LLLVGCVMDLIPAVLIFVPVLLPVLRAYNIDIAYFGIMMVINLSIGLITPPVGTVLYVGSGISKLGIGALSKGIAPFLFV
YAIIMMLIVFFPEIVIVPMNWLS
>Mature_423_residues
MLLLFLCSLFLLLFLGVPVALSMLLSASIMLYHLDMFDTQLITENFVMGTNNFPLMAIPFFMLTGEIMKHGGISERIINF
ATSMVGHIKGGLGYVAIISGLIFAGLSGSAVADTAALGAILIPMMISKKYDGARSTGLICAAGIISVVIPPSIPMIIYGI
TAGASITKLFMGGTVPGLLMVVGLWVTWKILYRNNDTSLERKQTGKERWVAFKKAFWPLLLPIIIIVGLRGGIFTPTEAG
VVAAIYAGIVSIAYKGLTFSKLKDVFIGTIKTTSMVMFVAASAMISAFAITVAQIPTELVQTIKGLTDSPTILMFIIMLF
LLLVGCVMDLIPAVLIFVPVLLPVLRAYNIDIAYFGIMMVINLSIGLITPPVGTVLYVGSGISKLGIGALSKGIAPFLFV
YAIIMMLIVFFPEIVIVPMNWLS

Specific function: Unknown

COG id: COG1593

COG function: function code G; TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, large permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the TRAP transporter large permease family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI48994950, Length=423, Percent_Identity=47.0449172576832, Blast_Score=339, Evalue=2e-94,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR010656
- InterPro:   IPR004681 [H]

Pfam domain/function: PF06808 DctM [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45397; Mature: 45397

Theoretical pI: Translated: 9.55; Mature: 9.55

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
5.9 %Met     (Translated Protein)
6.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
5.9 %Met     (Mature Protein)
6.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLLLFLCSLFLLLFLGVPVALSMLLSASIMLYHLDMFDTQLITENFVMGTNNFPLMAIPF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHH
FMLTGEIMKHGGISERIINFATSMVGHIKGGLGYVAIISGLIFAGLSGSAVADTAALGAI
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
LIPMMISKKYDGARSTGLICAAGIISVVIPPSIPMIIYGITAGASITKLFMGGTVPGLLM
HHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHCCCHHHHHH
VVGLWVTWKILYRNNDTSLERKQTGKERWVAFKKAFWPLLLPIIIIVGLRGGIFTPTEAG
HHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCH
VVAAIYAGIVSIAYKGLTFSKLKDVFIGTIKTTSMVMFVAASAMISAFAITVAQIPTELV
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QTIKGLTDSPTILMFIIMLFLLLVGCVMDLIPAVLIFVPVLLPVLRAYNIDIAYFGIMMV
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
INLSIGLITPPVGTVLYVGSGISKLGIGALSKGIAPFLFVYAIIMMLIVFFPEIVIVPMN
HHHHHHCCCCCHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCH
WLS
HCC
>Mature Secondary Structure
MLLLFLCSLFLLLFLGVPVALSMLLSASIMLYHLDMFDTQLITENFVMGTNNFPLMAIPF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHH
FMLTGEIMKHGGISERIINFATSMVGHIKGGLGYVAIISGLIFAGLSGSAVADTAALGAI
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
LIPMMISKKYDGARSTGLICAAGIISVVIPPSIPMIIYGITAGASITKLFMGGTVPGLLM
HHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHCCCHHHHHH
VVGLWVTWKILYRNNDTSLERKQTGKERWVAFKKAFWPLLLPIIIIVGLRGGIFTPTEAG
HHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCH
VVAAIYAGIVSIAYKGLTFSKLKDVFIGTIKTTSMVMFVAASAMISAFAITVAQIPTELV
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QTIKGLTDSPTILMFIIMLFLLLVGCVMDLIPAVLIFVPVLLPVLRAYNIDIAYFGIMMV
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
INLSIGLITPPVGTVLYVGSGISKLGIGALSKGIAPFLFVYAIIMMLIVFFPEIVIVPMN
HHHHHHCCCCCHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCH
WLS
HCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]