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The map label for this gene is yaaJ [C]

Identifier: 148825567

GI number: 148825567

Start: 484165

End: 485604

Strand: Direct

Name: yaaJ [C]

Synonym: CGSHiEE_02460

Alternate gene names: 148825567

Gene position: 484165-485604 (Clockwise)

Preceding gene: 148825566

Following gene: 148825569

Centisome position: 26.7

GC content: 40.35

Gene sequence:

>1440_bases
ATGGACTTTGAATTTTCAAAAATGTTAGAAGAAGTGCTAACTTGGATAGTCGCACACCTTGATGGACCTTTATGGGATGC
CACAATTGTTATTTTGCTTGGGACTGGTCTATTTTTTACCATTACAACAGGATTTGTGCAGTTCCGTTTATTCCCAGCAA
GCCTTCGTGAAATGTGGTTTGGTCGAGCGGTGGAGGGGAGTTCATTAACGCCTTTTCAAGCGTTTACGACAGGTCTTGCG
AGCCGTGTTGGTGTGGGTAACATTGGTGGGGTTGCAACGGCAATCGCCTTGGGAGGCGAAGGCGCAGTGTTTTGGATGTG
GGTAACGGCATTTATTGGTATGTCGAGTGCTTTCGCTGAATCTACCCTTGCTCAATTATTTAAAATTCAAGATAAAGATG
GCTCATTCCGTGGTGGCCCTGCTTATTATATTGTGCAAGGTTTAAAATCACGTTGTATGGCAGTGGCTTTTGCACTTGCA
TTAATTTTTACATTTGGTTTTGCCTTTAATTCTGTGCAGGCAAACTCTATTGTTGAAGCAACCAGCAATGCGTGGAATTG
GAAAGGGGAATATGTCGGTATTTCATTAGTAATTTTTACCGCACTTATTATTTTCGGTGGCGTTAAGCGTATTGCGATTA
TTTCGAGCAACCTTGTACCAATGATGGCACTTTTCTATTTGATTATGGCGGTAATTATTCTTGGCATGCATATTGATATG
ATCCCTTCCGTGATTCATCGTATTGTTCAAAGTGCATTTAGTTTTGATGCCGCCGCTGGCGGAATGTTTGGTGCATTGGT
ATCGAAAGCAATGATGATGGGGATTAAACGTGGTTTATTCTCAAACGAAGCGGGGATGGGATCTGCGCCTAATTCGGCTG
CAGCAGCTCACGTTAAGCATCCAGTTAGCCAAGGTTTAGTGCAAATGCTCGGTGTGTTTGTTGATACAATGATCGTTTGT
ACTTGTACTGCCGTTATTATTTTGCTTTCGAATAATTATGGTAGCGAAACACTCAAAAGTATCTCACTTACGCAAAATGC
TTTGCAATACCACATAGGTGAATTTGGGGTGTATTTCCTGGCGTTTATCTTATTGTTATTCGCTTATTCTTCTATTATTG
GTAACTATGCTTATGCGGAAAGCAATATCCGTTTTATAAAAAATAAACCTTGGTTTGTATTTTTGTTCCGTTTAATGGTG
CTATTTTTCGTGTATTTCGGTGCGGTTCGCTCTGGCAATGTGGTGTGGAATTTTGCAGATACGGTGATGGCAGTCATGGC
AATCATTAACTTGATCGCAATTTTGATGTTGTCGCCAATCGTATGGAAATTAATGAAAGATTATCAACGCCAGCTTAAAG
AAGGAAAAACGCCAGAGTTTAAAATTGATGAATACCCTGAATTACGTAAGAAAATATTTGATTCCAGAGTTTGGAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTCTTTTTTGTTTTTCTTTTCTTTAGAGAAATTATTAAAAAATCTCGCCTTTTCATTGAAAAACCATACAATCAAATTAT
TTATCGCTTGAGGGATGATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGATAAAATGGCTATAAAGAAATGCTCTGTCTTTCCAAAGGATTAGATTCTTATTTAAATAAATGTTTTTGATATTGTTT
CAAGCTTGGCATTTTTAATT

Product: putative Na+/alanine symporter

Products: Na (I) [Cytoplasm]; L-alanine [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 479; Mature: 479

Protein sequence:

>479_residues
MDFEFSKMLEEVLTWIVAHLDGPLWDATIVILLGTGLFFTITTGFVQFRLFPASLREMWFGRAVEGSSLTPFQAFTTGLA
SRVGVGNIGGVATAIALGGEGAVFWMWVTAFIGMSSAFAESTLAQLFKIQDKDGSFRGGPAYYIVQGLKSRCMAVAFALA
LIFTFGFAFNSVQANSIVEATSNAWNWKGEYVGISLVIFTALIIFGGVKRIAIISSNLVPMMALFYLIMAVIILGMHIDM
IPSVIHRIVQSAFSFDAAAGGMFGALVSKAMMMGIKRGLFSNEAGMGSAPNSAAAAHVKHPVSQGLVQMLGVFVDTMIVC
TCTAVIILLSNNYGSETLKSISLTQNALQYHIGEFGVYFLAFILLLFAYSSIIGNYAYAESNIRFIKNKPWFVFLFRLMV
LFFVYFGAVRSGNVVWNFADTVMAVMAIINLIAILMLSPIVWKLMKDYQRQLKEGKTPEFKIDEYPELRKKIFDSRVWK

Sequences:

>Translated_479_residues
MDFEFSKMLEEVLTWIVAHLDGPLWDATIVILLGTGLFFTITTGFVQFRLFPASLREMWFGRAVEGSSLTPFQAFTTGLA
SRVGVGNIGGVATAIALGGEGAVFWMWVTAFIGMSSAFAESTLAQLFKIQDKDGSFRGGPAYYIVQGLKSRCMAVAFALA
LIFTFGFAFNSVQANSIVEATSNAWNWKGEYVGISLVIFTALIIFGGVKRIAIISSNLVPMMALFYLIMAVIILGMHIDM
IPSVIHRIVQSAFSFDAAAGGMFGALVSKAMMMGIKRGLFSNEAGMGSAPNSAAAAHVKHPVSQGLVQMLGVFVDTMIVC
TCTAVIILLSNNYGSETLKSISLTQNALQYHIGEFGVYFLAFILLLFAYSSIIGNYAYAESNIRFIKNKPWFVFLFRLMV
LFFVYFGAVRSGNVVWNFADTVMAVMAIINLIAILMLSPIVWKLMKDYQRQLKEGKTPEFKIDEYPELRKKIFDSRVWK
>Mature_479_residues
MDFEFSKMLEEVLTWIVAHLDGPLWDATIVILLGTGLFFTITTGFVQFRLFPASLREMWFGRAVEGSSLTPFQAFTTGLA
SRVGVGNIGGVATAIALGGEGAVFWMWVTAFIGMSSAFAESTLAQLFKIQDKDGSFRGGPAYYIVQGLKSRCMAVAFALA
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IPSVIHRIVQSAFSFDAAAGGMFGALVSKAMMMGIKRGLFSNEAGMGSAPNSAAAAHVKHPVSQGLVQMLGVFVDTMIVC
TCTAVIILLSNNYGSETLKSISLTQNALQYHIGEFGVYFLAFILLLFAYSSIIGNYAYAESNIRFIKNKPWFVFLFRLMV
LFFVYFGAVRSGNVVWNFADTVMAVMAIINLIAILMLSPIVWKLMKDYQRQLKEGKTPEFKIDEYPELRKKIFDSRVWK

Specific function: Unknown

COG id: COG1115

COG function: function code E; Na+/alanine symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the sodium:alanine (SAF) symporter family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786188, Length=460, Percent_Identity=43.4782608695652, Blast_Score=349, Evalue=2e-97,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001463 [H]

Pfam domain/function: PF01235 Na_Ala_symp [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 52774; Mature: 52774

Theoretical pI: Translated: 9.33; Mature: 9.33

Prosite motif: PS00873 NA_ALANINE_SYMP

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
4.8 %Met     (Translated Protein)
5.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
4.8 %Met     (Mature Protein)
5.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Na (I) [Periplasm]; L-alanine [Periplasm] [C]

Specific reaction: Na (I) [Periplasm] + L-alanine [Periplasm] = Na (I) [Cytoplasm] + L-alanine [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]