Definition Psychrobacter sp. PRwf-1 chromosome, complete genome.
Accession NC_009524
Length 2,978,976

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The map label for this gene is yqeW [H]

Identifier: 148654084

GI number: 148654084

Start: 2852842

End: 2854704

Strand: Direct

Name: yqeW [H]

Synonym: PsycPRwf_2287

Alternate gene names: 148654084

Gene position: 2852842-2854704 (Clockwise)

Preceding gene: 148654076

Following gene: 148654085

Centisome position: 95.77

GC content: 46.48

Gene sequence:

>1863_bases
ATGAAAAATCGCTATCTCAACAGTATGGTGCCCCCTGTGATATTAAGGCACCTTAAAAAAGCAAAGTTCTTGGGATTGGG
GCTGCTGCTTATCGCCTTGGTGTACTCTTTTGTCATGAGCTCAGCTTGGCTGGTATTGTGCTATGGTCTGGCGCTATTTT
TGTTTGGTATGCAGTGTATAGAAGGCGCATTGCAAAGCGCGGCTGGCGGTAGGCTTGAGCAGATTATAGCCAAAAGCACT
GAGACTCCGATTAAGTCTTTTTTGTTCGGCATTGGGGCCACTTTTTTATTGCAGTCCACCACCTTAGTCTCTTTATTAAC
CATCGCTTTTTTGAGCACAGGCATGATTAGTCTTGCCGGCGGACTGGCGGTGATACTGGGCACCAATTTTGGGGCAACCA
GTGGTATATGGCTTTTGGCTTGGGCGGGACAAAGCTTAAGCTTAAGTCCGGCTGCACTGCCCATGCTGGTAGTGGGTGTT
TTGCTCGGCTTTATAGATAAGCGGCTCAAGGTGTTCGGTCAGGCATTGATTGGTATTGCGTTAATTTTTTTAGGGATCGA
TTCCATTAAAGACGGCTTTGGCGCCTTTGGTCAAATTGAGTTGTCTGATATTAAGGCCAGTGGTATCTCTCAAGTGCTGC
TATTCACCCTGCTGGGGTTTTTGCTCACTTGTGTACTGCAGTCCTCTCACGCCACTTTAATCTTGGTATTGGCCGCTTTG
GCTGCTGGCCAATTAACCCTCACCCAAAGCTTTGCCATTGCGCTAGGGTCTAACTTAGGCAGTAGCTTTACCACCGCCTT
GGTGGGTATGCTCAGCAGCGATAGAAATGGTCAGCGCTTGGCACTGGCGCACCTGATATATAACTGGGTGACCGCATTAT
TAGCCCTGATACTATGGCTGCCTCTTACCTTTGCTGTGGGGGCGATTGCCACTGTCATTGGGATGCACTCACCGTTGTTG
CAACTGGCCTTGTTCCACACCTTATTTAACGTATTGGGCGTTTCAGTATTTTGGGGTATTCAGCAGCCGTTTATCGAAAA
GCTGCACCTATTTTTGCCCGATAAATCACCAAAAAAACAACTGCCCGATGGGGCAGAAGCTGTACACCCCCTACATTTGC
ACCGCAATATGCTCAAGTCCACAGACACTGCCATTCATGCCGTCCATCAAGAGATTGAGCACTTAACCACCTTAGGGCTT
GAGGTGGTTTGTCATGCCATTTATGTGCCCAACGCGCAGCTATATACGCCTTCTTCTGAGCTGCCTAACCCTGCTCGGCC
GCTGCAGCTTGATGTGCAAAGCTTATACGAGTGGCAGATTAAGCCACTGTATAGTGAAATATTGAATTTCACCAGTAAAA
TAGATATCCATGCTAATAAGGTACAAAAGAAGCTTACCGATGCTCATATCAATGCCTTCCATGTGGTAGAAATGGTTAAG
CAAAGCAAGCACTTACAAAAAAATATGCAGCAATTTTTAAATACTCCTGGTACCTCCATTTATCAAGATTACATGGCGCT
GCGACAGCATCTTTTTGATATGCTCATAAGCTTTAATCGGGTACGCAGCCTACAAAAACAAAGCCTTGATAGGCAGCAGG
CCACCGAGATTTTTGTGCAGCACACAGAAGCATCCATGTCACCACACCACCATGTGCTCGACAAGCTTAGAGAGCATAAG
ATTGATAAACTGCAAGCCTCCTCGCTCATTAACGACATGAACTATGTGCGCCGTATTAATAGTGGATTGTCTGAGATTTT
AATCAATAGCCAAGATTTAAGCCTTAACAGCGTGAGCACAACTGGGTCTGCCACTAAAGTGATAGACACCCCCAATGGTG
TAGACAAGTCAGATAACGCTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGGGTTGGCTATAATCTTCAGCTCAGCTTATGATAGTATCAATTGTGCTTATTATAGCCGGATCTACCGCCCTGTCTTGC
CGTGACTTATTGGCTGTCTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTATAGCGGTGCAGACAGATGCCTCTTGCCTGCTTTTGCGTATAATGAGAGTATAGGCTATAAATTAGCGATTATCTTTG
AGCCTTTGTGCTGTATCTTT

Product: Na+/Pi-cotransporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 620; Mature: 620

Protein sequence:

>620_residues
MKNRYLNSMVPPVILRHLKKAKFLGLGLLLIALVYSFVMSSAWLVLCYGLALFLFGMQCIEGALQSAAGGRLEQIIAKST
ETPIKSFLFGIGATFLLQSTTLVSLLTIAFLSTGMISLAGGLAVILGTNFGATSGIWLLAWAGQSLSLSPAALPMLVVGV
LLGFIDKRLKVFGQALIGIALIFLGIDSIKDGFGAFGQIELSDIKASGISQVLLFTLLGFLLTCVLQSSHATLILVLAAL
AAGQLTLTQSFAIALGSNLGSSFTTALVGMLSSDRNGQRLALAHLIYNWVTALLALILWLPLTFAVGAIATVIGMHSPLL
QLALFHTLFNVLGVSVFWGIQQPFIEKLHLFLPDKSPKKQLPDGAEAVHPLHLHRNMLKSTDTAIHAVHQEIEHLTTLGL
EVVCHAIYVPNAQLYTPSSELPNPARPLQLDVQSLYEWQIKPLYSEILNFTSKIDIHANKVQKKLTDAHINAFHVVEMVK
QSKHLQKNMQQFLNTPGTSIYQDYMALRQHLFDMLISFNRVRSLQKQSLDRQQATEIFVQHTEASMSPHHHVLDKLREHK
IDKLQASSLINDMNYVRRINSGLSEILINSQDLSLNSVSTTGSATKVIDTPNGVDKSDNA

Sequences:

>Translated_620_residues
MKNRYLNSMVPPVILRHLKKAKFLGLGLLLIALVYSFVMSSAWLVLCYGLALFLFGMQCIEGALQSAAGGRLEQIIAKST
ETPIKSFLFGIGATFLLQSTTLVSLLTIAFLSTGMISLAGGLAVILGTNFGATSGIWLLAWAGQSLSLSPAALPMLVVGV
LLGFIDKRLKVFGQALIGIALIFLGIDSIKDGFGAFGQIELSDIKASGISQVLLFTLLGFLLTCVLQSSHATLILVLAAL
AAGQLTLTQSFAIALGSNLGSSFTTALVGMLSSDRNGQRLALAHLIYNWVTALLALILWLPLTFAVGAIATVIGMHSPLL
QLALFHTLFNVLGVSVFWGIQQPFIEKLHLFLPDKSPKKQLPDGAEAVHPLHLHRNMLKSTDTAIHAVHQEIEHLTTLGL
EVVCHAIYVPNAQLYTPSSELPNPARPLQLDVQSLYEWQIKPLYSEILNFTSKIDIHANKVQKKLTDAHINAFHVVEMVK
QSKHLQKNMQQFLNTPGTSIYQDYMALRQHLFDMLISFNRVRSLQKQSLDRQQATEIFVQHTEASMSPHHHVLDKLREHK
IDKLQASSLINDMNYVRRINSGLSEILINSQDLSLNSVSTTGSATKVIDTPNGVDKSDNA
>Mature_620_residues
MKNRYLNSMVPPVILRHLKKAKFLGLGLLLIALVYSFVMSSAWLVLCYGLALFLFGMQCIEGALQSAAGGRLEQIIAKST
ETPIKSFLFGIGATFLLQSTTLVSLLTIAFLSTGMISLAGGLAVILGTNFGATSGIWLLAWAGQSLSLSPAALPMLVVGV
LLGFIDKRLKVFGQALIGIALIFLGIDSIKDGFGAFGQIELSDIKASGISQVLLFTLLGFLLTCVLQSSHATLILVLAAL
AAGQLTLTQSFAIALGSNLGSSFTTALVGMLSSDRNGQRLALAHLIYNWVTALLALILWLPLTFAVGAIATVIGMHSPLL
QLALFHTLFNVLGVSVFWGIQQPFIEKLHLFLPDKSPKKQLPDGAEAVHPLHLHRNMLKSTDTAIHAVHQEIEHLTTLGL
EVVCHAIYVPNAQLYTPSSELPNPARPLQLDVQSLYEWQIKPLYSEILNFTSKIDIHANKVQKKLTDAHINAFHVVEMVK
QSKHLQKNMQQFLNTPGTSIYQDYMALRQHLFDMLISFNRVRSLQKQSLDRQQATEIFVQHTEASMSPHHHVLDKLREHK
IDKLQASSLINDMNYVRRINSGLSEILINSQDLSLNSVSTTGSATKVIDTPNGVDKSDNA

Specific function: Unknown

COG id: COG1283

COG function: function code P; Na+/phosphate symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To E.coli yjbB [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1790451, Length=352, Percent_Identity=26.1363636363636, Blast_Score=73, Evalue=5e-14,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003841
- InterPro:   IPR004633 [H]

Pfam domain/function: PF02690 Na_Pi_cotrans [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 67775; Mature: 67775

Theoretical pI: Translated: 9.19; Mature: 9.19

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKNRYLNSMVPPVILRHLKKAKFLGLGLLLIALVYSFVMSSAWLVLCYGLALFLFGMQCI
CCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EGALQSAAGGRLEQIIAKSTETPIKSFLFGIGATFLLQSTTLVSLLTIAFLSTGMISLAG
HHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GLAVILGTNFGATSGIWLLAWAGQSLSLSPAALPMLVVGVLLGFIDKRLKVFGQALIGIA
CEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIFLGIDSIKDGFGAFGQIELSDIKASGISQVLLFTLLGFLLTCVLQSSHATLILVLAAL
HHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
AAGQLTLTQSFAIALGSNLGSSFTTALVGMLSSDRNGQRLALAHLIYNWVTALLALILWL
HCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PLTFAVGAIATVIGMHSPLLQLALFHTLFNVLGVSVFWGIQQPFIEKLHLFLPDKSPKKQ
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHC
LPDGAEAVHPLHLHRNMLKSTDTAIHAVHQEIEHLTTLGLEVVCHAIYVPNAQLYTPSSE
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCC
LPNPARPLQLDVQSLYEWQIKPLYSEILNFTSKIDIHANKVQKKLTDAHINAFHVVEMVK
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QSKHLQKNMQQFLNTPGTSIYQDYMALRQHLFDMLISFNRVRSLQKQSLDRQQATEIFVQ
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HTEASMSPHHHVLDKLREHKIDKLQASSLINDMNYVRRINSGLSEILINSQDLSLNSVST
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
TGSATKVIDTPNGVDKSDNA
CCCCCEEEECCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKNRYLNSMVPPVILRHLKKAKFLGLGLLLIALVYSFVMSSAWLVLCYGLALFLFGMQCI
CCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EGALQSAAGGRLEQIIAKSTETPIKSFLFGIGATFLLQSTTLVSLLTIAFLSTGMISLAG
HHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GLAVILGTNFGATSGIWLLAWAGQSLSLSPAALPMLVVGVLLGFIDKRLKVFGQALIGIA
CEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIFLGIDSIKDGFGAFGQIELSDIKASGISQVLLFTLLGFLLTCVLQSSHATLILVLAAL
HHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
AAGQLTLTQSFAIALGSNLGSSFTTALVGMLSSDRNGQRLALAHLIYNWVTALLALILWL
HCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PLTFAVGAIATVIGMHSPLLQLALFHTLFNVLGVSVFWGIQQPFIEKLHLFLPDKSPKKQ
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHC
LPDGAEAVHPLHLHRNMLKSTDTAIHAVHQEIEHLTTLGLEVVCHAIYVPNAQLYTPSSE
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCC
LPNPARPLQLDVQSLYEWQIKPLYSEILNFTSKIDIHANKVQKKLTDAHINAFHVVEMVK
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QSKHLQKNMQQFLNTPGTSIYQDYMALRQHLFDMLISFNRVRSLQKQSLDRQQATEIFVQ
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HTEASMSPHHHVLDKLREHKIDKLQASSLINDMNYVRRINSGLSEILINSQDLSLNSVST
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
TGSATKVIDTPNGVDKSDNA
CCCCCEEEECCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8969508; 9023197; 9384377 [H]