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Definition Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 chromosome, complete genome.
Accession NC_009515
Length 1,853,160

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The map label for this gene is 148642776

Identifier: 148642776

GI number: 148642776

Start: 683076

End: 685844

Strand: Reverse

Name: 148642776

Synonym: Msm_0716

Alternate gene names: NA

Gene position: 685844-683076 (Counterclockwise)

Preceding gene: 148642777

Following gene: 148642775

Centisome position: 37.01

GC content: 36.26

Gene sequence:

>2769_bases
ATGAATAAAAAAACAATATTAACAATAAGTAAATCAGCAATCATTATTTTGATTCTGTTAGCTGTTGTTTTTGCATTAAG
AGCTCCTGCAGCGGACCTTAATATTTTGCCTACCGGTGATTTGAAGGCAGAATATGAAGATGCTTCAGGTCTTCCTTATT
TTAGTGAAATGGATTCATATTATAACTTAAGGTTGACTGAAAATTTCGTTGATCACGGTTATGTAGGAGATGAACTAGTC
GATGGTTCAAACTGGGATATGCATAGGAATTCCCCAGATGGAGATAAGATTAATTATGAGTTAGCTATTGTATGGGTAAC
GTCATTTTTCTACAATATAGCAAACCAGTTCTTCGGTGATTACACTGTTCAGGAAGTTGCATTCTGGACCGGTGCTATTG
TAGCATCTCTTGCAGTTGTTCCTGCATTTATCTTTGCTAGACGTCTGACTAATGATTTGGGTGCAATAACAGCTACATTG
ATAATTGTGCTTGCACCAAACTATTTTGCACACACATTCCCTGGATTTTTTGATACAGATATGTTCTACTATATCTTCTC
ATTATTCTTCATAATGTTCTTTATGGAGAGCTTGAGGTCTAAAAATCTTATTGCAAAAGTTGTCTTTGCAATATTGTCTA
TTGTATCTATTGGTCTTTTCTCCCAATCATGGACAGGATACATCTTTTATGTAGGTCTTATGGGTATCTTTTCAGTTGTG
TACTTAATATTATGTTATGTATTTAACATTGGTGATAGTGAAAGAGAGTTATACCCAAGTAAGGCTGCTTGGTTCGTACA
CCAGAAGGATTTAATGTCCATTGTTATTTTAGGTGTTATTGGATTTATCGGTCTTGCAGCATTTAAAGGAGTAGACGGTG
TACTTGGAATATTTGGCAGTTTAACTGGTTTATTGTCCTTGCAATCAACTTCAACTGTTGTAGGTGGATTCCCTAATGTA
CTTATTTCTGTTGCGGAATTGCAAATGCCAAGTATGCTTGGAGCAGGTATGGATTCATTCTTGCTTGCTAATTCCAATGG
TGTAATAAACGGTATTGGTGGAATTTTCGTATTCTTCGCTGGTTTAACGGTATTATTTATCTTTGCAAAAAGGATATATG
ATTATAGAAATGTTAAACAAGACGGAAACACAACTAAAAAACCGCCTAAATCCCAAAGATTGGCATCTTCTAAAAAAATT
GATGATGACCGTAAATTTAAAATATCTTTAGGTAGCGTAAGTAAATTTGCCAAAGATAATGAAGTAACTGAAGCTAAACG
TTTGAACTTAATGTTTGCTACTCTATTTATAGTATGGGTAGTAATTACAGCACTTGCAGTAAGTAGAGGTTCAAGGTTCA
TTACCACTATTGTATTGCCATTCGGTTTAATGGCAGGTATATTTGTAGGATATGCTTCTGACTATGTCAAAACTAAACTT
GATAATGACAAAATGTTAATGGCAGTTATATTGGTAACAGGATTCTTTGCATCATACCCATTAGCAGCAGTTACAGTACC
TATATTCGGTATTATATTATTCCTGTTAATTGCTATAGCTGGTGGAATAACCATATACGGACTGAAATCCAGTAAGTCTG
CATCTACTAAAGTACCTGTTAAGAAGTATGTTGCTATTATTGCTATTGCTCTTGCATTGATAACACCTACTGTTTGTGGT
GCTTATCAGACTGCTAATCAGGTAGTGCCTGGTACTAGTGATGCTATGTGGGATTCAATGGTATGGATTAATGAAAATAC
TGCTGATAATACTGTTGTTGCATCCTGGTGGGACTTCGGTTACCTCTTTGAGATTGCTGCTGACAGACAGGTAATCTTTG
ATGGAGGTAGTCAAAGTGGTAACAGTAGGGCATTCTGGCTAGGTCAGGCGATGACGACGGATAATATGGATTTGTCTGCA
GGAATATTTAGAATGTTGGGAACTTCCGGTGAAAATGCTACTAATACATTAACAGATTATACTGGCAGTCCGGGTAAAGC
AACTGATATTTTAATTGATATCCTGCCGAAAAACGCACAGGATGCTAAAAATGCATTAATTAATACATATGGTTTAACTA
CTGAGCAGGCTAATACTATTATTCCGCTTACTCATCCTGATAATCCAAGACCGGTTATCTTTGTAGCAAGTTCAGATATG
TTGCAAAAAGCTGGCTGGTGGAGTTACTTTGGTGCGTGGGACTTTGATAAGCAGAATTCCACAAACTTCAATTATTACGT
GCCTTCCCAGCAAGTAACTGTTGAACCTGGATCTACTGGCAGATTAGCTTTAATTAATGAATCCGGTTTGGAATATGATG
CAGTTATTACTAGAGGTACTGGAAACAACACTACTACTGGTCATACTGAAGCAGTATATTCAAATAACGGTTCTTTACTT
AAAATAAACGGATCAGAATTTAATCCATTGAATGTATCCCGTATCATGGTAATTGAAGGTAATCAATTAGTGAAAAATGA
ATCAATAGCTGGAGCTCCTAGCGATTCCAATTATACATTATTCCTGATGGGTGAAAATAATGTTTACACACCTATTATAA
TGCATAATAAATTGGCTGATTCAATGTTTACCAGATTGTACCTTTTAGGTGGTATGGGTCAGAATGTATTCTCCATGGTT
CATATGGAAAATGGAGTTTCATTATGGCAAGTAAATTATAACAACACGGCTGCTGGCGGAACTAGTACACCTGCTGCATC
TGGTGCTACTGATGGAAATATTGGTACTACTAGTCCGGACAGGGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTTCTTTAACATTCTTATAAATTTCAAATAAGTTTTTTAAATAATAAATTCAGTTGATGTAACTATTTTTATGTTAATT
GAATAATATCGAGGATTTTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTGATTAGGATATTTTAATCCTAATCTCTTTTTTTAATTAATAATATGGTGATTTAATGGGAATAGAGGAGAAAATAA
AAGATATTGAGGATGAAATT

Product: oligosaccharyl transferase, STT3 subunit

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 922; Mature: 922

Protein sequence:

>922_residues
MNKKTILTISKSAIIILILLAVVFALRAPAADLNILPTGDLKAEYEDASGLPYFSEMDSYYNLRLTENFVDHGYVGDELV
DGSNWDMHRNSPDGDKINYELAIVWVTSFFYNIANQFFGDYTVQEVAFWTGAIVASLAVVPAFIFARRLTNDLGAITATL
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YLILCYVFNIGDSERELYPSKAAWFVHQKDLMSIVILGVIGFIGLAAFKGVDGVLGIFGSLTGLLSLQSTSTVVGGFPNV
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DDDRKFKISLGSVSKFAKDNEVTEAKRLNLMFATLFIVWVVITALAVSRGSRFITTIVLPFGLMAGIFVGYASDYVKTKL
DNDKMLMAVILVTGFFASYPLAAVTVPIFGIILFLLIAIAGGITIYGLKSSKSASTKVPVKKYVAIIAIALALITPTVCG
AYQTANQVVPGTSDAMWDSMVWINENTADNTVVASWWDFGYLFEIAADRQVIFDGGSQSGNSRAFWLGQAMTTDNMDLSA
GIFRMLGTSGENATNTLTDYTGSPGKATDILIDILPKNAQDAKNALINTYGLTTEQANTIIPLTHPDNPRPVIFVASSDM
LQKAGWWSYFGAWDFDKQNSTNFNYYVPSQQVTVEPGSTGRLALINESGLEYDAVITRGTGNNTTTGHTEAVYSNNGSLL
KINGSEFNPLNVSRIMVIEGNQLVKNESIAGAPSDSNYTLFLMGENNVYTPIIMHNKLADSMFTRLYLLGGMGQNVFSMV
HMENGVSLWQVNYNNTAAGGTSTPAASGATDGNIGTTSPDRA

Sequences:

>Translated_922_residues
MNKKTILTISKSAIIILILLAVVFALRAPAADLNILPTGDLKAEYEDASGLPYFSEMDSYYNLRLTENFVDHGYVGDELV
DGSNWDMHRNSPDGDKINYELAIVWVTSFFYNIANQFFGDYTVQEVAFWTGAIVASLAVVPAFIFARRLTNDLGAITATL
IIVLAPNYFAHTFPGFFDTDMFYYIFSLFFIMFFMESLRSKNLIAKVVFAILSIVSIGLFSQSWTGYIFYVGLMGIFSVV
YLILCYVFNIGDSERELYPSKAAWFVHQKDLMSIVILGVIGFIGLAAFKGVDGVLGIFGSLTGLLSLQSTSTVVGGFPNV
LISVAELQMPSMLGAGMDSFLLANSNGVINGIGGIFVFFAGLTVLFIFAKRIYDYRNVKQDGNTTKKPPKSQRLASSKKI
DDDRKFKISLGSVSKFAKDNEVTEAKRLNLMFATLFIVWVVITALAVSRGSRFITTIVLPFGLMAGIFVGYASDYVKTKL
DNDKMLMAVILVTGFFASYPLAAVTVPIFGIILFLLIAIAGGITIYGLKSSKSASTKVPVKKYVAIIAIALALITPTVCG
AYQTANQVVPGTSDAMWDSMVWINENTADNTVVASWWDFGYLFEIAADRQVIFDGGSQSGNSRAFWLGQAMTTDNMDLSA
GIFRMLGTSGENATNTLTDYTGSPGKATDILIDILPKNAQDAKNALINTYGLTTEQANTIIPLTHPDNPRPVIFVASSDM
LQKAGWWSYFGAWDFDKQNSTNFNYYVPSQQVTVEPGSTGRLALINESGLEYDAVITRGTGNNTTTGHTEAVYSNNGSLL
KINGSEFNPLNVSRIMVIEGNQLVKNESIAGAPSDSNYTLFLMGENNVYTPIIMHNKLADSMFTRLYLLGGMGQNVFSMV
HMENGVSLWQVNYNNTAAGGTSTPAASGATDGNIGTTSPDRA
>Mature_922_residues
MNKKTILTISKSAIIILILLAVVFALRAPAADLNILPTGDLKAEYEDASGLPYFSEMDSYYNLRLTENFVDHGYVGDELV
DGSNWDMHRNSPDGDKINYELAIVWVTSFFYNIANQFFGDYTVQEVAFWTGAIVASLAVVPAFIFARRLTNDLGAITATL
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LQKAGWWSYFGAWDFDKQNSTNFNYYVPSQQVTVEPGSTGRLALINESGLEYDAVITRGTGNNTTTGHTEAVYSNNGSLL
KINGSEFNPLNVSRIMVIEGNQLVKNESIAGAPSDSNYTLFLMGENNVYTPIIMHNKLADSMFTRLYLLGGMGQNVFSMV
HMENGVSLWQVNYNNTAAGGTSTPAASGATDGNIGTTSPDRA

Specific function: Unknown

COG id: COG1287

COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, required for N-linked glycosylation

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the STT3 family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003674 [H]

Pfam domain/function: PF02516 STT3 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 100492; Mature: 100492

Theoretical pI: Translated: 5.09; Mature: 5.09

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNKKTILTISKSAIIILILLAVVFALRAPAADLNILPTGDLKAEYEDASGLPYFSEMDSY
CCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCC
YNLRLTENFVDHGYVGDELVDGSNWDMHRNSPDGDKINYELAIVWVTSFFYNIANQFFGD
EEEEEEHHHHCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCC
YTVQEVAFWTGAIVASLAVVPAFIFARRLTNDLGAITATLIIVLAPNYFAHTFPGFFDTD
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHCCCCCCCHH
MFYYIFSLFFIMFFMESLRSKNLIAKVVFAILSIVSIGLFSQSWTGYIFYVGLMGIFSVV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
YLILCYVFNIGDSERELYPSKAAWFVHQKDLMSIVILGVIGFIGLAAFKGVDGVLGIFGS
HHHHHHHHCCCCCHHHCCCCHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
LTGLLSLQSTSTVVGGFPNVLISVAELQMPSMLGAGMDSFLLANSNGVINGIGGIFVFFA
HHHHHEECCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCEEHHHHHHHHHH
GLTVLFIFAKRIYDYRNVKQDGNTTKKPPKSQRLASSKKIDDDRKFKISLGSVSKFAKDN
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCHHHHHCCC
EVTEAKRLNLMFATLFIVWVVITALAVSRGSRFITTIVLPFGLMAGIFVGYASDYVKTKL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
DNDKMLMAVILVTGFFASYPLAAVTVPIFGIILFLLIAIAGGITIYGLKSSKSASTKVPV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCCCH
KKYVAIIAIALALITPTVCGAYQTANQVVPGTSDAMWDSMVWINENTADNTVVASWWDFG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHCCEEEEECCCCCCCEEEEECCCC
YLFEIAADRQVIFDGGSQSGNSRAFWLGQAMTTDNMDLSAGIFRMLGTSGENATNTLTDY
EEEEEECCCEEEEECCCCCCCCCEEEEECEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC
TGSPGKATDILIDILPKNAQDAKNALINTYGLTTEQANTIIPLTHPDNPRPVIFVASSDM
CCCCCCHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEECCHH
LQKAGWWSYFGAWDFDKQNSTNFNYYVPSQQVTVEPGSTGRLALINESGLEYDAVITRGT
HHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCEEEECCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEECC
GNNTTTGHTEAVYSNNGSLLKINGSEFNPLNVSRIMVIEGNQLVKNESIAGAPSDSNYTL
CCCCCCCCEEEEEECCCCEEEECCCCCCCCCCEEEEEEECCEEECCCCCCCCCCCCCEEE
FLMGENNVYTPIIMHNKLADSMFTRLYLLGGMGQNVFSMVHMENGVSLWQVNYNNTAAGG
EEEECCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHEECCCCEEEEEECCCCCCCC
TSTPAASGATDGNIGTTSPDRA
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
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CCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCC
YNLRLTENFVDHGYVGDELVDGSNWDMHRNSPDGDKINYELAIVWVTSFFYNIANQFFGD
EEEEEEHHHHCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCC
YTVQEVAFWTGAIVASLAVVPAFIFARRLTNDLGAITATLIIVLAPNYFAHTFPGFFDTD
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHCCCCCCCHH
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EEEEEECCCEEEEECCCCCCCCCEEEEECEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC
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GNNTTTGHTEAVYSNNGSLLKINGSEFNPLNVSRIMVIEGNQLVKNESIAGAPSDSNYTL
CCCCCCCCEEEEEECCCCEEEECCCCCCCCCCEEEEEEECCEEECCCCCCCCCCCCCEEE
FLMGENNVYTPIIMHNKLADSMFTRLYLLGGMGQNVFSMVHMENGVSLWQVNYNNTAAGG
EEEECCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHEECCCCEEEEEECCCCCCCC
TSTPAASGATDGNIGTTSPDRA
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]