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The map label for this gene is nuoL [H]

Identifier: 148285166

GI number: 148285166

Start: 2107755

End: 2109662

Strand: Direct

Name: nuoL [H]

Synonym: OTBS_2164

Alternate gene names: 148285166

Gene position: 2107755-2109662 (Clockwise)

Preceding gene: 148285165

Following gene: 148285167

Centisome position: 99.09

GC content: 27.78

Gene sequence:

>1908_bases
ATGTCATTTTTAATTACATTATTACCGTGTTTACCTTTAATTTCAGGTGTAATTAGTAGATTAAATAATAGTTTTGCGAC
AAAAATAATATCGTATATAACTGTTATGTTAATTGCTAGTACTAGCTTTGCTGCAATTTTAGTTTTTTGGAATATTAGCA
AGCATAATAGTGTTGAACATATAATATTGTTTGAGTGGCTTGAGCTGTTAAATTTTAAATCACATTGGGCTATTTACATT
GATAAATTAACAGCACTAATGTTAGTCATAGTATCCTTAATTTCTACGATAGTTCATATTTATTCTATAGGTTATTTACA
TGACGATAAAGAATTACCTAAATTCATGTCATATTTATCTTTTTTTACTTTTTTTATGTTGATGTTAGTCTCATCAGATA
ATTTTTTACAGCTATTTTTTGGATGGGAAGGAGTAGGGGTAAGTTCTTACTTATTAATAGGATTTTGGCATAAAAAATAT
GCCGCAATAATTGCAGCATATAAAGCATTTATTGTTAATAGATTTGCTGACTGTGCATTTCTTTTAGCAATTATTGCTAT
TATTTATAATTGCAACTCTGTAGAATTTAAGACAGTATTTAGTCATGCTGAACAATTATCAAAAACAATAGTCTCAATTG
TTGATATTAAAATCAGTGTTTTAGACTTAATTTGTTGTTTGCTATTTATTGGATGTATGGGCAAATCTGCTCAAATTGGT
TTGCATATATGGTTACCAGATGCTATGGAAGGGCCTACTCCTGCATCAGCACTAATTCATGCTGCTACTATGGTAACAGC
TGGCATATTCTTATTGGCTAGATGTTCATTTATGTTTGAATATTCTACAGCAATATTAAATCTTATTGCTATTACTGGTG
GGTTTACTTGTATATTAACTTCAATAATTGCAGTTTGTCAAAATGATATAAAAAAAATCATTGCATATTCTACCTGTAGT
CAATTAGGTTATATGGTAATGGCATGTGGATCATCTAGTTATAATGGAGCAATGTTTCATTTACTAACGCATGCTTTTTT
TAAAGCAATGTTATTTTTAGCTGCAGGCAATGTTATACATATGACTCATCAGCAAGATTTAAATAAAATGCCGCAGCAAT
TGTGGAGAGTTATGCCTTATACTTATGGGTTATTTTGGTTAGGAACATTAGCAATTGTTGGAATATTTCCTTTTTCAGGA
TTCTATTCAAAGGATATGATACTAGAATCTGTTTATCTTACAGATAATAAATTTGTTTATTATCTGGGGATTATTGCAGT
ATTTTTCACAGCGATGTATTCAATTAAATTAATTATAGGAATTTTTCATCAACCTTCTTTTTCATCAACTAAACATTCGA
TTAAGGAAGTTTCGATAATTATGAATCTGCCGTTATTAATCTTAGCAATTGGTAGTGCTATTTCTGGATGGTATTGTTAT
AATATCTTAACTATTGGAAAAGTTGAATATTTTGCTAATTCATTATTTAATAATGGAAATTTAGAAAATTTACATATTAA
TTGCTGGATGATAAAAATACTTCCAATTTTAGTAGGAGTATTTGGCTTAATAATTGGGGGGTTAATTTATTATTATAAAA
GTAACGTGAATATTAGCATAATCAGGAGTATTAGTTCTCCAGCTAGGAACAAGTTTTATTTTGATGAAATATATAATACT
TTACTAGTGAAAACCTTTAATATTGTTTCATACTACTTAAGTATATTTGATATTAAATGCATAAATAAATTTTTAGATGA
TAGCTTGATATTTTTAGTGCAAAGTGGGTTTTCAGGTATAAAAAAAATGCAATCAGGGTATGTATCTTGCTATATATTAA
CAGCACTAGTTAGCATGACTGCATTTTTTACTTTAATTGTTATTAATTACTTTATAACTAGTAACTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGCAGCTGAATCTGCTATTGGATTAGCAATAATTGTGGTACATTTTCGTAATTGTTCTTCAATTTCAGTTAAGGATTTAA
ACAAATTGAAGGGATAAGAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGCCAATAGTAACTCAAGATATTCCTATATTATCAGTTTGTATTTCTTTGCCATTAAGTGCATTGATAATTTTGTTGCT
TATGAGATTAAGCAATTATT

Product: NADH dehydrogenase I chain L

Products: NA

Alternate protein names: NADH dehydrogenase I subunit L; NDH-1 subunit L [H]

Number of amino acids: Translated: 635; Mature: 634

Protein sequence:

>635_residues
MSFLITLLPCLPLISGVISRLNNSFATKIISYITVMLIASTSFAAILVFWNISKHNSVEHIILFEWLELLNFKSHWAIYI
DKLTALMLVIVSLISTIVHIYSIGYLHDDKELPKFMSYLSFFTFFMLMLVSSDNFLQLFFGWEGVGVSSYLLIGFWHKKY
AAIIAAYKAFIVNRFADCAFLLAIIAIIYNCNSVEFKTVFSHAEQLSKTIVSIVDIKISVLDLICCLLFIGCMGKSAQIG
LHIWLPDAMEGPTPASALIHAATMVTAGIFLLARCSFMFEYSTAILNLIAITGGFTCILTSIIAVCQNDIKKIIAYSTCS
QLGYMVMACGSSSYNGAMFHLLTHAFFKAMLFLAAGNVIHMTHQQDLNKMPQQLWRVMPYTYGLFWLGTLAIVGIFPFSG
FYSKDMILESVYLTDNKFVYYLGIIAVFFTAMYSIKLIIGIFHQPSFSSTKHSIKEVSIIMNLPLLILAIGSAISGWYCY
NILTIGKVEYFANSLFNNGNLENLHINCWMIKILPILVGVFGLIIGGLIYYYKSNVNISIIRSISSPARNKFYFDEIYNT
LLVKTFNIVSYYLSIFDIKCINKFLDDSLIFLVQSGFSGIKKMQSGYVSCYILTALVSMTAFFTLIVINYFITSN

Sequences:

>Translated_635_residues
MSFLITLLPCLPLISGVISRLNNSFATKIISYITVMLIASTSFAAILVFWNISKHNSVEHIILFEWLELLNFKSHWAIYI
DKLTALMLVIVSLISTIVHIYSIGYLHDDKELPKFMSYLSFFTFFMLMLVSSDNFLQLFFGWEGVGVSSYLLIGFWHKKY
AAIIAAYKAFIVNRFADCAFLLAIIAIIYNCNSVEFKTVFSHAEQLSKTIVSIVDIKISVLDLICCLLFIGCMGKSAQIG
LHIWLPDAMEGPTPASALIHAATMVTAGIFLLARCSFMFEYSTAILNLIAITGGFTCILTSIIAVCQNDIKKIIAYSTCS
QLGYMVMACGSSSYNGAMFHLLTHAFFKAMLFLAAGNVIHMTHQQDLNKMPQQLWRVMPYTYGLFWLGTLAIVGIFPFSG
FYSKDMILESVYLTDNKFVYYLGIIAVFFTAMYSIKLIIGIFHQPSFSSTKHSIKEVSIIMNLPLLILAIGSAISGWYCY
NILTIGKVEYFANSLFNNGNLENLHINCWMIKILPILVGVFGLIIGGLIYYYKSNVNISIIRSISSPARNKFYFDEIYNT
LLVKTFNIVSYYLSIFDIKCINKFLDDSLIFLVQSGFSGIKKMQSGYVSCYILTALVSMTAFFTLIVINYFITSN
>Mature_634_residues
SFLITLLPCLPLISGVISRLNNSFATKIISYITVMLIASTSFAAILVFWNISKHNSVEHIILFEWLELLNFKSHWAIYID
KLTALMLVIVSLISTIVHIYSIGYLHDDKELPKFMSYLSFFTFFMLMLVSSDNFLQLFFGWEGVGVSSYLLIGFWHKKYA
AIIAAYKAFIVNRFADCAFLLAIIAIIYNCNSVEFKTVFSHAEQLSKTIVSIVDIKISVLDLICCLLFIGCMGKSAQIGL
HIWLPDAMEGPTPASALIHAATMVTAGIFLLARCSFMFEYSTAILNLIAITGGFTCILTSIIAVCQNDIKKIIAYSTCSQ
LGYMVMACGSSSYNGAMFHLLTHAFFKAMLFLAAGNVIHMTHQQDLNKMPQQLWRVMPYTYGLFWLGTLAIVGIFPFSGF
YSKDMILESVYLTDNKFVYYLGIIAVFFTAMYSIKLIIGIFHQPSFSSTKHSIKEVSIIMNLPLLILAIGSAISGWYCYN
ILTIGKVEYFANSLFNNGNLENLHINCWMIKILPILVGVFGLIIGGLIYYYKSNVNISIIRSISSPARNKFYFDEIYNTL
LVKTFNIVSYYLSIFDIKCINKFLDDSLIFLVQSGFSGIKKMQSGYVSCYILTALVSMTAFFTLIVINYFITSN

Specific function: NDH-1 shuttles electrons from NADH, via FMN and iron- sulfur (Fe-S) centers, to quinones in the respiratory chain. Couples the redox reaction to proton translocation (for every two electrons transferred, four hydrogen ions are translocated across the cyto

COG id: COG1009

COG function: function code CP; NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the complex I subunit 5 family [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI251831117, Length=401, Percent_Identity=38.9027431421446, Blast_Score=249, Evalue=4e-66,
Organism=Escherichia coli, GI1788614, Length=563, Percent_Identity=33.5701598579041, Blast_Score=271, Evalue=7e-74,
Organism=Escherichia coli, GI1788829, Length=342, Percent_Identity=29.2397660818713, Blast_Score=124, Evalue=1e-29,
Organism=Escherichia coli, GI1788831, Length=352, Percent_Identity=29.2613636363636, Blast_Score=118, Evalue=1e-27,
Organism=Escherichia coli, GI1788613, Length=479, Percent_Identity=26.7223382045929, Blast_Score=103, Evalue=4e-23,
Organism=Escherichia coli, GI1788827, Length=356, Percent_Identity=27.247191011236, Blast_Score=102, Evalue=6e-23,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001750
- InterPro:   IPR001516
- InterPro:   IPR003945
- InterPro:   IPR018393 [H]

Pfam domain/function: PF00361 Oxidored_q1; PF00662 Oxidored_q1_N [H]

EC number: =1.6.99.5 [H]

Molecular weight: Translated: 71457; Mature: 71326

Theoretical pI: Translated: 8.35; Mature: 8.35

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.4 %Cys     (Translated Protein)
3.6 %Met     (Translated Protein)
6.0 %Cys+Met (Translated Protein)
2.4 %Cys     (Mature Protein)
3.5 %Met     (Mature Protein)
5.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSFLITLLPCLPLISGVISRLNNSFATKIISYITVMLIASTSFAAILVFWNISKHNSVEH
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCHH
IILFEWLELLNFKSHWAIYIDKLTALMLVIVSLISTIVHIYSIGYLHDDKELPKFMSYLS
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
FFTFFMLMLVSSDNFLQLFFGWEGVGVSSYLLIGFWHKKYAAIIAAYKAFIVNRFADCAF
HHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLAIIAIIYNCNSVEFKTVFSHAEQLSKTIVSIVDIKISVLDLICCLLFIGCMGKSAQIG
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEE
LHIWLPDAMEGPTPASALIHAATMVTAGIFLLARCSFMFEYSTAILNLIAITGGFTCILT
EEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
SIIAVCQNDIKKIIAYSTCSQLGYMVMACGSSSYNGAMFHLLTHAFFKAMLFLAAGNVIH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
MTHQQDLNKMPQQLWRVMPYTYGLFWLGTLAIVGIFPFSGFYSKDMILESVYLTDNKFVY
ECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHEEECCCCHHH
YLGIIAVFFTAMYSIKLIIGIFHQPSFSSTKHSIKEVSIIMNLPLLILAIGSAISGWYCY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
NILTIGKVEYFANSLFNNGNLENLHINCWMIKILPILVGVFGLIIGGLIYYYKSNVNISI
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE
IRSISSPARNKFYFDEIYNTLLVKTFNIVSYYLSIFDIKCINKFLDDSLIFLVQSGFSGI
EECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHH
KKMQSGYVSCYILTALVSMTAFFTLIVINYFITSN
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SFLITLLPCLPLISGVISRLNNSFATKIISYITVMLIASTSFAAILVFWNISKHNSVEH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCHH
IILFEWLELLNFKSHWAIYIDKLTALMLVIVSLISTIVHIYSIGYLHDDKELPKFMSYLS
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
FFTFFMLMLVSSDNFLQLFFGWEGVGVSSYLLIGFWHKKYAAIIAAYKAFIVNRFADCAF
HHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLAIIAIIYNCNSVEFKTVFSHAEQLSKTIVSIVDIKISVLDLICCLLFIGCMGKSAQIG
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEE
LHIWLPDAMEGPTPASALIHAATMVTAGIFLLARCSFMFEYSTAILNLIAITGGFTCILT
EEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
SIIAVCQNDIKKIIAYSTCSQLGYMVMACGSSSYNGAMFHLLTHAFFKAMLFLAAGNVIH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
MTHQQDLNKMPQQLWRVMPYTYGLFWLGTLAIVGIFPFSGFYSKDMILESVYLTDNKFVY
ECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHEEECCCCHHH
YLGIIAVFFTAMYSIKLIIGIFHQPSFSSTKHSIKEVSIIMNLPLLILAIGSAISGWYCY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
NILTIGKVEYFANSLFNNGNLENLHINCWMIKILPILVGVFGLIIGGLIYYYKSNVNISI
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE
IRSISSPARNKFYFDEIYNTLLVKTFNIVSYYLSIFDIKCINKFLDDSLIFLVQSGFSGI
EECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHH
KKMQSGYVSCYILTALVSMTAFFTLIVINYFITSN
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11557893 [H]