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The map label for this gene is 146302604

Identifier: 146302604

GI number: 146302604

Start: 5898160

End: 5899935

Strand: Reverse

Name: 146302604

Synonym: Fjoh_4877

Alternate gene names: NA

Gene position: 5899935-5898160 (Counterclockwise)

Preceding gene: 146302605

Following gene: 146302603

Centisome position: 96.77

GC content: 26.8

Gene sequence:

>1776_bases
GTGATAAAAATTGTTATAAAAAATAAATACAAATCTATAGACGTTTGTGAGTTTGAACTTCCTAATTTTTCAGTTTTAAC
AGGTTTAAATGGGAGTGGTAAGACACATTTGTTAGAAGCAATTGCAAATAATATAATTAGTGATGTATATGTAAATGGAA
ATAAAATTTCTTATGTAAGATACATTCCTTTTAATGGTTTGAATTCAGATATTAAAGAAGAATGTGATCCAGATGTAATC
ACAAGATGGATAAAAAGTATAGTGGATCCATTTAGAAAATCACTTGAGTCATTAAAAGAAAGAGGCGTAGAATTAACCGA
GAGTAATTTGATAAATTCAAGTGGTGATATGAGTTTTAGATTTGCCATAAAAAAAGTTTTAGAAAAAATAGGGAAAAAAA
TAGAAGATATTACAGATGATGATTTTTCAAATTATTTTGATGCATCTATGATTGCTCAGAATGATTTTTTTACAGCTCAA
TTTGCTCTAATTTTTAAAAATTATCATAGATTGTTTATTGAAAACGAATTAAACATATATTATAAATCTAAAAATATTCC
TACAGAATCTGATGGTTTATCTAATAATGATTTCATTAATAGAAATGGTATTGCACCATGGGATTTTGTAAATAATATAC
TTGCCGAGATAGATGTACCATATATTGTAAATTCACCCAGTGGAACAAGAGCAGAATCTAATTTTAAATTGAGATTAATT
AATCAAAATAATGGAATAGAAATTTCATCACAAGATTTGTCAACTGGTGAGAAAGTTTTAATGTCTTTAGCTTTAGCAAT
TTATAATTCAAGTGGAATAGATAATAAACCTGAGCTTTTATTGATAGATGAACCTGACGCTGCATTGCATCCCTCCATGT
CTCGAAAAATGATTGATATACTTAATAATCATATTGTAAAAGTAAGTAAGATTCCTAGTTTGATAACTTCTCATTCACCA
ACTACAATAATTTCGTCAGATGGGATTTCAATTTATCAAATGGAAAGAGGAAATTCAATACCAAATAAAATTTCAGTACA
AAAAGCCGTAGAATTATTGTCAAGTGACATTCCATTTTTGAAAATTTCTAATGATAAAAGAAGACAGGTGTTTGTTGAGA
GTAAATATGATGTAACATATTATGAGCTTTTAACTAATATTCTTTTAACAATTGACAAGATAGAATCTGAGCCAATTTAT
TTGCCAGCAAGAACTTCAAATGGATCTAATTGTACTGATGTAATTGAAGTAGTAAATAACTTGTATGATAATGGTAATGA
CCAAATTTATGGAATTATTGATTGGGATACAAGGAATGAAAATAAAGGAAGGATAATTGTTTTAGGAGAAAACGAAAGGT
ATTCAATTGAAAATTATCTTTTAGATCCATTAATGATGGGATTGCTTTTTATTAGAGAAGCAAAAGTTCCAATCTCCGAA
TTCGGATTCGAAACAATATCGAAATATTCAGAAATTGGAAACTTACAACTTGCAGAAGCTCAGGTGATAATTGATAAAAT
ATTGGTTGATTTAGGCTTGTTTTCTGCTAACGTAATTGAATATAATTTATACAATGGGTGGAAATTAAATATTTCTTCCG
AATTTAATTTATTTCAAGGTCATGATCTTGAAAATTTATATAAAAGAAAATATCCTTTTTTAAATGTTTATCAAAGAGAA
GATTCTCTAAAAAAAGATGTTATTCAAAAGATTGTAAATGATTTTCCAGAATTTGTTCCCATTAGAATTTTCGAAACAAT
AAAAAAAATTAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCAGTATCGCGTTTTCAGCGGTAAAATGGATGATATTGGATATGGGGAACATTGATGGTTTTGTTTAAAATGTATTATAA
TAAATATAAAAAGAGTAGTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AACTTAATTAATGATATTCTTATATTAGTGCTGTCCGCTATATATAGTCAAGAAAAAGGAAAAGCTCAAAAAGCTTCCTA
TTAAATTTTCTTAATATAAC

Product: AAA ATPase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 591; Mature: 591

Protein sequence:

>591_residues
MIKIVIKNKYKSIDVCEFELPNFSVLTGLNGSGKTHLLEAIANNIISDVYVNGNKISYVRYIPFNGLNSDIKEECDPDVI
TRWIKSIVDPFRKSLESLKERGVELTESNLINSSGDMSFRFAIKKVLEKIGKKIEDITDDDFSNYFDASMIAQNDFFTAQ
FALIFKNYHRLFIENELNIYYKSKNIPTESDGLSNNDFINRNGIAPWDFVNNILAEIDVPYIVNSPSGTRAESNFKLRLI
NQNNGIEISSQDLSTGEKVLMSLALAIYNSSGIDNKPELLLIDEPDAALHPSMSRKMIDILNNHIVKVSKIPSLITSHSP
TTIISSDGISIYQMERGNSIPNKISVQKAVELLSSDIPFLKISNDKRRQVFVESKYDVTYYELLTNILLTIDKIESEPIY
LPARTSNGSNCTDVIEVVNNLYDNGNDQIYGIIDWDTRNENKGRIIVLGENERYSIENYLLDPLMMGLLFIREAKVPISE
FGFETISKYSEIGNLQLAEAQVIIDKILVDLGLFSANVIEYNLYNGWKLNISSEFNLFQGHDLENLYKRKYPFLNVYQRE
DSLKKDVIQKIVNDFPEFVPIRIFETIKKIK

Sequences:

>Translated_591_residues
MIKIVIKNKYKSIDVCEFELPNFSVLTGLNGSGKTHLLEAIANNIISDVYVNGNKISYVRYIPFNGLNSDIKEECDPDVI
TRWIKSIVDPFRKSLESLKERGVELTESNLINSSGDMSFRFAIKKVLEKIGKKIEDITDDDFSNYFDASMIAQNDFFTAQ
FALIFKNYHRLFIENELNIYYKSKNIPTESDGLSNNDFINRNGIAPWDFVNNILAEIDVPYIVNSPSGTRAESNFKLRLI
NQNNGIEISSQDLSTGEKVLMSLALAIYNSSGIDNKPELLLIDEPDAALHPSMSRKMIDILNNHIVKVSKIPSLITSHSP
TTIISSDGISIYQMERGNSIPNKISVQKAVELLSSDIPFLKISNDKRRQVFVESKYDVTYYELLTNILLTIDKIESEPIY
LPARTSNGSNCTDVIEVVNNLYDNGNDQIYGIIDWDTRNENKGRIIVLGENERYSIENYLLDPLMMGLLFIREAKVPISE
FGFETISKYSEIGNLQLAEAQVIIDKILVDLGLFSANVIEYNLYNGWKLNISSEFNLFQGHDLENLYKRKYPFLNVYQRE
DSLKKDVIQKIVNDFPEFVPIRIFETIKKIK
>Mature_591_residues
MIKIVIKNKYKSIDVCEFELPNFSVLTGLNGSGKTHLLEAIANNIISDVYVNGNKISYVRYIPFNGLNSDIKEECDPDVI
TRWIKSIVDPFRKSLESLKERGVELTESNLINSSGDMSFRFAIKKVLEKIGKKIEDITDDDFSNYFDASMIAQNDFFTAQ
FALIFKNYHRLFIENELNIYYKSKNIPTESDGLSNNDFINRNGIAPWDFVNNILAEIDVPYIVNSPSGTRAESNFKLRLI
NQNNGIEISSQDLSTGEKVLMSLALAIYNSSGIDNKPELLLIDEPDAALHPSMSRKMIDILNNHIVKVSKIPSLITSHSP
TTIISSDGISIYQMERGNSIPNKISVQKAVELLSSDIPFLKISNDKRRQVFVESKYDVTYYELLTNILLTIDKIESEPIY
LPARTSNGSNCTDVIEVVNNLYDNGNDQIYGIIDWDTRNENKGRIIVLGENERYSIENYLLDPLMMGLLFIREAKVPISE
FGFETISKYSEIGNLQLAEAQVIIDKILVDLGLFSANVIEYNLYNGWKLNISSEFNLFQGHDLENLYKRKYPFLNVYQRE
DSLKKDVIQKIVNDFPEFVPIRIFETIKKIK

Specific function: Unknown

COG id: COG0419

COG function: function code L; ATPase involved in DNA repair

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 67413; Mature: 67413

Theoretical pI: Translated: 4.81; Mature: 4.81

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
2.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
2.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIKIVIKNKYKSIDVCEFELPNFSVLTGLNGSGKTHLLEAIANNIISDVYVNGNKISYVR
CEEEEEECCCCCCEEEEEECCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCEEEEEE
YIPFNGLNSDIKEECDPDVITRWIKSIVDPFRKSLESLKERGVELTESNLINSSGDMSFR
EECCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECHHHCCCCCCCCHHH
FAIKKVLEKIGKKIEDITDDDFSNYFDASMIAQNDFFTAQFALIFKNYHRLFIENELNIY
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEECCEEEE
YKSKNIPTESDGLSNNDFINRNGIAPWDFVNNILAEIDVPYIVNSPSGTRAESNFKLRLI
EECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEEE
NQNNGIEISSQDLSTGEKVLMSLALAIYNSSGIDNKPELLLIDEPDAALHPSMSRKMIDI
ECCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHH
LNNHIVKVSKIPSLITSHSPTTIISSDGISIYQMERGNSIPNKISVQKAVELLSSDIPFL
HCCCEEEEHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEE
KISNDKRRQVFVESKYDVTYYELLTNILLTIDKIESEPIYLPARTSNGSNCTDVIEVVNN
EECCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHH
LYDNGNDQIYGIIDWDTRNENKGRIIVLGENERYSIENYLLDPLMMGLLFIREAKVPISE
HHCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
FGFETISKYSEIGNLQLAEAQVIIDKILVDLGLFSANVIEYNLYNGWKLNISSEFNLFQG
HCHHHHHHHHHHCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCEEEEECCCCCCCCC
HDLENLYKRKYPFLNVYQREDSLKKDVIQKIVNDFPEFVPIRIFETIKKIK
CCHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MIKIVIKNKYKSIDVCEFELPNFSVLTGLNGSGKTHLLEAIANNIISDVYVNGNKISYVR
CEEEEEECCCCCCEEEEEECCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCEEEEEE
YIPFNGLNSDIKEECDPDVITRWIKSIVDPFRKSLESLKERGVELTESNLINSSGDMSFR
EECCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECHHHCCCCCCCCHHH
FAIKKVLEKIGKKIEDITDDDFSNYFDASMIAQNDFFTAQFALIFKNYHRLFIENELNIY
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEECCEEEE
YKSKNIPTESDGLSNNDFINRNGIAPWDFVNNILAEIDVPYIVNSPSGTRAESNFKLRLI
EECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEEE
NQNNGIEISSQDLSTGEKVLMSLALAIYNSSGIDNKPELLLIDEPDAALHPSMSRKMIDI
ECCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHH
LNNHIVKVSKIPSLITSHSPTTIISSDGISIYQMERGNSIPNKISVQKAVELLSSDIPFL
HCCCEEEEHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEE
KISNDKRRQVFVESKYDVTYYELLTNILLTIDKIESEPIYLPARTSNGSNCTDVIEVVNN
EECCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHH
LYDNGNDQIYGIIDWDTRNENKGRIIVLGENERYSIENYLLDPLMMGLLFIREAKVPISE
HHCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
FGFETISKYSEIGNLQLAEAQVIIDKILVDLGLFSANVIEYNLYNGWKLNISSEFNLFQG
HCHHHHHHHHHHCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCEEEEECCCCCCCCC
HDLENLYKRKYPFLNVYQREDSLKKDVIQKIVNDFPEFVPIRIFETIKKIK
CCHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA