| Definition | Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009441 |
| Length | 6,096,872 |
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The map label for this gene is sglT [H]
Identifier: 146299792
GI number: 146299792
Start: 2387824
End: 2389701
Strand: Direct
Name: sglT [H]
Synonym: Fjoh_2033
Alternate gene names: 146299792
Gene position: 2387824-2389701 (Clockwise)
Preceding gene: 146299791
Following gene: 146299793
Centisome position: 39.16
GC content: 35.09
Gene sequence:
>1878_bases ATGGATATTATTGACGTATCGATAATCGTAGCTTACATTCTGCTCTCGGTGAGTATCGGAATTTGGATTTCAAGAAAAGC AAAACAAGGATTAGATGATTATTTTCTTGGAGGAAAAACAATCAAATGGTATTTTTTAGGTCTAAGTAACGGATCTGGAA TGTTTGATGTTTCCGGAACTTCCTGGATGATTGGCGTACTTTTTCTGTATGGTGTAAAAAGCTTTATGTTCATGTGGTTG TGGCCAATCTGGAACCAGATTTTTGTAATGATGTTCCTTGCGGTCTGGATTAGAAGATCAAAAGTAATGACAGGTTCTGA GTGGATTTTAACCCGTTTTGGAAGTGACAGAGCCGGAAAAGCATCGCATATTATTGTGGCTATTTTTGCTATTATTTCTA CAATTGGTTTTATCGCTTATTTCTTTGAAGGAATTGGAAAATTTGTAACCATTATTCTTCCGTGGGATTTAACGCTTCAT TACGGAGATATGATTTTATTGACTTCTGAACGTTCTTATGCGTTGTTAATCATCTTTTTAACTACAATTTATACTGTAAA AGGCGGGATGTTCTCGGTAGTAGCGACAGAAGTGGTGCAATATTTAATTATGATTGTAGCCGGAGTTTTAATTGCCGGAT ATGCATTTATTAATTATACTGATATTCAGATTAATTCGATTATTACGCCAGAATGGAAAAATGTTTTCTTTGGCTGGCAG TTTGAAACCCAATGGAGTGATAAATTCCTAACCTTCAATAATTTAATTGATTCTGAAGGTTATAAAATGTTTGGCGCTTT CATCGGGATGACATTGTTTAAAGGGTTTTTTGCGAGTGTTGCCGGGCCAACGCCAAGTTATGATTTACAAAGAGTTCTTT CTACAAAATCGGTTAAAGAAGCTGCTTATATGAGTGGTTTCACAAACTTAATTTTATTCATTCCTAGATATTTATTAATT ACAGGAATCGTAGTAATTGCGCTGGTAAACTTAGCTCCAGAATTAAATGCAAATACTGGTTTAACCGGAGCCGATCTGGA ATTATTAATGCCAAAAGTGGTCAATTTATATATCCCGGTTGGAATTAAAGGAATTCTTTTAGCAGGTTTATTAGCCGCTT TTATGTCTGGATTCTCAGCTTTCGTAAATGCTGGACCAGCTTATATCGTAAACGATATTTATAAAAAATACTTTAAACCA GTTGCATCTAATGCACATTATATTAAAGTAAGTCAGATTTCTTCTTTCCTTGTAGTTGGTTTAGGTGTTTTTATGGGATT CTTTGCAGACTCAATCAACTCTTTAACCCTTTGGATTACAAGTGCTTTGTACGGAGGTTATGTAGCAGCCAATTTCCTAA AATGGATTTGGTGGCGTTTTAATGGCTGGGGGTATTTCTGGGGAATGTTCGCCGGATTAATTGTCGCTTCATTACAATTT GCTTTGGGTCAGGCCAAAGGAAGTTTAACCGAAGGTTCATTCTTATATGATTTAGCACAAGTACAGGCAATTTATTTGTT TCCGTTAATATTTGGTTTCTCAATTTTAGGATGTCTGTTAGGAACGTTCTTAAGTAAACCAACGGATATGGAAGTTTTAA AATCATTCTATTCAAATGTTAGACCTTGGGGATTCTGGGCCCCGGTTTATAAACAATTAAAAGTTGAAGACTATACTTTC GAGAAAAATAATGATTTCTGGAGAGATATGATGAACTGCGCAATTGGAATTATCTGGCAGTCAAGTATGATTCTGCTTCC AATATTCTTCATCATCAGAGATTATCCAAAAGCAATTACGGCTTTGATTGTGTTTTTAGTAACGACTACGATATTGAAGT TTACGTGGTTAGATAAGGTTAGAAAAATTGAAGATTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases GTTTTACATTTTGTAATGGGATCGCAGCCAAATAAAAGCTGGGGAACAAAAAAATAAACAAAACAAAAAACAAAACTAAC CTACTAACAAAAAAAATTAA
Downstream 100 bases:
>100_bases ATAAGACATACAGTTTGTCATTTCGAGGAACGAGAAATCGCACACGAAACTCGACAAAGATTGACGATTTAGATTGCGGA ATTTCTAGTGCGATTTCTCG
Product: Na+/solute symporter
Products: NA
Alternate protein names: Na(+)/glucose symporter [H]
Number of amino acids: Translated: 625; Mature: 625
Protein sequence:
>625_residues MDIIDVSIIVAYILLSVSIGIWISRKAKQGLDDYFLGGKTIKWYFLGLSNGSGMFDVSGTSWMIGVLFLYGVKSFMFMWL WPIWNQIFVMMFLAVWIRRSKVMTGSEWILTRFGSDRAGKASHIIVAIFAIISTIGFIAYFFEGIGKFVTIILPWDLTLH YGDMILLTSERSYALLIIFLTTIYTVKGGMFSVVATEVVQYLIMIVAGVLIAGYAFINYTDIQINSIITPEWKNVFFGWQ FETQWSDKFLTFNNLIDSEGYKMFGAFIGMTLFKGFFASVAGPTPSYDLQRVLSTKSVKEAAYMSGFTNLILFIPRYLLI TGIVVIALVNLAPELNANTGLTGADLELLMPKVVNLYIPVGIKGILLAGLLAAFMSGFSAFVNAGPAYIVNDIYKKYFKP VASNAHYIKVSQISSFLVVGLGVFMGFFADSINSLTLWITSALYGGYVAANFLKWIWWRFNGWGYFWGMFAGLIVASLQF ALGQAKGSLTEGSFLYDLAQVQAIYLFPLIFGFSILGCLLGTFLSKPTDMEVLKSFYSNVRPWGFWAPVYKQLKVEDYTF EKNNDFWRDMMNCAIGIIWQSSMILLPIFFIIRDYPKAITALIVFLVTTTILKFTWLDKVRKIED
Sequences:
>Translated_625_residues MDIIDVSIIVAYILLSVSIGIWISRKAKQGLDDYFLGGKTIKWYFLGLSNGSGMFDVSGTSWMIGVLFLYGVKSFMFMWL WPIWNQIFVMMFLAVWIRRSKVMTGSEWILTRFGSDRAGKASHIIVAIFAIISTIGFIAYFFEGIGKFVTIILPWDLTLH YGDMILLTSERSYALLIIFLTTIYTVKGGMFSVVATEVVQYLIMIVAGVLIAGYAFINYTDIQINSIITPEWKNVFFGWQ FETQWSDKFLTFNNLIDSEGYKMFGAFIGMTLFKGFFASVAGPTPSYDLQRVLSTKSVKEAAYMSGFTNLILFIPRYLLI TGIVVIALVNLAPELNANTGLTGADLELLMPKVVNLYIPVGIKGILLAGLLAAFMSGFSAFVNAGPAYIVNDIYKKYFKP VASNAHYIKVSQISSFLVVGLGVFMGFFADSINSLTLWITSALYGGYVAANFLKWIWWRFNGWGYFWGMFAGLIVASLQF ALGQAKGSLTEGSFLYDLAQVQAIYLFPLIFGFSILGCLLGTFLSKPTDMEVLKSFYSNVRPWGFWAPVYKQLKVEDYTF EKNNDFWRDMMNCAIGIIWQSSMILLPIFFIIRDYPKAITALIVFLVTTTILKFTWLDKVRKIED >Mature_625_residues MDIIDVSIIVAYILLSVSIGIWISRKAKQGLDDYFLGGKTIKWYFLGLSNGSGMFDVSGTSWMIGVLFLYGVKSFMFMWL WPIWNQIFVMMFLAVWIRRSKVMTGSEWILTRFGSDRAGKASHIIVAIFAIISTIGFIAYFFEGIGKFVTIILPWDLTLH YGDMILLTSERSYALLIIFLTTIYTVKGGMFSVVATEVVQYLIMIVAGVLIAGYAFINYTDIQINSIITPEWKNVFFGWQ FETQWSDKFLTFNNLIDSEGYKMFGAFIGMTLFKGFFASVAGPTPSYDLQRVLSTKSVKEAAYMSGFTNLILFIPRYLLI TGIVVIALVNLAPELNANTGLTGADLELLMPKVVNLYIPVGIKGILLAGLLAAFMSGFSAFVNAGPAYIVNDIYKKYFKP VASNAHYIKVSQISSFLVVGLGVFMGFFADSINSLTLWITSALYGGYVAANFLKWIWWRFNGWGYFWGMFAGLIVASLQF ALGQAKGSLTEGSFLYDLAQVQAIYLFPLIFGFSILGCLLGTFLSKPTDMEVLKSFYSNVRPWGFWAPVYKQLKVEDYTF EKNNDFWRDMMNCAIGIIWQSSMILLPIFFIIRDYPKAITALIVFLVTTTILKFTWLDKVRKIED
Specific function: Actively transports glucose into cells by Na(+) cotransport [H]
COG id: COG0591
COG function: function code ER; Na+/proline symporter
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the sodium:solute symporter (SSF) (TC 2.A.21) family [H]
Homologues:
Organism=Homo sapiens, GI109659836, Length=607, Percent_Identity=24.0527182866557, Blast_Score=105, Evalue=1e-22, Organism=Homo sapiens, GI14140236, Length=552, Percent_Identity=24.6376811594203, Blast_Score=100, Evalue=4e-21, Organism=Homo sapiens, GI109659839, Length=623, Percent_Identity=23.5955056179775, Blast_Score=100, Evalue=5e-21, Organism=Homo sapiens, GI4507031, Length=564, Percent_Identity=25, Blast_Score=86, Evalue=7e-17, Organism=Homo sapiens, GI206597483, Length=514, Percent_Identity=22.568093385214, Blast_Score=78, Evalue=3e-14, Organism=Homo sapiens, GI4507033, Length=512, Percent_Identity=22.8515625, Blast_Score=75, Evalue=1e-13, Organism=Homo sapiens, GI17941285, Length=435, Percent_Identity=22.7586206896552, Blast_Score=74, Evalue=6e-13, Organism=Homo sapiens, GI206597487, Length=539, Percent_Identity=22.4489795918367, Blast_Score=73, Evalue=1e-12,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR001734 - InterPro: IPR018212 - InterPro: IPR019900 [H]
Pfam domain/function: PF00474 SSF [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 70487; Mature: 70487
Theoretical pI: Translated: 9.25; Mature: 9.25
Prosite motif: PS50283 NA_SOLUT_SYMP_3
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 3.5 %Met (Translated Protein) 3.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 3.5 %Met (Mature Protein) 3.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDIIDVSIIVAYILLSVSIGIWISRKAKQGLDDYFLGGKTIKWYFLGLSNGSGMFDVSGT CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHCCCHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCCEEECCCH SWMIGVLFLYGVKSFMFMWLWPIWNQIFVMMFLAVWIRRSKVMTGSEWILTRFGSDRAGK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHEEECCCCCCCC ASHIIVAIFAIISTIGFIAYFFEGIGKFVTIILPWDLTLHYGDMILLTSERSYALLIIFL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCEEEEECCEEEEECCCCHHHHHHHH TTIYTVKGGMFSVVATEVVQYLIMIVAGVLIAGYAFINYTDIQINSIITPEWKNVFFGWQ HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEECCEECCCCCCEEEEEE FETQWSDKFLTFNNLIDSEGYKMFGAFIGMTLFKGFFASVAGPTPSYDLQRVLSTKSVKE EECCCCCCEEEHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH AAYMSGFTNLILFIPRYLLITGIVVIALVNLAPELNANTGLTGADLELLMPKVVNLYIPV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHEEECC GIKGILLAGLLAAFMSGFSAFVNAGPAYIVNDIYKKYFKPVASNAHYIKVSQISSFLVVG CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHH LGVFMGFFADSINSLTLWITSALYGGYVAANFLKWIWWRFNGWGYFWGMFAGLIVASLQF HHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH ALGQAKGSLTEGSFLYDLAQVQAIYLFPLIFGFSILGCLLGTFLSKPTDMEVLKSFYSNV HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCC RPWGFWAPVYKQLKVEDYTFEKNNDFWRDMMNCAIGIIWQSSMILLPIFFIIRDYPKAIT CCCCCHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ALIVFLVTTTILKFTWLDKVRKIED HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MDIIDVSIIVAYILLSVSIGIWISRKAKQGLDDYFLGGKTIKWYFLGLSNGSGMFDVSGT CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHCCCHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCCEEECCCH SWMIGVLFLYGVKSFMFMWLWPIWNQIFVMMFLAVWIRRSKVMTGSEWILTRFGSDRAGK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHEEECCCCCCCC ASHIIVAIFAIISTIGFIAYFFEGIGKFVTIILPWDLTLHYGDMILLTSERSYALLIIFL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCEEEEECCEEEEECCCCHHHHHHHH TTIYTVKGGMFSVVATEVVQYLIMIVAGVLIAGYAFINYTDIQINSIITPEWKNVFFGWQ HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEECCEECCCCCCEEEEEE FETQWSDKFLTFNNLIDSEGYKMFGAFIGMTLFKGFFASVAGPTPSYDLQRVLSTKSVKE EECCCCCCEEEHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH AAYMSGFTNLILFIPRYLLITGIVVIALVNLAPELNANTGLTGADLELLMPKVVNLYIPV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHEEECC GIKGILLAGLLAAFMSGFSAFVNAGPAYIVNDIYKKYFKPVASNAHYIKVSQISSFLVVG CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHH LGVFMGFFADSINSLTLWITSALYGGYVAANFLKWIWWRFNGWGYFWGMFAGLIVASLQF HHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH ALGQAKGSLTEGSFLYDLAQVQAIYLFPLIFGFSILGCLLGTFLSKPTDMEVLKSFYSNV HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCC RPWGFWAPVYKQLKVEDYTFEKNNDFWRDMMNCAIGIIWQSSMILLPIFFIIRDYPKAIT CCCCCHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ALIVFLVTTTILKFTWLDKVRKIED HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8652595; 10835424; 10757971 [H]