| Definition | Francisella tularensis subsp. tularensis WY96-3418, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009257 |
| Length | 1,898,476 |
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The map label for this gene is 134302423
Identifier: 134302423
GI number: 134302423
Start: 1465868
End: 1467781
Strand: Reverse
Name: 134302423
Synonym: FTW_1560
Alternate gene names: NA
Gene position: 1467781-1465868 (Counterclockwise)
Preceding gene: 134302428
Following gene: 134302422
Centisome position: 77.31
GC content: 31.82
Gene sequence:
>1914_bases ATGTTTGATTATATATTTAATAAAATTAAGGCGACGGTTTTCTCCAAAATTACCCCGGCTCAATTGCTTCTTACAGCTAT TTTAGCGTTTGTATTTGGGTTTGTTCCAGGTATTGCTTATTCACCATTACTTTTTATAGGAGTACTATTTCTAGTTATAA TCCTAAGGATAAATATCGGTGTATTTGTTTTTATTGCAATTATTGCTAAAGCGCTCTCTTATATTTTACAAGGAATTAGC TTTGCAGTGGGGACATTTTTACTTGATGGTTTCACGCAGCCATTATTTAAAACTTTAGTAAATACTCCTGTAGTTGCATA TGCAGGTTTTGATTATTACCTTGTAACAGGTGCATTTGTTGTTGCTATAGTTTTAGGGGTGATATTTGGGGTTATTATCG CAAAGTTTTATAAAAAAATAGTTGCAAAAATGGCAGCAATCCAGTTTGGTACAGAGCTTTATAACAAAATTACAAAAAAC TTTTTTGTTAAAATTGCTGGTTGGATTTTCTTAGGCAAGAATATTGCTAAAGTTAACTGGGTTGAGATGCAAAATCGCAA GTTTAGGCAGCCTTTTAGACTAACAGGTGTTATACTCGTGGCTTTAATTATTGCAGTTTTAATATACTCACCAAAGCTTT TAGAAACGTCGTTAGTATCAAATATCATCAAACAGCAGCTAACTAAAGCTAATGGAGCAACTGTTGATTATCAATCTCTA AATCTAGATTTAACTGATGCTAAACTAGGGATAACAGGTTTGGGAGCAGCAGATCCTAATGATCTTAATAAAGACAGATT CTACGCACAATCTGTCAGTGCTAGTATAAATATATCAAACTTGCTAACGCGACAAATTACTCTAAAAAATGTTGTTGTAA CGGGAGTGGCTTTAGATAAGCAAAGAACTACCAAAGCCAAACTATACATTGATACAAAACCTTTAACTTCAGAACAATCT AAGATTAGTTCAGAAGCTATAAAACAACAGGCTATTGAAACTGTTGGTAAGGTTGGCGAAAAATTACAACAAGTTGACCT TCAAAAGCTTAAAGAAAATAGTCAACAAGCTAAAGATATTGCTAATGGTATTAAACAAGTAGCAGAATTTTTATCTAATT TTAGGTCTAGTGATACTGAATCAGGACAGGTGAGTCAAGAGATTACTCCAAAAGCTGAGGCTAAGGTATATGGCTATGCA AACGTCAAGAATGAAGATTTGCGTGATAAATATCCAAGTTTTGTGATTCAAAATATTGATATTAAGGACTATAAGGATGC AGGAATTATATATAATGCAAATATAACTAATATATCAACAAATCCTGCTTTATTAGGATTGCCGACTACGATAGCTATTA AATCAACTAACAATAATGATTTTGATGCTAATATTGTTATTTCTAACAAGCAAAATGTTGATAATACAGTTAAGTTTAAC TTACAAAATATTACTGGTAATAATGTTAAGGGGCTAACTATTCAGGATGTTGGTTTAGATGCTGAGAGTTTAGCTGTATC AGGTCAAGGAACATGGCAGTTTAGTGGCATAAGAAACATAACGTTTAATATCCCACTTCAACTGAAGTTTAATAACGTAG CAGTTAGTTTCAAACAGTTAAGACAAAATGTTTCTGATCTAACCTTAGGTGGAGTTATATCGGGAGATTTAAATAAACCT AACCTTAGTGTTGATGCATCTTCTTTAAAGAACTTACTAAATGTTGATACTGTTAAAAACGTTGCAAATCAAGTAGCTAA GCAGACTGGGATAGATAAAAAGGCACAACAGGTAATCAATAGTGCTAAGATAAATGGTAAATCTATTAAAGATTTAAATG CTAATGATTTAAAGAATATTAATAAAAAAGATGTTCAAAATCTTGCTTCTCAATTTGGAATTACAATTAACTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TATGTTATTTTTTCTAATAAAAATACTTATTTTAATGTTTGAATTGTCTATAATATGGTAATGTTAATTTGGTAAAATTA CAAAACAAAGGTAGTTAAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TAAATATTTATCTAAACCCCCTTGCGTCAGAGCGTCTATTTGAGGGTATTTCTTTATAGTATTTAATTTTTACTTCAGTT GTTTCGCCACATCTTACGAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 637; Mature: 637
Protein sequence:
>637_residues MFDYIFNKIKATVFSKITPAQLLLTAILAFVFGFVPGIAYSPLLFIGVLFLVIILRINIGVFVFIAIIAKALSYILQGIS FAVGTFLLDGFTQPLFKTLVNTPVVAYAGFDYYLVTGAFVVAIVLGVIFGVIIAKFYKKIVAKMAAIQFGTELYNKITKN FFVKIAGWIFLGKNIAKVNWVEMQNRKFRQPFRLTGVILVALIIAVLIYSPKLLETSLVSNIIKQQLTKANGATVDYQSL NLDLTDAKLGITGLGAADPNDLNKDRFYAQSVSASINISNLLTRQITLKNVVVTGVALDKQRTTKAKLYIDTKPLTSEQS KISSEAIKQQAIETVGKVGEKLQQVDLQKLKENSQQAKDIANGIKQVAEFLSNFRSSDTESGQVSQEITPKAEAKVYGYA NVKNEDLRDKYPSFVIQNIDIKDYKDAGIIYNANITNISTNPALLGLPTTIAIKSTNNNDFDANIVISNKQNVDNTVKFN LQNITGNNVKGLTIQDVGLDAESLAVSGQGTWQFSGIRNITFNIPLQLKFNNVAVSFKQLRQNVSDLTLGGVISGDLNKP NLSVDASSLKNLLNVDTVKNVANQVAKQTGIDKKAQQVINSAKINGKSIKDLNANDLKNINKKDVQNLASQFGITIN
Sequences:
>Translated_637_residues MFDYIFNKIKATVFSKITPAQLLLTAILAFVFGFVPGIAYSPLLFIGVLFLVIILRINIGVFVFIAIIAKALSYILQGIS FAVGTFLLDGFTQPLFKTLVNTPVVAYAGFDYYLVTGAFVVAIVLGVIFGVIIAKFYKKIVAKMAAIQFGTELYNKITKN FFVKIAGWIFLGKNIAKVNWVEMQNRKFRQPFRLTGVILVALIIAVLIYSPKLLETSLVSNIIKQQLTKANGATVDYQSL NLDLTDAKLGITGLGAADPNDLNKDRFYAQSVSASINISNLLTRQITLKNVVVTGVALDKQRTTKAKLYIDTKPLTSEQS KISSEAIKQQAIETVGKVGEKLQQVDLQKLKENSQQAKDIANGIKQVAEFLSNFRSSDTESGQVSQEITPKAEAKVYGYA NVKNEDLRDKYPSFVIQNIDIKDYKDAGIIYNANITNISTNPALLGLPTTIAIKSTNNNDFDANIVISNKQNVDNTVKFN LQNITGNNVKGLTIQDVGLDAESLAVSGQGTWQFSGIRNITFNIPLQLKFNNVAVSFKQLRQNVSDLTLGGVISGDLNKP NLSVDASSLKNLLNVDTVKNVANQVAKQTGIDKKAQQVINSAKINGKSIKDLNANDLKNINKKDVQNLASQFGITIN >Mature_637_residues MFDYIFNKIKATVFSKITPAQLLLTAILAFVFGFVPGIAYSPLLFIGVLFLVIILRINIGVFVFIAIIAKALSYILQGIS FAVGTFLLDGFTQPLFKTLVNTPVVAYAGFDYYLVTGAFVVAIVLGVIFGVIIAKFYKKIVAKMAAIQFGTELYNKITKN FFVKIAGWIFLGKNIAKVNWVEMQNRKFRQPFRLTGVILVALIIAVLIYSPKLLETSLVSNIIKQQLTKANGATVDYQSL NLDLTDAKLGITGLGAADPNDLNKDRFYAQSVSASINISNLLTRQITLKNVVVTGVALDKQRTTKAKLYIDTKPLTSEQS KISSEAIKQQAIETVGKVGEKLQQVDLQKLKENSQQAKDIANGIKQVAEFLSNFRSSDTESGQVSQEITPKAEAKVYGYA NVKNEDLRDKYPSFVIQNIDIKDYKDAGIIYNANITNISTNPALLGLPTTIAIKSTNNNDFDANIVISNKQNVDNTVKFN LQNITGNNVKGLTIQDVGLDAESLAVSGQGTWQFSGIRNITFNIPLQLKFNNVAVSFKQLRQNVSDLTLGGVISGDLNKP NLSVDASSLKNLLNVDTVKNVANQVAKQTGIDKKAQQVINSAKINGKSIKDLNANDLKNINKKDVQNLASQFGITIN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 69734; Mature: 69734
Theoretical pI: Translated: 10.20; Mature: 10.20
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 0.5 %Met (Translated Protein) 0.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 0.5 %Met (Mature Protein) 0.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFDYIFNKIKATVFSKITPAQLLLTAILAFVFGFVPGIAYSPLLFIGVLFLVIILRINIG CHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VFVFIAIIAKALSYILQGISFAVGTFLLDGFTQPLFKTLVNTPVVAYAGFDYYLVTGAFV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHH VAIVLGVIFGVIIAKFYKKIVAKMAAIQFGTELYNKITKNFFVKIAGWIFLGKNIAKVNW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEE VEMQNRKFRQPFRLTGVILVALIIAVLIYSPKLLETSLVSNIIKQQLTKANGATVDYQSL EECCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEC NLDLTDAKLGITGLGAADPNDLNKDRFYAQSVSASINISNLLTRQITLKNVVVTGVALDK CEEEECCCCCEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCEEEHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECC QRTTKAKLYIDTKPLTSEQSKISSEAIKQQAIETVGKVGEKLQQVDLQKLKENSQQAKDI CCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ANGIKQVAEFLSNFRSSDTESGQVSQEITPKAEAKVYGYANVKNEDLRDKYPSFVIQNID HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHCCHHEEECCC IKDYKDAGIIYNANITNISTNPALLGLPTTIAIKSTNNNDFDANIVISNKQNVDNTVKFN CCCCCCCCEEEECCEEECCCCCEEEECCEEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEE LQNITGNNVKGLTIQDVGLDAESLAVSGQGTWQFSGIRNITFNIPLQLKFNNVAVSFKQL EEECCCCCCCCEEEEECCCCHHHEEECCCCCEEECCCCEEEEEEEEEEEECHHHHHHHHH RQNVSDLTLGGVISGDLNKPNLSVDASSLKNLLNVDTVKNVANQVAKQTGIDKKAQQVIN HCCHHHEEECCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH SAKINGKSIKDLNANDLKNINKKDVQNLASQFGITIN HHCCCCCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCC >Mature Secondary Structure MFDYIFNKIKATVFSKITPAQLLLTAILAFVFGFVPGIAYSPLLFIGVLFLVIILRINIG CHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VFVFIAIIAKALSYILQGISFAVGTFLLDGFTQPLFKTLVNTPVVAYAGFDYYLVTGAFV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHH VAIVLGVIFGVIIAKFYKKIVAKMAAIQFGTELYNKITKNFFVKIAGWIFLGKNIAKVNW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEE VEMQNRKFRQPFRLTGVILVALIIAVLIYSPKLLETSLVSNIIKQQLTKANGATVDYQSL EECCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEC NLDLTDAKLGITGLGAADPNDLNKDRFYAQSVSASINISNLLTRQITLKNVVVTGVALDK CEEEECCCCCEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCEEEHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECC QRTTKAKLYIDTKPLTSEQSKISSEAIKQQAIETVGKVGEKLQQVDLQKLKENSQQAKDI CCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ANGIKQVAEFLSNFRSSDTESGQVSQEITPKAEAKVYGYANVKNEDLRDKYPSFVIQNID HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHCCHHEEECCC IKDYKDAGIIYNANITNISTNPALLGLPTTIAIKSTNNNDFDANIVISNKQNVDNTVKFN CCCCCCCCEEEECCEEECCCCCEEEECCEEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEE LQNITGNNVKGLTIQDVGLDAESLAVSGQGTWQFSGIRNITFNIPLQLKFNNVAVSFKQL EEECCCCCCCCEEEEECCCCHHHEEECCCCCEEECCCCEEEEEEEEEEEECHHHHHHHHH RQNVSDLTLGGVISGDLNKPNLSVDASSLKNLLNVDTVKNVANQVAKQTGIDKKAQQVIN HCCHHHEEECCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH SAKINGKSIKDLNANDLKNINKKDVQNLASQFGITIN HHCCCCCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA