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The map label for this gene is ycnB [H]

Identifier: 126700122

GI number: 126700122

Start: 2893512

End: 2894912

Strand: Direct

Name: ycnB [H]

Synonym: CD2506

Alternate gene names: 126700122

Gene position: 2893512-2894912 (Clockwise)

Preceding gene: 126700121

Following gene: 126700131

Centisome position: 67.44

GC content: 30.76

Gene sequence:

>1401_bases
ATGGAAACCCAAAGTAACAATAAAAAAGGAAATTTAATAATAGCAATTGTAATGACTGGTGCTTTTATAAGTTCTCTCAG
TCAAACACTATTGTCAACAGCATTACCTAATATAATGTCAGATTTTAAAATTACTGCTGATATTGGTCAGTGGTTAACAA
CAATTTATCTACTTATTGCAGGTATTATTGTACCCACAACAGCTTATTTAATAAATCGATTTAGTACTAGAAAGTTATTT
ATTACATCAATGTCTATCTTTTCTATAGGATGTATTATTGCACTTTTTTCTAATAATTTTTCAACTATGTTGATTGCTCG
TGTGTTGCAGGCAATGGGTTCTGGTTCTCTAATGCCACTTTTACAAGTTATTATACTCTATTTATGCCCTGAGGAAAAAC
GTGGTGCAGCTATGAGTTTAGTTGGTATTACAGTAGGATTTGCTCCAGCAATAGGTCCAACTTTATCAGGATGGTTAGTA
GATTCATTTGGTTGGCATAGTTTATTTCTGTTTCTTTCCCCTATTGCTATATTAGATGTTATACTATCATTTATTCTATT
AAGAAATGTTGGGGAAACTCAAAAACTAAAATTAGATATACCTTCAATAGTACTATCATCTCTAGGTTTTGGTGGTTTAT
TAATTGGATTTACTAATCAAGGTAATTATGGGTGGACTAATATTGCCACATATTTACCAATATTAATAGGAATTATGTCA
TTAATTTTATTTACATTGCGTCAATTAAAATCTAAAGAACCTTTTTTAGAATTGAGGGTTTTTAAAAATAAACCATTTCT
TATTTCTACAATATTAATTATGATTGTATATGCCTCAATGATGTCTGCTACATTAATGATTCCTCTGTACGTTCAATCTG
TAAGAGGATTTTCTGCATTATCTTCAGGTTCATTAATGTTACCTGGTGCTATATTGATGGTTGTACTCAATCCAATTGCA
GGACGTCATTTAGATAAATATGGACCTCATGCTCTATCAATATTAGGAACAGGATGTTTGCTTTTAGGAACTTTATCCTT
CGCTTTTTTAGGCAGAGATACATCTTTAATTCATGTGTCATTGATGTATTGTATTCGTATGATTGGTATTTCAATGGTTT
TAATGCCATTAACTACATGGGGAATTAAAACATTAGATAGAGAACTTATATCTCATGCCACAGCAATTAATAACACACTC
CGTCAGATATCTGGAGCTATAGGTTCTGCTATACTTATTACTATAATGACAAGTGCTACTAAGAAAGCTCATATGAGTTC
AAACATGCTGTCTAACATTCATGGAATAGATGTTGCATTTTCAATAGCAGCTACTCTTGCATTTACTGGTTTAATTGTAT
CTATATGTTTTATAAAAAGACATCAAATTATTAGAAGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGCAATGATTACATATTTAGAAAAAGAAGACACTTTAAGACCAAAAGTACTTTTATTGAACAGCATTAAAAATCAATTAA
AAAAGGAGACGTTATAAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TACAGAAAAGGAGTTATCCTATGAACAATTTAAGTTTGCTCTGTGATAACTCCTTTTTATTCATTTTAACCAGTACAGTT
TTAATTATTCTATATATTTC

Product: transporter

Products: Proton [Cytoplasm]; multidrug [Periplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 466; Mature: 466

Protein sequence:

>466_residues
METQSNNKKGNLIIAIVMTGAFISSLSQTLLSTALPNIMSDFKITADIGQWLTTIYLLIAGIIVPTTAYLINRFSTRKLF
ITSMSIFSIGCIIALFSNNFSTMLIARVLQAMGSGSLMPLLQVIILYLCPEEKRGAAMSLVGITVGFAPAIGPTLSGWLV
DSFGWHSLFLFLSPIAILDVILSFILLRNVGETQKLKLDIPSIVLSSLGFGGLLIGFTNQGNYGWTNIATYLPILIGIMS
LILFTLRQLKSKEPFLELRVFKNKPFLISTILIMIVYASMMSATLMIPLYVQSVRGFSALSSGSLMLPGAILMVVLNPIA
GRHLDKYGPHALSILGTGCLLLGTLSFAFLGRDTSLIHVSLMYCIRMIGISMVLMPLTTWGIKTLDRELISHATAINNTL
RQISGAIGSAILITIMTSATKKAHMSSNMLSNIHGIDVAFSIAATLAFTGLIVSICFIKRHQIIRS

Sequences:

>Translated_466_residues
METQSNNKKGNLIIAIVMTGAFISSLSQTLLSTALPNIMSDFKITADIGQWLTTIYLLIAGIIVPTTAYLINRFSTRKLF
ITSMSIFSIGCIIALFSNNFSTMLIARVLQAMGSGSLMPLLQVIILYLCPEEKRGAAMSLVGITVGFAPAIGPTLSGWLV
DSFGWHSLFLFLSPIAILDVILSFILLRNVGETQKLKLDIPSIVLSSLGFGGLLIGFTNQGNYGWTNIATYLPILIGIMS
LILFTLRQLKSKEPFLELRVFKNKPFLISTILIMIVYASMMSATLMIPLYVQSVRGFSALSSGSLMLPGAILMVVLNPIA
GRHLDKYGPHALSILGTGCLLLGTLSFAFLGRDTSLIHVSLMYCIRMIGISMVLMPLTTWGIKTLDRELISHATAINNTL
RQISGAIGSAILITIMTSATKKAHMSSNMLSNIHGIDVAFSIAATLAFTGLIVSICFIKRHQIIRS
>Mature_466_residues
METQSNNKKGNLIIAIVMTGAFISSLSQTLLSTALPNIMSDFKITADIGQWLTTIYLLIAGIIVPTTAYLINRFSTRKLF
ITSMSIFSIGCIIALFSNNFSTMLIARVLQAMGSGSLMPLLQVIILYLCPEEKRGAAMSLVGITVGFAPAIGPTLSGWLV
DSFGWHSLFLFLSPIAILDVILSFILLRNVGETQKLKLDIPSIVLSSLGFGGLLIGFTNQGNYGWTNIATYLPILIGIMS
LILFTLRQLKSKEPFLELRVFKNKPFLISTILIMIVYASMMSATLMIPLYVQSVRGFSALSSGSLMLPGAILMVVLNPIA
GRHLDKYGPHALSILGTGCLLLGTLSFAFLGRDTSLIHVSLMYCIRMIGISMVLMPLTTWGIKTLDRELISHATAINNTL
RQISGAIGSAILITIMTSATKKAHMSSNMLSNIHGIDVAFSIAATLAFTGLIVSICFIKRHQIIRS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. EmrB family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788710, Length=433, Percent_Identity=27.7136258660508, Blast_Score=158, Evalue=7e-40,
Organism=Escherichia coli, GI1789042, Length=432, Percent_Identity=25.6944444444444, Blast_Score=136, Evalue=3e-33,
Organism=Escherichia coli, GI1790195, Length=311, Percent_Identity=25.4019292604502, Blast_Score=107, Evalue=2e-24,
Organism=Escherichia coli, GI87081983, Length=399, Percent_Identity=24.3107769423559, Blast_Score=107, Evalue=2e-24,
Organism=Escherichia coli, GI1788392, Length=402, Percent_Identity=24.3781094527363, Blast_Score=90, Evalue=2e-19,
Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6323735, Length=164, Percent_Identity=25.609756097561, Blast_Score=77, Evalue=7e-15,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004638
- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196
- InterPro:   IPR001411 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50552; Mature: 50552

Theoretical pI: Translated: 10.27; Mature: 10.27

Prosite motif: PS00639 THIOL_PROTEASE_HIS ; PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
4.7 %Met     (Translated Protein)
5.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
4.7 %Met     (Mature Protein)
5.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
METQSNNKKGNLIIAIVMTGAFISSLSQTLLSTALPNIMSDFKITADIGQWLTTIYLLIA
CCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
GIIVPTTAYLINRFSTRKLFITSMSIFSIGCIIALFSNNFSTMLIARVLQAMGSGSLMPL
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
LQVIILYLCPEEKRGAAMSLVGITVGFAPAIGPTLSGWLVDSFGWHSLFLFLSPIAILDV
HHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ILSFILLRNVGETQKLKLDIPSIVLSSLGFGGLLIGFTNQGNYGWTNIATYLPILIGIMS
HHHHHHHHCCCCCCEEEECHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LILFTLRQLKSKEPFLELRVFKNKPFLISTILIMIVYASMMSATLMIPLYVQSVRGFSAL
HHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHC
SSGSLMLPGAILMVVLNPIAGRHLDKYGPHALSILGTGCLLLGTLSFAFLGRDTSLIHVS
CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
LMYCIRMIGISMVLMPLTTWGIKTLDRELISHATAINNTLRQISGAIGSAILITIMTSAT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKAHMSSNMLSNIHGIDVAFSIAATLAFTGLIVSICFIKRHQIIRS
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
METQSNNKKGNLIIAIVMTGAFISSLSQTLLSTALPNIMSDFKITADIGQWLTTIYLLIA
CCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
GIIVPTTAYLINRFSTRKLFITSMSIFSIGCIIALFSNNFSTMLIARVLQAMGSGSLMPL
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
LQVIILYLCPEEKRGAAMSLVGITVGFAPAIGPTLSGWLVDSFGWHSLFLFLSPIAILDV
HHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ILSFILLRNVGETQKLKLDIPSIVLSSLGFGGLLIGFTNQGNYGWTNIATYLPILIGIMS
HHHHHHHHCCCCCCEEEECHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LILFTLRQLKSKEPFLELRVFKNKPFLISTILIMIVYASMMSATLMIPLYVQSVRGFSAL
HHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHC
SSGSLMLPGAILMVVLNPIAGRHLDKYGPHALSILGTGCLLLGTLSFAFLGRDTSLIHVS
CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
LMYCIRMIGISMVLMPLTTWGIKTLDRELISHATAINNTLRQISGAIGSAILITIMTSAT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKAHMSSNMLSNIHGIDVAFSIAATLAFTGLIVSICFIKRHQIIRS
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Proton [Periplasm]; multidrug [Cytoplasm] [C]

Specific reaction: Proton [Periplasm] + multidrug [Cytoplasm] = Proton [Cytoplasm] + multidrug [Periplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8969502; 9384377 [H]