Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 126699571

Identifier: 126699571

GI number: 126699571

Start: 2261410

End: 2263827

Strand: Direct

Name: 126699571

Synonym: CD1962

Alternate gene names: NA

Gene position: 2261410-2263827 (Clockwise)

Preceding gene: 126699570

Following gene: 126699592

Centisome position: 52.71

GC content: 24.44

Gene sequence:

>2418_bases
ATGTTTAGAAATAATAATCGCACATTTATAAGAAAAATAGCTTTAAATGATTTAAAAATTAATAAACTTAAAACATATCT
TTCAGGTATCATTATAATGATTTCTACATGTTTATTATTAACAGTGACCTTAGTTTCATATAATGCCTCTGTAGATTTAG
TTAATGCATCTCCATATCATGCTATATATAAATCTGTAGATGAAAAAGCAAAAAATATACTATATAAAGATAAAAACTTT
AGTGGCGTAGGAACTTACAAATTAATTGGAAGTAATAAAAAGACAGATTGTATTATGTCGATTGTTTATGCAGATGATAC
AGCAATTAAACTTATGAATTTTCAACCATTGAAAGGCAAACTACCTACAAATAAAAATGAAATTGCTATTTCAGAAAAAT
ATTTACAGGAATTTGGTTTAGATAAAGATATTGGAGATAGCATTAAATTAAATTATTATGATGATATTACGAATAAAGAA
GTTCAATGTGATTTTATTATTGTTGGATTTCTAGAAAATTATTATCAAGATAATGCCAAGCAATACTATACAGTCGTTTC
AAATGATTATTTTAAGAATATAGCTTCTACACCTTTACAAAATAAAAGTAATACTTTTGACGAGTCAAGACCTGATACTG
TAGATGTATTAGTTAAACTATCAGAAGAAAATACAGAGAAAGATTCAGCTTCAATTAAGACACAGTTAAAGAAAATTGGT
TTATCTTTAGGTATTAAGAAATATAATATATACTTAAATGATAACTATATTGAATCAAATTTAATTGATGGTGAGCAGAT
TATTACAGTTTTAGTAGTTGGAATAGTTGTTCTTTTTTCTAGCGTTTTTGTTATATATAGTATTTTTTATATTTCAGTTG
TTAATTCAGTTCAGATGTATGCTAAGTTGAAATCGTTAGGTATGACTTCTTTTCAGTTAAAAAAGATTATTTCTCTACAA
GGAAATATTTTGTCAATTATTTTTATTCCATTAGGGGTTATAGCTTCTTGTATAATTGCTTACATAATTCAACCATTAGC
ATGGCAAATGATAGCTGATTTATTTATAATTTTAATTTTATCACTGGTAATGTTTTTAACTGTTAGAATTTCTTTATTTA
AACCAGCTAGAATTATTTCTAAAATATCTGCTATTGAAGCCATGCAATATACAGAAACTAAATTTAGAAAAAAAGTAAAA
AATTTTAGTTATATAAATATAAAAAATCTAGCATTAAAGAATATCGAGTCAAATAGAAAAAAAAATTTGATTGCATTAAT
ATCGCTAAGCATTAGTGGAGTTTTATTTATTTCAATCGCTAATCTTGCTAATTCAATAGATTTCAAAAAACAACTATCTC
AACAATTTGTCTATAACGAAGATTATATAATTAGCATTAAGAGTGATAACTTGTATGAGCATATTACAGAAATCCAACAA
AATAATCCACTAACAGATTCTCTTAAGAATGAAATTAAATCTATTCATGGAGTAAAAAAATTAATTGAATCCAAAGCAAT
TAAAAGTAATATTATAGAACCTTACATCAAAGATAGAGACGAAAAACAATTTATTACTCTAATTAAAGGTATTACGCCTG
AACTTTCAAAATCACTTGAAGAATATATTGTCAGTGGAAAAATAGACTATACACATTTAGATTCAGATAGTTTAATTATA
AATAAATATAGAACAAAATATTATGGATTAAATTTAAAAGTTGGAGATACAGTTACATTTAATATCTTTAGTGGAAATGA
TATTATTAAAAAGAAAATGAAAATTATAGGAATCATTGACAATTCCAATACAGGAGGTATGTTTTTTGCTTCAGACAAAA
CTTTAGAATCTCTAACACCATATAATACAAATTTAGATTTTTCTATTTTAATAGATAAAAAGCATTCTAAAGAAGTTGAA
GAAAAGTTGTTAAGTATAATTCAGAAAAATTCAAATTTAATGCTTTATTCATATGAAGATGATTATAGAATGATTACTAG
AGCATTTCAATATATAATTATAGCTTCATACATTTTTGTTGGTTTAATTTCTTGCTTTGGTATACTAAATATGACCAATA
CCCTAGTAAACAGCGTTTTAATTAGAAAAAAAGAGTTTGCCTTACTTCAAGCCGTTGGAATGACAAGAAAGCAACTGCGA
AATATGCTTTATAGAGAAGGTCTAAACATAAGTATCAAAGCTATATGTACTTCAAGTATACTAGGTTATTTTGGTTCAAA
TCTACTTTGCACTTTTATAAAAGATGTAATTAGATTAGACTTTATTAATTTTAAATTTTCTATATTTACTATTTTAATTT
TTTCATTCGTATTAATTGGTATACAAGTTTTAGTGACTGAATTACTTGTAAGAAATATAGAAAAAAAATCACTTACAGAA
CGCTTACGTTCTCAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AACAATTGTAATGATTACACACAATAATGAAATTGCACAACTAACTGATAGAATTATTCGTATTGAAGATGGAAAAATTG
TTAACTAGGAGGTGTAGTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAATGTATATAAAAAATAGCCATTTTTTATACAAGTTTTAATATGATTTTTTAAAAGCTATAGGGATAGAAAATTTTGAC
TTTACATAATTTTCTATCCC

Product: ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: ABC Transporter Permease Protein; Efflux ABC Transporter Permease Protein; Permease; ATP Transporter Permease

Number of amino acids: Translated: 805; Mature: 805

Protein sequence:

>805_residues
MFRNNNRTFIRKIALNDLKINKLKTYLSGIIIMISTCLLLTVTLVSYNASVDLVNASPYHAIYKSVDEKAKNILYKDKNF
SGVGTYKLIGSNKKTDCIMSIVYADDTAIKLMNFQPLKGKLPTNKNEIAISEKYLQEFGLDKDIGDSIKLNYYDDITNKE
VQCDFIIVGFLENYYQDNAKQYYTVVSNDYFKNIASTPLQNKSNTFDESRPDTVDVLVKLSEENTEKDSASIKTQLKKIG
LSLGIKKYNIYLNDNYIESNLIDGEQIITVLVVGIVVLFSSVFVIYSIFYISVVNSVQMYAKLKSLGMTSFQLKKIISLQ
GNILSIIFIPLGVIASCIIAYIIQPLAWQMIADLFIILILSLVMFLTVRISLFKPARIISKISAIEAMQYTETKFRKKVK
NFSYINIKNLALKNIESNRKKNLIALISLSISGVLFISIANLANSIDFKKQLSQQFVYNEDYIISIKSDNLYEHITEIQQ
NNPLTDSLKNEIKSIHGVKKLIESKAIKSNIIEPYIKDRDEKQFITLIKGITPELSKSLEEYIVSGKIDYTHLDSDSLII
NKYRTKYYGLNLKVGDTVTFNIFSGNDIIKKKMKIIGIIDNSNTGGMFFASDKTLESLTPYNTNLDFSILIDKKHSKEVE
EKLLSIIQKNSNLMLYSYEDDYRMITRAFQYIIIASYIFVGLISCFGILNMTNTLVNSVLIRKKEFALLQAVGMTRKQLR
NMLYREGLNISIKAICTSSILGYFGSNLLCTFIKDVIRLDFINFKFSIFTILIFSFVLIGIQVLVTELLVRNIEKKSLTE
RLRSQ

Sequences:

>Translated_805_residues
MFRNNNRTFIRKIALNDLKINKLKTYLSGIIIMISTCLLLTVTLVSYNASVDLVNASPYHAIYKSVDEKAKNILYKDKNF
SGVGTYKLIGSNKKTDCIMSIVYADDTAIKLMNFQPLKGKLPTNKNEIAISEKYLQEFGLDKDIGDSIKLNYYDDITNKE
VQCDFIIVGFLENYYQDNAKQYYTVVSNDYFKNIASTPLQNKSNTFDESRPDTVDVLVKLSEENTEKDSASIKTQLKKIG
LSLGIKKYNIYLNDNYIESNLIDGEQIITVLVVGIVVLFSSVFVIYSIFYISVVNSVQMYAKLKSLGMTSFQLKKIISLQ
GNILSIIFIPLGVIASCIIAYIIQPLAWQMIADLFIILILSLVMFLTVRISLFKPARIISKISAIEAMQYTETKFRKKVK
NFSYINIKNLALKNIESNRKKNLIALISLSISGVLFISIANLANSIDFKKQLSQQFVYNEDYIISIKSDNLYEHITEIQQ
NNPLTDSLKNEIKSIHGVKKLIESKAIKSNIIEPYIKDRDEKQFITLIKGITPELSKSLEEYIVSGKIDYTHLDSDSLII
NKYRTKYYGLNLKVGDTVTFNIFSGNDIIKKKMKIIGIIDNSNTGGMFFASDKTLESLTPYNTNLDFSILIDKKHSKEVE
EKLLSIIQKNSNLMLYSYEDDYRMITRAFQYIIIASYIFVGLISCFGILNMTNTLVNSVLIRKKEFALLQAVGMTRKQLR
NMLYREGLNISIKAICTSSILGYFGSNLLCTFIKDVIRLDFINFKFSIFTILIFSFVLIGIQVLVTELLVRNIEKKSLTE
RLRSQ
>Mature_805_residues
MFRNNNRTFIRKIALNDLKINKLKTYLSGIIIMISTCLLLTVTLVSYNASVDLVNASPYHAIYKSVDEKAKNILYKDKNF
SGVGTYKLIGSNKKTDCIMSIVYADDTAIKLMNFQPLKGKLPTNKNEIAISEKYLQEFGLDKDIGDSIKLNYYDDITNKE
VQCDFIIVGFLENYYQDNAKQYYTVVSNDYFKNIASTPLQNKSNTFDESRPDTVDVLVKLSEENTEKDSASIKTQLKKIG
LSLGIKKYNIYLNDNYIESNLIDGEQIITVLVVGIVVLFSSVFVIYSIFYISVVNSVQMYAKLKSLGMTSFQLKKIISLQ
GNILSIIFIPLGVIASCIIAYIIQPLAWQMIADLFIILILSLVMFLTVRISLFKPARIISKISAIEAMQYTETKFRKKVK
NFSYINIKNLALKNIESNRKKNLIALISLSISGVLFISIANLANSIDFKKQLSQQFVYNEDYIISIKSDNLYEHITEIQQ
NNPLTDSLKNEIKSIHGVKKLIESKAIKSNIIEPYIKDRDEKQFITLIKGITPELSKSLEEYIVSGKIDYTHLDSDSLII
NKYRTKYYGLNLKVGDTVTFNIFSGNDIIKKKMKIIGIIDNSNTGGMFFASDKTLESLTPYNTNLDFSILIDKKHSKEVE
EKLLSIIQKNSNLMLYSYEDDYRMITRAFQYIIIASYIFVGLISCFGILNMTNTLVNSVLIRKKEFALLQAVGMTRKQLR
NMLYREGLNISIKAICTSSILGYFGSNLLCTFIKDVIRLDFINFKFSIFTILIFSFVLIGIQVLVTELLVRNIEKKSLTE
RLRSQ

Specific function: Unknown

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 91788; Mature: 91788

Theoretical pI: Translated: 9.64; Mature: 9.64

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFRNNNRTFIRKIALNDLKINKLKTYLSGIIIMISTCLLLTVTLVSYNASVDLVNASPYH
CCCCCCHHEEEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHH
AIYKSVDEKAKNILYKDKNFSGVGTYKLIGSNKKTDCIMSIVYADDTAIKLMNFQPLKGK
HHHHHHHHHHHHCEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCC
LPTNKNEIAISEKYLQEFGLDKDIGDSIKLNYYDDITNKEVQCDFIIVGFLENYYQDNAK
CCCCCCCEEEEHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHCCCH
QYYTVVSNDYFKNIASTPLQNKSNTFDESRPDTVDVLVKLSEENTEKDSASIKTQLKKIG
HEEEEECCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEHEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LSLGIKKYNIYLNDNYIESNLIDGEQIITVLVVGIVVLFSSVFVIYSIFYISVVNSVQMY
HHCCEEEEEEEECCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKLKSLGMTSFQLKKIISLQGNILSIIFIPLGVIASCIIAYIIQPLAWQMIADLFIILIL
HHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLVMFLTVRISLFKPARIISKISAIEAMQYTETKFRKKVKNFSYINIKNLALKNIESNRK
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHCCCCCCC
KNLIALISLSISGVLFISIANLANSIDFKKQLSQQFVYNEDYIISIKSDNLYEHITEIQQ
CCEEEEEEHHHCHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHC
NNPLTDSLKNEIKSIHGVKKLIESKAIKSNIIEPYIKDRDEKQFITLIKGITPELSKSLE
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
EYIVSGKIDYTHLDSDSLIINKYRTKYYGLNLKVGDTVTFNIFSGNDIIKKKMKIIGIID
HHHHCCCCEEEECCCCCEEEEEHHHEEEEEEEEECCEEEEEEECCCHHHHCCEEEEEEEE
NSNTGGMFFASDKTLESLTPYNTNLDFSILIDKKHSKEVEEKLLSIIQKNSNLMLYSYED
CCCCCCEEEECCCCHHHCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECC
DYRMITRAFQYIIIASYIFVGLISCFGILNMTNTLVNSVLIRKKEFALLQAVGMTRKQLR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NMLYREGLNISIKAICTSSILGYFGSNLLCTFIKDVIRLDFINFKFSIFTILIFSFVLIG
HHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IQVLVTELLVRNIEKKSLTERLRSQ
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MFRNNNRTFIRKIALNDLKINKLKTYLSGIIIMISTCLLLTVTLVSYNASVDLVNASPYH
CCCCCCHHEEEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHH
AIYKSVDEKAKNILYKDKNFSGVGTYKLIGSNKKTDCIMSIVYADDTAIKLMNFQPLKGK
HHHHHHHHHHHHCEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCC
LPTNKNEIAISEKYLQEFGLDKDIGDSIKLNYYDDITNKEVQCDFIIVGFLENYYQDNAK
CCCCCCCEEEEHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHCCCH
QYYTVVSNDYFKNIASTPLQNKSNTFDESRPDTVDVLVKLSEENTEKDSASIKTQLKKIG
HEEEEECCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEHEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LSLGIKKYNIYLNDNYIESNLIDGEQIITVLVVGIVVLFSSVFVIYSIFYISVVNSVQMY
HHCCEEEEEEEECCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKLKSLGMTSFQLKKIISLQGNILSIIFIPLGVIASCIIAYIIQPLAWQMIADLFIILIL
HHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLVMFLTVRISLFKPARIISKISAIEAMQYTETKFRKKVKNFSYINIKNLALKNIESNRK
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHCCCCCCC
KNLIALISLSISGVLFISIANLANSIDFKKQLSQQFVYNEDYIISIKSDNLYEHITEIQQ
CCEEEEEEHHHCHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHC
NNPLTDSLKNEIKSIHGVKKLIESKAIKSNIIEPYIKDRDEKQFITLIKGITPELSKSLE
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
EYIVSGKIDYTHLDSDSLIINKYRTKYYGLNLKVGDTVTFNIFSGNDIIKKKMKIIGIID
HHHHCCCCEEEECCCCCEEEEEHHHEEEEEEEEECCEEEEEEECCCHHHHCCEEEEEEEE
NSNTGGMFFASDKTLESLTPYNTNLDFSILIDKKHSKEVEEKLLSIIQKNSNLMLYSYED
CCCCCCEEEECCCCHHHCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECC
DYRMITRAFQYIIIASYIFVGLISCFGILNMTNTLVNSVLIRKKEFALLQAVGMTRKQLR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NMLYREGLNISIKAICTSSILGYFGSNLLCTFIKDVIRLDFINFKFSIFTILIFSFVLIG
HHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IQVLVTELLVRNIEKKSLTERLRSQ
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA