Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is ybjZ [C]

Identifier: 126699071

GI number: 126699071

Start: 1695070

End: 1697631

Strand: Direct

Name: ybjZ [C]

Synonym: CD1467

Alternate gene names: 126699071

Gene position: 1695070-1697631 (Clockwise)

Preceding gene: 126699070

Following gene: 126699072

Centisome position: 39.51

GC content: 25.76

Gene sequence:

>2562_bases
ATGAATTTATATACATCACTAACTATTAGATACTTAAAACAAAATAAAAGAAGAACCATTGTAACCATAATCGGTATAAT
ACTTTCAACAGCTTTAATTTGTGGTATAGGAAATATATTTGAAAGTTTTATGGATTATCAAATGAGAGAAACTATAAAGA
ATGATGGAAGTTTCCATGTTACATTTTATGATGTAAATAGAAAAAATGTGGAATATGTAACGAAATCAGCTGAAATAGAA
AAACATGCATTTACCAAACAACTTGGATATTCTAAATTAGAAAATAGTGAAAATGCTATATTAAGTATAAAGCAATATGA
TAAAAATGCAATAAATGGATATAAAGTTTCTATAAAAGAAGGTAGATTTCCAGCTAAGGAAGGAGAAATTGTTTTAAGTG
AAAGTATTATTAATCTTATAGATGATAAGTTAAAAATAGGAGATAAGATAACTTTAAAAGTAGGGGATATGTTTGACTCA
AGCAAGAAAAAGATTGATAGTATGACATTTCATGAAGGTGATTATATAGCAAATGAAAAAGATAGAACTTTTAAAGTTGT
TGGTATAATTGAAAAACCTGGGTTTGAACGTTATAATGGAATTGCAACAGCTATAGCCTACTTTAATCCTATGAATAATT
ACAATGATACAATTAATGTATCAGTAGCAGTAAAAAATCCTAAAGATGTGTATAAGATAAGTAATAAAATAAGTAAAAAT
ATATATTCAAATAAAGATAAAGAAGCAGTTTCTGATATGATAAAATACAATGAACATTTATTGAGGTTACAAGGTGCTAG
TAAGTATTCAAATATAAATAGCTCTATAAAGTCTATAATTATAGCAGTAACTATTTTAGTAATCGTATGTACAATTGCTA
CAGTGTACAATTCCTTTAGTATTTCTATAAATGAACGAAAAAAACAGTTTGGGATATTAAATTCTATAGGTGCTACATCT
AGTCAAATTAAAAGATTAGTTTTTATAGAAGGTATTATAATTAGTTTAATTGGTATACCAATAGGACTAATATCTGGAAC
AGTAGCTATAGACTTATTGTTTAAAATTATAAATAAGTATTTTACTGAATCGGTTGTTACTAAGATGAGTTTGCAGATAG
TGTATAATCCAATAATAATTATTGTTAGTATAATAATAGTTTTGCTTACAATCTTTATATCAATTCTACTACCTGCAATA
TCGGCTTCTAATATTTCTCCCCTTAATGTGATTAAAAATACTGGAGAGTATAAAGTGGGCAAAATCAAAAGCTCAAGACT
TATTAAAATGATTTTTAAAACTGAAGGAGTACTTGCATATAAAAATATTAGGAGAAATAGAAAAAAATTTATAATAACTC
TTTTTTCTTTAATGGTAAGTATAATAATATTTATATCTTTTAGTGGCTTTACATTACTTTTACTAAGAGGTGAAGAAATT
AGAAATTCTCAAAGAAAATATGATTTGTATTTAACTGCAAAGAACACAGCTAGGTCTGTAGAGGATACTATAAGTGAACT
AGAAGATATTGATGGGATAAAAAACTTTGAATTGGCAACAGGACAATATGTGTCTATAAGAGTAAGTGAAAATAAAATAA
ATAAATCCAAGGAAGATTTAATCAGGAAATATTATCAAAAATATAAGATTGGAGATAGTTATGAATATGATTTCAGTAAT
AATGAATTAATTTTTCCAGGAGATTTTGCAGTAAAAAACAAAATAAATAACTTAGTACAGGGCTCTTTTAATAAAGAGAG
AGCAATTGAAGAAAATGGTGTTATATTAGTTAGAAAAAGTGCAATTGAAGAAAATGGGAAGAAAGGTGTAGTAGAACTTA
CCAACTATAAAGTAGGAGATACAGTAAATTGTGAATATCTTGATGAAAATGCCTTAAGTAAAAAAGTAAAGGTCAAGATT
CTTGCTATAACTGATGAAGAACGTCTAGGTCTTGGTTATCAAAATATGGGGTTACAATTTATAACTTATGATGAAGTTGC
TAAAAATTTAAATTTAAAATTAAGTAAAAGCCTTATATTTATTGATTCAGGAGGAAGCATTAAGACTAAGAAGGAAATAG
AAGCTTTGGCAAATAAAAATAATTTTAACTTTTATGATGAAAGTGCAAGCAATGAAAGTGAAAAACAAGATTTAAAGGTT
ATTAAAATATTTGTATATGGTTTTATAGTAGTGATATCTTTAGTGAGTGTTACAAATATTCTAAATACAGTAAGTACAAG
TATAAATCTAAGAAAAAGAGAACTTGCAGTAATACAATCTATAGGGGTTACTCCTAAAGGATTTAGGAAAATGATATATT
TAGAAAGTTTTATATATGGTATACTGTCATTGTTGTTTGGAATACCAATTAGTATTGGTATAATTCTAATTATGAATAAA
CTTATTTCAGGTGTAATTGAATTTTCTCCGATTATACCGTGGACAGCCATAGTTATCTGTATAGTAAGTGTTTTTATAAT
AACTTTTATAGCAGGGTATATACCAATGAGTAAATTAAATAAAGAAAATATAATAGATAATATAAGAAGAGAAAGTATAT
AG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GACACTAATAATGATAACTCATGACAAAAATATGGCACTTCAAGCTGATAGAATTATAAGCATAGAAGATGGAATCATAA
AAAGTGATGAGGTGATGTAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATATAAAAATAATTCTTAACTATATAAAATATTATTAAAATCATTTAAGTGGTATAAAATATTATTATATCACTTAAATG
ATTTTTTATTTATATAAGAA

Product: ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: ABC Transporter Permease Protein; Permease; Efflux ABC Transporter Permease Protein; ABC Transporter-Associated Permease; ATP Transporter Permease

Number of amino acids: Translated: 853; Mature: 853

Protein sequence:

>853_residues
MNLYTSLTIRYLKQNKRRTIVTIIGIILSTALICGIGNIFESFMDYQMRETIKNDGSFHVTFYDVNRKNVEYVTKSAEIE
KHAFTKQLGYSKLENSENAILSIKQYDKNAINGYKVSIKEGRFPAKEGEIVLSESIINLIDDKLKIGDKITLKVGDMFDS
SKKKIDSMTFHEGDYIANEKDRTFKVVGIIEKPGFERYNGIATAIAYFNPMNNYNDTINVSVAVKNPKDVYKISNKISKN
IYSNKDKEAVSDMIKYNEHLLRLQGASKYSNINSSIKSIIIAVTILVIVCTIATVYNSFSISINERKKQFGILNSIGATS
SQIKRLVFIEGIIISLIGIPIGLISGTVAIDLLFKIINKYFTESVVTKMSLQIVYNPIIIIVSIIIVLLTIFISILLPAI
SASNISPLNVIKNTGEYKVGKIKSSRLIKMIFKTEGVLAYKNIRRNRKKFIITLFSLMVSIIIFISFSGFTLLLLRGEEI
RNSQRKYDLYLTAKNTARSVEDTISELEDIDGIKNFELATGQYVSIRVSENKINKSKEDLIRKYYQKYKIGDSYEYDFSN
NELIFPGDFAVKNKINNLVQGSFNKERAIEENGVILVRKSAIEENGKKGVVELTNYKVGDTVNCEYLDENALSKKVKVKI
LAITDEERLGLGYQNMGLQFITYDEVAKNLNLKLSKSLIFIDSGGSIKTKKEIEALANKNNFNFYDESASNESEKQDLKV
IKIFVYGFIVVISLVSVTNILNTVSTSINLRKRELAVIQSIGVTPKGFRKMIYLESFIYGILSLLFGIPISIGIILIMNK
LISGVIEFSPIIPWTAIVICIVSVFIITFIAGYIPMSKLNKENIIDNIRRESI

Sequences:

>Translated_853_residues
MNLYTSLTIRYLKQNKRRTIVTIIGIILSTALICGIGNIFESFMDYQMRETIKNDGSFHVTFYDVNRKNVEYVTKSAEIE
KHAFTKQLGYSKLENSENAILSIKQYDKNAINGYKVSIKEGRFPAKEGEIVLSESIINLIDDKLKIGDKITLKVGDMFDS
SKKKIDSMTFHEGDYIANEKDRTFKVVGIIEKPGFERYNGIATAIAYFNPMNNYNDTINVSVAVKNPKDVYKISNKISKN
IYSNKDKEAVSDMIKYNEHLLRLQGASKYSNINSSIKSIIIAVTILVIVCTIATVYNSFSISINERKKQFGILNSIGATS
SQIKRLVFIEGIIISLIGIPIGLISGTVAIDLLFKIINKYFTESVVTKMSLQIVYNPIIIIVSIIIVLLTIFISILLPAI
SASNISPLNVIKNTGEYKVGKIKSSRLIKMIFKTEGVLAYKNIRRNRKKFIITLFSLMVSIIIFISFSGFTLLLLRGEEI
RNSQRKYDLYLTAKNTARSVEDTISELEDIDGIKNFELATGQYVSIRVSENKINKSKEDLIRKYYQKYKIGDSYEYDFSN
NELIFPGDFAVKNKINNLVQGSFNKERAIEENGVILVRKSAIEENGKKGVVELTNYKVGDTVNCEYLDENALSKKVKVKI
LAITDEERLGLGYQNMGLQFITYDEVAKNLNLKLSKSLIFIDSGGSIKTKKEIEALANKNNFNFYDESASNESEKQDLKV
IKIFVYGFIVVISLVSVTNILNTVSTSINLRKRELAVIQSIGVTPKGFRKMIYLESFIYGILSLLFGIPISIGIILIMNK
LISGVIEFSPIIPWTAIVICIVSVFIITFIAGYIPMSKLNKENIIDNIRRESI
>Mature_853_residues
MNLYTSLTIRYLKQNKRRTIVTIIGIILSTALICGIGNIFESFMDYQMRETIKNDGSFHVTFYDVNRKNVEYVTKSAEIE
KHAFTKQLGYSKLENSENAILSIKQYDKNAINGYKVSIKEGRFPAKEGEIVLSESIINLIDDKLKIGDKITLKVGDMFDS
SKKKIDSMTFHEGDYIANEKDRTFKVVGIIEKPGFERYNGIATAIAYFNPMNNYNDTINVSVAVKNPKDVYKISNKISKN
IYSNKDKEAVSDMIKYNEHLLRLQGASKYSNINSSIKSIIIAVTILVIVCTIATVYNSFSISINERKKQFGILNSIGATS
SQIKRLVFIEGIIISLIGIPIGLISGTVAIDLLFKIINKYFTESVVTKMSLQIVYNPIIIIVSIIIVLLTIFISILLPAI
SASNISPLNVIKNTGEYKVGKIKSSRLIKMIFKTEGVLAYKNIRRNRKKFIITLFSLMVSIIIFISFSGFTLLLLRGEEI
RNSQRKYDLYLTAKNTARSVEDTISELEDIDGIKNFELATGQYVSIRVSENKINKSKEDLIRKYYQKYKIGDSYEYDFSN
NELIFPGDFAVKNKINNLVQGSFNKERAIEENGVILVRKSAIEENGKKGVVELTNYKVGDTVNCEYLDENALSKKVKVKI
LAITDEERLGLGYQNMGLQFITYDEVAKNLNLKLSKSLIFIDSGGSIKTKKEIEALANKNNFNFYDESASNESEKQDLKV
IKIFVYGFIVVISLVSVTNILNTVSTSINLRKRELAVIQSIGVTPKGFRKMIYLESFIYGILSLLFGIPISIGIILIMNK
LISGVIEFSPIIPWTAIVICIVSVFIITFIAGYIPMSKLNKENIIDNIRRESI

Specific function: Unknown

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Integral Membrane Protein. Inner Membrane [C]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 96241; Mature: 96241

Theoretical pI: Translated: 9.85; Mature: 9.85

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNLYTSLTIRYLKQNKRRTIVTIIGIILSTALICGIGNIFESFMDYQMRETIKNDGSFHV
CCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE
TFYDVNRKNVEYVTKSAEIEKHAFTKQLGYSKLENSENAILSIKQYDKNAINGYKVSIKE
EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCEEEEEHHCCCCCCCEEEEEEC
GRFPAKEGEIVLSESIINLIDDKLKIGDKITLKVGDMFDSSKKKIDSMTFHEGDYIANEK
CCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC
DRTFKVVGIIEKPGFERYNGIATAIAYFNPMNNYNDTINVSVAVKNPKDVYKISNKISKN
CCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH
IYSNKDKEAVSDMIKYNEHLLRLQGASKYSNINSSIKSIIIAVTILVIVCTIATVYNSFS
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEE
ISINERKKQFGILNSIGATSSQIKRLVFIEGIIISLIGIPIGLISGTVAIDLLFKIINKY
EEEEHHHHHHCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FTESVVTKMSLQIVYNPIIIIVSIIIVLLTIFISILLPAISASNISPLNVIKNTGEYKVG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCEEEE
KIKSSRLIKMIFKTEGVLAYKNIRRNRKKFIITLFSLMVSIIIFISFSGFTLLLLRGEEI
EECHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECHHH
RNSQRKYDLYLTAKNTARSVEDTISELEDIDGIKNFELATGQYVSIRVSENKINKSKEDL
HCCCCEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCEEEEEEECCCCCCCHHHH
IRKYYQKYKIGDSYEYDFSNNELIFPGDFAVKNKINNLVQGSFNKERAIEENGVILVRKS
HHHHHHHCCCCCCEEECCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCEEEEEEC
AIEENGKKGVVELTNYKVGDTVNCEYLDENALSKKVKVKILAITDEERLGLGYQNMGLQF
HHHCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEECCCHHCCCEEEEEEEEEECCHHHCCCHHHCCEEE
ITYDEVAKNLNLKLSKSLIFIDSGGSIKTKKEIEALANKNNFNFYDESASNESEKQDLKV
EEHHHHHHCCCEEEECEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHH
IKIFVYGFIVVISLVSVTNILNTVSTSINLRKRELAVIQSIGVTPKGFRKMIYLESFIYG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
ILSLLFGIPISIGIILIMNKLISGVIEFSPIIPWTAIVICIVSVFIITFIAGYIPMSKLN
HHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCC
KENIIDNIRRESI
HHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MNLYTSLTIRYLKQNKRRTIVTIIGIILSTALICGIGNIFESFMDYQMRETIKNDGSFHV
CCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE
TFYDVNRKNVEYVTKSAEIEKHAFTKQLGYSKLENSENAILSIKQYDKNAINGYKVSIKE
EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCEEEEEHHCCCCCCCEEEEEEC
GRFPAKEGEIVLSESIINLIDDKLKIGDKITLKVGDMFDSSKKKIDSMTFHEGDYIANEK
CCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC
DRTFKVVGIIEKPGFERYNGIATAIAYFNPMNNYNDTINVSVAVKNPKDVYKISNKISKN
CCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH
IYSNKDKEAVSDMIKYNEHLLRLQGASKYSNINSSIKSIIIAVTILVIVCTIATVYNSFS
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEE
ISINERKKQFGILNSIGATSSQIKRLVFIEGIIISLIGIPIGLISGTVAIDLLFKIINKY
EEEEHHHHHHCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FTESVVTKMSLQIVYNPIIIIVSIIIVLLTIFISILLPAISASNISPLNVIKNTGEYKVG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCEEEE
KIKSSRLIKMIFKTEGVLAYKNIRRNRKKFIITLFSLMVSIIIFISFSGFTLLLLRGEEI
EECHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECHHH
RNSQRKYDLYLTAKNTARSVEDTISELEDIDGIKNFELATGQYVSIRVSENKINKSKEDL
HCCCCEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCEEEEEEECCCCCCCHHHH
IRKYYQKYKIGDSYEYDFSNNELIFPGDFAVKNKINNLVQGSFNKERAIEENGVILVRKS
HHHHHHHCCCCCCEEECCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCEEEEEEC
AIEENGKKGVVELTNYKVGDTVNCEYLDENALSKKVKVKILAITDEERLGLGYQNMGLQF
HHHCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEECCCHHCCCEEEEEEEEEECCHHHCCCHHHCCEEE
ITYDEVAKNLNLKLSKSLIFIDSGGSIKTKKEIEALANKNNFNFYDESASNESEKQDLKV
EEHHHHHHCCCEEEECEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHH
IKIFVYGFIVVISLVSVTNILNTVSTSINLRKRELAVIQSIGVTPKGFRKMIYLESFIYG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
ILSLLFGIPISIGIILIMNKLISGVIEFSPIIPWTAIVICIVSVFIITFIAGYIPMSKLN
HHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCC
KENIIDNIRRESI
HHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA