| Definition | Clostridium difficile 630 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009089 |
| Length | 4,290,252 |
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The map label for this gene is 126698168
Identifier: 126698168
GI number: 126698168
Start: 708285
End: 713495
Strand: Direct
Name: 126698168
Synonym: CD0590
Alternate gene names: NA
Gene position: 708285-713495 (Clockwise)
Preceding gene: 126698167
Following gene: 126698172
Centisome position: 16.51
GC content: 31.05
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AAATATAATTAATATATAAATTTTAAAGAAATTTACAAAAGGGGATGTTTCAAAATGAAAATTTGAATCATCTCCTTTTT TGTAAAAAATAGAAATAAGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1736; Mature: 1735
Protein sequence:
>1736_residues MANKLYSEIVNLLEEGRDELRKYDLKEKSILLFLGASGVGKSTCINYLKGCVMEEKTDEETGQIYITAKDSAVEIGNGVY SKTLCPEVVDIANRDFSLCDCPGFFDNRGAEYMIAGAMLVRETISTSSKVKGMVVILDYQSLLDSRHTLLIETGKNLKDM LGDYAKYKENFFFLINKIPKTLIGNVTEEKIRNILEKAKEDLDSQEKDYDGCKELVYLLNVALSDGVSIKLCNPLDKQPE KLLNEMKNLPETFEKTDLGLMLTASCKIEIQKAVDVTYKDLEKLLVPYIESVKKGMEDSISILSSINSLKDKKIQLDKMY TDLCSRTNNMKELMEFVQELSYGDGVQKVNILEETRLLLELNSYCSETHIVGLSELLKSLLKNTLEDTLKDIKYWIAEEE YREEEAKRLEDAEYRIEKIQSCTYIKSYEKENVLSIYIPIPKVNLSDLTKIISGYQLNILSSIYMYGDCELKIDCNMEKE VFSGKNIVLLTEKLHIPEGTYSINVSGKDAEKLVGESSIYDGMNGRNGNNAGTSGDIILSFKEIEKRGELKLYVDGGRGG NGQDGKKGDTGITGEAGANAKIGSKKESKEFANVKGTKYYVVKAEKGKQGGTGGTGGNGGNAGLGSKSGQVYLLGKAPLL KSAISKKDGNHGLAGKGGSGGAGGAGGLGGIRGIYEETIRYIGTSPPMDNSDRNYYYFDRYVFNHALNQKQAADDGEKLN ALYEEHKDWTISKREDSGSAGAEGKAGHSGDALKEKELLKQEYSLSIDTFFYEFFERFGFSGIKGYRNLRLLCAVGILEA DILELSHIYEIFHAVEKIEMQLNREILQKYYSFEKKNKAVLSLDDMNTKKEFYKEAKEIYEYLINKLMQSDRIESFVGKN QNFSEWSMILFALEQKTAFYVQMIEESEIGGNRVTDIRSLTDYLDKTLRELEQGKKDELKEGYFNTYKESILTQIESGNQ QIEVLKNELENKMLSVNAKMNLLIQEIIKMKEDEQEDIEELKKKQAKLEEQMKTQLILSGIQSALSLLTAFSGVGQACLG AFDSAKSLKENLSAKEEEYQWTNRMVDFSDFKLDSDGMRFVLGEQLSEDRKNALDKMTYNLAGVDEERRTKFDQIKEIIV KSIDDDNYADKADDIQRAKEGLSESEYKEIYTKIQKKEIGMLEANYNNKQQKDKLAALEKSKQAIERQQKTSKIKNALSI GSSACSLINTAISGVNNCLNVKSSFESKIEVVKEAIKDKENNIKKLDELNTQMVEFKDKTLKESVIPFVEKFDSTVKNQD IFENEISKLKMKEVLTELSTKFGSLKMENSEEISIIFKKVQDMMETQIIITDKIDKKKDNLAMGELIYQMSDSGNQMNEY QKKLIHQIELNQVRYLCQVEAAAFQLWTFPFGSNIVNILNRCHVGITEDENEVINQAKEQNRQIREFLDQDAYQWQKTDN HILKVALTGSLDGKSRVGFENTYSLYDCNEEEVKKLLTGDEISFEVPLNKNFDAIKYVTMYANIPNLRRNILEDSLKVKV HIHLYDSGYFSLYDDKKDVYYQYVFPQNYINITHGLDIKYNDSDSINSIWSSVEDKGIEKFKNAGLNSGRSPYSMAKISL KAHFNRKLSYDSLTNEQKKKLESYFDKPSKYAWSDSIDILRSLGYIDLKGILSKSWYEIKKDIDSDGEIMKHFSILQVDL LERIIYEQTSILKENIPNLTIELVGCGIYVESEFNYLKQNDLKCYEERLVENTIIG
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
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Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 197244; Mature: 197112
Theoretical pI: Translated: 4.97; Mature: 4.97
Prosite motif: PS00037 MYB_1
Important sites: NA
Signals:
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Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.3 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 3.6 %Cys+Met (Translated Protein) 1.3 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 3.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MANKLYSEIVNLLEEGRDELRKYDLKEKSILLFLGASGVGKSTCINYLKGCVMEEKTDEE CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC TGQIYITAKDSAVEIGNGVYSKTLCPEVVDIANRDFSLCDCPGFFDNRGAEYMIAGAMLV CCEEEEEECCCCHHHCCCCHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHH RETISTSSKVKGMVVILDYQSLLDSRHTLLIETGKNLKDMLGDYAKYKENFFFLINKIPK HHHHCCHHHCCCEEEEEEHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLIGNVTEEKIRNILEKAKEDLDSQEKDYDGCKELVYLLNVALSDGVSIKLCNPLDKQPE HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCHH KLLNEMKNLPETFEKTDLGLMLTASCKIEIQKAVDVTYKDLEKLLVPYIESVKKGMEDSI HHHHHHHCCHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHH SILSSINSLKDKKIQLDKMYTDLCSRTNNMKELMEFVQELSYGDGVQKVNILEETRLLLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH LNSYCSETHIVGLSELLKSLLKNTLEDTLKDIKYWIAEEEYREEEAKRLEDAEYRIEKIQ HHHHHCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SCTYIKSYEKENVLSIYIPIPKVNLSDLTKIISGYQLNILSSIYMYGDCELKIDCNMEKE 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