| Definition | Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 5b str. L20 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009053 |
| Length | 2,274,482 |
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The map label for this gene is 126208184
Identifier: 126208184
GI number: 126208184
Start: 809425
End: 812742
Strand: Reverse
Name: 126208184
Synonym: APL_0704
Alternate gene names: NA
Gene position: 812742-809425 (Counterclockwise)
Preceding gene: 126208185
Following gene: 126208183
Centisome position: 35.73
GC content: 38.58
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases ACTAAAGAGTGAAATAGTTTTGTGAAAAGTTGGAGATCTCTATTCTTTATCAAGATCGCCCCCCTCTTTAGTAAAGAGGG GCGGGGGGAGATTTGTAACG
Downstream 100 bases:
>100_bases TGAAGATTACCCCTTATCACGCCCGTTATTTTGCCAACGAAATCACTTGTCGCCGTACGGACGACAACCGTTTGTCGCAA TCGCTGTTTGATGCCAAAGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Type III Restriction R Protein; DEAD/DEAH Box Helicase Domain-Containing Protein; Dead/Deah Box Helicase Domain Protein; Type III Restriction Res Subunit; Type III Restriction- System Restriction Subunit; Type III Restriction
Number of amino acids: Translated: 1105; Mature: 1105
Protein sequence:
>1105_residues MLKGQKMKRTFHDNLILNRYLLSLFNQDNLEKFKQRLGDDRFEGIDNDGQTKVFHELTGGQLFQTDLISANDLRRYDLNI VKHWQQITENRNKAEGHILNLKYFQYLSLLFTEIHLDFYFNRQNELLNQLNEQLVLLKENDSTFPDFDLYELGDLNKLAF WNATGSGKTLLMHVNILQYQHYQKNKDLTVFVITPNDGLSQQHLAEFSASNLPANLFDKNKPFQGTGLFNDIQIMDINKL ADKDGELTVAVDRFLDLNKLVLVDEGHRGSSGDQWLARRQKLIGDGFAFEYSATFGQAVKDGKTVKDCLFDIQKKIGKAN GISKKADVQKIPTSFTDKQEAKQKAVFETYAKCVLFDYSYKFFYADGYGKEFSILNMKADDYGVADNDRKYFVASLLSFY QQLYLFAKNQEKLTAYNLHKPLWVFVGNTVNKEDSDIWAVVEQLAYFLDGKNRPQILAWLNDLLCDEPLLLDSKGNAIFR HRFLPLASFKGDLDRLYKDILQRLFNSGSSQHLYLYDLKKASGEIALSIDNDLKKSFALINVGDSNELLKSAVKLDNVSV QQDEFSEGLFGTINQDSSTLNLLIGSRKFTEGWSSWRVSTMGLLNMGRGEGSQIIQLFGRGVRLKGRDFSLRRTPINQMP KGLGLDKLETLNIFGIKADYMAKFREYLEDEGIQSPDEVLQLDFPVQKKLPTNVALKTLRLKDGYKDNQKMGFKRQEMVQ LYELPEFAQGKIKPILAVLDLYPRLEALSSKAVRQSESDERQSNKFKREIFALFDWDKLYLDLQQYKMERTWSNLRVSRD GLRKFVESRDDWYLLYVPNSAMEVRSFGDIQTQQDILFQLLKEYTDQFYRRLKNAYEQQFMETAIITEENGSFFETYKML FGEEENLPYEREQAVKKIEELADLIRDKKIEQAMNWQSPLSEFKAICFNSHLFYPLLSFDKSTGLPIKISPLPLAAESEM QFIDDLMQAEKSGELAKWLGGKSLYLMRNADRKDKGLGFALAGNFYPDFLLWVVDHANGKQWLNFVDPKGIRNMDLHDPK FGLYQEVKALEAKIADPNLVLNSFILSITKLQDWVNMTLTVEELAERHILFMENNYLQQMFEKMQ
Sequences:
>Translated_1105_residues MLKGQKMKRTFHDNLILNRYLLSLFNQDNLEKFKQRLGDDRFEGIDNDGQTKVFHELTGGQLFQTDLISANDLRRYDLNI VKHWQQITENRNKAEGHILNLKYFQYLSLLFTEIHLDFYFNRQNELLNQLNEQLVLLKENDSTFPDFDLYELGDLNKLAF WNATGSGKTLLMHVNILQYQHYQKNKDLTVFVITPNDGLSQQHLAEFSASNLPANLFDKNKPFQGTGLFNDIQIMDINKL ADKDGELTVAVDRFLDLNKLVLVDEGHRGSSGDQWLARRQKLIGDGFAFEYSATFGQAVKDGKTVKDCLFDIQKKIGKAN GISKKADVQKIPTSFTDKQEAKQKAVFETYAKCVLFDYSYKFFYADGYGKEFSILNMKADDYGVADNDRKYFVASLLSFY QQLYLFAKNQEKLTAYNLHKPLWVFVGNTVNKEDSDIWAVVEQLAYFLDGKNRPQILAWLNDLLCDEPLLLDSKGNAIFR HRFLPLASFKGDLDRLYKDILQRLFNSGSSQHLYLYDLKKASGEIALSIDNDLKKSFALINVGDSNELLKSAVKLDNVSV QQDEFSEGLFGTINQDSSTLNLLIGSRKFTEGWSSWRVSTMGLLNMGRGEGSQIIQLFGRGVRLKGRDFSLRRTPINQMP KGLGLDKLETLNIFGIKADYMAKFREYLEDEGIQSPDEVLQLDFPVQKKLPTNVALKTLRLKDGYKDNQKMGFKRQEMVQ LYELPEFAQGKIKPILAVLDLYPRLEALSSKAVRQSESDERQSNKFKREIFALFDWDKLYLDLQQYKMERTWSNLRVSRD GLRKFVESRDDWYLLYVPNSAMEVRSFGDIQTQQDILFQLLKEYTDQFYRRLKNAYEQQFMETAIITEENGSFFETYKML FGEEENLPYEREQAVKKIEELADLIRDKKIEQAMNWQSPLSEFKAICFNSHLFYPLLSFDKSTGLPIKISPLPLAAESEM QFIDDLMQAEKSGELAKWLGGKSLYLMRNADRKDKGLGFALAGNFYPDFLLWVVDHANGKQWLNFVDPKGIRNMDLHDPK FGLYQEVKALEAKIADPNLVLNSFILSITKLQDWVNMTLTVEELAERHILFMENNYLQQMFEKMQ >Mature_1105_residues MLKGQKMKRTFHDNLILNRYLLSLFNQDNLEKFKQRLGDDRFEGIDNDGQTKVFHELTGGQLFQTDLISANDLRRYDLNI VKHWQQITENRNKAEGHILNLKYFQYLSLLFTEIHLDFYFNRQNELLNQLNEQLVLLKENDSTFPDFDLYELGDLNKLAF WNATGSGKTLLMHVNILQYQHYQKNKDLTVFVITPNDGLSQQHLAEFSASNLPANLFDKNKPFQGTGLFNDIQIMDINKL ADKDGELTVAVDRFLDLNKLVLVDEGHRGSSGDQWLARRQKLIGDGFAFEYSATFGQAVKDGKTVKDCLFDIQKKIGKAN GISKKADVQKIPTSFTDKQEAKQKAVFETYAKCVLFDYSYKFFYADGYGKEFSILNMKADDYGVADNDRKYFVASLLSFY QQLYLFAKNQEKLTAYNLHKPLWVFVGNTVNKEDSDIWAVVEQLAYFLDGKNRPQILAWLNDLLCDEPLLLDSKGNAIFR HRFLPLASFKGDLDRLYKDILQRLFNSGSSQHLYLYDLKKASGEIALSIDNDLKKSFALINVGDSNELLKSAVKLDNVSV QQDEFSEGLFGTINQDSSTLNLLIGSRKFTEGWSSWRVSTMGLLNMGRGEGSQIIQLFGRGVRLKGRDFSLRRTPINQMP KGLGLDKLETLNIFGIKADYMAKFREYLEDEGIQSPDEVLQLDFPVQKKLPTNVALKTLRLKDGYKDNQKMGFKRQEMVQ LYELPEFAQGKIKPILAVLDLYPRLEALSSKAVRQSESDERQSNKFKREIFALFDWDKLYLDLQQYKMERTWSNLRVSRD GLRKFVESRDDWYLLYVPNSAMEVRSFGDIQTQQDILFQLLKEYTDQFYRRLKNAYEQQFMETAIITEENGSFFETYKML FGEEENLPYEREQAVKKIEELADLIRDKKIEQAMNWQSPLSEFKAICFNSHLFYPLLSFDKSTGLPIKISPLPLAAESEM QFIDDLMQAEKSGELAKWLGGKSLYLMRNADRKDKGLGFALAGNFYPDFLLWVVDHANGKQWLNFVDPKGIRNMDLHDPK FGLYQEVKALEAKIADPNLVLNSFILSITKLQDWVNMTLTVEELAERHILFMENNYLQQMFEKMQ
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 128040; Mature: 128040
Theoretical pI: Translated: 6.06; Mature: 6.06
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 2.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 2.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLKGQKMKRTFHDNLILNRYLLSLFNQDNLEKFKQRLGDDRFEGIDNDGQTKVFHELTGG CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCCCHHHHCCCC QLFQTDLISANDLRRYDLNIVKHWQQITENRNKAEGHILNLKYFQYLSLLFTEIHLDFYF CEEHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE NRQNELLNQLNEQLVLLKENDSTFPDFDLYELGDLNKLAFWNATGSGKTLLMHVNILQYQ CCHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCCCHHCCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEHHHHH HYQKNKDLTVFVITPNDGLSQQHLAEFSASNLPANLFDKNKPFQGTGLFNDIQIMDINKL HHCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEHHH ADKDGELTVAVDRFLDLNKLVLVDEGHRGSSGDQWLARRQKLIGDGFAFEYSATFGQAVK CCCCCCEEEEEHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHH DGKTVKDCLFDIQKKIGKANGISKKADVQKIPTSFTDKQEAKQKAVFETYAKCVLFDYSY CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECE KFFYADGYGKEFSILNMKADDYGVADNDRKYFVASLLSFYQQLYLFAKNQEKLTAYNLHK EEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCC PLWVFVGNTVNKEDSDIWAVVEQLAYFLDGKNRPQILAWLNDLLCDEPLLLDSKGNAIFR CEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCEEEH HRFLPLASFKGDLDRLYKDILQRLFNSGSSQHLYLYDLKKASGEIALSIDNDLKKSFALI HHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEECCHHCCCEEEE NVGDSNELLKSAVKLDNVSVQQDEFSEGLFGTINQDSSTLNLLIGSRKFTEGWSSWRVST ECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCEEECCCCCEEEEEECCCHHHCCCCCCEEHH MGLLNMGRGEGSQIIQLFGRGVRLKGRDFSLRRTPINQMPKGLGLDKLETLNIFGIKADY HHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEECCCCEEECCCHHHCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHH MAKFREYLEDEGIQSPDEVLQLDFPVQKKLPTNVALKTLRLKDGYKDNQKMGFKRQEMVQ HHHHHHHHHHCCCCCHHHHEEECCCHHHCCCCCHHHEEEEECCCCCCCHHCCCCHHHHHH LYELPEFAQGKIKPILAVLDLYPRLEALSSKAVRQSESDERQSNKFKREIFALFDWDKLY HHCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH LDLQQYKMERTWSNLRVSRDGLRKFVESRDDWYLLYVPNSAMEVRSFGDIQTQQDILFQL HHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHH LKEYTDQFYRRLKNAYEQQFMETAIITEENGSFFETYKMLFGEEENLPYEREQAVKKIEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH LADLIRDKKIEQAMNWQSPLSEFKAICFNSHLFYPLLSFDKSTGLPIKISPLPLAAESEM HHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHH QFIDDLMQAEKSGELAKWLGGKSLYLMRNADRKDKGLGFALAGNFYPDFLLWVVDHANGK HHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCH QWLNFVDPKGIRNMDLHDPKFGLYQEVKALEAKIADPNLVLNSFILSITKLQDWVNMTLT HHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE VEELAERHILFMENNYLQQMFEKMQ HHHHHHCCEEEEECHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MLKGQKMKRTFHDNLILNRYLLSLFNQDNLEKFKQRLGDDRFEGIDNDGQTKVFHELTGG CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCCCHHHHCCCC QLFQTDLISANDLRRYDLNIVKHWQQITENRNKAEGHILNLKYFQYLSLLFTEIHLDFYF CEEHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE NRQNELLNQLNEQLVLLKENDSTFPDFDLYELGDLNKLAFWNATGSGKTLLMHVNILQYQ CCHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCCCHHCCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEHHHHH HYQKNKDLTVFVITPNDGLSQQHLAEFSASNLPANLFDKNKPFQGTGLFNDIQIMDINKL HHCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEHHH ADKDGELTVAVDRFLDLNKLVLVDEGHRGSSGDQWLARRQKLIGDGFAFEYSATFGQAVK CCCCCCEEEEEHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHH DGKTVKDCLFDIQKKIGKANGISKKADVQKIPTSFTDKQEAKQKAVFETYAKCVLFDYSY CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECE KFFYADGYGKEFSILNMKADDYGVADNDRKYFVASLLSFYQQLYLFAKNQEKLTAYNLHK EEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCC PLWVFVGNTVNKEDSDIWAVVEQLAYFLDGKNRPQILAWLNDLLCDEPLLLDSKGNAIFR CEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCEEEH HRFLPLASFKGDLDRLYKDILQRLFNSGSSQHLYLYDLKKASGEIALSIDNDLKKSFALI HHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEECCHHCCCEEEE NVGDSNELLKSAVKLDNVSVQQDEFSEGLFGTINQDSSTLNLLIGSRKFTEGWSSWRVST ECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCEEECCCCCEEEEEECCCHHHCCCCCCEEHH MGLLNMGRGEGSQIIQLFGRGVRLKGRDFSLRRTPINQMPKGLGLDKLETLNIFGIKADY HHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEECCCCEEECCCHHHCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHH MAKFREYLEDEGIQSPDEVLQLDFPVQKKLPTNVALKTLRLKDGYKDNQKMGFKRQEMVQ HHHHHHHHHHCCCCCHHHHEEECCCHHHCCCCCHHHEEEEECCCCCCCHHCCCCHHHHHH LYELPEFAQGKIKPILAVLDLYPRLEALSSKAVRQSESDERQSNKFKREIFALFDWDKLY HHCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH LDLQQYKMERTWSNLRVSRDGLRKFVESRDDWYLLYVPNSAMEVRSFGDIQTQQDILFQL HHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHH LKEYTDQFYRRLKNAYEQQFMETAIITEENGSFFETYKMLFGEEENLPYEREQAVKKIEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH LADLIRDKKIEQAMNWQSPLSEFKAICFNSHLFYPLLSFDKSTGLPIKISPLPLAAESEM HHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHH QFIDDLMQAEKSGELAKWLGGKSLYLMRNADRKDKGLGFALAGNFYPDFLLWVVDHANGK HHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCH QWLNFVDPKGIRNMDLHDPKFGLYQEVKALEAKIADPNLVLNSFILSITKLQDWVNMTLT HHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE VEELAERHILFMENNYLQQMFEKMQ HHHHHHCCEEEEECHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA