| Definition | Shewanella baltica OS155 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009052 |
| Length | 5,127,376 |
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The map label for this gene is 126176417
Identifier: 126176417
GI number: 126176417
Start: 4959520
End: 4961175
Strand: Direct
Name: 126176417
Synonym: Sbal_4232
Alternate gene names: NA
Gene position: 4959520-4961175 (Clockwise)
Preceding gene: 126176414
Following gene: 126176418
Centisome position: 96.73
GC content: 50.36
Gene sequence:
>1656_bases ATGCTCTATCTTCTTGCTAGCTGTATCGCACTCTTAATTGGGCCACTGTTTTATCGCTACTTTTCATCGGGCAGCGGATT ACAGAAGGGGCTCGATGGCTTTATATTCGTCTCATTAGGCGGACTAGTGCTGATCCACATCTTGCCAGAGCTACTGCAGC ATGGCGGTTTGCTAGCCGTAGTCTTTGTATTCCTAGGTATCTGGGGACCGACCGCTAGCGAACGCCTTTTCCACCGTTAT TCAGAAATCACCCATAATCTCACCTTATCCCTAGGGATTGGCGGCTTGCTACTGCACACCATCACCGACGGTGGCGCTAT GGTATTGGCGCAGCAAGACGGCAGTTCGATCTTACTTGCCCTCGGGGTCATTATGCATCGCCTCCCCGTCGGCCTCGCCA TTTGGTGGTTACTCAAACCTCAAGTCGGCACCCGCTGGGCTAGCTTAGTGCTGGTCGCTATGATGCTACTTACGGGTGTT GGTTACTTTGCAGGCGAGCAATTAATCACTCAGCTCAGTTTAGAAAATACCGTTTATTTACAAGCCTTTGTTACCGGTTC GATTTTGCATGTGGTGCTACATCAACCCCACGGTCAGCACGATACCGACAAGCAAGGCAAATACGAGTACCAAGCGGGTA TCGGCAGTTTGCTCGGCATAGGCTTGCTCGTGATGCTGCTCTTGATGGATTCTGGCGGCCACGAACATGCCCACCATGAT CACAGCACAGAACAATTAATGACTTGGCTACTGACACTCGCGCCCATATTACTGCTGAGCTATGGTGCGGCGGCGCTGCG CTTTAAATTAGGTCTGACACCGCAGGATAGCAGCTTAGCCCGTCGCTGGTTCCAACGCTTAGCGGGGCCAGAAGCTCTCG TCATCACCGCCCTGTTACTCGGCCCTTGGCTAGCGTTATTCCAGTTACTTGTGGTTTTTATTCTTAGCGCTTATTTAAGC CACGCTAACGTTACTATTACCGATCCGCATACTAAATTACCCAGTAATTCCCTACGTTTCGGCTTTGCACATTTAGTCGA TCGCAGCGCACCGTGGATTTTACTCAGCCTAGTACTAGTGAATTTAATCGGCCATCCTTCAGTGCCATTAAGCAATCCGC TGCTGCAGGTTATAGTGCTGTTGCTCGTGTTTTTACCTATGCGTTTCTGCAACTTAGGCGCTGCGGTACTGGCTCTTGCA CTGGCCTACAGTGGCTGGAGCCCTATCGCAATTATGATGCCGCTGATTGCCGCACCTGTGCTTAACATATCGCAGCTTAA GTTAATGACATGGCCGCAAAGGGCAATATTACTGAGTATTATTGCGCTGAGTTTAGTCGCAGCACTACGTTTGCCACTGT GGTTCTCTCTATTCACTTTGCCAGAAGTGGTGAACTTAGTCGCGCTACTGATCCTGTCGGGATTATTTGCCGCCAGCTTA CTGCGCTTAGGCCCACGTAAATTTCTACGCCGCTTAATGCTGAGCAAACCGGCAGCTCATGCGCATAGTCATTCGCACAG CCACGAACATGCAACCCATGAACCTAGCACTTCGCACACATCTGTGCAGAGCACTGCTGAAACGCCTAGTGCCCATGATC ATTCCGATGAGCATACACACGATAAAGCAAAAGCAAATAAGCACACGCACCACTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CGCAAAATGTCAGTTTGGTAAATTGCCAGCAAGTCACTGCTCACTTTGCCTTACAGCTGGTATACTATGGCGTTTTTTCA GCAAATTTTCCGTGGAATCC
Downstream 100 bases:
>100_bases CACTGTTCATTTGTGAGCAGACAGGCTAAGTTAATCTACCTTTGGATTAATTTAGCCTGCTATGTGCATACTCTTTGTCG CCATTAATGCCCATCCTAAG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 551; Mature: 551
Protein sequence:
>551_residues MLYLLASCIALLIGPLFYRYFSSGSGLQKGLDGFIFVSLGGLVLIHILPELLQHGGLLAVVFVFLGIWGPTASERLFHRY SEITHNLTLSLGIGGLLLHTITDGGAMVLAQQDGSSILLALGVIMHRLPVGLAIWWLLKPQVGTRWASLVLVAMMLLTGV GYFAGEQLITQLSLENTVYLQAFVTGSILHVVLHQPHGQHDTDKQGKYEYQAGIGSLLGIGLLVMLLLMDSGGHEHAHHD HSTEQLMTWLLTLAPILLLSYGAAALRFKLGLTPQDSSLARRWFQRLAGPEALVITALLLGPWLALFQLLVVFILSAYLS HANVTITDPHTKLPSNSLRFGFAHLVDRSAPWILLSLVLVNLIGHPSVPLSNPLLQVIVLLLVFLPMRFCNLGAAVLALA LAYSGWSPIAIMMPLIAAPVLNISQLKLMTWPQRAILLSIIALSLVAALRLPLWFSLFTLPEVVNLVALLILSGLFAASL LRLGPRKFLRRLMLSKPAAHAHSHSHSHEHATHEPSTSHTSVQSTAETPSAHDHSDEHTHDKAKANKHTHH
Sequences:
>Translated_551_residues MLYLLASCIALLIGPLFYRYFSSGSGLQKGLDGFIFVSLGGLVLIHILPELLQHGGLLAVVFVFLGIWGPTASERLFHRY SEITHNLTLSLGIGGLLLHTITDGGAMVLAQQDGSSILLALGVIMHRLPVGLAIWWLLKPQVGTRWASLVLVAMMLLTGV GYFAGEQLITQLSLENTVYLQAFVTGSILHVVLHQPHGQHDTDKQGKYEYQAGIGSLLGIGLLVMLLLMDSGGHEHAHHD HSTEQLMTWLLTLAPILLLSYGAAALRFKLGLTPQDSSLARRWFQRLAGPEALVITALLLGPWLALFQLLVVFILSAYLS HANVTITDPHTKLPSNSLRFGFAHLVDRSAPWILLSLVLVNLIGHPSVPLSNPLLQVIVLLLVFLPMRFCNLGAAVLALA LAYSGWSPIAIMMPLIAAPVLNISQLKLMTWPQRAILLSIIALSLVAALRLPLWFSLFTLPEVVNLVALLILSGLFAASL LRLGPRKFLRRLMLSKPAAHAHSHSHSHEHATHEPSTSHTSVQSTAETPSAHDHSDEHTHDKAKANKHTHH >Mature_551_residues MLYLLASCIALLIGPLFYRYFSSGSGLQKGLDGFIFVSLGGLVLIHILPELLQHGGLLAVVFVFLGIWGPTASERLFHRY SEITHNLTLSLGIGGLLLHTITDGGAMVLAQQDGSSILLALGVIMHRLPVGLAIWWLLKPQVGTRWASLVLVAMMLLTGV GYFAGEQLITQLSLENTVYLQAFVTGSILHVVLHQPHGQHDTDKQGKYEYQAGIGSLLGIGLLVMLLLMDSGGHEHAHHD HSTEQLMTWLLTLAPILLLSYGAAALRFKLGLTPQDSSLARRWFQRLAGPEALVITALLLGPWLALFQLLVVFILSAYLS HANVTITDPHTKLPSNSLRFGFAHLVDRSAPWILLSLVLVNLIGHPSVPLSNPLLQVIVLLLVFLPMRFCNLGAAVLALA LAYSGWSPIAIMMPLIAAPVLNISQLKLMTWPQRAILLSIIALSLVAALRLPLWFSLFTLPEVVNLVALLILSGLFAASL LRLGPRKFLRRLMLSKPAAHAHSHSHSHEHATHEPSTSHTSVQSTAETPSAHDHSDEHTHDKAKANKHTHH
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 60084; Mature: 60084
Theoretical pI: Translated: 8.96; Mature: 8.96
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 2.4 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 2.4 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLYLLASCIALLIGPLFYRYFSSGSGLQKGLDGFIFVSLGGLVLIHILPELLQHGGLLAV CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH VFVFLGIWGPTASERLFHRYSEITHNLTLSLGIGGLLLHTITDGGAMVLAQQDGSSILLA HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHH LGVIMHRLPVGLAIWWLLKPQVGTRWASLVLVAMMLLTGVGYFAGEQLITQLSLENTVYL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEH QAFVTGSILHVVLHQPHGQHDTDKQGKYEYQAGIGSLLGIGLLVMLLLMDSGGHEHAHHD HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC HSTEQLMTWLLTLAPILLLSYGAAALRFKLGLTPQDSSLARRWFQRLAGPEALVITALLL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH GPWLALFQLLVVFILSAYLSHANVTITDPHTKLPSNSLRFGFAHLVDRSAPWILLSLVLV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH NLIGHPSVPLSNPLLQVIVLLLVFLPMRFCNLGAAVLALALAYSGWSPIAIMMPLIAAPV HHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCC LNISQLKLMTWPQRAILLSIIALSLVAALRLPLWFSLFTLPEVVNLVALLILSGLFAASL CCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LRLGPRKFLRRLMLSKPAAHAHSHSHSHEHATHEPSTSHTSVQSTAETPSAHDHSDEHTH HHHCHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCHHH DKAKANKHTHH HHHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure MLYLLASCIALLIGPLFYRYFSSGSGLQKGLDGFIFVSLGGLVLIHILPELLQHGGLLAV CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH VFVFLGIWGPTASERLFHRYSEITHNLTLSLGIGGLLLHTITDGGAMVLAQQDGSSILLA HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHH LGVIMHRLPVGLAIWWLLKPQVGTRWASLVLVAMMLLTGVGYFAGEQLITQLSLENTVYL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEH QAFVTGSILHVVLHQPHGQHDTDKQGKYEYQAGIGSLLGIGLLVMLLLMDSGGHEHAHHD HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC HSTEQLMTWLLTLAPILLLSYGAAALRFKLGLTPQDSSLARRWFQRLAGPEALVITALLL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH GPWLALFQLLVVFILSAYLSHANVTITDPHTKLPSNSLRFGFAHLVDRSAPWILLSLVLV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH NLIGHPSVPLSNPLLQVIVLLLVFLPMRFCNLGAAVLALALAYSGWSPIAIMMPLIAAPV HHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCC LNISQLKLMTWPQRAILLSIIALSLVAALRLPLWFSLFTLPEVVNLVALLILSGLFAASL CCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LRLGPRKFLRRLMLSKPAAHAHSHSHSHEHATHEPSTSHTSVQSTAETPSAHDHSDEHTH HHHCHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCHHH DKAKANKHTHH HHHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA