| Definition | Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009004 |
| Length | 2,529,478 |
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The map label for this gene is yusP [H]
Identifier: 125623701
GI number: 125623701
Start: 822270
End: 823712
Strand: Direct
Name: yusP [H]
Synonym: llmg_0856
Alternate gene names: 125623701
Gene position: 822270-823712 (Clockwise)
Preceding gene: 125623700
Following gene: 125623703
Centisome position: 32.51
GC content: 39.85
Gene sequence:
>1443_bases ATGGGAGAAAATACTGTTCCTCAAAAATCTAGTGATAATGTGGGCTCAATAGTGGCTTTAATGGTCGCCCTATTGGTAGC AATCTTTGCTTTTCAGCTTAATGCTTCAATGCTCTCGCCTGCTTTGGTTACCATGCAGGCTCAATTACATACGACAGCTT CGTCTATAGCACTGACACAAACCATCTTTTTTACAGCTGCGGCCTTATTTGCTTTGTTTTTGCCTCGTTTGGCAGATTTA ATTGGACGAAAAAAAGTTCTGATTGGGATGCTTACCTTAACAATGATTGGTTGTCTTATTTCTGGATTTGCGACTAATGT AGGAATTTTGATGATTGGTCGTATCTTACAAGGTGCTGCTGGACCTGTAGTTCCACTTTGTTTAATCATCTTGCACGTGA AAGTGCGTGATGAGAAGAGATATGCAAAATTAATGGCCATACTTACTTCAATTAATGGTGGAATTGCTGGAGTTGATGCC TTAGCAGGTGGCTGGTTAGTGAGCCATGGTGGTTTCCGTTCAGTATTTTTTGTTATGGGAATTACGGCAGCACTTGCTAT TCTTTTAGTAAGTTTTGGAACGCAAGAGTCAACTGCAAAAGATACACCAAAAATGGATTGGACTGGAGTCATTCTTTTAG TAGTAGCAATGGGTGCGCTCTTGAGTGCGGTTAATGCTTTGCAAGGAAGCTTTGGAAATCTTGGACTTCCTAATTGGCTT TTAGCTTCAATCTTGGCTCTTTTGGGTCTGATCTGTTTCGTTGGATTTTGGCAAGTGGAAAAACGAGTGAACCATCCGAT GGTTCCTATTCATTATTTGAAGCAAAGAAGAACATGGGGATTATTAATTACAACTCTATTAACAATGACTGGTGTTTTTG CAATTATGAATGGAATTATTCCTGCTTTAGGTCAAGATGGTAAGTTTGGTTTGGGACTTGGGGCAGATATGGTTTCTCTT GTTACCCTTACTCCTTATGCGCTTGCTGGCTTATTCTTTGGACCTGTTTCAGGCTTCTTGGCTGCTCGCTTTGGTTTTGC GAAGGTCCTTCGAGTGGGGCTTTTAACGACGATTATCGGAATAGTTTTGGCTGTTGCTGGCGTGCTACAACCTTCAATCT GGCTTTTATTGTTGGTATCTACCTTCATTGGGATTACCTATGCTGGGATAACAAATATTATGTTAAATGGTCTCGGAATT GTGCTTTCACCAGAGGATAATCCAGGCTATCTTCCAGGATTAAATGCTGGAATGTTTAATCTGGGAGCTGGTCTCAGCTT CATTATTTTATATGCTGTACCAACAGTTTTACATACGAGTGTTGGTGGAAGCAGTTCTGGTTATATTTCTGGGATTGTTA CAGGATTGATTCTTGTTATTATTGCTTTCTTTACTTCGTTTTTGATTCCAGATTCTAAAGACTGTAAAATAAACCTTGAA TAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AACTTCGCAAAAAGTAAAATTTATAATATAATAGATAGCTGGGGCTCTTTTAAGGTTGCGAAACATAAAGAGAGTTTATC CTCTAAAAAAAGGAGAAAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases ATATTAATTTATTACTCATCAAAAAACTCTCACGGAATTCCGGCAGAGTTTTTTTATTCTGGTAAATTATCAAAGTATTC TGGGAAAGCTTTTAAAACTG
Product: hypothetical protein
Products: Proton [Cytoplasm]; drug [Periplasm] [C]
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 480; Mature: 479
Protein sequence:
>480_residues MGENTVPQKSSDNVGSIVALMVALLVAIFAFQLNASMLSPALVTMQAQLHTTASSIALTQTIFFTAAALFALFLPRLADL IGRKKVLIGMLTLTMIGCLISGFATNVGILMIGRILQGAAGPVVPLCLIILHVKVRDEKRYAKLMAILTSINGGIAGVDA LAGGWLVSHGGFRSVFFVMGITAALAILLVSFGTQESTAKDTPKMDWTGVILLVVAMGALLSAVNALQGSFGNLGLPNWL LASILALLGLICFVGFWQVEKRVNHPMVPIHYLKQRRTWGLLITTLLTMTGVFAIMNGIIPALGQDGKFGLGLGADMVSL VTLTPYALAGLFFGPVSGFLAARFGFAKVLRVGLLTTIIGIVLAVAGVLQPSIWLLLLVSTFIGITYAGITNIMLNGLGI VLSPEDNPGYLPGLNAGMFNLGAGLSFIILYAVPTVLHTSVGGSSSGYISGIVTGLILVIIAFFTSFLIPDSKDCKINLE
Sequences:
>Translated_480_residues MGENTVPQKSSDNVGSIVALMVALLVAIFAFQLNASMLSPALVTMQAQLHTTASSIALTQTIFFTAAALFALFLPRLADL IGRKKVLIGMLTLTMIGCLISGFATNVGILMIGRILQGAAGPVVPLCLIILHVKVRDEKRYAKLMAILTSINGGIAGVDA LAGGWLVSHGGFRSVFFVMGITAALAILLVSFGTQESTAKDTPKMDWTGVILLVVAMGALLSAVNALQGSFGNLGLPNWL LASILALLGLICFVGFWQVEKRVNHPMVPIHYLKQRRTWGLLITTLLTMTGVFAIMNGIIPALGQDGKFGLGLGADMVSL VTLTPYALAGLFFGPVSGFLAARFGFAKVLRVGLLTTIIGIVLAVAGVLQPSIWLLLLVSTFIGITYAGITNIMLNGLGI VLSPEDNPGYLPGLNAGMFNLGAGLSFIILYAVPTVLHTSVGGSSSGYISGIVTGLILVIIAFFTSFLIPDSKDCKINLE >Mature_479_residues GENTVPQKSSDNVGSIVALMVALLVAIFAFQLNASMLSPALVTMQAQLHTTASSIALTQTIFFTAAALFALFLPRLADLI GRKKVLIGMLTLTMIGCLISGFATNVGILMIGRILQGAAGPVVPLCLIILHVKVRDEKRYAKLMAILTSINGGIAGVDAL AGGWLVSHGGFRSVFFVMGITAALAILLVSFGTQESTAKDTPKMDWTGVILLVVAMGALLSAVNALQGSFGNLGLPNWLL ASILALLGLICFVGFWQVEKRVNHPMVPIHYLKQRRTWGLLITTLLTMTGVFAIMNGIIPALGQDGKFGLGLGADMVSLV TLTPYALAGLFFGPVSGFLAARFGFAKVLRVGLLTTIIGIVLAVAGVLQPSIWLLLLVSTFIGITYAGITNIMLNGLGIV LSPEDNPGYLPGLNAGMFNLGAGLSFIILYAVPTVLHTSVGGSSSGYISGIVTGLILVIIAFFTSFLIPDSKDCKINLE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. EmrB family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004638 - InterPro: IPR020846 - InterPro: IPR011701 - InterPro: IPR016196 - InterPro: IPR005829 - InterPro: IPR001411 [H]
Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 50378; Mature: 50247
Theoretical pI: Translated: 9.74; Mature: 9.74
Prosite motif: PS50850 MFS
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 3.5 %Met (Translated Protein) 4.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 3.3 %Met (Mature Protein) 4.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MGENTVPQKSSDNVGSIVALMVALLVAIFAFQLNASMLSPALVTMQAQLHTTASSIALTQ CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TIFFTAAALFALFLPRLADLIGRKKVLIGMLTLTMIGCLISGFATNVGILMIGRILQGAA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC GPVVPLCLIILHVKVRDEKRYAKLMAILTSINGGIAGVDALAGGWLVSHGGFRSVFFVMG CCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCHHEECCCHHHHHHHHH ITAALAILLVSFGTQESTAKDTPKMDWTGVILLVVAMGALLSAVNALQGSFGNLGLPNWL HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH LASILALLGLICFVGFWQVEKRVNHPMVPIHYLKQRRTWGLLITTLLTMTGVFAIMNGII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PALGQDGKFGLGLGADMVSLVTLTPYALAGLFFGPVSGFLAARFGFAKVLRVGLLTTIIG HHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVLAVAGVLQPSIWLLLLVSTFIGITYAGITNIMLNGLGIVLSPEDNPGYLPGLNAGMFN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHH LGAGLSFIILYAVPTVLHTSVGGSSSGYISGIVTGLILVIIAFFTSFLIPDSKDCKINLE HCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECC >Mature Secondary Structure GENTVPQKSSDNVGSIVALMVALLVAIFAFQLNASMLSPALVTMQAQLHTTASSIALTQ CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TIFFTAAALFALFLPRLADLIGRKKVLIGMLTLTMIGCLISGFATNVGILMIGRILQGAA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC GPVVPLCLIILHVKVRDEKRYAKLMAILTSINGGIAGVDALAGGWLVSHGGFRSVFFVMG CCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCHHEECCCHHHHHHHHH ITAALAILLVSFGTQESTAKDTPKMDWTGVILLVVAMGALLSAVNALQGSFGNLGLPNWL HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH LASILALLGLICFVGFWQVEKRVNHPMVPIHYLKQRRTWGLLITTLLTMTGVFAIMNGII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PALGQDGKFGLGLGADMVSLVTLTPYALAGLFFGPVSGFLAARFGFAKVLRVGLLTTIIG HHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVLAVAGVLQPSIWLLLLVSTFIGITYAGITNIMLNGLGIVLSPEDNPGYLPGLNAGMFN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHH LGAGLSFIILYAVPTVLHTSVGGSSSGYISGIVTGLILVIIAFFTSFLIPDSKDCKINLE HCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: Proton [Periplasm]; drug [Cytoplasm] [C]
Specific reaction: Proton [Periplasm] + drug [Cytoplasm] = Proton [Cytoplasm] + drug [Periplasm] [C]
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9384377 [H]