Definition Prochlorococcus marinus str. MIT 9303, complete genome.
Accession NC_008820
Length 2,682,675

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The map label for this gene is 124024514

Identifier: 124024514

GI number: 124024514

Start: 2487256

End: 2489403

Strand: Reverse

Name: 124024514

Synonym: P9303_28261

Alternate gene names: NA

Gene position: 2489403-2487256 (Counterclockwise)

Preceding gene: 124024516

Following gene: 124024513

Centisome position: 92.8

GC content: 41.67

Gene sequence:

>2148_bases
ATGCAGAGAAAAATGGCAATTATTTACCAACTCACTTTTTTGCTATCAGTTATCATTGTCGCCTATATCATTGGTTGGTC
TCTGACTGGCTATGCCTTTAAGGCCTCGCGGGATTTAAGCAGTAAGCCGTTTCTCGTTATTGCTACAGGCTTGGCTTGGA
TTGTGATTGCATCAGCTTGGGCGCTTCTGTTAAGCAGGCTGTTTCCATTTTATATTTATCTGCAGTACACGATTGTCTTC
ATACCTGTCTTCGTTGGGATTCTATTGAGAAAAAGAATCCAAGTATATTCTACGATTAAACAGCATGTAGCCAGGCTTTT
GAAGGTCTCTTGGCTCTTCTTTGTTCCAACTTTGATTCTTGTAGCGCTAGGAATCATTTCTTCTATGCATCATAAGGTGC
AATTTGGGGTTGACTCTGCACTTTACATTCAATTAGCACATCATTTACTTCGTTCGCCAACTAACCCCACAGAAGTCTCG
AATCTTGTCGAGACAGGTCATTTGGCTTGGGCAGGATTTGTTCAAAGTCATCGATGGGGCTTGCCACTGCTTGTCCAATT
TTTCAGCTCGAGCATTTTTAGTGATCTTGCAAAGAATTCCTACGCCCTGTGCTCAGTATTCATCGTTTTGCCGGCTGGAT
TGATTGTAGAGAATCTTCCCACTGTTGAGGATTCCAAAAACTGTATTTCGACATTGAGATTATATGTACTTTTTCCATGT
GTGGGATTAAATTGGTTTCTTTTCTCTCTACTACTGGAAGGGCAATGGCCTAATCTTGTGGCGTTAACATTCTACTTTTT
GGCGTCCATTTTCATCCTCGACTCTTTATACGACACACTCAGCCTAAATTCTAAGAAGTTGATCAGTCTTTGGAAGATCT
TACTATCTGCATTGTTCTTTTCGGCAGCCTGCACGATATATGGAGAGTTTTTCTTGCTGCATTGGATGTCAGTATCGATC
TTAATTGCAGTTTATGTTGGATTAAGCATTCGCTCTGTTTATTCAATCGGATGCAAGGTAGGCGTTGACTTATTGCGTTT
CCTTTTGGTAATAATTGGTTGTTCTATTTTTCTCTGTCTGCCTTATTTACAGAGTGCATTTTCTCACACGTCGACAATAA
AACTGACTACTGTTGGTTACCCTCAGCCACGCCCATTACTGCTCCCAGATCTTCTTGGAATTGATTCTCCTTGGCTTTTG
GATGATTGGCGCTCCCAAATGAATTCTTTTACCGAAGTGGGGGAGTCCGTATATAGCTTGGTTGATTCTAGTGATATCAA
ATATTATGTACTCCTTGCTTTTGTTGGCCTTTGCGCATTGGCAGCTTTATGCATTAGGTGTGCATTCTCTGAGTTGGACC
TCTCGTCTCGTCAAGGCAAGTTGTTTTACACCTTCGCATTGCTCGTTCCGATTTATTCTTTGGTAGCTATTCTTTATACC
TTTAAGTCGGCCTCTGGTGCAGGCGTAAATGAAGACTACATATGGTTGAAGCTATGCAGCTATTTATTTTTGTTCGTTCA
ATATATTTTGCTCTCAGCACTCTCCATTTCGCTTGCCAATAAACAGGATGTGGCTCGTGCACCGTTAGATCAGTTCTTTT
ATGGCAGCTCATTGTCCTATCTATTTGTATCTCTTTATTCTGTAATGGTTGCATTTACTTGTTTCTTTTATCTGAATTCA
TTTTCTGAGCACTCAGCTCGGGCCCGCATCCTTTCTGAACAGACGAAGAATGTGCTTGCGAGTGATTACTCAGATTGCAT
CATTTTGCTGCCTCCAAGAGGAGTCTCTAGGCGGGAGAGGCGTTGGGCAGATCGAACAAAGGAATTCATTGCAACCTCTA
CCTCGCCTAATGCCACTTCTTCCTCTCGAGCTTTAAGATTTCTAGGTAGTTGGTCTTTGCAGGTTAGGCACCTTGGTGTT
CCACCTCACCCACTCTCCATGACTGGCAACATTTGTCTAATGGTTGATACAAGCCGAGATTCATATGACAGGCGGTTTAT
TAAAGACATTCATCGCTTGTCTGATTCGCAACGCACTCTTCCAGATGATTGGACTTTGTATGTAACAGATTACACTTTTG
GTGATCTTGAAAAGATTGGTAGTGTCAATCTCTACAGTAAGCTTTATAGTGGGATTGAGAATCAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGTCGATATTGGACTCGTTGATTGGTCAAGTCATACGAGATCTTTGCAGTGTATGTACTCGATTGCTAGCGCAATCTGAA
GTGGCTAAATTAAGGGTGTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGTTTTTCATTGACTCTTTTGCATTGACTTAATCTTGCATATGATGAAATAATTGTCTCTTACTCCTTCCCCTGTCGCAA
AGTCAACTTGAGATCTAGAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 715; Mature: 715

Protein sequence:

>715_residues
MQRKMAIIYQLTFLLSVIIVAYIIGWSLTGYAFKASRDLSSKPFLVIATGLAWIVIASAWALLLSRLFPFYIYLQYTIVF
IPVFVGILLRKRIQVYSTIKQHVARLLKVSWLFFVPTLILVALGIISSMHHKVQFGVDSALYIQLAHHLLRSPTNPTEVS
NLVETGHLAWAGFVQSHRWGLPLLVQFFSSSIFSDLAKNSYALCSVFIVLPAGLIVENLPTVEDSKNCISTLRLYVLFPC
VGLNWFLFSLLLEGQWPNLVALTFYFLASIFILDSLYDTLSLNSKKLISLWKILLSALFFSAACTIYGEFFLLHWMSVSI
LIAVYVGLSIRSVYSIGCKVGVDLLRFLLVIIGCSIFLCLPYLQSAFSHTSTIKLTTVGYPQPRPLLLPDLLGIDSPWLL
DDWRSQMNSFTEVGESVYSLVDSSDIKYYVLLAFVGLCALAALCIRCAFSELDLSSRQGKLFYTFALLVPIYSLVAILYT
FKSASGAGVNEDYIWLKLCSYLFLFVQYILLSALSISLANKQDVARAPLDQFFYGSSLSYLFVSLYSVMVAFTCFFYLNS
FSEHSARARILSEQTKNVLASDYSDCIILLPPRGVSRRERRWADRTKEFIATSTSPNATSSSRALRFLGSWSLQVRHLGV
PPHPLSMTGNICLMVDTSRDSYDRRFIKDIHRLSDSQRTLPDDWTLYVTDYTFGDLEKIGSVNLYSKLYSGIENQ

Sequences:

>Translated_715_residues
MQRKMAIIYQLTFLLSVIIVAYIIGWSLTGYAFKASRDLSSKPFLVIATGLAWIVIASAWALLLSRLFPFYIYLQYTIVF
IPVFVGILLRKRIQVYSTIKQHVARLLKVSWLFFVPTLILVALGIISSMHHKVQFGVDSALYIQLAHHLLRSPTNPTEVS
NLVETGHLAWAGFVQSHRWGLPLLVQFFSSSIFSDLAKNSYALCSVFIVLPAGLIVENLPTVEDSKNCISTLRLYVLFPC
VGLNWFLFSLLLEGQWPNLVALTFYFLASIFILDSLYDTLSLNSKKLISLWKILLSALFFSAACTIYGEFFLLHWMSVSI
LIAVYVGLSIRSVYSIGCKVGVDLLRFLLVIIGCSIFLCLPYLQSAFSHTSTIKLTTVGYPQPRPLLLPDLLGIDSPWLL
DDWRSQMNSFTEVGESVYSLVDSSDIKYYVLLAFVGLCALAALCIRCAFSELDLSSRQGKLFYTFALLVPIYSLVAILYT
FKSASGAGVNEDYIWLKLCSYLFLFVQYILLSALSISLANKQDVARAPLDQFFYGSSLSYLFVSLYSVMVAFTCFFYLNS
FSEHSARARILSEQTKNVLASDYSDCIILLPPRGVSRRERRWADRTKEFIATSTSPNATSSSRALRFLGSWSLQVRHLGV
PPHPLSMTGNICLMVDTSRDSYDRRFIKDIHRLSDSQRTLPDDWTLYVTDYTFGDLEKIGSVNLYSKLYSGIENQ
>Mature_715_residues
MQRKMAIIYQLTFLLSVIIVAYIIGWSLTGYAFKASRDLSSKPFLVIATGLAWIVIASAWALLLSRLFPFYIYLQYTIVF
IPVFVGILLRKRIQVYSTIKQHVARLLKVSWLFFVPTLILVALGIISSMHHKVQFGVDSALYIQLAHHLLRSPTNPTEVS
NLVETGHLAWAGFVQSHRWGLPLLVQFFSSSIFSDLAKNSYALCSVFIVLPAGLIVENLPTVEDSKNCISTLRLYVLFPC
VGLNWFLFSLLLEGQWPNLVALTFYFLASIFILDSLYDTLSLNSKKLISLWKILLSALFFSAACTIYGEFFLLHWMSVSI
LIAVYVGLSIRSVYSIGCKVGVDLLRFLLVIIGCSIFLCLPYLQSAFSHTSTIKLTTVGYPQPRPLLLPDLLGIDSPWLL
DDWRSQMNSFTEVGESVYSLVDSSDIKYYVLLAFVGLCALAALCIRCAFSELDLSSRQGKLFYTFALLVPIYSLVAILYT
FKSASGAGVNEDYIWLKLCSYLFLFVQYILLSALSISLANKQDVARAPLDQFFYGSSLSYLFVSLYSVMVAFTCFFYLNS
FSEHSARARILSEQTKNVLASDYSDCIILLPPRGVSRRERRWADRTKEFIATSTSPNATSSSRALRFLGSWSLQVRHLGV
PPHPLSMTGNICLMVDTSRDSYDRRFIKDIHRLSDSQRTLPDDWTLYVTDYTFGDLEKIGSVNLYSKLYSGIENQ

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 80710; Mature: 80710

Theoretical pI: Translated: 8.73; Mature: 8.73

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.0 %Cys     (Translated Protein)
1.1 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
2.0 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQRKMAIIYQLTFLLSVIIVAYIIGWSLTGYAFKASRDLSSKPFLVIATGLAWIVIASAW
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHH
ALLLSRLFPFYIYLQYTIVFIPVFVGILLRKRIQVYSTIKQHVARLLKVSWLFFVPTLIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VALGIISSMHHKVQFGVDSALYIQLAHHLLRSPTNPTEVSNLVETGHLAWAGFVQSHRWG
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCC
LPLLVQFFSSSIFSDLAKNSYALCSVFIVLPAGLIVENLPTVEDSKNCISTLRLYVLFPC
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VGLNWFLFSLLLEGQWPNLVALTFYFLASIFILDSLYDTLSLNSKKLISLWKILLSALFF
HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
SAACTIYGEFFLLHWMSVSILIAVYVGLSIRSVYSIGCKVGVDLLRFLLVIIGCSIFLCL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PYLQSAFSHTSTIKLTTVGYPQPRPLLLPDLLGIDSPWLLDDWRSQMNSFTEVGESVYSL
HHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VDSSDIKYYVLLAFVGLCALAALCIRCAFSELDLSSRQGKLFYTFALLVPIYSLVAILYT
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FKSASGAGVNEDYIWLKLCSYLFLFVQYILLSALSISLANKQDVARAPLDQFFYGSSLSY
HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCHHHHHCCCHHHH
LFVSLYSVMVAFTCFFYLNSFSEHSARARILSEQTKNVLASDYSDCIILLPPRGVSRRER
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCHHHH
RWADRTKEFIATSTSPNATSSSRALRFLGSWSLQVRHLGVPPHPLSMTGNICLMVDTSRD
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCC
SYDRRFIKDIHRLSDSQRTLPDDWTLYVTDYTFGDLEKIGSVNLYSKLYSGIENQ
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MQRKMAIIYQLTFLLSVIIVAYIIGWSLTGYAFKASRDLSSKPFLVIATGLAWIVIASAW
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHH
ALLLSRLFPFYIYLQYTIVFIPVFVGILLRKRIQVYSTIKQHVARLLKVSWLFFVPTLIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VALGIISSMHHKVQFGVDSALYIQLAHHLLRSPTNPTEVSNLVETGHLAWAGFVQSHRWG
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LPLLVQFFSSSIFSDLAKNSYALCSVFIVLPAGLIVENLPTVEDSKNCISTLRLYVLFPC
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VGLNWFLFSLLLEGQWPNLVALTFYFLASIFILDSLYDTLSLNSKKLISLWKILLSALFF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LFVSLYSVMVAFTCFFYLNSFSEHSARARILSEQTKNVLASDYSDCIILLPPRGVSRRER
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCHHHH
RWADRTKEFIATSTSPNATSSSRALRFLGSWSLQVRHLGVPPHPLSMTGNICLMVDTSRD
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCC
SYDRRFIKDIHRLSDSQRTLPDDWTLYVTDYTFGDLEKIGSVNLYSKLYSGIENQ
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA