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The map label for this gene is 124027968

Identifier: 124027968

GI number: 124027968

Start: 1115591

End: 1117456

Strand: Direct

Name: 124027968

Synonym: Hbut_1100

Alternate gene names: NA

Gene position: 1115591-1117456 (Clockwise)

Preceding gene: 124027967

Following gene: 124027970

Centisome position: 66.92

GC content: 51.07

Gene sequence:

>1866_bases
TTGTCTCTGCTTCGCCGCTTCGCGAGGAGGTTTCGTAAGAAGCGGGAAAGCACTGCTAGAAGAAGAACTGTAAAAAAGGT
TCCATTGACACTTATCTATGATAGCTTGGCTTTAACTGTTCTCGGGAAGTACCCGGAGAGATTTGCGAAGGCCTTCCAGC
TCTATGAGATGATTGATAAGGCTGGTCTCAATACACACCCAACCCTCTATGCTGCGCGTATCCTCTTCGCCGTTGTGCTG
TTACTTTCAGCCGCTGTGGTGGCTACTATATATCTCGCCTTTCTACCGATAAGCTTCACCGTGAAGGTTGTAATTAGCCT
TGCCCTCTTCTTTGCACCCGTGATAGTGTTTGTTGCTGGCCTCATGTACCCGGCCTCTAAGGCTTCTAGTAGGGCTGAGC
GTGTAGACATGGAGTTTCCATTCTTTGCGGCTTACATGACTGCTATGGCTTATGGTGGTGTGCCTCCGGAGAAGCTTATT
GAGAGGCTTGCCGAGATAAGGATGTTCCGTGCCCTCCGAGAGGAAGCAAGACGTATACTCAGGGACGTAAAGATCTTCGG
CAAGAACATCCTATCGGCTCTTGAGCACAACGCGCTACACCACCCTTCAAGGCTTTACCGCGACTTCATGCTCGGTTATC
TTACAGTGATACGTACCGGCGGTAATGTGCATCATTACCTGGAGGTTCGTACACAAGAGGTTATCCAGGCAAGGATGGAG
GATCTCAGAAACCGTGCCGACCGTGTTGGCCTCATAGTTGAGGCCTACGTTGCAGTAGCAGTGCTTGGAACATTATCGTT
CTACATATTCTTCATCGTGAGCGGCCTCATAGGCCGTGCAGTAGGCGGCGGGCTTGGAGGCACTACGGGCCTCATACTCT
ATAGCTTCATAGTGCTGCCACTGATAACAATAGCAATACTAATGCTCCTTAACACCACCATACCAAGCTACGAGAATATC
CGTGAGCCATACATCTACATGGCTATCAGCGTTCCAACCGCGTTCGTCACGTCACTAATACTCCTCCAGCTAACCGGTGT
CTACCGCATACCAACAGCTACAGTTGATATCAAGGCTATATCCATGGCTTCTGCCATATTCGCACTAGGCTTAATGATAG
CTAGTTTGGGTCCCGCAATAGTCTACATGAGGATTGCAAGGAAGGAGAAGAAGATAAACCGTAGCCTGCCAGCATTCTTC
CGTGATCTCTCCGAGGTTAGGAGAACCGGGCTCAGCCCTGAGCGCAGCATCATAGTACTGTCGGAGCGCGACTATGGTGA
GCTTAGCAACGTCATACGCCGCATAGCCGCCGCGCTGTCAATGGGCCTCCACGTAGAGAGGGCGTTCAGGACCGCTATCA
AGGGGTACAAGAGCTGGATACTCCGTGTAACCATGAGGTTCCTCGTTGACGCCATAGATGTTGGTGGCGGTAGTCCAACA
ACAATAGACTCGCTGGCCAGGTTCGTGTCCACATTGATAGAGCTAAACGAGAATCTTAAGAGGAGGCTTAAGCCCTTCAT
CATAATGCCTTACTTTGGCGCCGTGATAGTTGCTGTTGCGAGCATACTGACCCTAGCAATGCTCGTAAACGCTATCGCCG
CTACCGGCCTCGGTACTACACAGTATAGCTTTGGCGGACTCCAGGTGAGTCTCTCGCCGGCACAGATTGGCAAGCTACTA
CTACTAGCGTCAATTGCGTCGATACTGAATGGTTGGCTTAGCGGCCTGGTGGCTGGAAAGCTTGCCGACCTGCATACGGC
AGGCGGGTTCCTCCATGCAACACTGCTAACCGCTATAGTACTCGTTTCGATAATAGCAGCGTTAACGGTATCTGGTTCGC
TACTACAGTCTGTAGCTGCTGGCTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATGCACTACGTGGTTTATCCGGTAGTCTCGCTACATCTGACCTAACTGGCAAGAAGCTAGCAGTGACACCCATAAGAGT
TCTAGGGTGGTGCTTGGGCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTTTTCGCTCTACCACCGCCGAGGAAGTCTAGTAGTGAGCGGCTCTGCAAGGGCTGGCCTTTCTGCCTCCTGATGTCACG
GAAGAGCTTCTGAACATCTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 621; Mature: 620

Protein sequence:

>621_residues
MSLLRRFARRFRKKRESTARRRTVKKVPLTLIYDSLALTVLGKYPERFAKAFQLYEMIDKAGLNTHPTLYAARILFAVVL
LLSAAVVATIYLAFLPISFTVKVVISLALFFAPVIVFVAGLMYPASKASSRAERVDMEFPFFAAYMTAMAYGGVPPEKLI
ERLAEIRMFRALREEARRILRDVKIFGKNILSALEHNALHHPSRLYRDFMLGYLTVIRTGGNVHHYLEVRTQEVIQARME
DLRNRADRVGLIVEAYVAVAVLGTLSFYIFFIVSGLIGRAVGGGLGGTTGLILYSFIVLPLITIAILMLLNTTIPSYENI
REPYIYMAISVPTAFVTSLILLQLTGVYRIPTATVDIKAISMASAIFALGLMIASLGPAIVYMRIARKEKKINRSLPAFF
RDLSEVRRTGLSPERSIIVLSERDYGELSNVIRRIAAALSMGLHVERAFRTAIKGYKSWILRVTMRFLVDAIDVGGGSPT
TIDSLARFVSTLIELNENLKRRLKPFIIMPYFGAVIVAVASILTLAMLVNAIAATGLGTTQYSFGGLQVSLSPAQIGKLL
LLASIASILNGWLSGLVAGKLADLHTAGGFLHATLLTAIVLVSIIAALTVSGSLLQSVAAG

Sequences:

>Translated_621_residues
MSLLRRFARRFRKKRESTARRRTVKKVPLTLIYDSLALTVLGKYPERFAKAFQLYEMIDKAGLNTHPTLYAARILFAVVL
LLSAAVVATIYLAFLPISFTVKVVISLALFFAPVIVFVAGLMYPASKASSRAERVDMEFPFFAAYMTAMAYGGVPPEKLI
ERLAEIRMFRALREEARRILRDVKIFGKNILSALEHNALHHPSRLYRDFMLGYLTVIRTGGNVHHYLEVRTQEVIQARME
DLRNRADRVGLIVEAYVAVAVLGTLSFYIFFIVSGLIGRAVGGGLGGTTGLILYSFIVLPLITIAILMLLNTTIPSYENI
REPYIYMAISVPTAFVTSLILLQLTGVYRIPTATVDIKAISMASAIFALGLMIASLGPAIVYMRIARKEKKINRSLPAFF
RDLSEVRRTGLSPERSIIVLSERDYGELSNVIRRIAAALSMGLHVERAFRTAIKGYKSWILRVTMRFLVDAIDVGGGSPT
TIDSLARFVSTLIELNENLKRRLKPFIIMPYFGAVIVAVASILTLAMLVNAIAATGLGTTQYSFGGLQVSLSPAQIGKLL
LLASIASILNGWLSGLVAGKLADLHTAGGFLHATLLTAIVLVSIIAALTVSGSLLQSVAAG
>Mature_620_residues
SLLRRFARRFRKKRESTARRRTVKKVPLTLIYDSLALTVLGKYPERFAKAFQLYEMIDKAGLNTHPTLYAARILFAVVLL
LSAAVVATIYLAFLPISFTVKVVISLALFFAPVIVFVAGLMYPASKASSRAERVDMEFPFFAAYMTAMAYGGVPPEKLIE
RLAEIRMFRALREEARRILRDVKIFGKNILSALEHNALHHPSRLYRDFMLGYLTVIRTGGNVHHYLEVRTQEVIQARMED
LRNRADRVGLIVEAYVAVAVLGTLSFYIFFIVSGLIGRAVGGGLGGTTGLILYSFIVLPLITIAILMLLNTTIPSYENIR
EPYIYMAISVPTAFVTSLILLQLTGVYRIPTATVDIKAISMASAIFALGLMIASLGPAIVYMRIARKEKKINRSLPAFFR
DLSEVRRTGLSPERSIIVLSERDYGELSNVIRRIAAALSMGLHVERAFRTAIKGYKSWILRVTMRFLVDAIDVGGGSPTT
IDSLARFVSTLIELNENLKRRLKPFIIMPYFGAVIVAVASILTLAMLVNAIAATGLGTTQYSFGGLQVSLSPAQIGKLLL
LASIASILNGWLSGLVAGKLADLHTAGGFLHATLLTAIVLVSIIAALTVSGSLLQSVAAG

Specific function: Unknown

COG id: COG2064

COG function: function code NU; Flp pilus assembly protein TadC

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To M.jannaschii flaJ [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018076 [H]

Pfam domain/function: PF00482 GSPII_F [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 68140; Mature: 68009

Theoretical pI: Translated: 10.75; Mature: 10.75

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSLLRRFARRFRKKRESTARRRTVKKVPLTLIYDSLALTVLGKYPERFAKAFQLYEMIDK
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AGLNTHPTLYAARILFAVVLLLSAAVVATIYLAFLPISFTVKVVISLALFFAPVIVFVAG
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LMYPASKASSRAERVDMEFPFFAAYMTAMAYGGVPPEKLIERLAEIRMFRALREEARRIL
HHCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RDVKIFGKNILSALEHNALHHPSRLYRDFMLGYLTVIRTGGNVHHYLEVRTQEVIQARME
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
DLRNRADRVGLIVEAYVAVAVLGTLSFYIFFIVSGLIGRAVGGGLGGTTGLILYSFIVLP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
LITIAILMLLNTTIPSYENIREPYIYMAISVPTAFVTSLILLQLTGVYRIPTATVDIKAI
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHH
SMASAIFALGLMIASLGPAIVYMRIARKEKKINRSLPAFFRDLSEVRRTGLSPERSIIVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEE
SERDYGELSNVIRRIAAALSMGLHVERAFRTAIKGYKSWILRVTMRFLVDAIDVGGGSPT
ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
TIDSLARFVSTLIELNENLKRRLKPFIIMPYFGAVIVAVASILTLAMLVNAIAATGLGTT
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
QYSFGGLQVSLSPAQIGKLLLLASIASILNGWLSGLVAGKLADLHTAGGFLHATLLTAIV
CEECCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
LVSIIAALTVSGSLLQSVAAG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
SLLRRFARRFRKKRESTARRRTVKKVPLTLIYDSLALTVLGKYPERFAKAFQLYEMIDK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AGLNTHPTLYAARILFAVVLLLSAAVVATIYLAFLPISFTVKVVISLALFFAPVIVFVAG
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LMYPASKASSRAERVDMEFPFFAAYMTAMAYGGVPPEKLIERLAEIRMFRALREEARRIL
HHCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RDVKIFGKNILSALEHNALHHPSRLYRDFMLGYLTVIRTGGNVHHYLEVRTQEVIQARME
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
DLRNRADRVGLIVEAYVAVAVLGTLSFYIFFIVSGLIGRAVGGGLGGTTGLILYSFIVLP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
LITIAILMLLNTTIPSYENIREPYIYMAISVPTAFVTSLILLQLTGVYRIPTATVDIKAI
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHH
SMASAIFALGLMIASLGPAIVYMRIARKEKKINRSLPAFFRDLSEVRRTGLSPERSIIVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEE
SERDYGELSNVIRRIAAALSMGLHVERAFRTAIKGYKSWILRVTMRFLVDAIDVGGGSPT
ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
TIDSLARFVSTLIELNENLKRRLKPFIIMPYFGAVIVAVASILTLAMLVNAIAATGLGTT
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
QYSFGGLQVSLSPAQIGKLLLLASIASILNGWLSGLVAGKLADLHTAGGFLHATLLTAIV
CEECCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
LVSIIAALTVSGSLLQSVAAG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]