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Definition Prochlorococcus marinus str. MIT 9515, complete genome.
Accession NC_008817
Length 1,704,176

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The map label for this gene is 123966638

Identifier: 123966638

GI number: 123966638

Start: 1242852

End: 1244900

Strand: Direct

Name: 123966638

Synonym: P9515_14051

Alternate gene names: NA

Gene position: 1242852-1244900 (Clockwise)

Preceding gene: 123966637

Following gene: 123966639

Centisome position: 72.93

GC content: 23.96

Gene sequence:

>2049_bases
ATGAAAATTTTAAATACACGAAATTCTATTTTTACTTTCTTCTTAGTAATAAAGATATTTTTTATAATTTTGGTCGTTCC
GAGTATTCAAGATGTATGGTTTATCGATTTTATAAAAAATTCAATTAATAATCCTAGTTTAGATCCATGGTCTAGTTATT
TATCAAATTATGGAGACTCATTAGGATTCCCATATGGTCCAATAATGTTTTTAATATTTATACCTTTATCATTTACTTTT
TGGTTTATAGGAATACCTTTTGGTCTAGAAGACTACTTTTTAGGTATTGGTTTTAGATTTAACTTACTTATATTTGATTT
AATTTCATTATTAGTTTTATCAAAGTTATTAAATAATAAAAAAGAAATTATCATTTTCTATTGGTTATCTCCATTGATAT
TTTATGTAACTTATATTTATGGACAATTAGATATTATCCCTACAACAATTGTACTTATCGGATACCTTAAGTTATATAAA
AATGAATTTAAAAATAGTGGATACTTTTTTGGTTTAGCAATCGCAACAAAATTAAGTTTTGCTTTGATTATACCTTTTCC
AATAATTTATCTTTGGCAAAATAAAAGATTATCTTTTGGTTTTAAACCCTTTATAAAATCTCTTTCTGAAATATTATTAG
TATTTGTTTTAACTCCAGTGATATCAAGTGGTTATAGACAAATGGTATTATCAACTCCAGAAAAAGCATCTTTAATATCT
TTTAATTTTTCTCTAAACGATGACTTAAAAATATTTATCTTGCCTTTGATATTTATTTTAATTATCTACTCAATCTGGAG
ATTGAAAAGATCAAATTTCACTTTACTTATTTCGATTACAGGCTTATCTTTTCTTATTTCTACACTAATGATGCCTCCAT
CTCCAGGTTGGTATTTATGGGCGCTGCCATTTTTAATAATCTATCAAATAAAAACTGATATTAATGGAAAATTACTAATA
TCATTTTTTACATTTTTGCCAATTATTATAATATTCCCAAATAATATTTTTTCAAAATTAAGTTTTTTGAATTCAAATTA
TAAATATAATACAATACTTATAAATAGTCTTAATGCAGATTTAATTTATACACTATTTATTAGTTTAGGTATACTTATTG
CTATAAGACTTTATAGAGAGTCAATACAAAGCAGTAATTATTACAAACTAAATAAAAGAGCTTTTGTTATAGGAATATCC
GGAGGACCATCATCAGGTAAAGATATACTATCAAAATCAATAGTGGATTTACTTGGAGATCACTCTACTTTAGTTTTTAG
AGAAAGAGATTATTTTAAATGGAATAAAAATCTAAGTAATACAGAAAAACATAATTCCATTAATATCAAATCAAATGATC
TATTAAAATTAAATTCAGACTTGGATTTAATTTCGAATAAAAATGTTCTTAATAGAAAAACTATTAATAACTCCATTACT
AAATTCCAAAGCATGAAATCCTTCTCTAAGGATTTTATAGTTGTTAATGGATATCATATTTTTCTGCCCGATGTATTAAA
TAAATTTTTTAATATAAAAATCTTTTTAGATCCAGAAACTGAACTTAATAAAAATTGGCTTAAAAACAAAAATGACTCTC
AACCAAATCCTACCAAAATATCGAACTTCAAAGATTTAAAAAAGTATCAGGATTTATATTCTGAACAAAAAAACTGCTCT
GATATAATTTTTTCATTTTCTTACATAAATAAAGAGATATTATCTTACAAAAAAGTTCAAAATTTACCTATAAAAATGGA
TGTTTTTCTTAAGGATGGCATTTATGCAGAAAACCTATCAAAAGCATTAATTTCTATATGTGGGGTAAAACTAAATTCAA
ATATCTCAAATACTGATTTTTCAGCAAAACTTTCTATAGAAGGAGATATTTGGCCAGAAGATATAAAATTAGCCGCTACT
AGATTGGTTCCTAATCTAGAAGAAATTATAGATTACAATGCAAAATGGCAATCTAATATACTTGGATTAATGCAATTAAT
AATACTTATGCAAATCGCTTATGTTTTTAAATATAAAATTGAGAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GACATCAACATTCAAAATGTTTGGATTTAAAAAATTATATCCAATTTAATCAAATGTACTTTGATGCTGTTTGTACTAAG
AAAGTTAAATTTTGGGAAGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGACTTTAAAATTAATTAATGATCAAAAGTTTAAGAGACTTCCAAAAGCAATTATATTTGATACGGATAATACTTTATA
TTCGTACGCACCAGCTAATG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 682; Mature: 682

Protein sequence:

>682_residues
MKILNTRNSIFTFFLVIKIFFIILVVPSIQDVWFIDFIKNSINNPSLDPWSSYLSNYGDSLGFPYGPIMFLIFIPLSFTF
WFIGIPFGLEDYFLGIGFRFNLLIFDLISLLVLSKLLNNKKEIIIFYWLSPLIFYVTYIYGQLDIIPTTIVLIGYLKLYK
NEFKNSGYFFGLAIATKLSFALIIPFPIIYLWQNKRLSFGFKPFIKSLSEILLVFVLTPVISSGYRQMVLSTPEKASLIS
FNFSLNDDLKIFILPLIFILIIYSIWRLKRSNFTLLISITGLSFLISTLMMPPSPGWYLWALPFLIIYQIKTDINGKLLI
SFFTFLPIIIIFPNNIFSKLSFLNSNYKYNTILINSLNADLIYTLFISLGILIAIRLYRESIQSSNYYKLNKRAFVIGIS
GGPSSGKDILSKSIVDLLGDHSTLVFRERDYFKWNKNLSNTEKHNSINIKSNDLLKLNSDLDLISNKNVLNRKTINNSIT
KFQSMKSFSKDFIVVNGYHIFLPDVLNKFFNIKIFLDPETELNKNWLKNKNDSQPNPTKISNFKDLKKYQDLYSEQKNCS
DIIFSFSYINKEILSYKKVQNLPIKMDVFLKDGIYAENLSKALISICGVKLNSNISNTDFSAKLSIEGDIWPEDIKLAAT
RLVPNLEEIIDYNAKWQSNILGLMQLIILMQIAYVFKYKIEN

Sequences:

>Translated_682_residues
MKILNTRNSIFTFFLVIKIFFIILVVPSIQDVWFIDFIKNSINNPSLDPWSSYLSNYGDSLGFPYGPIMFLIFIPLSFTF
WFIGIPFGLEDYFLGIGFRFNLLIFDLISLLVLSKLLNNKKEIIIFYWLSPLIFYVTYIYGQLDIIPTTIVLIGYLKLYK
NEFKNSGYFFGLAIATKLSFALIIPFPIIYLWQNKRLSFGFKPFIKSLSEILLVFVLTPVISSGYRQMVLSTPEKASLIS
FNFSLNDDLKIFILPLIFILIIYSIWRLKRSNFTLLISITGLSFLISTLMMPPSPGWYLWALPFLIIYQIKTDINGKLLI
SFFTFLPIIIIFPNNIFSKLSFLNSNYKYNTILINSLNADLIYTLFISLGILIAIRLYRESIQSSNYYKLNKRAFVIGIS
GGPSSGKDILSKSIVDLLGDHSTLVFRERDYFKWNKNLSNTEKHNSINIKSNDLLKLNSDLDLISNKNVLNRKTINNSIT
KFQSMKSFSKDFIVVNGYHIFLPDVLNKFFNIKIFLDPETELNKNWLKNKNDSQPNPTKISNFKDLKKYQDLYSEQKNCS
DIIFSFSYINKEILSYKKVQNLPIKMDVFLKDGIYAENLSKALISICGVKLNSNISNTDFSAKLSIEGDIWPEDIKLAAT
RLVPNLEEIIDYNAKWQSNILGLMQLIILMQIAYVFKYKIEN
>Mature_682_residues
MKILNTRNSIFTFFLVIKIFFIILVVPSIQDVWFIDFIKNSINNPSLDPWSSYLSNYGDSLGFPYGPIMFLIFIPLSFTF
WFIGIPFGLEDYFLGIGFRFNLLIFDLISLLVLSKLLNNKKEIIIFYWLSPLIFYVTYIYGQLDIIPTTIVLIGYLKLYK
NEFKNSGYFFGLAIATKLSFALIIPFPIIYLWQNKRLSFGFKPFIKSLSEILLVFVLTPVISSGYRQMVLSTPEKASLIS
FNFSLNDDLKIFILPLIFILIIYSIWRLKRSNFTLLISITGLSFLISTLMMPPSPGWYLWALPFLIIYQIKTDINGKLLI
SFFTFLPIIIIFPNNIFSKLSFLNSNYKYNTILINSLNADLIYTLFISLGILIAIRLYRESIQSSNYYKLNKRAFVIGIS
GGPSSGKDILSKSIVDLLGDHSTLVFRERDYFKWNKNLSNTEKHNSINIKSNDLLKLNSDLDLISNKNVLNRKTINNSIT
KFQSMKSFSKDFIVVNGYHIFLPDVLNKFFNIKIFLDPETELNKNWLKNKNDSQPNPTKISNFKDLKKYQDLYSEQKNCS
DIIFSFSYINKEILSYKKVQNLPIKMDVFLKDGIYAENLSKALISICGVKLNSNISNTDFSAKLSIEGDIWPEDIKLAAT
RLVPNLEEIIDYNAKWQSNILGLMQLIILMQIAYVFKYKIEN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 78932; Mature: 78932

Theoretical pI: Translated: 9.85; Mature: 9.85

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
1.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
1.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKILNTRNSIFTFFLVIKIFFIILVVPSIQDVWFIDFIKNSINNPSLDPWSSYLSNYGDS
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCC
LGFPYGPIMFLIFIPLSFTFWFIGIPFGLEDYFLGIGFRFNLLIFDLISLLVLSKLLNNK
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
KEIIIFYWLSPLIFYVTYIYGQLDIIPTTIVLIGYLKLYKNEFKNSGYFFGLAIATKLSF
CCEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHH
ALIIPFPIIYLWQNKRLSFGFKPFIKSLSEILLVFVLTPVISSGYRQMVLSTPEKASLIS
HEEECCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCEEEE
FNFSLNDDLKIFILPLIFILIIYSIWRLKRSNFTLLISITGLSFLISTLMMPPSPGWYLW
EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHCCCCCCCHHHH
ALPFLIIYQIKTDINGKLLISFFTFLPIIIIFPNNIFSKLSFLNSNYKYNTILINSLNAD
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCHH
LIYTLFISLGILIAIRLYRESIQSSNYYKLNKRAFVIGISGGPSSGKDILSKSIVDLLGD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCC
HSTLVFRERDYFKWNKNLSNTEKHNSINIKSNDLLKLNSDLDLISNKNVLNRKTINNSIT
CCEEEEECCCHHEECCCCCCCCCCCEEEECCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
KFQSMKSFSKDFIVVNGYHIFLPDVLNKFFNIKIFLDPETELNKNWLKNKNDSQPNPTKI
HHHHHHHCCCCEEEEECEEEEHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCC
SNFKDLKKYQDLYSEQKNCSDIIFSFSYINKEILSYKKVQNLPIKMDVFLKDGIYAENLS
CCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCHHHHH
KALISICGVKLNSNISNTDFSAKLSIEGDIWPEDIKLAATRLVPNLEEIIDYNAKWQSNI
HHHHHHHCCEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCHHHHH
LGLMQLIILMQIAYVFKYKIEN
HHHHHHHHHHHHHHHHHEEECC
>Mature Secondary Structure
MKILNTRNSIFTFFLVIKIFFIILVVPSIQDVWFIDFIKNSINNPSLDPWSSYLSNYGDS
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCC
LGFPYGPIMFLIFIPLSFTFWFIGIPFGLEDYFLGIGFRFNLLIFDLISLLVLSKLLNNK
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
KEIIIFYWLSPLIFYVTYIYGQLDIIPTTIVLIGYLKLYKNEFKNSGYFFGLAIATKLSF
CCEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHH
ALIIPFPIIYLWQNKRLSFGFKPFIKSLSEILLVFVLTPVISSGYRQMVLSTPEKASLIS
HEEECCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCEEEE
FNFSLNDDLKIFILPLIFILIIYSIWRLKRSNFTLLISITGLSFLISTLMMPPSPGWYLW
EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHCCCCCCCHHHH
ALPFLIIYQIKTDINGKLLISFFTFLPIIIIFPNNIFSKLSFLNSNYKYNTILINSLNAD
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCHH
LIYTLFISLGILIAIRLYRESIQSSNYYKLNKRAFVIGISGGPSSGKDILSKSIVDLLGD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCC
HSTLVFRERDYFKWNKNLSNTEKHNSINIKSNDLLKLNSDLDLISNKNVLNRKTINNSIT
CCEEEEECCCHHEECCCCCCCCCCCEEEECCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
KFQSMKSFSKDFIVVNGYHIFLPDVLNKFFNIKIFLDPETELNKNWLKNKNDSQPNPTKI
HHHHHHHCCCCEEEEECEEEEHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCC
SNFKDLKKYQDLYSEQKNCSDIIFSFSYINKEILSYKKVQNLPIKMDVFLKDGIYAENLS
CCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCHHHHH
KALISICGVKLNSNISNTDFSAKLSIEGDIWPEDIKLAATRLVPNLEEIIDYNAKWQSNI
HHHHHHHCCEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCHHHHH
LGLMQLIILMQIAYVFKYKIEN
HHHHHHHHHHHHHHHHHEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA