| Definition | Prochlorococcus marinus str. MIT 9515, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008817 |
| Length | 1,704,176 |
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The map label for this gene is 123966563
Identifier: 123966563
GI number: 123966563
Start: 1168177
End: 1170075
Strand: Reverse
Name: 123966563
Synonym: P9515_13301
Alternate gene names: NA
Gene position: 1170075-1168177 (Counterclockwise)
Preceding gene: 123966564
Following gene: 123966562
Centisome position: 68.66
GC content: 28.96
Gene sequence:
>1899_bases GTGCATACTTATAATATGAGTGTTATTTTTATCCAGAAGATGATAAGTAAATCTAATAAAGAGAATTTAGTCAATTACTT TAACTCTATAAAATTTAGTTTTTGGAAACCATCTTTAATCTTTTATTTGCTAGCTGTTTTTTCTTTTTTGTTTTGGCTAA TAATTGGTCCTTCAAGCTGGAGAAATGTAGATGATTATGGTACTTTTTTTGATGTTATTAAAAAAATAAATTCATTTGAA TCAAGTAATAATTTCCCGCTTTCCTCACAGATTGCCTACCCAATAGACTTTCAAAGTATCAAACCTATAAATCTATTACA AGCAACTCTAAAAACATGTAGAGAAGGTTGGGGCACTTATCCACCTTTATGGGGGTTTATCTATCTTCCTCTAACTATTC CATTCTTAAAGTTTGGTTTGGATTGGACTAGATTTGCCACTTTAGTGGTTGGATTTATAAGTGCAGTCTTAACAGCATAC CTTTTGAGTAATAACATAACAACTATTTTTTATTCTTTTAAAGATAAAATTAGAATTAAAAATTTCCAAAGAATTAGATA CTTAATTGATTTTTTATCGATCTTAATCGTATGTTTTAATCCGGAATTGATGTTACATGCAAGTTCCTATATGCCATATC AGCTCCCTGCAATAAGTACTTTGATTTGTTTATCTTTATTTACCTCTTTTTATACTTACCAAATTAAGATCAATGGTAGT AATCAAACCTTTTCCAATAAAACATTTGATATTCCACTGCTTTACACATTATTAATCATATGGCTTTCTTCGTTGTTGGG ATTTCAAACTATATTTTTATATCTTGGCATATTGCTAGCAAGTTTTTATTTTTTATTCACTGAAAAACAACCCTTGAAAA TTATTAAAAAAATATATCGAAAAAATTCTGTTATTTTTATCAACAAAAAACCAAAATTCTATTCAACTTTAGGAATAACA TTTTCCATTTCGCTTTTATTGGGTTTTTCGAAATATCACTACTTTAAATTAATTTCTATAATTAGCCAAAATGAAGGTAC AGCTCAATGGGCCTATGGTGATGGACTTTTATATAAGTTGGATCTACAGAGTTATTCATTGAACACAAATTTTATACATC TAGTTCATGCAATATCCAGATTAGCTTCTCTATCGATCTATCCATTTAGAAACGGACAAGGCTTTTCATCTTTTGTGTTA TTTCTTTTTGTTATACCATCATTTGTTTTCTTATTTAGAGTCACAAAATTGTCAAGAATTGTTGCCCTAATTATTTTTAG TGTTTTATTAATTACAATATCTTTTTCATTTAAAGGAAATTATGCCTTCGCTCCATCTAGACATAATATTTATTTGTTTC CATGTTTTTGGATACCAGTAATTACCTATTTTGTATACCTTTGTGATCAGGCTTTTTATAATTTTTGGAATTTTAAATTT TTGCTGCCTATTTCTTTATCACTCTTTTTTACGATAGGACTTTTTGTTTCTACAAATTCGGTGAATTATACCAACTATCA AAGAGAAAAATTATATCAAATGGCTGATAAAAGTAACATATATCCTTCTACAATAGGCCAGCATGATTTATGGTCACTCT ATTGGACTCATGGGGACAAAGAATGGAGCTCAGTAGTAGGAAAAGAATGTAGTATAAATAATAGGATCACATCTACAAAT TTGGCTTTTATTTATGGTCATAGTGAACCACTGCAACTAAATAATGAAGAACAACGAAAATCTTTAGAAGTGTTTTCTGA TGGTTGTATAAAAAAATCAGATAGTTTGCAAATAGTTGATTCATATGAATTTAAAAGGGATATACACTTCGAGATGGACA AATTTGTTGGCTGGAGCGGTTCGAGTGCCTACGGCTATTTGATTTCTAAGTTGAATTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases AATTATTTGAAAGCAGAGTTAATATTTTTTAAATTGTAAGGATATTTATCAGATATATATAGTTTTCTAATTTTTAGAAA ACAAGTAATTGCCTTCGTAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TAGATATAGTTTATAAGGAGTATTATTAAAGGGTTAAATTGATAAGTCGAAGATTTTTCTAAATGAGGTTATTTTTTTTT ATCTTTATATTTACTCAATT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 632; Mature: 632
Protein sequence:
>632_residues MHTYNMSVIFIQKMISKSNKENLVNYFNSIKFSFWKPSLIFYLLAVFSFLFWLIIGPSSWRNVDDYGTFFDVIKKINSFE SSNNFPLSSQIAYPIDFQSIKPINLLQATLKTCREGWGTYPPLWGFIYLPLTIPFLKFGLDWTRFATLVVGFISAVLTAY LLSNNITTIFYSFKDKIRIKNFQRIRYLIDFLSILIVCFNPELMLHASSYMPYQLPAISTLICLSLFTSFYTYQIKINGS NQTFSNKTFDIPLLYTLLIIWLSSLLGFQTIFLYLGILLASFYFLFTEKQPLKIIKKIYRKNSVIFINKKPKFYSTLGIT FSISLLLGFSKYHYFKLISIISQNEGTAQWAYGDGLLYKLDLQSYSLNTNFIHLVHAISRLASLSIYPFRNGQGFSSFVL FLFVIPSFVFLFRVTKLSRIVALIIFSVLLITISFSFKGNYAFAPSRHNIYLFPCFWIPVITYFVYLCDQAFYNFWNFKF LLPISLSLFFTIGLFVSTNSVNYTNYQREKLYQMADKSNIYPSTIGQHDLWSLYWTHGDKEWSSVVGKECSINNRITSTN LAFIYGHSEPLQLNNEEQRKSLEVFSDGCIKKSDSLQIVDSYEFKRDIHFEMDKFVGWSGSSAYGYLISKLN
Sequences:
>Translated_632_residues MHTYNMSVIFIQKMISKSNKENLVNYFNSIKFSFWKPSLIFYLLAVFSFLFWLIIGPSSWRNVDDYGTFFDVIKKINSFE SSNNFPLSSQIAYPIDFQSIKPINLLQATLKTCREGWGTYPPLWGFIYLPLTIPFLKFGLDWTRFATLVVGFISAVLTAY LLSNNITTIFYSFKDKIRIKNFQRIRYLIDFLSILIVCFNPELMLHASSYMPYQLPAISTLICLSLFTSFYTYQIKINGS NQTFSNKTFDIPLLYTLLIIWLSSLLGFQTIFLYLGILLASFYFLFTEKQPLKIIKKIYRKNSVIFINKKPKFYSTLGIT FSISLLLGFSKYHYFKLISIISQNEGTAQWAYGDGLLYKLDLQSYSLNTNFIHLVHAISRLASLSIYPFRNGQGFSSFVL FLFVIPSFVFLFRVTKLSRIVALIIFSVLLITISFSFKGNYAFAPSRHNIYLFPCFWIPVITYFVYLCDQAFYNFWNFKF LLPISLSLFFTIGLFVSTNSVNYTNYQREKLYQMADKSNIYPSTIGQHDLWSLYWTHGDKEWSSVVGKECSINNRITSTN LAFIYGHSEPLQLNNEEQRKSLEVFSDGCIKKSDSLQIVDSYEFKRDIHFEMDKFVGWSGSSAYGYLISKLN >Mature_632_residues MHTYNMSVIFIQKMISKSNKENLVNYFNSIKFSFWKPSLIFYLLAVFSFLFWLIIGPSSWRNVDDYGTFFDVIKKINSFE SSNNFPLSSQIAYPIDFQSIKPINLLQATLKTCREGWGTYPPLWGFIYLPLTIPFLKFGLDWTRFATLVVGFISAVLTAY LLSNNITTIFYSFKDKIRIKNFQRIRYLIDFLSILIVCFNPELMLHASSYMPYQLPAISTLICLSLFTSFYTYQIKINGS NQTFSNKTFDIPLLYTLLIIWLSSLLGFQTIFLYLGILLASFYFLFTEKQPLKIIKKIYRKNSVIFINKKPKFYSTLGIT FSISLLLGFSKYHYFKLISIISQNEGTAQWAYGDGLLYKLDLQSYSLNTNFIHLVHAISRLASLSIYPFRNGQGFSSFVL FLFVIPSFVFLFRVTKLSRIVALIIFSVLLITISFSFKGNYAFAPSRHNIYLFPCFWIPVITYFVYLCDQAFYNFWNFKF LLPISLSLFFTIGLFVSTNSVNYTNYQREKLYQMADKSNIYPSTIGQHDLWSLYWTHGDKEWSSVVGKECSINNRITSTN LAFIYGHSEPLQLNNEEQRKSLEVFSDGCIKKSDSLQIVDSYEFKRDIHFEMDKFVGWSGSSAYGYLISKLN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 73602; Mature: 73602
Theoretical pI: Translated: 9.68; Mature: 9.68
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.1 %Cys (Translated Protein) 1.1 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 1.1 %Cys (Mature Protein) 1.1 %Met (Mature Protein) 2.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MHTYNMSVIFIQKMISKSNKENLVNYFNSIKFSFWKPSLIFYLLAVFSFLFWLIIGPSSW CCEECCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC RNVDDYGTFFDVIKKINSFESSNNFPLSSQIAYPIDFQSIKPINLLQATLKTCREGWGTY CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCC PPLWGFIYLPLTIPFLKFGLDWTRFATLVVGFISAVLTAYLLSNNITTIFYSFKDKIRIK CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHH NFQRIRYLIDFLSILIVCFNPELMLHASSYMPYQLPAISTLICLSLFTSFYTYQIKINGS HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCC NQTFSNKTFDIPLLYTLLIIWLSSLLGFQTIFLYLGILLASFYFLFTEKQPLKIIKKIYR CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHC KNSVIFINKKPKFYSTLGITFSISLLLGFSKYHYFKLISIISQNEGTAQWAYGDGLLYKL CCCEEEEECCCCEEEEHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCEEEEE DLQSYSLNTNFIHLVHAISRLASLSIYPFRNGQGFSSFVLFLFVIPSFVFLFRVTKLSRI ECCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VALIIFSVLLITISFSFKGNYAFAPSRHNIYLFPCFWIPVITYFVYLCDQAFYNFWNFKF HHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEECCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEE LLPISLSLFFTIGLFVSTNSVNYTNYQREKLYQMADKSNIYPSTIGQHDLWSLYWTHGDK EHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCH EWSSVVGKECSINNRITSTNLAFIYGHSEPLQLNNEEQRKSLEVFSDGCIKKSDSLQIVD HHHHHCCCCCCCCCCEEECEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEE SYEFKRDIHFEMDKFVGWSGSSAYGYLISKLN CCCHHHCCCEEHHHHCCCCCCCCHHHHEECCC >Mature Secondary Structure MHTYNMSVIFIQKMISKSNKENLVNYFNSIKFSFWKPSLIFYLLAVFSFLFWLIIGPSSW CCEECCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC RNVDDYGTFFDVIKKINSFESSNNFPLSSQIAYPIDFQSIKPINLLQATLKTCREGWGTY CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCC PPLWGFIYLPLTIPFLKFGLDWTRFATLVVGFISAVLTAYLLSNNITTIFYSFKDKIRIK CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHH NFQRIRYLIDFLSILIVCFNPELMLHASSYMPYQLPAISTLICLSLFTSFYTYQIKINGS HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCC NQTFSNKTFDIPLLYTLLIIWLSSLLGFQTIFLYLGILLASFYFLFTEKQPLKIIKKIYR CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHC KNSVIFINKKPKFYSTLGITFSISLLLGFSKYHYFKLISIISQNEGTAQWAYGDGLLYKL CCCEEEEECCCCEEEEHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCEEEEE DLQSYSLNTNFIHLVHAISRLASLSIYPFRNGQGFSSFVLFLFVIPSFVFLFRVTKLSRI ECCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VALIIFSVLLITISFSFKGNYAFAPSRHNIYLFPCFWIPVITYFVYLCDQAFYNFWNFKF HHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEECCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEE LLPISLSLFFTIGLFVSTNSVNYTNYQREKLYQMADKSNIYPSTIGQHDLWSLYWTHGDK EHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCH EWSSVVGKECSINNRITSTNLAFIYGHSEPLQLNNEEQRKSLEVFSDGCIKKSDSLQIVD HHHHHCCCCCCCCCCEEECEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEE SYEFKRDIHFEMDKFVGWSGSSAYGYLISKLN CCCHHHCCCEEHHHHCCCCCCCCHHHHEECCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA