| Definition | Prochlorococcus marinus str. MIT 9515, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008817 |
| Length | 1,704,176 |
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The map label for this gene is 123965964
Identifier: 123965964
GI number: 123965964
Start: 660026
End: 661324
Strand: Direct
Name: 123965964
Synonym: P9515_07291
Alternate gene names: NA
Gene position: 660026-661324 (Clockwise)
Preceding gene: 123965960
Following gene: 123965966
Centisome position: 38.73
GC content: 28.18
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TTTATTTACTGCTAATAGTAGAATGAATGTTAATAATAAAATTATTTATTTCTATTTTAATAAAAATATTTAATTCAATA ATTCTCGATTTATAAATGTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TCATTTAATTAATGAAAGGTTAAAAACCATTACCTGTATAAGGATCTCGTAAAAGCAAACTTCCTTTTTTAAGTAAAGAT CTATATCACCTTTTTATTTG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 432; Mature: 432
Protein sequence:
>432_residues MKSLLKYPDKFFFKRCDNLILKIFSDTEIGWKIDLKIALIAFGTTIFFAFPSLWIYFRPDKAGRLFYQMLQSENPLNRDL PLTAQILSYRFFVPTLNYFLGLRGYSVVVIPVISSFINLYFISRIIRKSTRDILFSAICVIGISLTWFITEGTAFWNTTD SVSHLLLLLPAAFRLNPTYFIFALPSALFVDERSIFACAFLWLFLLRRDLMCGDYLNEIGSNFFNLKITRNILLTTYSMF IGFVFWIIGRYLIDSGIIAPAPDISLVTNQITDFWEFFGKHWPPQILNYLSSFRWVYFFPLVLIFKLLKKSSNSFRKRYG FNFKSYFGIHLLLFIFYSSIVMINGDVWRSMSFSYFFILESILILYTLNKKLISVLNYWITFLMLLTPVTFFGLNLTPQI SFPMPIVLLRTYFGFGDSYMIFFKKLFIFVPS
Sequences:
>Translated_432_residues MKSLLKYPDKFFFKRCDNLILKIFSDTEIGWKIDLKIALIAFGTTIFFAFPSLWIYFRPDKAGRLFYQMLQSENPLNRDL PLTAQILSYRFFVPTLNYFLGLRGYSVVVIPVISSFINLYFISRIIRKSTRDILFSAICVIGISLTWFITEGTAFWNTTD SVSHLLLLLPAAFRLNPTYFIFALPSALFVDERSIFACAFLWLFLLRRDLMCGDYLNEIGSNFFNLKITRNILLTTYSMF IGFVFWIIGRYLIDSGIIAPAPDISLVTNQITDFWEFFGKHWPPQILNYLSSFRWVYFFPLVLIFKLLKKSSNSFRKRYG FNFKSYFGIHLLLFIFYSSIVMINGDVWRSMSFSYFFILESILILYTLNKKLISVLNYWITFLMLLTPVTFFGLNLTPQI SFPMPIVLLRTYFGFGDSYMIFFKKLFIFVPS >Mature_432_residues MKSLLKYPDKFFFKRCDNLILKIFSDTEIGWKIDLKIALIAFGTTIFFAFPSLWIYFRPDKAGRLFYQMLQSENPLNRDL PLTAQILSYRFFVPTLNYFLGLRGYSVVVIPVISSFINLYFISRIIRKSTRDILFSAICVIGISLTWFITEGTAFWNTTD SVSHLLLLLPAAFRLNPTYFIFALPSALFVDERSIFACAFLWLFLLRRDLMCGDYLNEIGSNFFNLKITRNILLTTYSMF IGFVFWIIGRYLIDSGIIAPAPDISLVTNQITDFWEFFGKHWPPQILNYLSSFRWVYFFPLVLIFKLLKKSSNSFRKRYG FNFKSYFGIHLLLFIFYSSIVMINGDVWRSMSFSYFFILESILILYTLNKKLISVLNYWITFLMLLTPVTFFGLNLTPQI SFPMPIVLLRTYFGFGDSYMIFFKKLFIFVPS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
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Paralogues:
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Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 50781; Mature: 50781
Theoretical pI: Translated: 10.00; Mature: 10.00
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
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Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 3.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 2.1 %Met (Mature Protein) 3.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKSLLKYPDKFFFKRCDNLILKIFSDTEIGWKIDLKIALIAFGTTIFFAFPSLWIYFRPD CCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHCEEEEECCC KAGRLFYQMLQSENPLNRDLPLTAQILSYRFFVPTLNYFLGLRGYSVVVIPVISSFINLY HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHH FISRIIRKSTRDILFSAICVIGISLTWFITEGTAFWNTTDSVSHLLLLLPAAFRLNPTYF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE IFALPSALFVDERSIFACAFLWLFLLRRDLMCGDYLNEIGSNFFNLKITRNILLTTYSMF EEECCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHH IGFVFWIIGRYLIDSGIIAPAPDISLVTNQITDFWEFFGKHWPPQILNYLSSFRWVYFFP HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LVLIFKLLKKSSNSFRKRYGFNFKSYFGIHLLLFIFYSSIVMINGDVWRSMSFSYFFILE HHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHCCHHHHHHHH SILILYTLNKKLISVLNYWITFLMLLTPVTFFGLNLTPQISFPMPIVLLRTYFGFGDSYM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHH IFFKKLFIFVPS HHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MKSLLKYPDKFFFKRCDNLILKIFSDTEIGWKIDLKIALIAFGTTIFFAFPSLWIYFRPD CCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHCEEEEECCC KAGRLFYQMLQSENPLNRDLPLTAQILSYRFFVPTLNYFLGLRGYSVVVIPVISSFINLY HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHH FISRIIRKSTRDILFSAICVIGISLTWFITEGTAFWNTTDSVSHLLLLLPAAFRLNPTYF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE IFALPSALFVDERSIFACAFLWLFLLRRDLMCGDYLNEIGSNFFNLKITRNILLTTYSMF EEECCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHH IGFVFWIIGRYLIDSGIIAPAPDISLVTNQITDFWEFFGKHWPPQILNYLSSFRWVYFFP HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LVLIFKLLKKSSNSFRKRYGFNFKSYFGIHLLLFIFYSSIVMINGDVWRSMSFSYFFILE HHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHCCHHHHHHHH SILILYTLNKKLISVLNYWITFLMLLTPVTFFGLNLTPQISFPMPIVLLRTYFGFGDSYM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHH IFFKKLFIFVPS HHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA