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Definition Prochlorococcus marinus str. MIT 9515, complete genome.
Accession NC_008817
Length 1,704,176

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The map label for this gene is thiP [H]

Identifier: 123965788

GI number: 123965788

Start: 492674

End: 494212

Strand: Reverse

Name: thiP [H]

Synonym: P9515_05531

Alternate gene names: 123965788

Gene position: 494212-492674 (Counterclockwise)

Preceding gene: 123965789

Following gene: 123965783

Centisome position: 29.0

GC content: 32.1

Gene sequence:

>1539_bases
TTGAAAATTATTATTAAACATACAAAAAAATTATTAACCTATTTAAAACCTTTAGATATTGCATCTTTAATTGTTGCAGT
TGTAGTTATAATTCCAATTTTTAATTTCTTGATTGAAGGCATAGGTTATGTTTTAGGAGGAAATTTTTCTTTAGGATTTT
CAGGTAGAAAAGAAATATTTGGCACATTGAAACTTTTAATCCTAACTAGTTTTTTTGGAGGTGGGTTAGGAACCTTAAAT
GGATGGTTACTCTCAAATTGTGAATTTAGATTAAGGAAAAATCTTCGTATTTTTCAACTAATTCCACTGGCAACTCCAGC
ATATTTGATTACTGCAGTTTTACAGGATTTAGGAAGTATTTTGGGATATCAAATAACTGGTTTATGGTGGGGAGTTCTTA
TACTTTCTATTACTACTTATCCTTATGTTTTCATACTTGCCAATGAAAGTTTTAATAAATTTGGAGTTAATCAAATTAAT
GCTAGTAGAGGTTTAGGAATTGGACCATGGGGTAGTTTTTTTAAAATTGCACTCCCAATGGCATTGCCTGCATTGACAAC
TGGAATCAGCCTTATGTGTATGGAAGTTATGAATGAGCTGGGAACAGTTGAGTTATTAAATATCCCAAGTATTTCTAAAG
GTATAACAGAGAACTGGATTATTGAGGGGAATCCTAAGAGTGATATTGGATTATCATTAGTTGCCCTATTGATAGTATTT
GCTTTAATTTTGTTTGAAAAATTCTCAAGAAAGAAAACAAAGCGTTGGAGTGAAAATCCTGCATCATTAGATTCGCTTGG
ATGGGAATTAAGAGGATATAGATCTTACTTAGCAGTATTAGTAACTTTATTTCCTCCATTGTTTTCGATTGGGCTTCCAT
TTTCATGGTTTCTACTAAATATTGATCAGTTAAAAAAAGGATTTACGACAGAATTACTTTCTCTAACCTTGAGAACTGTT
AGCCTCGGAATAATTGCTGCATTATTAACATTATTTTTCTCTCTAATATTTACACTAGCTAATCGTCAAAGTAAGAGCTT
ACTAACTAAATTCATAACATTCCCTGCAGGGATAGGATATGCAATACCAGGTACAGTATTAGCGATATCATTAATAACTA
TTTCTAATACAAAGTTCCATTTTATAGCTTTATGTCTTCTGATCTGGGGTTATATAGTTCGATTTTTGACTATTTCAAAA
GGAACTCTTGATTCTGGGTTTGAGAGAATATCTCCTAGTCTTGATGAGGCTGCAAAGGGCTTAGGCTCTAATTGGCTTGA
TGTTATTAAAAAGATACATCTTCCCTTATTAAAAGGACCAATATTTGTTGGTTCACTTTTAGTGTTCGTAGATACAATTA
AGGAATTGCCAATTACATTTATTCTCAGACCATTCGACTTTGATACATTATCCGTAAGGATATATCAATATGCTGGAGAT
GAGCGAATGGCTGAAGCACTATTACCAGCACTCTTCATAACGATTGTGGGTTTAATTGCATCGAGTACATTGATTCCAAG
TTTAGAAAAAAAGAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTCATAGGAAAAAATTTAGATCATCAAACTATTAAGAATCAACTTGATTCTTGTAGATTTAATTCGAGAGACGAAGCATA
ATAAAGTTTTAATTTAATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTCTTTTTAAAAGTTTTCTAAATAAGAAAGGGAGGCCTAATAATAAATCTGCCGAAGTAGATATCAATCTAAAATAAAT
TAAACTTACAAAGATTGGAT

Product: putative iron ABC transporter

Products: ADP; phosphate; S2O32- [Cytoplasm]; SO42- [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: Iron(III)-transport system permease protein fbpB 2 [H]

Number of amino acids: Translated: 512; Mature: 512

Protein sequence:

>512_residues
MKIIIKHTKKLLTYLKPLDIASLIVAVVVIIPIFNFLIEGIGYVLGGNFSLGFSGRKEIFGTLKLLILTSFFGGGLGTLN
GWLLSNCEFRLRKNLRIFQLIPLATPAYLITAVLQDLGSILGYQITGLWWGVLILSITTYPYVFILANESFNKFGVNQIN
ASRGLGIGPWGSFFKIALPMALPALTTGISLMCMEVMNELGTVELLNIPSISKGITENWIIEGNPKSDIGLSLVALLIVF
ALILFEKFSRKKTKRWSENPASLDSLGWELRGYRSYLAVLVTLFPPLFSIGLPFSWFLLNIDQLKKGFTTELLSLTLRTV
SLGIIAALLTLFFSLIFTLANRQSKSLLTKFITFPAGIGYAIPGTVLAISLITISNTKFHFIALCLLIWGYIVRFLTISK
GTLDSGFERISPSLDEAAKGLGSNWLDVIKKIHLPLLKGPIFVGSLLVFVDTIKELPITFILRPFDFDTLSVRIYQYAGD
ERMAEALLPALFITIVGLIASSTLIPSLEKKN

Sequences:

>Translated_512_residues
MKIIIKHTKKLLTYLKPLDIASLIVAVVVIIPIFNFLIEGIGYVLGGNFSLGFSGRKEIFGTLKLLILTSFFGGGLGTLN
GWLLSNCEFRLRKNLRIFQLIPLATPAYLITAVLQDLGSILGYQITGLWWGVLILSITTYPYVFILANESFNKFGVNQIN
ASRGLGIGPWGSFFKIALPMALPALTTGISLMCMEVMNELGTVELLNIPSISKGITENWIIEGNPKSDIGLSLVALLIVF
ALILFEKFSRKKTKRWSENPASLDSLGWELRGYRSYLAVLVTLFPPLFSIGLPFSWFLLNIDQLKKGFTTELLSLTLRTV
SLGIIAALLTLFFSLIFTLANRQSKSLLTKFITFPAGIGYAIPGTVLAISLITISNTKFHFIALCLLIWGYIVRFLTISK
GTLDSGFERISPSLDEAAKGLGSNWLDVIKKIHLPLLKGPIFVGSLLVFVDTIKELPITFILRPFDFDTLSVRIYQYAGD
ERMAEALLPALFITIVGLIASSTLIPSLEKKN
>Mature_512_residues
MKIIIKHTKKLLTYLKPLDIASLIVAVVVIIPIFNFLIEGIGYVLGGNFSLGFSGRKEIFGTLKLLILTSFFGGGLGTLN
GWLLSNCEFRLRKNLRIFQLIPLATPAYLITAVLQDLGSILGYQITGLWWGVLILSITTYPYVFILANESFNKFGVNQIN
ASRGLGIGPWGSFFKIALPMALPALTTGISLMCMEVMNELGTVELLNIPSISKGITENWIIEGNPKSDIGLSLVALLIVF
ALILFEKFSRKKTKRWSENPASLDSLGWELRGYRSYLAVLVTLFPPLFSIGLPFSWFLLNIDQLKKGFTTELLSLTLRTV
SLGIIAALLTLFFSLIFTLANRQSKSLLTKFITFPAGIGYAIPGTVLAISLITISNTKFHFIALCLLIWGYIVRFLTISK
GTLDSGFERISPSLDEAAKGLGSNWLDVIKKIHLPLLKGPIFVGSLLVFVDTIKELPITFILRPFDFDTLSVRIYQYAGD
ERMAEALLPALFITIVGLIASSTLIPSLEKKN

Specific function: Part of the ABC transporter complex fbpABC (TC 3.A.1.10.1) involved in Fe(3+) ions import. Probably responsible for the translocation of the substrate across the membrane [H]

COG id: COG1178

COG function: function code P; ABC-type Fe3+ transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 2 ABC transmembrane type-1 domains [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000515 [H]

Pfam domain/function: PF00528 BPD_transp_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56545; Mature: 56545

Theoretical pI: Translated: 10.05; Mature: 10.05

Prosite motif: PS50928 ABC_TM1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
1.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
1.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKIIIKHTKKLLTYLKPLDIASLIVAVVVIIPIFNFLIEGIGYVLGGNFSLGFSGRKEIF
CEEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCHHHHH
GTLKLLILTSFFGGGLGTLNGWLLSNCEFRLRKNLRIFQLIPLATPAYLITAVLQDLGSI
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHCHHHHCCCHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LGYQITGLWWGVLILSITTYPYVFILANESFNKFGVNQINASRGLGIGPWGSFFKIALPM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
ALPALTTGISLMCMEVMNELGTVELLNIPSISKGITENWIIEGNPKSDIGLSLVALLIVF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH
ALILFEKFSRKKTKRWSENPASLDSLGWELRGYRSYLAVLVTLFPPLFSIGLPFSWFLLN
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
IDQLKKGFTTELLSLTLRTVSLGIIAALLTLFFSLIFTLANRQSKSLLTKFITFPAGIGY
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCC
AIPGTVLAISLITISNTKFHFIALCLLIWGYIVRFLTISKGTLDSGFERISPSLDEAAKG
CCCHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHH
LGSNWLDVIKKIHLPLLKGPIFVGSLLVFVDTIKELPITFILRPFDFDTLSVRIYQYAGD
CCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEEEEEEEEECCH
ERMAEALLPALFITIVGLIASSTLIPSLEKKN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKIIIKHTKKLLTYLKPLDIASLIVAVVVIIPIFNFLIEGIGYVLGGNFSLGFSGRKEIF
CEEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCHHHHH
GTLKLLILTSFFGGGLGTLNGWLLSNCEFRLRKNLRIFQLIPLATPAYLITAVLQDLGSI
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHCHHHHCCCHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LGYQITGLWWGVLILSITTYPYVFILANESFNKFGVNQINASRGLGIGPWGSFFKIALPM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
ALPALTTGISLMCMEVMNELGTVELLNIPSISKGITENWIIEGNPKSDIGLSLVALLIVF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH
ALILFEKFSRKKTKRWSENPASLDSLGWELRGYRSYLAVLVTLFPPLFSIGLPFSWFLLN
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
IDQLKKGFTTELLSLTLRTVSLGIIAALLTLFFSLIFTLANRQSKSLLTKFITFPAGIGY
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCC
AIPGTVLAISLITISNTKFHFIALCLLIWGYIVRFLTISKGTLDSGFERISPSLDEAAKG
CCCHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHH
LGSNWLDVIKKIHLPLLKGPIFVGSLLVFVDTIKELPITFILRPFDFDTLSVRIYQYAGD
CCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEEEEEEEEECCH
ERMAEALLPALFITIVGLIASSTLIPSLEKKN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: ATP; S2O32- [Periplasm]; H2O; SO42- [Periplasm]; ATP [C]

Specific reaction: ATP + S2O32- [Periplasm] + H2O = ADP + phosphate + S2O32- [Cytoplasm] SO42- [Periplasm] + H2O + ATP = SO42- [Cytoplasm] + phosphate + ADP [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800; 7927717 [H]