| Definition | Prochlorococcus marinus str. AS9601, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008816 |
| Length | 1,669,886 |
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The map label for this gene is 123969018
Identifier: 123969018
GI number: 123969018
Start: 1266344
End: 1268449
Strand: Reverse
Name: 123969018
Synonym: A9601_14861
Alternate gene names: NA
Gene position: 1268449-1266344 (Counterclockwise)
Preceding gene: 123969020
Following gene: 123969017
Centisome position: 75.96
GC content: 30.67
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TTACAAACTTCAAGATCATCTATAATAATTAAAATTACTTTTTAATAATGTTTGATGAACTCTCGTCACGCTTTGAAGAC GCAGTAAAGGGTTTAAGAGG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 701; Mature: 701
Protein sequence:
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Sequences:
>Translated_701_residues MELPLDHFRLIGVSPSATSEEILRAFQLRLDKTPDEGFTYEVLTQRSELLRLTADLLTDPESRREYENLLLNGNSGLDFS SNREVAGLILLWESGSPKEAFKITRKALQPPQTPALGSSREADLTLLAALTARDSAIQEQQLRSYSSASDFLHEGIKLLQ RMGKLGEKRKELEEDLAALLPYRILDLLSRDLNDQDSHKKGLSMLENLIIKRGGLEGNNKSEYKDYLNQQEFEAFFQQIK PFLTVQEQIDLFLELQKRGSLEAGFLAFLSLTAIGFSRRKPEKLFEARRILKKLNLSGLDSMPLVGCLDLLLADIDQASA RFSSSSDENLRDWLNNYPGNKLEAICIFCKNWLENDVLVGYRDINSKEVDLDSWFEDREIQEFIEKLEKKTKKIAIRSNL QNQQTEKESSTKTTEDFDNVLGNIDERRLPWPGGIKQGYEKVETKKTEFNEEYFKKKPIEFYNFLIEKIAEFKFSFGEFL KDKEIINRSPYLIYIYAFLILFAFGIGIGFLRNNFKKSIQDESIAEKPLIAKDKNQKISEIDIIQEIKKNPSNKLNSISE KSTSIISYEFKELNTASPTLEDIKNLINRWLLNKSNYLEGKGEINLSKIVSKGLIDRTIEERQNDIKKGIYKEINSQILK IDLESQTSSRIVVLVELNYLERLVKNSGEFINETSLNPLKVKYILGFSNKSWKLVDFVSGL >Mature_701_residues MELPLDHFRLIGVSPSATSEEILRAFQLRLDKTPDEGFTYEVLTQRSELLRLTADLLTDPESRREYENLLLNGNSGLDFS SNREVAGLILLWESGSPKEAFKITRKALQPPQTPALGSSREADLTLLAALTARDSAIQEQQLRSYSSASDFLHEGIKLLQ RMGKLGEKRKELEEDLAALLPYRILDLLSRDLNDQDSHKKGLSMLENLIIKRGGLEGNNKSEYKDYLNQQEFEAFFQQIK PFLTVQEQIDLFLELQKRGSLEAGFLAFLSLTAIGFSRRKPEKLFEARRILKKLNLSGLDSMPLVGCLDLLLADIDQASA RFSSSSDENLRDWLNNYPGNKLEAICIFCKNWLENDVLVGYRDINSKEVDLDSWFEDREIQEFIEKLEKKTKKIAIRSNL QNQQTEKESSTKTTEDFDNVLGNIDERRLPWPGGIKQGYEKVETKKTEFNEEYFKKKPIEFYNFLIEKIAEFKFSFGEFL KDKEIINRSPYLIYIYAFLILFAFGIGIGFLRNNFKKSIQDESIAEKPLIAKDKNQKISEIDIIQEIKKNPSNKLNSISE KSTSIISYEFKELNTASPTLEDIKNLINRWLLNKSNYLEGKGEINLSKIVSKGLIDRTIEERQNDIKKGIYKEINSQILK IDLESQTSSRIVVLVELNYLERLVKNSGEFINETSLNPLKVKYILGFSNKSWKLVDFVSGL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 80575; Mature: 80575
Theoretical pI: Translated: 5.34; Mature: 5.34
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 0.6 %Met (Translated Protein) 1.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 0.6 %Met (Mature Protein) 1.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MELPLDHFRLIGVSPSATSEEILRAFQLRLDKTPDEGFTYEVLTQRSELLRLTADLLTDP CCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC ESRREYENLLLNGNSGLDFSSNREVAGLILLWESGSPKEAFKITRKALQPPQTPALGSSR HHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC EADLTLLAALTARDSAIQEQQLRSYSSASDFLHEGIKLLQRMGKLGEKRKELEEDLAALL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PYRILDLLSRDLNDQDSHKKGLSMLENLIIKRGGLEGNNKSEYKDYLNQQEFEAFFQQIK HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PFLTVQEQIDLFLELQKRGSLEAGFLAFLSLTAIGFSRRKPEKLFEARRILKKLNLSGLD HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC SMPLVGCLDLLLADIDQASARFSSSSDENLRDWLNNYPGNKLEAICIFCKNWLENDVLVG CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE YRDINSKEVDLDSWFEDREIQEFIEKLEKKTKKIAIRSNLQNQQTEKESSTKTTEDFDNV EECCCCCCCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHH LGNIDERRLPWPGGIKQGYEKVETKKTEFNEEYFKKKPIEFYNFLIEKIAEFKFSFGEFL HCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KDKEIINRSPYLIYIYAFLILFAFGIGIGFLRNNFKKSIQDESIAEKPLIAKDKNQKISE HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCCCCCCCCCHHH IDIIQEIKKNPSNKLNSISEKSTSIISYEFKELNTASPTLEDIKNLINRWLLNKSNYLEG HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC KGEINLSKIVSKGLIDRTIEERQNDIKKGIYKEINSQILKIDLESQTSSRIVVLVELNYL CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEHHHH ERLVKNSGEFINETSLNPLKVKYILGFSNKSWKLVDFVSGL HHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MELPLDHFRLIGVSPSATSEEILRAFQLRLDKTPDEGFTYEVLTQRSELLRLTADLLTDP CCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC ESRREYENLLLNGNSGLDFSSNREVAGLILLWESGSPKEAFKITRKALQPPQTPALGSSR HHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC EADLTLLAALTARDSAIQEQQLRSYSSASDFLHEGIKLLQRMGKLGEKRKELEEDLAALL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PYRILDLLSRDLNDQDSHKKGLSMLENLIIKRGGLEGNNKSEYKDYLNQQEFEAFFQQIK HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PFLTVQEQIDLFLELQKRGSLEAGFLAFLSLTAIGFSRRKPEKLFEARRILKKLNLSGLD HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC SMPLVGCLDLLLADIDQASARFSSSSDENLRDWLNNYPGNKLEAICIFCKNWLENDVLVG CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE YRDINSKEVDLDSWFEDREIQEFIEKLEKKTKKIAIRSNLQNQQTEKESSTKTTEDFDNV EECCCCCCCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHH LGNIDERRLPWPGGIKQGYEKVETKKTEFNEEYFKKKPIEFYNFLIEKIAEFKFSFGEFL HCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KDKEIINRSPYLIYIYAFLILFAFGIGIGFLRNNFKKSIQDESIAEKPLIAKDKNQKISE HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCCCCCCCCCHHH IDIIQEIKKNPSNKLNSISEKSTSIISYEFKELNTASPTLEDIKNLINRWLLNKSNYLEG HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC KGEINLSKIVSKGLIDRTIEERQNDIKKGIYKEINSQILKIDLESQTSSRIVVLVELNYL CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEHHHH ERLVKNSGEFINETSLNPLKVKYILGFSNKSWKLVDFVSGL HHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA