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The map label for this gene is 123968478

Identifier: 123968478

GI number: 123968478

Start: 813331

End: 814830

Strand: Reverse

Name: 123968478

Synonym: A9601_09451

Alternate gene names: NA

Gene position: 814830-813331 (Counterclockwise)

Preceding gene: 123968479

Following gene: 123968475

Centisome position: 48.8

GC content: 26.67

Gene sequence:

>1500_bases
ATGAATCACTTGAAGTTAAAGTATATAAAGTATTTGGTCTTAATATTATTTCTATATATTTTATTTTCGATATTTGTAAG
AATAGTAAATATTTATACTATTTTATTTTTAATAATAATTATTTATATCTTTTATAATATTGATAAGAAATTATTTAAAA
AAATAGTTTATAAAGTTATATATAAAAATAAAAAAAATACACTTTTATTTAAAAATACATATGGTGCTGCCAAGATAAGT
TTGGAAGGGGTCGAGAATATTAATAAAAAAATTAACGATAAAGTAAAAGTTGAATTGTTAAATTACCAAAAAAATAAACT
AGAGTCCCAATTAAAAACAGGAGATTATAAAGTTACTCTTTTTGGAGCAGGTTCCTCAGGAAAAACATCTATAGCAAGAT
CATTATTGAAAAATATTGTCGGACAAACTTCAGCAAAAATAGGTACGACAAAGCATATTAAAAGCTATAAAATTCGTATC
CCAATCTTAAAAAGAAACATTAATATAGTGGATACTCCGGGTTTATTCGAACCATCTAAATTAGGAGAAGAAAGAGAAAA
AGCAACAATTTTACAAGCATCAAATTCTGACTTGGTTCTTTTTGTGTTAGATCAGGACATAAATAAATACGAAAACTATT
TAATTAAAGAATTATTAAAATTAAGAAAAAAAATAATAATAGTTCTAAATAAATGCGATTTGAGGTCTAGAGATGAAAAT
AATCTCATCAAAGAAAATATAATTTCTATAACTTCCGCTAGAAAAAATAAAATTTCAGTTGTTAAAACAATTGCAGCACC
TCAAGATTCTCCATACATAAAATCAGATGCTTTAAATTTAGTTCCAGAGGTAGGAAGTTTATTTAGAGAAATAATTGAAA
CACTCGATAATAATGGTGAAGAGTTATTGGCAGATAATATTCTTTTTCGCTCAAATAAGTTAGGTATTAAAAGTAAAAAT
TTCGTCCAAGAACAAAGATATTTGATGTCAAATAAAGTGATTAATAAATACATGTGGATAACAGGAGGTGTAATACTAGT
TAATCCACTACCAGCTATTGATTTCCTTACTACTACCTCCGTAAACCTTCAAATGATAATGGAATTATCAAAAATATATG
AAATAAAGCTTACAAAAAAAGATGCAAAAGATTTAGCGACATCATTGCTAAGCGCATTGGCTAAACAAGGAATACTAAAA
GGGGGACTCGCTATTCTTTCTCCTGCTTTAGCTACAAGTTTGACAAAAATAATATTATCTAAATCTATACAATCAGTTAC
AGCAGGCTGGTTAATAAGGATAGTAGGACTAAGTTTGATTGAGTATTTTAAAAATGGTCAAGATTGGGGAGATGGAGGAA
TTCAAGAAGTAGTAGATAAGATCTATAGGATAAGTAAGAGAGAGGACATCCTAAACAACTTCGTAAAAGAAGCTATTTCA
AAAATTGAAATGAAAAAATATTTTAAATCAAATAAAAGGTTGCCCCCATTTACTATGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAAATATTATAAATTTTCCAGTATTTAATATTGCTGATATATCTATTAATATTGGTTTTATTTTTTTACTGTATAACTT
ATTTAAAAATAATAGATAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATTGGATAATTGATCATTTAGATATGTTCTGAAATCAAAGATAGTTATTAAGAGTAAATAAGCAATACAAATAGCTATA
GATATAAACCCTGTTACAAT

Product: GTPase SAR1

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 499; Mature: 499

Protein sequence:

>499_residues
MNHLKLKYIKYLVLILFLYILFSIFVRIVNIYTILFLIIIIYIFYNIDKKLFKKIVYKVIYKNKKNTLLFKNTYGAAKIS
LEGVENINKKINDKVKVELLNYQKNKLESQLKTGDYKVTLFGAGSSGKTSIARSLLKNIVGQTSAKIGTTKHIKSYKIRI
PILKRNINIVDTPGLFEPSKLGEEREKATILQASNSDLVLFVLDQDINKYENYLIKELLKLRKKIIIVLNKCDLRSRDEN
NLIKENIISITSARKNKISVVKTIAAPQDSPYIKSDALNLVPEVGSLFREIIETLDNNGEELLADNILFRSNKLGIKSKN
FVQEQRYLMSNKVINKYMWITGGVILVNPLPAIDFLTTTSVNLQMIMELSKIYEIKLTKKDAKDLATSLLSALAKQGILK
GGLAILSPALATSLTKIILSKSIQSVTAGWLIRIVGLSLIEYFKNGQDWGDGGIQEVVDKIYRISKREDILNNFVKEAIS
KIEMKKYFKSNKRLPPFTM

Sequences:

>Translated_499_residues
MNHLKLKYIKYLVLILFLYILFSIFVRIVNIYTILFLIIIIYIFYNIDKKLFKKIVYKVIYKNKKNTLLFKNTYGAAKIS
LEGVENINKKINDKVKVELLNYQKNKLESQLKTGDYKVTLFGAGSSGKTSIARSLLKNIVGQTSAKIGTTKHIKSYKIRI
PILKRNINIVDTPGLFEPSKLGEEREKATILQASNSDLVLFVLDQDINKYENYLIKELLKLRKKIIIVLNKCDLRSRDEN
NLIKENIISITSARKNKISVVKTIAAPQDSPYIKSDALNLVPEVGSLFREIIETLDNNGEELLADNILFRSNKLGIKSKN
FVQEQRYLMSNKVINKYMWITGGVILVNPLPAIDFLTTTSVNLQMIMELSKIYEIKLTKKDAKDLATSLLSALAKQGILK
GGLAILSPALATSLTKIILSKSIQSVTAGWLIRIVGLSLIEYFKNGQDWGDGGIQEVVDKIYRISKREDILNNFVKEAIS
KIEMKKYFKSNKRLPPFTM
>Mature_499_residues
MNHLKLKYIKYLVLILFLYILFSIFVRIVNIYTILFLIIIIYIFYNIDKKLFKKIVYKVIYKNKKNTLLFKNTYGAAKIS
LEGVENINKKINDKVKVELLNYQKNKLESQLKTGDYKVTLFGAGSSGKTSIARSLLKNIVGQTSAKIGTTKHIKSYKIRI
PILKRNINIVDTPGLFEPSKLGEEREKATILQASNSDLVLFVLDQDINKYENYLIKELLKLRKKIIIVLNKCDLRSRDEN
NLIKENIISITSARKNKISVVKTIAAPQDSPYIKSDALNLVPEVGSLFREIIETLDNNGEELLADNILFRSNKLGIKSKN
FVQEQRYLMSNKVINKYMWITGGVILVNPLPAIDFLTTTSVNLQMIMELSKIYEIKLTKKDAKDLATSLLSALAKQGILK
GGLAILSPALATSLTKIILSKSIQSVTAGWLIRIVGLSLIEYFKNGQDWGDGGIQEVVDKIYRISKREDILNNFVKEAIS
KIEMKKYFKSNKRLPPFTM

Specific function: Unknown

COG id: COG1100

COG function: function code R; GTPase SAR1 and related small G proteins

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56803; Mature: 56803

Theoretical pI: Translated: 10.42; Mature: 10.42

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
1.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
1.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNHLKLKYIKYLVLILFLYILFSIFVRIVNIYTILFLIIIIYIFYNIDKKLFKKIVYKVI
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
YKNKKNTLLFKNTYGAAKISLEGVENINKKINDKVKVELLNYQKNKLESQLKTGDYKVTL
HCCCCCEEEEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEE
FGAGSSGKTSIARSLLKNIVGQTSAKIGTTKHIKSYKIRIPILKRNINIVDTPGLFEPSK
EECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHCEEEEEEEEEECCCCEEECCCCCCCHH
LGEEREKATILQASNSDLVLFVLDQDINKYENYLIKELLKLRKKIIIVLNKCDLRSRDEN
HCCHHHHHHEEEECCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCC
NLIKENIISITSARKNKISVVKTIAAPQDSPYIKSDALNLVPEVGSLFREIIETLDNNGE
CHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
ELLADNILFRSNKLGIKSKNFVQEQRYLMSNKVINKYMWITGGVILVNPLPAIDFLTTTS
HHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCHHHHHCCC
VNLQMIMELSKIYEIKLTKKDAKDLATSLLSALAKQGILKGGLAILSPALATSLTKIILS
CHHHHHHHHHHHHEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KSIQSVTAGWLIRIVGLSLIEYFKNGQDWGDGGIQEVVDKIYRISKREDILNNFVKEAIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KIEMKKYFKSNKRLPPFTM
HHHHHHHHHCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNHLKLKYIKYLVLILFLYILFSIFVRIVNIYTILFLIIIIYIFYNIDKKLFKKIVYKVI
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
YKNKKNTLLFKNTYGAAKISLEGVENINKKINDKVKVELLNYQKNKLESQLKTGDYKVTL
HCCCCCEEEEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEE
FGAGSSGKTSIARSLLKNIVGQTSAKIGTTKHIKSYKIRIPILKRNINIVDTPGLFEPSK
EECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHCEEEEEEEEEECCCCEEECCCCCCCHH
LGEEREKATILQASNSDLVLFVLDQDINKYENYLIKELLKLRKKIIIVLNKCDLRSRDEN
HCCHHHHHHEEEECCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCC
NLIKENIISITSARKNKISVVKTIAAPQDSPYIKSDALNLVPEVGSLFREIIETLDNNGE
CHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
ELLADNILFRSNKLGIKSKNFVQEQRYLMSNKVINKYMWITGGVILVNPLPAIDFLTTTS
HHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCHHHHHCCC
VNLQMIMELSKIYEIKLTKKDAKDLATSLLSALAKQGILKGGLAILSPALATSLTKIILS
CHHHHHHHHHHHHEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KSIQSVTAGWLIRIVGLSLIEYFKNGQDWGDGGIQEVVDKIYRISKREDILNNFVKEAIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KIEMKKYFKSNKRLPPFTM
HHHHHHHHHCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA