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The map label for this gene is 123968129

Identifier: 123968129

GI number: 123968129

Start: 518895

End: 520118

Strand: Direct

Name: 123968129

Synonym: A9601_05941

Alternate gene names: NA

Gene position: 518895-520118 (Clockwise)

Preceding gene: 123968127

Following gene: 123968131

Centisome position: 31.07

GC content: 26.72

Gene sequence:

>1224_bases
TTGAGAAGTTGGCAAATTTTTAAAATATGGGGAATTCCCTTTAAAGTTCATCCTTATTGGTTTGCTATTCTCTTTTTATT
CTCATGGAGTATAAGTAATCAGGTTAATTTGACCTCAAGTGACATTTATAATACCAAAGAAGCTTGGATTATAGGATTTT
TTACTTCTTTTTTCTTATTATCTTCAATTGTTTTTCATGAGATTTTTCGTACTTTTGTTTCTCTTAATCAGGGTGTAAAA
ATAAAAAATATTACTTTTTATTTTCTCGGAGCAATTTTACAAATAGATAAGTATTGTCAAACTGCTTTAGGTAATATAAA
AATTGCAGTTGTTAAACCTCTTTTATGTTTCGCTACAGCATTTATCCTATTATTAGTTAGTAGCAACAGTGCATCCCAAG
AACAAATAGCAGTTAATGTAATTTCTAGAGTAGGTATATTTAATTTATTCTTAGGTTTCTTAAATTTGATTCCAATTGGT
TCTTTAGATGGAGGAAATTTATTAAAAAGTATTATTTGGCATTTTTCAGGAAGTAAAAATAAAGGAAGAAACTTTCTCAA
TAAAGTAAATTTATTATTATCTTTTTTTGTTCTATTTTTTGGGATAGTTTGTTTATTTAGATTTAACTTTTACTTTGGTT
TTATTCTTTCTCTTTTGGGATTGTTTGGAGTTAATTCTTCAAAATCTGAAAGTCAATTTTTTAAAATTGAAAATATACTT
AAATTTAGTAAAGTTTCTGAGATTAAATTAAAGCCGTTGAGGAAAATTGAATACGATTCAAATTTCTCAGAATTTAATAC
ACTTATAAAAAATAAAAAGGATATATCGGATAAATATTATTTTGTTACGAATAATGGTAGATGGACCGGTTTTGTTAATG
AGAGTATTTTAAAAACTGTTTCCTTAAATAAATGGGAACGGAACTTTGTTGGAGATTTTAAGAAACCAATCGATAATTTT
GAGAGTGTATCTTATAACGATAAATTATGGAGAACTATAGAAAGACTTGAAGAAACAAATGAAGGTTTTTTGTTGGTCCT
CAATGCTGCAGATATCCCTTTGGGGATAATTGATAGGTCAAAAATTGGGAACTTTGTATTGCATAAATTAGGTTTAAATT
TGCCTTCAGAGATTGTTAACAAATTAAACTTTAAAAATAACTACCCCTTAGGAATTGAATTGCCAAGAATAATTAATTCA
ATGAAGCAGAAAGGAGATCTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGAAGTTAGCCCACAAATTTTAATTAAAGTATTAGTCTTGGGCATATGATTATCATGTATGTAAAATTAATATTATTGCT
AAATATAGCGGAGTTTATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAACTCTTGCATAAAAATTTTCTAATATTTTTATTATCTATCTCAATATTTTTGAAATTTATATTTGATTTATTCTTTAG
GAATGAATTTCTTAAATGTT

Product: Zn-dependent proteases

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 407; Mature: 407

Protein sequence:

>407_residues
MRSWQIFKIWGIPFKVHPYWFAILFLFSWSISNQVNLTSSDIYNTKEAWIIGFFTSFFLLSSIVFHEIFRTFVSLNQGVK
IKNITFYFLGAILQIDKYCQTALGNIKIAVVKPLLCFATAFILLLVSSNSASQEQIAVNVISRVGIFNLFLGFLNLIPIG
SLDGGNLLKSIIWHFSGSKNKGRNFLNKVNLLLSFFVLFFGIVCLFRFNFYFGFILSLLGLFGVNSSKSESQFFKIENIL
KFSKVSEIKLKPLRKIEYDSNFSEFNTLIKNKKDISDKYYFVTNNGRWTGFVNESILKTVSLNKWERNFVGDFKKPIDNF
ESVSYNDKLWRTIERLEETNEGFLLVLNAADIPLGIIDRSKIGNFVLHKLGLNLPSEIVNKLNFKNNYPLGIELPRIINS
MKQKGDL

Sequences:

>Translated_407_residues
MRSWQIFKIWGIPFKVHPYWFAILFLFSWSISNQVNLTSSDIYNTKEAWIIGFFTSFFLLSSIVFHEIFRTFVSLNQGVK
IKNITFYFLGAILQIDKYCQTALGNIKIAVVKPLLCFATAFILLLVSSNSASQEQIAVNVISRVGIFNLFLGFLNLIPIG
SLDGGNLLKSIIWHFSGSKNKGRNFLNKVNLLLSFFVLFFGIVCLFRFNFYFGFILSLLGLFGVNSSKSESQFFKIENIL
KFSKVSEIKLKPLRKIEYDSNFSEFNTLIKNKKDISDKYYFVTNNGRWTGFVNESILKTVSLNKWERNFVGDFKKPIDNF
ESVSYNDKLWRTIERLEETNEGFLLVLNAADIPLGIIDRSKIGNFVLHKLGLNLPSEIVNKLNFKNNYPLGIELPRIINS
MKQKGDL
>Mature_407_residues
MRSWQIFKIWGIPFKVHPYWFAILFLFSWSISNQVNLTSSDIYNTKEAWIIGFFTSFFLLSSIVFHEIFRTFVSLNQGVK
IKNITFYFLGAILQIDKYCQTALGNIKIAVVKPLLCFATAFILLLVSSNSASQEQIAVNVISRVGIFNLFLGFLNLIPIG
SLDGGNLLKSIIWHFSGSKNKGRNFLNKVNLLLSFFVLFFGIVCLFRFNFYFGFILSLLGLFGVNSSKSESQFFKIENIL
KFSKVSEIKLKPLRKIEYDSNFSEFNTLIKNKKDISDKYYFVTNNGRWTGFVNESILKTVSLNKWERNFVGDFKKPIDNF
ESVSYNDKLWRTIERLEETNEGFLLVLNAADIPLGIIDRSKIGNFVLHKLGLNLPSEIVNKLNFKNNYPLGIELPRIINS
MKQKGDL

Specific function: Unknown

COG id: COG1994

COG function: function code R; Zn-dependent proteases

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 2 CBS domains [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000644
- InterPro:   IPR008915
- InterPro:   IPR016483 [H]

Pfam domain/function: PF00571 CBS; PF02163 Peptidase_M50 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 46837; Mature: 46837

Theoretical pI: Translated: 10.23; Mature: 10.23

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
0.5 %Met     (Translated Protein)
1.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
0.5 %Met     (Mature Protein)
1.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRSWQIFKIWGIPFKVHPYWFAILFLFSWSISNQVNLTSSDIYNTKEAWIIGFFTSFFLL
CCCCEEEEEECCCEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
SSIVFHEIFRTFVSLNQGVKIKNITFYFLGAILQIDKYCQTALGNIKIAVVKPLLCFATA
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEHHHHHHHHHHHH
FILLLVSSNSASQEQIAVNVISRVGIFNLFLGFLNLIPIGSLDGGNLLKSIIWHFSGSKN
HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCC
KGRNFLNKVNLLLSFFVLFFGIVCLFRFNFYFGFILSLLGLFGVNSSKSESQFFKIENIL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
KFSKVSEIKLKPLRKIEYDSNFSEFNTLIKNKKDISDKYYFVTNNGRWTGFVNESILKTV
HHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCEEEEECCHHHHHHH
SLNKWERNFVGDFKKPIDNFESVSYNDKLWRTIERLEETNEGFLLVLNAADIPLGIIDRS
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCEEECCHH
KIGNFVLHKLGLNLPSEIVNKLNFKNNYPLGIELPRIINSMKQKGDL
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MRSWQIFKIWGIPFKVHPYWFAILFLFSWSISNQVNLTSSDIYNTKEAWIIGFFTSFFLL
CCCCEEEEEECCCEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
SSIVFHEIFRTFVSLNQGVKIKNITFYFLGAILQIDKYCQTALGNIKIAVVKPLLCFATA
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEHHHHHHHHHHHH
FILLLVSSNSASQEQIAVNVISRVGIFNLFLGFLNLIPIGSLDGGNLLKSIIWHFSGSKN
HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCC
KGRNFLNKVNLLLSFFVLFFGIVCLFRFNFYFGFILSLLGLFGVNSSKSESQFFKIENIL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
KFSKVSEIKLKPLRKIEYDSNFSEFNTLIKNKKDISDKYYFVTNNGRWTGFVNESILKTV
HHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCEEEEECCHHHHHHH
SLNKWERNFVGDFKKPIDNFESVSYNDKLWRTIERLEETNEGFLLVLNAADIPLGIIDRS
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCEEECCHH
KIGNFVLHKLGLNLPSEIVNKLNFKNNYPLGIELPRIINSMKQKGDL
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8590279; 8905231 [H]