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The map label for this gene is yfbS [C]

Identifier: 120597734

GI number: 120597734

Start: 1031758

End: 1033482

Strand: Direct

Name: yfbS [C]

Synonym: Sputw3181_0904

Alternate gene names: 120597734

Gene position: 1031758-1033482 (Clockwise)

Preceding gene: 120597733

Following gene: 120597735

Centisome position: 21.91

GC content: 46.78

Gene sequence:

>1725_bases
GTGAGTGACTTGTGGCAATTAGCGATTATTTTGATAGGGCTTGTGGCTGGCTTAATTAGCGGCCGTATCAACCCAGCGGT
ATTGTTTTTATTTGCATTTTTGCTCTGTTATCTCTTGGGCATGGTTGCGCTCGATACCGCATTAACAAGCTTTACCAATA
TTGGCTTAGTCACACTTGTCCTGTTGGTGTTGGCCGCGACGGCGTTAGAAAAAACGTCCTTGCTGGGAAAGTTGAGTCAA
GTCATAGGTAATAGTTCTTTGCCTATGACAATGGCAAAACTCGGTTTTTCGACGGCTTTGCTGTCGTCTTTCACTAACAA
CACTGCGGTGGTGGCATCGCTTATCGGTGTTGTGCGCCGCAATCAGGCACACGCGCCAGCTAAGCTATTGTTGCCACTAA
ATTATGCGGCAATTTTAGGCGGCACACTGACCCTGATTGGTACCTCGACTAACCTGATTGTGAACTCCTTTGTAGAAAAC
GCTGGCTTACCCGCCTTAGGGTTCTTCGAGTTTACGCCGGTGGCTGTGATTATTTTAGTGGCTGGAATGCTGTTACTGAC
CTTACTGGCGAATATTCTGCCTGATAGAAGAGAAGATTCAAACGAAGAAACGCTACCTTATTTGCTCGAAGCCCATGTGG
CGAAAGGTTCGTCCTTGGTTGGTCGCAGTGTGGTGGATAACAAACTTAGGGCGCTGAAAAAGTTATATCTCGTTGAATTA
GAACGCAGTGGCATTTGTATTTGCCCTGTGCCGCCCCAGTTAGTATTACAAGCGGACGACGTGCTGCGTTTCAGTGGCGC
GGTGGAATCGGTCGAGTTATTGCATCAATTCGATGGTTTAGATTGGTTTGGTAAGCATCAAGCTAAGGGACAAAATTTAG
TTGAAGCCGTACTCGCGCCATCATCTCGTTTAGTGGGCAGTTCGTTAAAAGCAACGCGTTTTCGTGAGCAGTTCGATGCG
GCTGTGATGGCTATTCGCCGTGGAAATCACCCACTAAAGGGTGGGCTTGGTGACATAATCCTGCAACCCGGTGATGTGTT
GTTATTGACACCAGGTGATGGTTTTAGCAATAGCGCAAAGCTAAGTTCAGAGTTTGCGGCGATCAGCGGTTTAGATTTGA
ATGTGCGTTTAGACAGTCATCGTGGTCGCTGGGTGTTGCTGGGCTTTGCGGCAACGATCGTCCTGAGTGTTACTGACGTA
TTGCCATTGGCTAAAGGTTTAGTGATATTGCTGCTGAGTTATTTTGCCATCGGCGCTGTCACACTGTCTGAGCTGAAACG
CCGTTTTCCATTTGAACTTGTCATCATTGTTGGCAGTGCACTTGGTCTTGCTAATTTGATGATGAGTACAGGCCTTGCGA
ACAACTTAGCCCAAGGATTATTGAGTGTAATCAATGGTTATGGGGTCTTTGGTGCCTTTGTAGGTGTGTATTTTATGACC
TTGTTACTGACTGAACTGGTGACCAATAACGCAGCGGCAGCGCTGGCGTTCCCTATTGCCTACGCGATTGCGCTTAATTA
TGGTGTCGATGCAAGACCCTTTATTATGGCGGTCGTCTTTGGTGCCAGTGCGAGCTTTATTTCACCCTATGGCTATCAAA
CGAACTTAATGGTGTTTAATGCGGGTAATTATCGCTTTAGTGACTTTGTCCGCCTTGGATTGCCGTTATCTGTGCTGTAT
TCCCTGATAGTGATATTTATGGTGCCGATCATCTTTCCATTTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTCACAATTTAGTGCCTTTGAAGTCGAGTTTAATGCCTTAGTGCGTAAACACTTCCCCCATTGGCAAGCGATAGATATCA
CTCAGCTTGGAGCTTAATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGATTAGCTTGTGTTTATAGCCCTTATGTTAGCGGTTAGTCAACATGGGGATTGAGGAGTTTTTATGACAAATATCGTGT
GGCATCAACATCCTGTAGAC

Product: TrkA domain-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 574; Mature: 573

Protein sequence:

>574_residues
MSDLWQLAIILIGLVAGLISGRINPAVLFLFAFLLCYLLGMVALDTALTSFTNIGLVTLVLLVLAATALEKTSLLGKLSQ
VIGNSSLPMTMAKLGFSTALLSSFTNNTAVVASLIGVVRRNQAHAPAKLLLPLNYAAILGGTLTLIGTSTNLIVNSFVEN
AGLPALGFFEFTPVAVIILVAGMLLLTLLANILPDRREDSNEETLPYLLEAHVAKGSSLVGRSVVDNKLRALKKLYLVEL
ERSGICICPVPPQLVLQADDVLRFSGAVESVELLHQFDGLDWFGKHQAKGQNLVEAVLAPSSRLVGSSLKATRFREQFDA
AVMAIRRGNHPLKGGLGDIILQPGDVLLLTPGDGFSNSAKLSSEFAAISGLDLNVRLDSHRGRWVLLGFAATIVLSVTDV
LPLAKGLVILLLSYFAIGAVTLSELKRRFPFELVIIVGSALGLANLMMSTGLANNLAQGLLSVINGYGVFGAFVGVYFMT
LLLTELVTNNAAAALAFPIAYAIALNYGVDARPFIMAVVFGASASFISPYGYQTNLMVFNAGNYRFSDFVRLGLPLSVLY
SLIVIFMVPIIFPF

Sequences:

>Translated_574_residues
MSDLWQLAIILIGLVAGLISGRINPAVLFLFAFLLCYLLGMVALDTALTSFTNIGLVTLVLLVLAATALEKTSLLGKLSQ
VIGNSSLPMTMAKLGFSTALLSSFTNNTAVVASLIGVVRRNQAHAPAKLLLPLNYAAILGGTLTLIGTSTNLIVNSFVEN
AGLPALGFFEFTPVAVIILVAGMLLLTLLANILPDRREDSNEETLPYLLEAHVAKGSSLVGRSVVDNKLRALKKLYLVEL
ERSGICICPVPPQLVLQADDVLRFSGAVESVELLHQFDGLDWFGKHQAKGQNLVEAVLAPSSRLVGSSLKATRFREQFDA
AVMAIRRGNHPLKGGLGDIILQPGDVLLLTPGDGFSNSAKLSSEFAAISGLDLNVRLDSHRGRWVLLGFAATIVLSVTDV
LPLAKGLVILLLSYFAIGAVTLSELKRRFPFELVIIVGSALGLANLMMSTGLANNLAQGLLSVINGYGVFGAFVGVYFMT
LLLTELVTNNAAAALAFPIAYAIALNYGVDARPFIMAVVFGASASFISPYGYQTNLMVFNAGNYRFSDFVRLGLPLSVLY
SLIVIFMVPIIFPF
>Mature_573_residues
SDLWQLAIILIGLVAGLISGRINPAVLFLFAFLLCYLLGMVALDTALTSFTNIGLVTLVLLVLAATALEKTSLLGKLSQV
IGNSSLPMTMAKLGFSTALLSSFTNNTAVVASLIGVVRRNQAHAPAKLLLPLNYAAILGGTLTLIGTSTNLIVNSFVENA
GLPALGFFEFTPVAVIILVAGMLLLTLLANILPDRREDSNEETLPYLLEAHVAKGSSLVGRSVVDNKLRALKKLYLVELE
RSGICICPVPPQLVLQADDVLRFSGAVESVELLHQFDGLDWFGKHQAKGQNLVEAVLAPSSRLVGSSLKATRFREQFDAA
VMAIRRGNHPLKGGLGDIILQPGDVLLLTPGDGFSNSAKLSSEFAAISGLDLNVRLDSHRGRWVLLGFAATIVLSVTDVL
PLAKGLVILLLSYFAIGAVTLSELKRRFPFELVIIVGSALGLANLMMSTGLANNLAQGLLSVINGYGVFGAFVGVYFMTL
LLTELVTNNAAAALAFPIAYAIALNYGVDARPFIMAVVFGASASFISPYGYQTNLMVFNAGNYRFSDFVRLGLPLSVLYS
LIVIFMVPIIFPF

Specific function: Unknown

COG id: COG0471

COG function: function code P; Di- and tricarboxylate transporters

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 2 RCK C-terminal domains [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788629, Length=609, Percent_Identity=26.4367816091954, Blast_Score=166, Evalue=3e-42,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001898
- InterPro:   IPR006037 [H]

Pfam domain/function: PF00939 Na_sulph_symp; PF02080 TrkA_C [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 61218; Mature: 61087

Theoretical pI: Translated: 8.41; Mature: 8.41

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSDLWQLAIILIGLVAGLISGRINPAVLFLFAFLLCYLLGMVALDTALTSFTNIGLVTLV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLVLAATALEKTSLLGKLSQVIGNSSLPMTMAKLGFSTALLSSFTNNTAVVASLIGVVRR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHC
NQAHAPAKLLLPLNYAAILGGTLTLIGTSTNLIVNSFVENAGLPALGFFEFTPVAVIILV
CCCCCCEEEEEECCHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
AGMLLLTLLANILPDRREDSNEETLPYLLEAHVAKGSSLVGRSVVDNKLRALKKLYLVEL
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE
ERSGICICPVPPQLVLQADDVLRFSGAVESVELLHQFDGLDWFGKHQAKGQNLVEAVLAP
CCCCEEEECCCHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCC
SSRLVGSSLKATRFREQFDAAVMAIRRGNHPLKGGLGDIILQPGDVLLLTPGDGFSNSAK
CHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEECCCCEEEECCCCCCCCCCH
LSSEFAAISGLDLNVRLDSHRGRWVLLGFAATIVLSVTDVLPLAKGLVILLLSYFAIGAV
HHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLSELKRRFPFELVIIVGSALGLANLMMSTGLANNLAQGLLSVINGYGVFGAFVGVYFMT
HHHHHHHHCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
LLLTELVTNNAAAALAFPIAYAIALNYGVDARPFIMAVVFGASASFISPYGYQTNLMVFN
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEE
AGNYRFSDFVRLGLPLSVLYSLIVIFMVPIIFPF
CCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SDLWQLAIILIGLVAGLISGRINPAVLFLFAFLLCYLLGMVALDTALTSFTNIGLVTLV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLVLAATALEKTSLLGKLSQVIGNSSLPMTMAKLGFSTALLSSFTNNTAVVASLIGVVRR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHC
NQAHAPAKLLLPLNYAAILGGTLTLIGTSTNLIVNSFVENAGLPALGFFEFTPVAVIILV
CCCCCCEEEEEECCHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
AGMLLLTLLANILPDRREDSNEETLPYLLEAHVAKGSSLVGRSVVDNKLRALKKLYLVEL
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE
ERSGICICPVPPQLVLQADDVLRFSGAVESVELLHQFDGLDWFGKHQAKGQNLVEAVLAP
CCCCEEEECCCHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCC
SSRLVGSSLKATRFREQFDAAVMAIRRGNHPLKGGLGDIILQPGDVLLLTPGDGFSNSAK
CHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEECCCCEEEECCCCCCCCCCH
LSSEFAAISGLDLNVRLDSHRGRWVLLGFAATIVLSVTDVLPLAKGLVILLLSYFAIGAV
HHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLSELKRRFPFELVIIVGSALGLANLMMSTGLANNLAQGLLSVINGYGVFGAFVGVYFMT
HHHHHHHHCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
LLLTELVTNNAAAALAFPIAYAIALNYGVDARPFIMAVVFGASASFISPYGYQTNLMVFN
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEE
AGNYRFSDFVRLGLPLSVLYSLIVIFMVPIIFPF
CCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8905231 [H]